РИКС (ген)

ARHGAP32
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	3IUG
Идентификаторы
Псевдонимы	ARHGAP32 , GC-GAP, GRIT, PX-RICS, RICS, p200RhoGAP, p250GAP, белок 32, активирующий Rho ГТФазу.
Внешние идентификаторы	Опустить : 608541 ; МГИ : 2450166 ; Гомологен : 8812 ; Генные карты : ARHGAP32 ; OMA : ARHGAP32 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 11 (human)
End	129,279,324 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 9 (mouse)
End	32,179,742 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	middle temporal gyrus; ; secondary oocyte; ; postcentral gyrus; ; endothelial cell; ; Brodmann area 23; ; superior frontal gyrus; ; primary visual cortex; ; entorhinal cortex; ; sural nerve; ; palpebral conjunctiva;
	Top expressed in
	primary motor cortex; ; cingulate gyrus; ; lateral geniculate nucleus; ; olfactory tubercle; ; prefrontal cortex; ; lateral septal nucleus; ; anterior amygdaloid area; ; piriform cortex; ; mammillary body; ; ventromedial nucleus;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	protein binding; phosphatidylinositol binding; GTPase activator activity; phosphatidylinositol phosphate binding;
Cellular component	cytoplasm; cytosol; endosome; postsynaptic membrane; cell projection; endoplasmic reticulum membrane; membrane; postsynaptic density; Golgi membrane; plasma membrane; dendritic spine; synapse; cell junction; endoplasmic reticulum; endosome membrane; fibrillar center; nucleoplasm; Golgi apparatus; cell cortex; actin cytoskeleton;
Biological process	positive regulation of GTPase activity; regulation of small GTPase mediated signal transduction; signal transduction; small GTPase mediated signal transduction;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9743
	330914
	ENSG00000134909
	ENSMUSG00000041444
	A7KAX9
	Q811P8
	НМ_001142685 ; НМ_014715 ; НМ_001378024 ; НМ_001378025
	НМ_001195632 ; НМ_177379 ; НМ_001370957 ; НМ_001370958
	НП_001136157 ; НП_055530 ; НП_001364953 ; НП_001364954
	НП_001182561 ; НП_796353 ; НП_001357886 ; НП_001357887
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Белок 32, активирующий Rho-GTPase, представляет собой белок , который у человека кодируется RICS геном . ^{[ 5 ]} RICS имеет две известные изоформы: RICS, которые экспрессируются преимущественно в конусах роста нейритов и на постсинаптических мембранах , и PX-RICS, который более широко экспрессируется в эндоплазматическом ретикулуме , аппарате Гольджи и эндосомах . ^{[ 6 ]} Единственным известным доменом RICS является домен RhoGAP , тогда как PX-RICS имеет дополнительную гомологию Phox и домен SH3 .

Функция

RICS (также известный как GRIT/Arhgap32) представляет собой нейрон-ассоциированный белок, активирующий ГТФазу, который может регулировать морфологию и силу дендритных шипов путем модуляции активности Rho-ГТФазы . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Изоформы

РИКС

Эксперименты показали, что нокдаун RICS или просто нокаут его GAP или C-концевого сайта связывания TrkA приводит к аномально удлиненным нейритам и блокирует NGF . рост, регулируемый ^{[ 7 ]}

Известно, что активность GAP RICS регулируется двумя сайтами фосфорилирования, один из которых контролируется CaMKII, а другой - RPTPa . Когда CaMKII активируется Ca ²⁺ вход через NMDA-рецепторы и инактивирует RICS посредством фосфорилирования , что, в свою очередь, увеличивает количество активных GTP-связанных форм Cdc42 и Rac1 . Таким образом, это может вызвать, например, ремоделирование дендритных шипиков . Поскольку в некоторых экспериментах было показано, что Cdc42 не влияет на морфологию позвоночника, в то время как другие показали, что Rac1 влияет (через путь PAK1 , LIMK , CFL1 ), наиболее вероятный путь - через Rac1. Тот факт, что RACS также связывается с β-катенином и N-кадгеринами in vivo в составе PSD (с которым он связывается через PSD-95 и имеет слабое связывание с субъединицами NR2), предполагает, что может существовать другой путь изменения структуры позвоночника. . ^{[ 6 ]} Сайт фосфорилирования, контролируемый RPTPa, контролирует специфичность активности GAP посредством механизма, который, как полагают, включает перемещение c-концевой области RICS. В фосфорилированном состоянии RICS может влиять на Rac, Rho и Cdc42, но после дефосфорилирования RPTPa он может влиять только на Rac. Дополнительный сайт фосфорилирования, регулируемый FYN, контролирует связывание RPTPa с RICS. ^{[ 8 ]}

