✖


Jump to content

Список сайтов разрезания самонаводящейся эндонуклеазы

Легенда об азотистых основаниях
Код Нуклеотид представлен
А Аденин (А)
С Цитозин (С)
Г Гуанин (Г)
Т Тимин (Т)
Н A, C, G или T
М А или С
Р А или Г
В А или Т
И С или Т
С С или Г
К Г или Т
ЧАС А, С или Т
Б С, Г или Т
V А, С или G
Д А, Г или Т

представляют Хоминг-эндонуклеазы собой особый тип ферментов рестрикции, кодируемых интронами или интеинами . Они действуют на клеточную ДНК клетки, которая их синтезирует; точнее, в противоположном аллеле гена , который их кодирует. [1]

Самонаводящиеся эндонуклеазы

[ редактировать ]

В список вошли некоторые из наиболее изученных примеров. Подробно описаны следующие концепции:

Фермент Сан-Франциско PDB-код Источник Д СКЛ Последовательность распознавания Резать
I-лет [2] H11П8К Аспергиллы нидуланс И миф 5' TTGAGGAGGTTTCTCTGTAAATAA
3' AACTCCTCCAAAGAGACATTTATT 		5' ---TTGAGGAGGTTTC   TCTGTAAATAA--- 3'
3' ---AACTCCTCC   AAAGAGACATTTATT--- 5'
Я-CeuI [3] [4] [5] [6] H12EX5 Хламидомонада эугаметос И хлор 5' TAACTATAACGGTCCTAAGGTAGCGA
3' ATTGATATTGCCAGGATTCCATCGCT 		5' ---TAACTATAACGGTCCTAA   GGTAGCGA--- 3'
3' ---ATTGATATTGCCAG   GATTCCATCGCT--- 5'
И-ЧуИ [7] [8] H1Q32001 Хламидомонада гумикола И хлор 5' GAAGGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATC
3' CTTCCAAACCGTGGAGCTACAGCCGAGTAG		 5' ---GAAGGTTTGGCACCTCG   ATGTCGGCTCATC--- 3'
3' ---CTTCCAAACCGTG   GAGCTACAGCCGAGTAG--- 5'
I-CpaI [8] [9] H1Q39562 Хламидомонада бледная И хлор 5' CGATCCTAAGGTAGCGAAATTCA
3' GCTAGGATTCCATCGCTTTAAGT 		5' ---CGATCCTAAGGTAGCGAA   ATTCA--- 3'
3' ---GCTAGGATTCCATC   GCTTTAAGT--- 5'
I-CpaII [10] H1Q39559 Хламидомонада бледная И хлор 5' CCCGGCTAACTCTGTGCCAG
3' GGGCCGATTGAGACACGGTC 		5' ---CCCGGCTAACTC   TGTGCCAG--- 3'
5' ---GGGCCGAT   TGAGACACGGTC--- 3'
Я-КреИ [11] H11БП7 Хламидомонада Рейнхардти И хлор 5' CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3' GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5' ---CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG--- 3'
3' ---GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC--- 5'
Я-ДмоИ H11Б24 Десульфурококк мобилизис А хрм 5' ATGCCTTGCCGGGTAAGTTCCGGCGCGCAT
3' TACGGAACGGCCCATTCAAGGCCGCGCGTA 		5' ---ATGCCTTGCCGGGTAA   GTTCCGGCGCGCAT--- 3'
3' ---TACGGAACGGCC   CATTCAAGGCCGCGCGTA--- 5'
Н-Три [12] H11 МОУ Гибрид: I-DmoI и I-CreI. И Э 5' CAAAACGTCGTAAGTTCCGGCGCG
3' GTTTTGCAGCATTCAAGGCCGCGC 		5' ---CAAAACGTCGTAA   GTTCCGGCGCG--- 3'
3' ---GTTTTGCAG   CATTCAAGGCCGCGC--- 5'
Я-HmuI [13] [14] H31U3E Bacillus subtilis SP01 Фаг Б фаг 5' AGTAATGAGCCTAACGCTCAGCAA
3' TCATTACTCGGATTGCGAGTCGTT		  Никующая эндонуклеаза : *
