Морфометрия
Морфометрия (от греческого μορφή morphe , «форма, форма», и -μετρία metria , «измерение») или морфометрия [ 5 ] относится к количественному анализу формы , концепции, которая включает в себя размер и форму. Морфометрический анализ обычно проводится на организмах и полезен при анализе их летописи окаменелостей, влияния мутаций на форму, изменений формы в процессе развития, ковариаций между экологическими факторами и формой, а также для оценки количественно-генетических параметров формы. Морфометрию можно использовать для количественной оценки признаков, имеющих эволюционное значение, и, обнаружив изменения в форме, сделать вывод об их онтогенезе , функциях или эволюционных отношениях. Основная цель морфометрии — статистическая проверка гипотез о факторах, влияющих на форму.
«Морфометрия» в более широком смысле также используется для точного определения местоположения определенных областей органов, таких как мозг, [ 6 ] [ 7 ] и при описании форм других вещей.
Формы
[ редактировать ]Обычно выделяют три общих подхода к форме: традиционную морфометрию, морфометрию на основе ориентиров и морфометрию на основе контуров.
«Традиционная» морфометрия
[ редактировать ]Традиционная морфометрия анализирует длину, ширину, массу, углы, соотношения и площади. [ 8 ] Обычно традиционные морфометрические данные представляют собой измерения размеров. Недостатком использования многих измерений размера является то, что большинство из них будут сильно коррелированы; в результате, несмотря на множество измерений, независимых переменных мало. Например, длина голени будет варьироваться в зависимости от длины бедра, а также от длины плечевой и локтевой костей и даже от размеров головы. Тем не менее, традиционные морфометрические данные полезны, когда особый интерес представляют абсолютные или относительные размеры, например, при исследованиях роста. Эти данные также полезны, когда измерения размеров имеют теоретическое значение, например, масса тела, площадь поперечного сечения и длина конечностей при исследованиях функциональной морфологии. Однако у этих измерений есть одно важное ограничение: они содержат мало информации о пространственном распределении изменений формы по организму. Они также полезны при определении степени воздействия определенных загрязняющих веществ на человека. К таким индексам относятся гепатосоматический индекс, гонадосоматический индекс , а также факторы состояния (shakumbila, 2014).
Геометрическая морфометрия на основе ориентиров
[ редактировать ]В геометрической морфометрии на основе ориентиров пространственная информация, отсутствующая в традиционной морфометрии, содержится в данных, поскольку данные представляют собой координаты ориентиров : дискретные анатомические локусы, которые, возможно, гомологичны у всех лиц, участвующих в анализе (т. е. их можно рассматривать как «одна и та же» точка в каждом образце исследования). Например, место пересечения двух конкретных швов является ориентиром, равно как и пересечение жилок на крыле или листе насекомого, или отверстия — небольшие отверстия, через которые проходят вены и кровеносные сосуды. В исследованиях на основе ориентиров традиционно анализировались 2D-данные, но с ростом доступности методов 3D-визуализации 3D-анализ становится все более осуществимым даже для небольших структур, таких как зубы. [ 9 ] Найти достаточно ориентиров, чтобы дать исчерпывающее описание формы, может быть сложно при работе с окаменелостями или легко повреждаемыми экземплярами. Это связано с тем, что все ориентиры должны присутствовать во всех образцах, хотя координаты отсутствующих ориентиров можно оценить. Данные для каждого человека состоят из конфигурации ориентиров.
Есть три признанные категории достопримечательностей. [ 10 ] Ориентиры типа 1 определяются локально, т.е. с точки зрения структур, близких к этой точке; например, пересечение трех швов или пересечение вен на крыле насекомого определяются локально и окружены тканью со всех сторон. Ориентиры типа 3 , напротив, определяются как точки, удаленные от ориентира, и часто определяются как точка, «наиболее удаленная» от другой точки. Ориентиры типа 2 являются промежуточными; в эту категорию входят такие точки, как структура вершины или локальные минимумы и максимумы кривизны. Они определены с учетом местных особенностей, но не окружены со всех сторон. Помимо ориентиров, существуют полуориентиры — точки, положение которых на кривой произвольно, но которые предоставляют информацию о кривизне в двух направлениях. [ 11 ] или трехмерное. [ 12 ]
Геометрическая морфометрия на основе Прокруста
[ редактировать ]Анализ формы начинается с удаления информации, не относящейся к форме. По определению, форма не изменяется в результате перемещения, масштабирования или вращения. [ 13 ] Таким образом, для сравнения форм из координат ориентиров удаляется информация, не связанная с формой. Существует несколько способов выполнить эти три операции. Один из методов — зафиксировать координаты двух точек (0,0) и (0,1), которые являются двумя концами базовой линии. За один шаг фигуры переводятся в одно и то же положение (этим значениям присваиваются одни и те же две координаты), фигуры масштабируются (до единицы длины базовой линии) и поворачиваются. [ 10 ] Альтернативным и предпочтительным методом является наложение Прокруста . Этот метод переводит центр тяжести фигур в (0,0); координата x центроида представляет собой среднее значение координат x ориентиров, а координата y центроида представляет собой среднее значение координат y . Фигуры масштабируются до единичного размера центроида, который представляет собой квадратный корень из суммы квадратов расстояний от каждого ориентира до центроида. Конфигурация поворачивается, чтобы минимизировать отклонение между ней и эталоном, обычно средней формой. В случае с полуориентирами также удаляется изменение положения вдоль кривой. Поскольку пространство форм искривлено, анализ выполняется путем проецирования форм на пространство, касательное к пространству форм. В касательном пространстве для проверки статистических гипотез о форме можно использовать традиционные многомерные статистические методы, такие как многомерный дисперсионный анализ и многомерная регрессия.