PX-РИКС

PX-RICS является доминирующей изоформой, экспрессируемой во время развития нервной системы. Известно, что активность GAP гораздо ниже, чем у RICS. Хотя он более широко выражен, чем RICS, известно, что он ингибирует удлинение нейронов. ^{[ 9 ]} В подтверждение идеи о том, что это синаптически значимая изоформа, известно, что она связывает NR2B и PSD95 in vivo.

Известно, что PX-RICS участвует в транспортировке некоторых синаптических белков, у которых отсутствуют сигналы экспорта ER, из эндоплазматического ретикулума в аппарат Гольджи. Это было показано для β-катенина и N-кадгерина, у последнего из которых отсутствует сигнал экспорта ER, а у первого связывается последний внутри ER как необходимая, но недостаточная часть процесса его экспорта. Было обнаружено, что PX-RICS является необходимым компонентом для экспорта этого комплекса в аппарат Гольджи, а затем далее в клеточную мембрану. Считается, что PX-RICS делает это, сначала локализуясь на мембране ЭР - это происходит путем связывания с GABARAP , который связывает ЭР, и через его гомологичный домен Phox, который имеет высокую аффинность связывания с Pi4P, преобладающим фосфоинозитидом в эндоплазматическая сеть и аппарат Гольджи. Считается, что PX-RICS связывает гетеродимер белков 14-3-3, кодируемых генами YWHAZ и YWHAQ . Сайт, в котором происходит это связывание, представляет собой сайт RSKSDP на c-конце PX-RICS, который фосфорилируется CAMKII для стимулирования связывания. ^{[ 10 ]} Также теперь было показано, что мембранный транспорт FGFR4, белка, связывающего N-кадгерин, зависит от нокдауна PX-RICS. ^{[ 11 ]}

Взаимодействия

Было показано, что RICS (ген) взаимодействует с:

