Jump to content

ХДРБС1

ХДРБС1
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы KHDRBS1 , Sam68, p62, p68, содержащий домен KH, связывание РНК, связанный с сигнальной трансдукцией 1, содержащий РНК-связывающий домен KH, связанный с сигнальной трансдукцией 1
Внешние идентификаторы ПРОПУСКАТЬ : 602489 ; МГИ : 893579 ; Гомологен : 4781 ; Генные карты : ХДРБС1 ; ОМА : KHDRBS1 — ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001271878
НМ_006559

НМ_011317

RefSeq (белок)

НП_001258807
НП_006550

НП_035447

Местоположение (UCSC) Чр 1: 32.01 – 32.06 Мб Chr 4: 129,6 – 129,64 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Содержащий домен KH РНК-связывающий белок 1, связанный с сигнальной трансдукцией, представляет собой белок , который у человека кодируется KHDRBS1 геном . [ 5 ] [ 6 ]

Этот ген кодирует член семейства белков, содержащих домен гомологии K , РНК-связывающих белков, связанных с трансдукцией сигнала. Кодируемый белок, по-видимому, имеет множество функций и может участвовать в различных клеточных процессах, включая альтернативный сплайсинг , регуляцию клеточного цикла , образование 3'-конца РНК, онкогенез и регуляцию экспрессии гена вируса иммунодефицита человека . [ 7 ]

Sam68 (Src-ассоциированный субстрат в митозе массой 68 кДа) официально называется KHDRBS1 (содержащий домен KH, связывание РНК, ассоциированная сигнальная трансдукция 1). Sam68 представляет собой РНК-связывающий белок KH-типа , который распознает прямые повторы U(U/A)AA с относительно высоким сродством. [ 8 ] [ 9 ] Sam68 является преимущественно ядерным , и его основная функция в ядре заключается в регулировании альтернативного сплайсинга путем распознавания последовательностей РНК, соседних с включенным/исключенным экзоном (ами).

Клиническое значение

[ редактировать ]

Sam68 влияет на альтернативный сплайсинг ряда генов, играющих центральную роль в таких процессах, как нейрогенез и адипогенез, а также в таких заболеваниях, как спинальная мышечная атрофия (СМА) и рак .

Нейрогенез

[ редактировать ]

Было продемонстрировано, что Sam68 участвует в альтернативном сплайсинге мРНК, участвующих в нормальном нейрогенезе, с использованием чувствительных к сплайсингу микрочипов. [ 10 ] Было также показано, что Sam68 участвует в эпителиально-мезенхимальном переходе путем регуляции альтернативного сплайсинга SF2/ASF. [ 11 ] Было показано, что Sam68 регулирует зависимый от активности альтернативный сплайсинг нейрексина -1 в центральной нервной системе, что приводит к нарушениям нервного развития. [ 12 ]

Адипогенез

[ редактировать ]

Sam68 влияет на альтернативный сплайсинг киназы mTOR, способствуя худощавому фенотипу, наблюдаемому у мышей с дефицитом Sam68. [ 13 ]

Спинальная мышечная атрофия

[ редактировать ]

Роль Sam68 была дополнительно подчеркнута при спинальной мышечной атрофии (СМА), поскольку Sam68 способствует пропуску экзона 7, что приводит к нефункциональному белку SMN2. [ 11 ]

Sam68 регулирует альтернативный сплайсинг ряда генов, связанных с раком.