Анализ, основанный на Прокрусте, имеет некоторые ограничения. Во-первых, суперпозиция Прокруста использует критерий наименьших квадратов для поиска оптимального вращения; следовательно, вариации, локализованные на одном ориентире, будут размазаны по многим. Это называется «эффект Пиноккио». Другая причина заключается в том, что наложение само по себе может наложить шаблон ковариации на ориентиры. [ 14 ] [ 15 ] Кроме того, любая информация, которую нельзя уловить с помощью ориентиров и полуориентиров, не может быть проанализирована, включая классические измерения, такие как «наибольшая ширина черепа». Более того, существует критика методов, основанных на Прокрусте, которые мотивируют альтернативный подход к анализу важных данных.
Матричный анализ евклидовых расстояний
[ редактировать ]Диффеоморфометрия
[ редактировать ]Диффеоморфометрия [ 16 ] фокусируется на сравнении форм и форм с метрической структурой, основанной на диффеоморфизмах, и занимает центральное место в области вычислительной анатомии . [ 17 ] Диффеоморфная регистрация, [ 18 ] представленный в 90-х годах, сейчас является важным игроком с существующими базами кода, организованными вокруг ANTS, [ 19 ] ДАРТЕЛЛ, [ 20 ] ДЕМОНЫ, [ 21 ] ЛДДММ , [ 22 ] СтационарныйLDDMM [ 23 ] являются примерами активно используемых вычислительных кодов для построения соответствий между системами координат на основе разреженных признаков и плотных изображений. Морфометрия на основе вокселей (VBM) — важная технология, основанная на многих из этих принципов. Методы, основанные на диффеоморфных потоках, используются. Например, деформации могут быть диффеоморфизмами окружающего пространства, что приводит к созданию структуры LDDMM (LDDMM ( Large Deformation Diffeomorphic Metric Mapping ) для сравнения форм. [ 24 ] О таких деформациях является правоинвариантная метрика вычислительной анатомии , которая обобщает метрику несжимаемых эйлеровых потоков, но включает норму Соболева, обеспечивающую гладкость потоков: [ 25 ] теперь определены метрики, связанные с гамильтоновыми управлениями диффеоморфных потоков. [ 26 ]
Общий анализ
[ редактировать ]Анализ контура — это еще один подход к анализу формы. Что отличает контурный анализ, так это то, что коэффициенты математических функций подгоняются к точкам, выбранным вдоль контура. Существует несколько способов количественной оценки контура. Старые методы, такие как «подгонка к полиномиальной кривой». [ 27 ] и Количественный анализ основных компонентов [ 28 ] были вытеснены двумя основными современными подходами: анализом собственных форм , [ 29 ] и эллиптический анализ Фурье (EFA), [ 30 ] используя контуры, нарисованные вручную или на компьютере. Первый предполагает установку заданного количества полуориентиров через равные промежутки вокруг контура фигуры, записывая отклонение каждого шага от полуориентира к полуориентиру от того, каким был бы угол этого шага, если бы объект представлял собой простой круг. [ 31 ] Последний определяет контур как сумму минимального количества эллипсов, необходимых для имитации формы. [ 32 ]
Оба метода имеют свои слабые стороны; наиболее опасным (и легко преодолимым) является их подверженность шуму в очертаниях. [ 33 ] Точно так же ни один из них не сравнивает гомологичные точки, и глобальным изменениям всегда придается больший вес, чем локальным вариациям (которые могут иметь серьезные биологические последствия). Анализ собственной формы требует установки эквивалентной отправной точки для каждого образца, что может быть источником ошибок. ОДВ также страдает от избыточности, поскольку не все переменные являются независимыми. [ 33 ] С другой стороны, их можно применять к сложным кривым без необходимости определения центроида; это значительно упрощает удаление эффекта местоположения, размера и вращения. [ 33 ] Недостатки контурной морфометрии заключаются в том, что она не сравнивает точки гомологичного происхождения и чрезмерно упрощает сложные формы, ограничиваясь рассмотрением контура, а не внутренних изменений. Кроме того, поскольку он аппроксимирует контур серией эллипсов, он плохо справляется с заостренными формами. [ 34 ]
Одна из критических замечаний к методам, основанным на контурах, заключается в том, что они игнорируют гомологию - известным примером такого игнорирования является способность методов, основанных на контурах, сравнивать лопатку с картофельными чипсами. [ 35 ] Такое сравнение было бы невозможно, если бы данные ограничивались биологически гомологичными точками. Аргументом против этой критики является то, что, если ориентировочные подходы к морфометрии могут использоваться для проверки биологических гипотез в отсутствие данных о гомологии, неуместно обвинять подходы, основанные на схемах, в том, что они позволяют проводить одни и те же типы исследований. [ 36 ]