Было описано, что микроРНК Мир-132 нацелена на деградацию мРНК этого гена; Считается, что это важно для регуляции развития нейронов. ^{[ 16 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134909 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041444 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок, активирующий ГТФазу RICS Rho» .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Овада С., Моришита Ю., Акияма Т. (март 2003 г.). «RICS, новый белок, активирующий ГТФазу для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторов бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата» . Ж. Биол. Хим . 278 (11): 9920–7. дои : 10.1074/jbc.M208872200 . ПМИД 12531901 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросе Э., Гото Н., Мории Х., Ота Ю., Мори Н. (декабрь 2002 г.). «Grit, белок семейства Rho, активирующий ГТФазу, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адаптерными молекулами N-Shc и CrkL/Crk» . Мол. Клетка. Биол . 22 (24): 8721–34. дои : 10.1128/MCB.22.24.8721-8734.2002 . ПМК 139861 . ПМИД 12446789 .
^ Шаньон М.Ю., Ву КЛ, Наказава Т., Ямамото Т., Нода М., Бланшето С., Трембле М.Л. (ноябрь 2010 г.). «Рецептор тирозинфосфатазы сигма (RPTPσ) регулирует p250GAP, новый субстрат, который ослабляет передачу сигналов Rac». Клетка. Сигнал . 22 (11): 1626–33. doi : 10.1016/j.cellsig.2010.06.001 . ПМИД 20550964 .
^ Хаяши Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Овада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (август 2007 г.). «PX-RICS, новый сплайсинговый вариант RICS, является основной изоформой, экспрессирующейся во время развития нейронов» . Генные клетки . 12 (8): 929–39. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01101.x . ПМИД 17663722 . S2CID 22118853 .
^ Накамура Т., Хаяси Т., Мимори-Киёсуэ Ю., Сакауэ Ф., Мацуура К., Иемура С., Нацуме Т., Акияма Т. (май 2010 г.). «Комплекс PX-RICS-14-3-3zeta/theta соединяет N-кадгерин-бета-катенин с динеин-динактином, опосредуя его экспорт из эндоплазматического ретикулума» . Ж. Биол. Хим . 285 (21): 16145–54. дои : 10.1074/jbc.M109.081315 . ПМЦ 2871483 . ПМИД 20308060 .
^ Накамура Т., Хаяси Т., Насу-Нишимура Ю., Сакауэ Ф., Моришита Ю., Окабе Т., Овада С., Мацуура К., Акияма Т. (май 2008 г.). «PX-RICS опосредует транспорт комплекса N-кадгерин/бета-катенин от ER к Гольджи» . Генс Дев . 22 (9): 1244–56. дои : 10.1101/gad.1632308 . ПМЦ 2335319 . ПМИД 18451111 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Чжао С., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2» . Ж. Биол. Хим . 278 (36): 34641–53. дои : 10.1074/jbc.M304594200 . ПМИД 12819203 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Накадзава Т., Ватабе А.М., Тэдзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Х., Иноуэ А., Окабе С., Манабэ Т., Ямамото Т. (июль 2003 г.). «p250GAP, новый обогащенный мозгом белок, активирующий ГТФазу для ГТФаз семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата» . Мол. Биол. Клетка . 14 (7): 2921–34. doi : 10.1091/mbc.E02-09-0623 . ПМК 165687 . ПМИД 12857875 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мун С.Ю., Занг Х., Чжэн Юй (февраль 2003 г.). «Характеристика специфичного для мозга белка, активирующего Rho GTPase, p200RhoGAP» . Ж. Биол. Хим . 278 (6): 4151–9. дои : 10.1074/jbc.M207789200 . ПМИД 12454018 .
^ Танигучи С., Лю Х., Наказава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (июнь 2003 г.). «p250GAP, нейрональный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 306 (1): 151–5. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00923-9 . ПМИД 12788081 .
^ Во Н., Кляйн М.Е., Варламова О., Келлер Д.М., Ямамото Т., Гудман Р.Х., Импи С. (ноябрь 2005 г.). «МикроРНК, индуцированная белком, связывающим элемент ответа цАМФ, регулирует морфогенез нейронов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (45): 16426–31. дои : 10.1073/pnas.0508448102 . ПМЦ 1283476 . ПМИД 16260724 .