Прямые доказательства участия Sam68 в альтернативном сплайсинге были показаны в содействии включению вариабельного экзона 5 (v5) в CD44, что коррелирует с потенциалом миграции клеток. [ 14 ] [ 15 ] CD44 представляет собой белок клеточной поверхности, экспрессия которого связана с раком, а его экспрессия предсказывает прогноз при ряде типов опухолей. [ 16 ] [ 17 ] При раке простаты Sam68 также взаимодействует с белками комплекса сплайсинга KHDRBS3 (T-STAR) и метадерином (MTDH), которые также изменяют сплайсинг CD44. [ 17 ] Впоследствии было показано, что нокдаун Sam68 задерживает пролиферацию клеток рака простаты LNCaP. [ 18 ]

Кроме того, Sam68 в сочетании с hnRNPA1 влияет на выбор альтернативных 5'-сайтов сплайсинга Bcl-x, регулирующих пути выживания и апоптоза. [ 19 ]

РНК-связывающая активность Sam68 регулируется посттрансляционными модификациями, так что Sam68 часто называют белком STAR (активатор сигнальной трансдукции РНК), с помощью которого сигналы от факторов роста или растворимых тирозинкиназ , таких как киназы семейства Src , действуют на регулируют процессы клеточной РНК, такие как альтернативный сплайсинг. [ 20 ] Например, Sam68-зависимый альтернативный сплайсинг экзона v5 CD44 регулируется ERK фосфорилированием Sam68. [ 15 ] и альтернативный сплайсинг Bcl-x регулируется p59fyn-зависимым фосфорилированием Sam68. [ 19 ]

Sam68 также находится ниже рецептора эпидермального фактора роста (EGFR). [ 21 ] фактор роста гепатоцитов (HGF)/Met-рецептор ( c-Met ), [ 22 ] лептин [ 23 ] и рецепторы фактора некроза опухоли (TNF). [ 24 ] Хотя роль Sam68 в этих путях постепенно выявляется, многое еще предстоит определить. Также было показано, что Sam68 повторно локализуется в цитоплазме рядом с плазматической мембраной, где он выполняет функцию транспорта и регулирования трансляции определенных мРНК. [ 25 ] и регулирует миграцию клеток. [ 21 ]

Многочисленные роли Sam68 при раке были рассмотрены Bielli et al ., [ 26 ]

Исследования нокаута генов

[ редактировать ]

Мышей с дефицитом Sam68 получали путем целенаправленного разрушения экзонов 4-5 гена sam68, которые кодируют функциональную область домена KH . [ 27 ] Генотипы потомков от гетерозиготных интеркроссов демонстрировали менделевскую сегрегацию на E18.5. Несмотря на отсутствие видимых деформаций, многие щенки Sam68-/- умерли при рождении по неизвестным причинам. [ 27 ] Мыши Sam68+/- были фенотипически нормальными, а детеныши Sam68-/-, пережившие перинатальный период, неизменно доживали до старости. Мыши Sam68-/- весили меньше, чем однопометные животные Sam68+/+, и анализ магнитно-резонансной томографии подтвердил, что молодые мыши Sam68-/- демонстрировали значительное снижение ожирения, хотя потребление пищи было аналогичным. [ 13 ] Более того, мыши Sam68-/- были защищены от ожирения, вызванного питанием. [ 13 ] Преадипоциты с дефицитом Sam68 (клетки 3T3-L1) имели нарушенный адипогенез, а мыши Sam68-/- имели на ~ 45% меньше стволовых клеток взрослого происхождения (ADSC) в их стромально-сосудистой фракции (SVF) из WAT. [ 13 ]

Образование опухоли in vivo

[ редактировать ]