  3' ---TCATTACTCGGATTGC   GAGTCGTT--- 5'
Я-HmuII [14] [15] H3Q38137 Bacillus subtilis SP82 Фаг Б фаг 5' AGTAATGAGCCTAACGCTCAACAA
3' TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTT		  Никующая эндонуклеаза : *
  3' ---TCATTACTCGGATTGCGAGTTGTTN35   NNNN--- 5'
Я-меньше [16] [17] H3P0A3U1 Лактококк лактис Б хрм 5' CACATCCATAACCATATCATTTTT
3' GTGTAGGTATTGGTATAGTAAAAA 		5' ---CACATCCATAA   CCATATCATTTTT--- 3'
3' ---GTGTAGGTATTGGTATAGTAA   AAA--- 5'
Я-МсоИ H11М5Х Мономастикс сп. И 5' CTGGGTTCAAAACGTCGTGAGACAGTTTGG
3' GACCCAAGTTTTGCAGCACTCTGTCAAACC 		5' ---CTGGGTTCAAAACGTCGTGA   GACAGTTTGG--- 3'
3' ---GACCCAAGTTTTGCAG   CACTCTGTCAAACC--- 5'
ПИ-ПфуИ H11DQ3 Пирококк яростный Vc1 А 5' GAAGATGGGAGGAGGGACCGGACTCAACTT
3' CTTCTACCCTCCTCCCTGGCCTGAGTTGAA 		5' ---GAAGATGGGAGGAGGG   ACCGGACTCAACTT--- 3'
3' ---CTTCTACCCTCC   TCCCTGGCCTGAGTTGAA--- 5'
ПИ-ПкоII H12CW7 Пирококк кодакаренсис БАА-918 А 5' CAGTACTACGGTTAC
3' GTCATGATGCCAATG 		5' ---CAGTACTACG  GTTAC--- 3'
3' ---GTCATG  ATGCCAATG--- 5'
Я-ПорИ [18] [19] H3Пиробакулум органотрофный А хрм 5' GCGAGCCCGTAAGGGTGTGTACGGG
3' CGCTCGGGCATTCCCACACATGCCC 		5' ---GCGAGCCCGTAAGGGT   GTGTACGGG--- 3'
3' ---CGCTCGGGCATT   CCCACACATGCCC--- 5'
I-PpoI H41 ЭВКС Физарум многоцефальный И плазмида 5' TAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAAT
3' ATTGATACTGAGAGAATTCCATCGGTTTA		 5' ---TAACTATGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAAT--- 3'
3' ---ATTGATACTGAGAG   AATTCCATCGGTTTA--- 5'
ПИ-ПспИ H1Q51334 Пирококк сп. А хрм 5' TGGCAAACAGCTATTATGGGTATTATGGGT
3' ACCGTTTGTCGATAATACCCATAATACCCA 		5' ---TGGCAAACAGCTATTAT   GGGTATTATGGGT--- 3'
3' ---ACCGTTTGTCGAT   AATACCCATAATACCCA--- 5'
Я-ScaI [20] [21] H1P03873 Сахаромицес капенсис И миф 5' TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3' ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG 		5' ---TGTCACATTGAGGTGCACT   AGTTATTAC--- 3'
3' ---ACAGTGTAACTCCAC   GTGATCAATAATG--- 5'
I-SceI [4] [5] H11Р7М Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' AGTTACGCTAGGGATAACAGGGTAATATAG
3' TCAATGCGATCCCTATTGTCCCATTATATC 		5' ---AGTTACGCTAGGGATAA   CAGGGTAATATAG--- 3'
3' ---TCAATGCGATCCC   TATTGTCCCATTATATC--- 5'
PI-SceI [22] [23] H11ВДЕ Сахаромицеты cerevisiae И 5' ATCTATGTCGGGTGCGGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA
3' TAGATACAGCCCACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT 		5' ---ATCTATGTCGGGTGC   GGAGAAAGAGGTAATGAAATGGCA--- 3'
3' ---TAGATACAGCC   CACGCCTCTTTCTCCATTACTTTACCGT--- 5'
I-SceII [24] [25] [26] H1Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' TTTTGATTCTTTGGTCACCCTGAAGTATA
3' AAAACTAAGAAACCAGTGGGACTTCATAT 		5' ---TTTTGATTCTTTGGTCACCC   TGAAGTATA--- 3'