Дальнейшее чтение

Хаяши Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Овада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (2007). «PX-RICS, новый сплайсинговый вариант RICS, является основной изоформой, экспрессирующейся во время развития нейронов» . Генные клетки . 12 (8): 929–39. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01101.x . ПМИД 17663722 . S2CID 22118853 .
Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Г., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Э., Барабаси А.Л., Видал М., Зогби Х.И. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия при наследственных атаксиях человека и нарушениях дегенерации клеток Пуркинье» . Клетка . 125 (4): 801–14. дои : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . ПМИД 16713569 . S2CID 13709685 .
Бензингер А., Мустер Н., Кох Х.Б., Йейтс-младший, Хермекинг Х. (2005). «Целевой протеомный анализ сигмы 14-3-3, эффектора p53, который обычно подавляется при раке» . Мол. Клетка. Протеомика . 4 (6): 785–95. дои : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . ПМИД 15778465 .
Наказава Т., Ватабе А.М., Тэдзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Х., Иноуэ А., Окабе С., Манабэ Т., Ямамото Т. (2004). «p250GAP, новый обогащенный мозгом белок, активирующий ГТФазу для ГТФаз семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата» . Мол. Биол. Клетка . 14 (7): 2921–34. doi : 10.1091/mbc.E02-09-0623 . ПМК 165687 . ПМИД 12857875 .
Чжао С., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (2003). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2» . Ж. Биол. Хим . 278 (36): 34641–53. дои : 10.1074/jbc.M304594200 . ПМИД 12819203 .
Танигучи С., Лю Х., Наказава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (2003). «p250GAP, нейрональный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 306 (1): 151–5. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00923-9 . ПМИД 12788081 .
Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Овада С., Моришита Ю., Акияма Т. (2003). «RICS, новый белок, активирующий ГТФазу для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторов бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата» . Ж. Биол. Хим . 278 (11): 9920–7. дои : 10.1074/jbc.M208872200 . ПМИД 12531901 .
Гардинер Э.М., Пестонжамасп К.Н., Боль Б.П., Чемберлен С., Хан К.М., Бокох Г.М. (2003). «Пространственный и временной анализ активации Rac во время хемотаксиса живых нейтрофилов» . Курс. Биол . 12 (23): 2029–34. дои : 10.1016/S0960-9822(02)01334-9 . ПМИД 12477392 . S2CID 13589833 .
Мун С.Ю., Занг Х., Чжэн Юй (2003). «Характеристика специфичного для мозга белка, активирующего Rho GTPase, p200RhoGAP» . Ж. Биол. Хим . 278 (6): 4151–9. дои : 10.1074/jbc.M207789200 . ПМИД 12454018 .
Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросе Э., Гото Н., Мории Х., Ота Ю., Мори Н. (2003). «Grit, белок семейства Rho, активирующий ГТФазу, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адаптерными молекулами N-Shc и CrkL/Crk» . Мол. Клетка. Биол . 22 (24): 8721–34. дои : 10.1128/MCB.22.24.8721-8734.2002 . ПМК 139861 . ПМИД 12446789 .
Накаяма М., Кикуно Р., Охара О (2003). «Белко-белковые взаимодействия между крупными белками: двухгибридный скрининг с использованием функционально классифицированной библиотеки, состоящей из длинных кДНК» . Геном Рез . 12 (11): 1773–84. дои : 10.1101/гр.406902 . ПМК 187542 . ПМИД 12421765 .
Нагасе Т., Исикава К., Суяма М., Кикуно Р., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые кодируют большие белки in vitro» . ДНК Рез . 5 (5): 277–86. дои : 10.1093/dnares/5.5.277 . ПМИД 9872452 .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000134909 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041444 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: белок, активирующий ГТФазу RICS Rho» .

[Okabe_2003-6] Jump up to: ^а ^б ^с Окабе Т., Накамура Т., Нисимура Ю.Н., Коху К., Овада С., Моришита Ю., Акияма Т. (март 2003 г.). «RICS, новый белок, активирующий ГТФазу для Cdc42 и Rac1, участвует в передаче сигналов рецепторов бета-катенин-N-кадгерина и N-метил-D-аспартата» . Ж. Биол. Хим . 278 (11): 9920–7. дои : 10.1074/jbc.M208872200 . ПМИД 12531901 .

[pmid12446789-7] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж ^г Накамура Т., Комия М., Соне К., Хиросе Э., Гото Н., Мории Х., Ота Ю., Мори Н. (декабрь 2002 г.). «Grit, белок семейства Rho, активирующий ГТФазу, регулирует расширение нейритов посредством ассоциации с рецептором TrkA и адаптерными молекулами N-Shc и CrkL/Crk» . Мол. Клетка. Биол . 22 (24): 8721–34. дои : 10.1128/MCB.22.24.8721-8734.2002 . ПМК 139861 . ПМИД 12446789 .

[pmid20550964-8] Шаньон М.Ю., Ву КЛ, Наказава Т., Ямамото Т., Нода М., Бланшето С., Трембле М.Л. (ноябрь 2010 г.). «Рецептор тирозинфосфатазы сигма (RPTPσ) регулирует p250GAP, новый субстрат, который ослабляет передачу сигналов Rac». Клетка. Сигнал . 22 (11): 1626–33. doi : 10.1016/j.cellsig.2010.06.001 . ПМИД 20550964 .