У мышей Sam68-/- не развивались опухоли и не наблюдалось иммунологических или других серьезных заболеваний. Однако мыши Sam68-/- испытывали трудности с размножением из-за мужского бесплодия. [ 25 ] [ 27 ] и женское бесплодие. [ 28 ] У мышей Sam68-null наблюдались дефекты координации движений, и они падали с вращающегося барабана на более низких скоростях и преждевременно по сравнению с контрольной группой дикого типа. [ 29 ] Мыши Sam68-/- защищены от возрастного остеопороза . [ 27 ] Используя мышиную модель онкогенеза молочной железы с вирусом опухоли молочной железы - средним Т-антигеном полиомы (MMTV-PyMT), было показано, что снижение экспрессии Sam68 снижает опухолевую нагрузку и метастазирование . [ 30 ] Кривые Каплана-Мейера показали, что потеря одного аллеля sam68 (PyMT; Sam68+/-) была связана со значительной задержкой появления пальпируемых опухолей и значительным снижением множественности опухолей. Эти данные позволяют предположить, что Sam68 необходим для PyMT-индуцированного онкогенеза молочной железы. Нокдаун экспрессии Sam68 в клетках молочной железы, полученных из PyMT, уменьшил количество очагов опухоли легких у бестимусных мышей, что позволяет предположить, что Sam68 также необходим для метастазирования опухоли молочной железы.