3' ---AAAACTAAGAAACCAG   TGGGACTTCATAT--- 5'
I-SecIII [24] [27] [28] H1Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' ATTGGAGGTTTTGGTAACTATTTATTACC
3' TAACCTCCAAAACCATTGATAAATAATGG 		5' ---ATTGGAGGTTTTGGTAAC   TATTTATTACC--- 3'
3' ---TAACCTCCAAAACC   ATTGATAAATAATGG--- 5'
I-SceIV [24] [29] [30] H1Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' TCTTTTCTCTTGATTAGCCCTAATCTACG
3' AGAAAAGAGAACTAATCGGGATTAGATGC 		5' ---TCTTTTCTCTTGATTA   GCCCTAATCTACG--- 3'
3' ---AGAAAAGAGAAC   TAATCGGGATTAGATGC--- 5'
I-SceV [24] [31] H3Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' AATAATTTTCTTCTTAGTAATGCC
3' TTATTAAAAGAAGAATCATTACGG 		5' ---AATAATTTTCT   TCTTAGTAATGCC--- 3'
3' ---TTATTAAAAGAAGAATCATTA   CGG--- 5'
I-SceVI [24] [32] H3Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' GTTATTTAATGTTTTAGTAGTTGG
3' CAATAAATTACAAAATCATCAACC 		5' ---GTTATTTAATG   TTTTAGTAGTTGG--- 3'
3' ---CAATAAATTACAAAATCATCA   ACC--- 5'
I-SceVII [20] H1Сахаромицеты cerevisiae И миф 5' TGTCACATTGAGGTGCACTAGTTATTAC
3' ACAGTGTAACTCCACGTGATCAATAATG		  Неизвестный **
I-Ssp6803I H52ОСТ Синехоцистис сп. ПКЦ 6803 Б 5' GTCGGGCTCATAACCCGAA
3' CAGCCCGAGTATTGGGCTT 		5' ---GTCGGGCT   CATAACCCGAA--- 3'
3' ---CAGCCCGAGTA   TTGGGCTT--- 5'
Я-ТевИ [33] [34] [35] H21I3J Фаг Escherichia coli Т4 Б фаг 5' AGTGGTATCAACGCTCAGTAGATG
3' TCACCATAGT TGCGAGTCATCTAC 		5' ---AGTGGTATCAAC   GCTCAGTAGATG--- 3'
3' ---TCACCATAGT   TGCGAGTCATCTAC--- 5'
Я-ТевII [33] [36] H2Фаг Escherichia coli Т4 Б фаг 5' GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGTTATTC
3' CGAATACTCATACTTCACTTGTGCAATAAG 		5' ---GCTTATGAGTATGAAGTGAACACGT   TATTC--- 3'
3' ---CGAATACTCATACTTCACTTGTG   CAATAAG--- 5'
Я-ThevIII [37] H3 Escherichia coli RB3 Фаг Б фаг 5' TATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC
3' ATACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG 		5' ---T   ATGTATCTTTTGCGTGTACCTTTAACTTC--- 3'
3' ---AT   ACATAGAAAACGCACATGGAAATTGAAG--- 5'
ПИ-ТлиI [38] [39] H1Термококк литоралис А хрм 5' TAYGCNGAYACNGACGGYTTYT
3' ATRCGNCTRTGNCTGCCTAARA 		5' ---TAYGCNGAYACNGACGG   YTTYT--- 3'
3' ---ATRCGNCTRTGNC   TGCCTAARA--- 5'
ПИ-TliII [22] [39] [40] H1Термококк литоралис А хрм 5' AAATTGCTTGCAAACAGCTATTACGGCTAT
3' TTTAACGAACGTTTGTCGATAATGCCGATA		  Неизвестный **
Я-Tsp061I H12DCH Термопротеус сп. IC-061 А 5' CTTCAGTATGCCCCGAAAC
3' GAAGTCATACGGGGCTTTG 		5' ---CTTCAGTAT   GCCCCGAAAC--- 3'
3' ---GAAGT   CATACGGGGCTTTG--- 5'
И-Вди141И H13Э54 Вулканисаета распространила IC-141 А 5' CCTGACTCTCTTAAGGTAGCCAAA
3' GGACTGAGAGAATTCCATCGGTTT 		5' ---CCTGACTCTCTTAA   GGTAGCCAAA--- 3'
3' ---GGACTGAG   AGAATTCCATCGGTTT--- 5'