[pmid17663722-9] Хаяши Т., Окабе Т., Насу-Нисимура Ю., Сакауэ Ф., Овада С., Мацуура К., Акияма Т., Накамура Т. (август 2007 г.). «PX-RICS, новый сплайсинговый вариант RICS, является основной изоформой, экспрессирующейся во время развития нейронов» . Генные клетки . 12 (8): 929–39. дои : 10.1111/j.1365-2443.2007.01101.x . ПМИД 17663722 . S2CID 22118853 .

[pmid20308060-10] Накамура Т., Хаяси Т., Мимори-Киёсуэ Ю., Сакауэ Ф., Мацуура К., Иемура С., Нацуме Т., Акияма Т. (май 2010 г.). «Комплекс PX-RICS-14-3-3zeta/theta соединяет N-кадгерин-бета-катенин с динеин-динактином, опосредуя его экспорт из эндоплазматического ретикулума» . Ж. Биол. Хим . 285 (21): 16145–54. дои : 10.1074/jbc.M109.081315 . ПМЦ 2871483 . ПМИД 20308060 .

[pmid18451111-11] Накамура Т., Хаяси Т., Насу-Нишимура Ю., Сакауэ Ф., Моришита Ю., Окабе Т., Овада С., Мацуура К., Акияма Т. (май 2008 г.). «PX-RICS опосредует транспорт комплекса N-кадгерин/бета-катенин от ER к Гольджи» . Генс Дев . 22 (9): 1244–56. дои : 10.1101/gad.1632308 . ПМЦ 2335319 . ПМИД 18451111 .

[pmid12819203-12] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и ^ж Чжао С., Ма Х., Босси-Ветцель Э., Липтон С.А., Чжан З., Фэн Г.С. (сентябрь 2003 г.). «GC-GAP, белок, активирующий ГТФазу семейства Rho, который взаимодействует с сигнальными адаптерами Gab1 и Gab2» . Ж. Биол. Хим . 278 (36): 34641–53. дои : 10.1074/jbc.M304594200 . ПМИД 12819203 .

[pmid12857875-13] Jump up to: ^а ^б ^с Накадзава Т., Ватабе А.М., Тэдзука Т., Ёсида Ю., Ёкояма К., Умемори Х., Иноуэ А., Окабе С., Манабэ Т., Ямамото Т. (июль 2003 г.). «p250GAP, новый обогащенный мозгом белок, активирующий ГТФазу для ГТФаз семейства Rho, участвует в передаче сигналов рецептора N-метил-d-аспартата» . Мол. Биол. Клетка . 14 (7): 2921–34. doi : 10.1091/mbc.E02-09-0623 . ПМК 165687 . ПМИД 12857875 .

[pmid12454018-14] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Мун С.Ю., Занг Х., Чжэн Юй (февраль 2003 г.). «Характеристика специфичного для мозга белка, активирующего Rho GTPase, p200RhoGAP» . Ж. Биол. Хим . 278 (6): 4151–9. дои : 10.1074/jbc.M207789200 . ПМИД 12454018 .

[pmid12788081-15] Танигучи С., Лю Х., Наказава Т., Ёкояма К., Тэдзука Т., Ямамото Т. (июнь 2003 г.). «p250GAP, нейрональный белок RhoGAP, связан с Fyn и фосфорилируется им». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 306 (1): 151–5. дои : 10.1016/S0006-291X(03)00923-9 . ПМИД 12788081 .

[pmid16260724-16] Во Н., Кляйн М.Е., Варламова О., Келлер Д.М., Ямамото Т., Гудман Р.Х., Импи С. (ноябрь 2005 г.). «МикроРНК, индуцированная белком, связывающим элемент ответа цАМФ, регулирует морфогенез нейронов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 102 (45): 16426–31. дои : 10.1073/pnas.0508448102 . ПМЦ 1283476 . ПМИД 16260724 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]