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000121774 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000028790 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Вонг Дж., Мюллер О., Кларк Р., Конрой Л., Моран М.Ф., Полакис П., Маккормик Ф. (июнь 1992 г.). «Молекулярное клонирование и свойства связывания нуклеиновых кислот GAP-ассоциированного тирозинового фосфопротеина p62». Клетка . 69 (3): 551–8. дои : 10.1016/0092-8674(92)90455-L . ПМИД   1374686 . S2CID   30950990 .
  6. ^ Ли Дж., Берр Дж.Г. (январь 2000 г.). «Сальпальфа и Салпбета, замедляющие рост гомологи Sam68». Джин . 240 (1): 133–47. дои : 10.1016/S0378-1119(99)00421-7 . ПМИД   10564820 .
  7. ^ «Ген Энтреза: содержащий домен KH, связывание РНК, связанная с сигнальной трансдукцией 1» .
  8. ^ Галарно А., Ричард С. (май 2009 г.). «РНК-связывающие белки STAR GLD-1, QKI, SAM68 и SLM-2 связывают двудольные мотивы РНК» . БМК Мол Биол . 10 (47): 47. дои : 10.1186/1471-2199-10-47 . ПМК   2697983 . ПМИД   19457263 .
  9. ^ Лин Кью, Тейлор С.Дж., Шеллоуэй Д. (октябрь 1997 г.). «Специфичность и детерминанты связывания РНК Sam68. Значение для биологической функции доменов K-гомологии» . J Биол Хим . 272 (43): 27274–27280. дои : 10.1074/jbc.272.43.27274 . ПМИД   9341174 .
  10. ^ Чавла Дж., Лин Ч., Хан А., Шиуэ Л., Арес М.Дж., Блэк Д.Л. (январь 2009 г.). «Sam68 регулирует набор альтернативно сплайсированных экзонов во время нейрогенеза» . Мол Клеточная Биол . 29 (1): 201–13. дои : 10.1128/MCB.01349-08 . ПМК   2612485 . ПМИД   18936165 .
  11. ^ Jump up to: а б Педротти С., Бьелли П., Паронетто М.П., ​​Чиккозанти Ф., Фимиа Г.М., Стамм С., Мэнли Дж.Л., Сетте К. (апрель 2010 г.). «Регулятор сплайсинга Sam68 связывается с новым экзонным глушителем сплайсинга и действует в альтернативном сплайсинге SMN2 при спинальной мышечной атрофии» . ЭМБО Дж . 29 (7): 1235–47. дои : 10.1038/emboj.2010.19 . ПМЦ   2857462 . ПМИД   20186123 .
  12. ^ Иидзима Т., Ву К., Витте Х., Ханно-Иидзима Ю., Глаттер Т., Ричард С., Шайффеле П. (декабрь 2011 г.). «SAM68 регулирует зависимый от активности нейронов альтернативный сплайсинг нейрексина-1» . Клетка . 147 (7): 1601–14. дои : 10.1016/j.cell.2011.11.028 . ПМК   3246220 . ПМИД   22196734 .
  13. ^ Jump up to: а б с д Хуот М.Э., Фогель Г., Забараускас А., Нго К.Т., Куломб-Хантингтон Дж., Маевски Дж., Ричард С. (апрель 2012 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 STAR регулирует альтернативный сплайсинг mTOR во время адипогенеза» . Мол Клетка . 46 (2): 187–99. doi : 10.1016/j.molcel.2012.02.007 . ПМИД   22424772 .
  14. ^ Ченг С., Sharp PA (январь 2006 г.). «Регуляция альтернативного сплайсинга CD44 с помощью SRm160 и его потенциальная роль в инвазии опухолевых клеток» . Мол Клеточная Биол . 26 (1): 362–70. дои : 10.1128/MCB.26.1.362-370.2006 . ПМЦ   1317625 . ПМИД   16354706 .
  15. ^ Jump up to: а б Материя Н., Херрлих П., Кениг Х. (декабрь 2002 г.). «Сигналзависимая регуляция сплайсинга посредством фосфорилирования Sam68». Природа . 420 (6916): 691–5. Бибкод : 2002Natur.420..691M . дои : 10.1038/nature01153 . ПМИД   12478298 . S2CID   4349060 .
  16. ^ Наор, Дэвид; Недвецки, Шломо; Голаны, Ицхак; Мельник, Лора; Фейтельсон, Йорам (ноябрь 2002 г.). «CD44 при раке» . Критические обзоры клинических лабораторных наук . 39 (6): 527–579. дои : 10.1080/10408360290795574 . ISSN   1040-8363 . ПМИД   12484499 . S2CID   30019668 .
  17. ^ Jump up to: а б Лакстон, Хейли Дж.; Симпсон, Бенджамин С.; Миллс, Ян Г.; Бриндл, Никола Р.; Ахмед, Зеба; Ставринид, Василис; Хиви, Сьюзен; Штамм, Стефан; Уитакер, Хейли К. (23 августа 2019 г.). «Онкоген метадгерин взаимодействует с известными белками сплайсинга YTHDC1, Sam68 и T-STAR и играет новую роль в альтернативном сплайсинге мРНК» . Раки . 11 (9): 1233. doi : 10.3390/cancers11091233 . ISSN   2072-6694 . ПМК   6770463 . ПМИД   31450747 .
  18. ^ Буса Р., Паронетто М.П., ​​Фарини Д., Пьерантоцци Э., Ботти Ф., Анджелини Д.Ф., Аттисани Ф., Веспасиани Дж., Сетте К. (июнь 2007 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 способствует пролиферации и выживанию клеток рака простаты человека» . Онкоген . 26 (30): 4372–82. дои : 10.1038/sj.onc.1210224 . ПМИД   17237817 .