* : Никующая эндонуклеаза : Эти ферменты разрезают только одну цепь ДНК, оставляя другую цепь нетронутой.
** : Неизвестное место разрезания : Исследователи пока не смогли определить точное место разрезания этих ферментов.

См. также

[ редактировать ]

Источники информации

[ редактировать ]

Базы данных и списки ферментов рестрикции:

  • Очень полная база данных ферментов рестрикции, поддерживаемая New England Biolabs. Он включает в себя всю биологическую, структурную, кинетическую и коммерческую информацию о тысячах ферментов. Также включает соответствующую литературу по каждой молекуле: Робертс Р.Дж., Винце Т., Посфаи Дж., Маселис Д. «REBASE» . Проверено 7 января 2010 г. База данных рестрикционных ферментов.
  • База данных интеинов, размещенная в New England Biolabs. Перлер ФБ. «ИнБейс» . Архивировано из оригинала 2 августа 2010 г. Проверено 5 февраля 2010 г. База данных и реестр Интеина . [41]
  • Подробная информация для биохимических экспериментов: «Искатель ферментов» . Архивировано из оригинала 8 января 2010 г. Проверено 7 января 2010 г. Поиск ферментов New England Biolabs.
  • Алфавитный список ферментов и их сайтов рестрикции: «Веб-страница фермента рестрикции GenScript» . Архивировано из оригинала 4 июля 2009 г. Проверено 7 января 2010 г.
  • Общие сведения о сайтах рестрикции и биохимических условиях проведения реакций рестрикции: «Ресурс рестрикционных ферментов» . Архивировано из оригинала 3 февраля 2002 г. Проверено 7 января 2010 г. Веб-страница ферментов рестрикции Promega.

Базы данных белков:

Примечания и ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Ламбовиц А.М., Белфорт М. (1993). «Интроны как мобильные генетические элементы». Анну Рев Биохим . 62 : 587–622. дои : 10.1146/annurev.bi.62.070193.003103 . ПМИД   8352597 .
  2. ^ Наито Т., Кусано К., Кобаяши И. (февраль 1995 г.). «Эгоистическое поведение систем ограничения-модификации». Наука . 267 (5199): 897–99. Бибкод : 1995Sci...267..897N . дои : 10.1126/science.7846533 . ПМИД   7846533 . S2CID   31128438 .
  3. ^ Жакье А., Дюжон Б. (июнь 1985 г.). «Белок, кодируемый интроном, активен в процессе преобразования генов, который распространяет интрон в митохондриальный ген». Клетка . 41 (2): 383–94. дои : 10.1016/S0092-8674(85)80011-8 . ПМИД   3886163 . S2CID   20519242 .
  4. ^ Перейти обратно: а б Готье А., Тюрмель М., Лемье К. (январь 1991 г.). «Интрон группы I в гене рРНК большой субъединицы хлоропласта Chlamydomonas eugametos кодирует двухцепочечную эндонуклеазу, которая расщепляет сайт самонаведения этого интрона». Карр Жене . 19 (1): 43–47. дои : 10.1007/BF00362086 . ПМИД   2036685 . S2CID   19785524 .
  5. ^ Перейти обратно: а б Маршалл П., Лемье К. (август 1991 г.). «Схема расщепления самонаводящейся эндонуклеазы, кодируемой пятым интроном в гене, кодирующем рРНК большой субъединицы хлоропласта, Chlamydomonas eugametos». Джин . 104 (2): 241–5. дои : 10.1016/0378-1119(91)90256-Б . ПМИД   1916294 .
  6. ^ Термель М., Буланже Дж., Шнаре М.Н., Грей М.В., Лемье К. (март 1991 г.). «Шесть интронов группы I и три внутренних транскрибируемых спейсера в гене большой субъединицы рибосомальной РНК хлоропласта зеленой водоросли Chlamydomonas eugametos». Дж Мол Биол . 218 (2): 293–311. дои : 10.1016/0022-2836(91)90713-G . ПМИД   1849178 .
  7. ^ Коте В., Мерсье Ж.П., Лемье К., Тюрмель М. (июль 1993 г.). «Один интрон группы I в гене rrnL хлоропласта Chlamydomonas humicola кодирует сайт-специфическую ДНК-эндонуклеазу (I-ChuI)». Джин . 129 (1): 69–76. дои : 10.1016/0378-1119(93)90697-2 . ПМИД   8335261 .
  8. ^ Перейти обратно: а б Термель М., Гутелл Р.Р., Мерсье Дж.П., Отис С., Лемье С. (июль 1993 г.). «Анализ гена рибосомальной РНК большой субъединицы хлоропласта из 17 таксонов Chlamydomonas. Три внутренних транскрибируемых спейсера и 12 сайтов вставки интронов группы I». Дж Мол Биол . 232 (2): 446–67. дои : 10.1006/jmbi.1993.1402 . ПМИД   8393936 .
  9. ^ Термель М., Коте В., Отис К., Мерсье Дж.П., Грей М.В., Лонерган К.М., Лемье К. (июль 1995 г.). «Эволюционный перенос ORF-содержащих интронов группы I между различными субклеточными компартментами (хлоропластами и митохондриями)» . Мол Биол Эвол . 12 (4): 533–45. doi : 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040234 . ПМИД   7659010 .
  10. ^ Термель М., Мерсье Ж.П., Коте В., Отис С., Лемье С. (июль 1995 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеаза, кодируемая интроном группы I в гене малой субъединицы рРНК хлоропласта Chlamydomonas pallidostigmatica, вводит одноцепочечный разрыв при низких концентрациях Mg2+» . Нуклеиновые кислоты Рез . 23 (13): 2519–25. дои : 10.1093/нар/23.13.2519 . ПМК   307060 . ПМИД   7630730 .
  11. ^ Юрица М.С., Моннат Р.Дж., Стоддард Б.Л. (октябрь 1998 г.). «Распознавание и расщепление ДНК самонаводящейся эндонуклеазой LAGLIDADG I-CreI» . Мол. Клетка . 2 (4): 469–76. дои : 10.1016/S1097-2765(00)80146-X . ПМИД   9809068 .
  12. ^ Шевалье Б.С., Кортемме Т., Чедси М.С., Бейкер Д., Моннат Р.Дж., Стоддард Б.Л. (октябрь 2002 г.). «Дизайн, активность и структура высокоспецифичной искусственной эндонуклеазы» . Мол. Клетка . 10 (4): 895–905. дои : 10.1016/S1097-2765(02)00690-1 . ПМИД   12419232 .
  13. ^ Гудрич-Блэр Х., Скарлато В., Готт Дж.М., Сюй М., Шуб Д.А. (октябрь 1990 г.). «Интрон группы I самосплайсинга в гене ДНК-полимеразы бактериофага SPO1 Bacillus subtilis». Клетка . 63 (2): 417–24. дои : 10.1016/0092-8674(90)90174-D . ПМИД   2119891 . S2CID   35873609 .
  14. ^ Перейти обратно: а б Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (январь 1996 г.). «Помимо хоминга: конкуренция между интронными эндонуклеазами дает селективное преимущество в отношении фланкирующих генетических маркеров» . Клетка . 84 (2): 211–21. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80976-9 . ПМИД   8565067 .
  15. ^ Гудрич-Блэр Х., Шуб Д.А. (сентябрь 1994 г.). «Гены ДНК-полимеразы нескольких HMU-бактериофагов имеют схожие интроны группы I с сильно расходящимися открытыми рамками считывания» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (18): 3715–21. дои : 10.1093/нар/22.18.3715 . ПМК   308352 . ПМИД   7937082 .
  16. ^ Ширман С., Годон Дж. Дж., Гассон М. (июль 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II в гене функционального переноса Lactococcus Lactis». Мол Микробиол . 21 (1): 45–53. дои : 10.1046/j.1365-2958.1996.00610.x . ПМИД   8843433 . S2CID   382897 .
  17. ^ Миллс Д.А., Маккей Л.Л., Данни Г.М. (июнь 1996 г.). «Сплайсинг интрона группы II, участвующего в конъюгативном переносе pRS01 у лактококков» . J Бактериол . 178 (12): 3531–8. дои : 10.1128/jb.178.12.3531-3538.1996 . ПМК   178122 . ПМИД   8655550 .
  18. ^ Ликке-Андерсен Дж., Ти-Нгок Х.П., Гарретт Р.А. (ноябрь 1994 г.). «Специфичность ДНК-субстрата и кинетика расщепления архейной эндонуклеазы самонаводящегося типа из Pyrobaculumorganotropum» . Нуклеиновые кислоты Рез . 22 (22): 4583–90. дои : 10.1093/нар/22.22.4583 . ПМК   308504 . ПМИД   7984405 .
  19. ^ Далгаард Дж. З., Гаррет Р. А. (ноябрь 1992 г.). «Интроны, кодирующие белок, из гена, кодирующего 23S рРНК, образуют стабильные круги у гипертермофильной археи Pyrobaculumorganotropum». Джин . 121 (1): 103–10. дои : 10.1016/0378-1119(92)90167-Н . ПМИД   1427083 .
  20. ^ Перейти обратно: а б Щепанек Т., Лазовска Дж. (июль 1996 г.). «Замена двух несмежных аминокислот в РНК-матуразе S.cerevisiae bi2, кодируемой интроном, достаточна для приобретения хоминг-эндонуклеазной активности» . ЭМБО Дж . 15 (14): 3758–67. дои : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00746.x . ПМК   452048 . ПМИД   8670880 .
  21. ^ Лазовска Дж., Щепанек Т., Макадре С., Докова М. (1992). «Два гомологичных митохондриальных интрона близкородственных видов Saccharomyces отличаются лишь несколькими аминокислотными заменами в открытых рамках считывания: один подвижен, другой нет». ЧР акад. наук. Париж . 315 (2): 37–41. ПМИД   1330224 .