  19. ^ Jump up to: а б Паронетто MP, Аксель Т., Массиелло А., Чалфант CE, Сетте C (март 2007 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 модулирует альтернативный сплайсинг Bcl-x» . J Клеточная Биол . 176 (7): 929–39. дои : 10.1083/jcb.200701005 . ПМК   2064079 . ПМИД   17371836 .
  20. ^ Ричард С. (2010). «Достижение ЗВЕЗД: связь РНК-связывающих белков с болезнями». Посттранскрипционная регуляция с помощью белков STAR . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 693. стр. 142–57. дои : 10.1007/978-1-4419-7005-3_10 . ISBN  978-1-4419-7004-6 . ПМИД   21189691 .
  21. ^ Jump up to: а б Хуот М.Э., Фогель Г., Ричард С. (ноябрь 2009 г.). «Идентификация рибонуклеопротеинового комплекса Sam68, регулируемого эпидермальным фактором роста» . J Биол Хим . 284 (46): 31903–13. дои : 10.1074/jbc.M109.018465 . ПМЦ   2797261 . ПМИД   19762470 .
  22. ^ Локателли А., Ланге, Калифорния (июнь 2011 г.). «Рецепторы Met индуцируют Sam68-зависимую миграцию клеток путем активации альтернативных членов семейства киназ, регулируемых внеклеточными сигналами» . J Биол Хим . 286 (24): 21062–72. дои : 10.1074/jbc.M110.211409 . ПМК   3122167 . ПМИД   21489997 .
  23. ^ Марони П., Читтерио Л., Пикколетти Р., Бендинелли П. (октябрь 2009 г.). «Sam68 и ERKs регулируют лептин-индуцированную экспрессию мРНК OB-Rb в мышечных трубках C2C12» (PDF) . Мол клеточный эндокринол . 309 (1–2): 26–31. дои : 10.1016/j.mce.2009.05.021 . ПМИД   19524014 . S2CID   28228732 .
  24. ^ Рамакришнан П., Балтимор Д. (июль 2011 г.). «Sam68 необходим как для активации NF-κB, так и для передачи сигналов апоптоза рецептором TNF» . Мол Клетка . 43 (2): 167–79. doi : 10.1016/j.molcel.2011.05.007 . ПМЦ   3142289 . ПМИД   21620750 .
  25. ^ Jump up to: а б Паронетто М.П., ​​Мессина В., Бьянки Э., Барчи М., Фогель Дж., Моретти С., Паломби Ф., Стефанини М., Джеремия Р., Ричард С., Сетте С. (апрель 2009 г.). «Sam68 регулирует трансляцию целевых мРНК в мужских половых клетках, необходимых для сперматогенеза мышей» . J Клеточная Биол . 185 (2): 235–49. дои : 10.1083/jcb.200811138 . ПМК   2700383 . ПМИД   19380878 .
  26. ^ Бьелли П., Буса Р., Паронетто MP, Sette C (июль 2011 г.). «РНК-связывающий белок Sam68 играет многофункциональную роль в развитии рака человека» (PDF) . Эндокринный рак . 18 (4): Р91–Р102. дои : 10.1530/ERC-11-0041 . hdl : 2108/88068 . ПМИД   21565971 .
  27. ^ Jump up to: а б с д Ричард С., Тораби Н., Франко Г.В., Трембле Г.А., Чен Т., Фогель Г., Морель М., Клеру П., Форже-Ричард А., Комарова С., Трембле М.Л., Ли В., Ли А., Гао Ю.Дж., Хендерсон Дж.Е. (декабрь 2005 г.) . «Аблация РНК-связывающего белка Sam68 защищает мышей от возрастной потери костной массы» . ПЛОС Генет . 1 (6): е74. дои : 10.1371/journal.pgen.0010074 . ПМЦ   1315279 . ПМИД   16362077 .
  28. ^ Бьянки Э., Барбагалло Ф., Валери С., Джеремия Р., Салустри А., Де Феличи М., Сетте С. (декабрь 2010 г.). «Аблация гена Sam68 ухудшает женскую фертильность и гонадотропин-зависимое развитие фолликула» . Хум Мол Жене . 19 (24): 4886–94. дои : 10.1093/hmg/ddq422 . ПМИД   20881015 .
  29. ^ Луконг К.Е., Ричард С. (июнь 2008 г.). «Дефекты координации движений у мышей с дефицитом РНК-связывающего белка Sam68». Поведение мозга Res . 189 (2): 357–63. дои : 10.1016/j.bbr.2008.01.010 . ПМИД   18325609 . S2CID   37887832 .
  30. ^ Ричард С., Фогель Г., Хуот М.Э., Го Т., Мюллер В.Дж., Луконг К.Э. (январь 2008 г.). «Гаплонедостаточность Sam68 задерживает начало опухолевого процесса и метастазирования в молочной железе» . Онкоген . 27 (4): 548–56. дои : 10.1038/sj.onc.1210652 . ПМИД   17621265 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: a555c78c74c47ccab104410c94893029__1693047060
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/a5/29/a555c78c74c47ccab104410c94893029.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
KHDRBS1 - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)