  22. ^ Перейти обратно: а б Кейн П.М., Ямаширо К.Т., Вольчик Д.Ф., Нефф Н., Гебл М., Стивенс Т.Х. (ноябрь 1990 г.). «Сплайсинг белка превращает продукт гена дрожжей TFP1 в субъединицу вакуолярной H (+)-аденозинтрифосфатазы массой 69 кДа». Наука . 250 (4981): 651–7. Бибкод : 1990Sci...250..651K . дои : 10.1126/science.2146742 . ПМИД   2146742 .
  23. ^ Гимбл Ф.С., Торнер Дж. (май 1992 г.). «Наведение гена ДНК-эндонуклеазы путем мейотической конверсии генов у Saccharomyces cerevisiae». Природа . 357 (6376): 301–6. Бибкод : 1992Natur.357..301G . дои : 10.1038/357301a0 . ПМИД   1534148 . S2CID   4363512 .
  24. ^ Перейти обратно: а б с д и Бониц С.Г., Коруцци Г., Таленфельд Б.Е., Цаголов А., Мачино Г. (декабрь 1980 г.). «Сборка мембранной системы митохондрий. Структура и нуклеотидная последовательность гена, кодирующего субъединицу 1 цитохромоксидазы дрожжей» . J Биол Хим . 255 (24): 11927–41. дои : 10.1016/S0021-9258(19)70224-5 . ПМИД   6254986 .
  25. ^ Хэнсон Д.К., Лэмб М.Р., Малер Х.Р., Перлман П.С. (март 1982 г.). «Доказательства трансляции промежуточных последовательностей в митохондриальном геноме Saccharomyces cerevisiae» . J Биол Хим . 257 (6): 3218–24. дои : 10.1016/S0021-9258(19)81098-0 . ПМИД   6277926 .
  26. ^ Делаходд А., Гогель В., Бекам А.М., Крезо Ф., Переа Дж., Банрокес Дж., Жак К. (февраль 1989 г.). «Сайт-специфическая ДНК-эндонуклеазная и РНК-матуразная активность двух гомологичных белков, кодируемых интронами, из митохондрий дрожжей». Клетка . 56 (3): 431–41. дои : 10.1016/0092-8674(89)90246-8 . ПМИД   2536593 . S2CID   24082963 .
  27. ^ Саргуэль Б., Делаходд А., Хатат Д., Тиан Г.Л., Лазовска Дж., Жак К. (февраль 1991 г.). «Новая специфическая активность ДНК-эндонуклеазы в митохондриях дрожжей». Мол Джин Жене . 225 (2): 340–1. дои : 10.1007/BF00269867 . ПМИД   1848651 . S2CID   8873378 .
  28. ^ Переа Дж., Десдуэ К., Шаприа М., Жак К. (январь 1993 г.). «I-Sce III: новая эндонуклеаза, кодируемая интроном группы I, из митохондрий дрожжей» . Нуклеиновые кислоты Рез . 21 (2): 358. doi : 10.1093/nar/21.2.358 . ПМК   309119 . ПМИД   8441645 .
  29. ^ Моран Дж.В., Вернетт К.М., Мекленбург К.Л., Бутов Р.А., Перлман П.С. (август 1992 г.). «Интрон 5-альфа гена COXI митохондриальной ДНК дрожжей представляет собой мобильный интрон I группы» . Нуклеиновые кислоты Рез . 20 (15): 4069–76. дои : 10.1093/нар/20.15.4069 . ПМК   334089 . ПМИД   1324475 .
  30. ^ Серафин Б., Фэй Дж., Хатат Д., Жак К. (апрель 1992 г.). «Митохондриальный интрон дрожжей aI5 альфа: связанная эндонуклеазная активность и подвижность in vivo». Джин . 113 (1): 1–8. дои : 10.1016/0378-1119(92)90663-А . ПМИД   1314207 .
  31. ^ Лян Ф., Романиенко П.Дж., Уивер Д.Т., Джегго П.А., Джасин М. (август 1996 г.). «Репарация двухцепочечного разрыва хромосом в клетках с дефицитом Ku80» . ПНАС . 93 (17): 8929–33. Бибкод : 1996PNAS...93.8929L . дои : 10.1073/pnas.93.17.8929 . ПМЦ   38571 . ПМИД   8799130 .
  32. ^ Ян Дж., Циммерли С., Перлман П.С., Ламбовиц А.М. (май 1996 г.). «Эффективная интеграция интронной РНК в двухцепочечную ДНК путем обратного сплайсинга». Природа . 381 (6580): 332–5. Бибкод : 1996Natur.381..332Y . дои : 10.1038/381332a0 . ПМИД   8692273 . S2CID   4337808 .
  33. ^ Перейти обратно: а б Белл-Педерсен Д. , Квирк С., Клайман Дж., Белфорт М. (июль 1990 г.). «Подвижность интронов в фаге Т4 зависит от особого класса эндонуклеаз и не зависит от последовательностей ДНК, кодирующих ядро ​​интрона: механистические и эволюционные последствия» . Нуклеиновые кислоты Рез . 18 (13): 3763–70. дои : 10.1093/нар/18.13.3763 . ПМК   331075 . ПМИД   2165250 .
  34. ^ Чу Ф.К., Мэйли Дж., Педерсен-Лейн Дж., Ван А.М., Мэйли Ф. (май 1990 г.). «Характеристика сайта рестрикции прокариотической эндонуклеазы, кодируемой интроном» . ПНАС . 87 (9): 3574–8. Бибкод : 1990PNAS...87.3574C . дои : 10.1073/pnas.87.9.3574 . ПМК   53944 . ПМИД   2159153 .
  35. ^ Белл-Педерсен Д., Квирк С.М., Обри М., Белфорт М. (октябрь 1989 г.). «Сайт-специфическая эндонуклеаза и совместная конверсия фланкирующих экзонов, связанных с мобильным интроном td фага Т4». Джин . 82 (1): 119–26. дои : 10.1016/0378-1119(89)90036-X . ПМИД   2555262 .
  36. ^ Шуб Д.А., Готт Дж.М., Сюй М.К., Ланг Б.Ф., Мишель Ф., Томашевски Дж., Педерсен-Лейн Дж., Белфорт М. (февраль 1988 г.). «Структурная консервативность трех гомологичных интронов бактериофага Т4 и интронов группы I эукариот» . ПНАС . 85 (4): 1151–5. Бибкод : 1988PNAS...85.1151S . дои : 10.1073/pnas.85.4.1151 . ПМК   279724 . ПМИД   3422485 .
  37. ^ Эдди С.Р., Голд L (июнь 1991 г.). «Интрон nrdB фага T4: делеционный мутант версии, обнаруженной в дикой природе» . Генс Дев . 5 (6): 1032–41. дои : 10.1101/gad.5.6.1032 . ПМИД   2044951 .
  38. ^ Сюй М., Саутворт М.В., Мерша Ф.Б., Хорнстра Л.Дж., Перлер Ф.Б. (декабрь 1993 г.). «Сплайсинг белков очищенного предшественника in vitro и идентификация разветвленного промежуточного продукта». Клетка . 75 (7): 1371–7. дои : 10.1016/0092-8674(93)90623-X . ПМИД   8269515 . S2CID   33579721 .
  39. ^ Перейти обратно: а б Перлер Ф.Б., Комб Д.Г., Джек В.Е., Моран Л.С., Цян Б., Кучера Р.Б., Беннер Дж., Слатко Б.Е., Нванкво Д.О., Хемпстед С.К., Карлоу К.К., Яннаш Х. (июнь 1992 г.). «Промежуточные последовательности в гене ДНК-полимеразы архей» . ПНАС . 89 (12): 5577–81. Бибкод : 1992PNAS...89.5577P . дои : 10.1073/pnas.89.12.5577 . ПМК   49335 . ПМИД   1608969 .
  40. ^ Хирата Р., Осумк Ю., Накано А., Кавасаки Х., Сузуки К., Анраку Ю. (апрель 1990 г.). «Молекулярная структура гена VMA1, кодирующего каталитическую субъединицу H (+)-транслоцирующей аденозинтрифосфатазы из вакуолярных мембран Saccharomyces cerevisiae» . J Биол Хим . 265 (12): 6726–33. дои : 10.1016/S0021-9258(19)39210-5 . ПМИД   2139027 .
  41. ^ Перлер ФБ (январь 2002 г.). «InBase: база данных Интеина» . Нуклеиновые кислоты Рез . 30 (1): 383–4. дои : 10.1093/нар/30.1.383 . ПМК   99080 . ПМИД   11752343 .
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_homing_endonuclease_cutting_sites&oldid=1134675101"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7daa0e490263036945e2a5058c80acfb__1674159780
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/7d/fb/7daa0e490263036945e2a5058c80acfb.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
List of homing endonuclease cutting sites - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)