Анализ данных
[ редактировать ]Многомерные статистические методы можно использовать для проверки статистических гипотез о факторах, влияющих на форму, и для визуализации их эффектов. Чтобы визуализировать закономерности изменения данных, данные необходимо привести к понятной (малоразмерной) форме. Анализ главных компонентов (PCA) является широко используемым инструментом для суммирования изменений. Проще говоря, этот метод проецирует как можно большую часть общих вариаций на несколько измерений. Пример см. на рисунке справа. Каждая ось на графике PCA является собственным вектором ковариационной матрицы переменных формы. Первая ось учитывает максимальное изменение выборки, а последующие оси представляют дальнейшие способы изменения выборки. Характер кластеризации образцов в этом морфопространстве представляет собой сходства и различия в формах, которые могут отражать филогенетические отношения . Помимо изучения закономерностей вариаций, методы многомерной статистики можно использовать для проверки статистических гипотез о факторах, влияющих на форму, и для визуализации их эффектов, хотя для этой цели PCA не требуется, если только метод не требует инвертирования дисперсионно-ковариационной матрицы.
Ориентировочные данные позволяют визуализировать разницу между средними значениями популяции или отклонение индивидуума от среднего значения популяции по крайней мере двумя способами. На одном изображены векторы на ориентирах, которые показывают величину и направление смещения этого ориентира относительно других. Второй изображает разницу с помощью тонких пластинчатых сплайнов — интерполяционной функции, которая моделирует изменения между ориентирами на основе данных об изменениях координат ориентиров . Эта функция создает нечто похожее на деформированную сетку; там, где регионы относительно вытянуты, сетка будет выглядеть растянутой, а где эти регионы относительно укорочены, сетка будет выглядеть сжатой.
Экология и эволюционная биология
[ редактировать ]Д'Арси Томпсон в 1917 году предположил, что формы многих различных видов также могут быть связаны таким образом. В случае с раковинами и рогами он дал довольно точный анализ... Но он также рисовал различные изображения рыб и черепов и утверждал, что они связаны деформациями координат. [ 37 ]
Анализ формы широко используется в экологии и эволюционной биологии для изучения пластичности. [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] эволюционные изменения формы [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] и в эволюционной биологии развития для изучения эволюции онтогенеза формы, [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ] а также причины стабильности развития, канализации и модульности. [ 48 ] [ 49 ] [ 50 ] [ 51 ] [ 52 ] Многие другие применения анализа формы в экологии и эволюционной биологии можно найти во вступительном тексте: Зельдич, МЛ; Свидерски, Д.Л.; Листы, HD (2012). Геометрическая морфометрия для биологов: учебник для начинающих . Лондон: Эльзевир: Академик Пресс.
Нейровизуализация
[ редактировать ]В нейровизуализации наиболее распространенными вариантами являются морфометрия , деформационная морфометрия и поверхностная морфометрия мозга воксельная . [ нужны разъяснения ]
Этот раздел нуждается в расширении . Вы можете помочь, добавив к нему . ( июнь 2008 г. ) |
Костная гистоморфометрия
[ редактировать ]Гистоморфометрия кости включает получение биоптата кости и обработку образцов кости в лаборатории, получение оценок пропорциональных объемов и поверхностей, занимаемых различными компонентами кости. Сначала кость разрушается с помощью ванн с высококонцентрированным этанолом и ацетоном . Затем кость встраивают и окрашивают , чтобы ее можно было визуализировать/проанализировать под микроскопом . [ 53 ] Получение костной биопсии осуществляется с помощью трепана для костной биопсии. [ 54 ]
См. также
[ редактировать ]- Аллометрия
- Аллометрическая инженерия
- Морфометрия мозга
- Д'Арси Вентворт Томпсон
- Геометрическая морфометрика в антропологии
- Геоморфометрия
- Меристика
- Филогенетические сравнительные методы
Примечания
[ редактировать ]^ 1 от греческого: «морф», что означает форму или форму, и «метрон», измерение.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кьяппе, LM; и др. (1999). «Новая позднемезозойская птица-конфуциоорнитид из Китая» (PDF) . Журнал палеонтологии позвоночных . 19 (1): 1–7. Бибкод : 1999JVPal..19....1Q . дои : 10.1080/02724634.1999.10011117 . [ постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Норелл, Массачусетс; и др. (1999). «Анатомия и систематика Confuciusornithidae (Theropoda: Aves) позднего мезозоя северо-восточного Китая» (PDF) . Бюллетень Американского музея естественной истории . 242 : 10. Архивировано из оригинала (PDF) 19 ноября 2011 г. Проверено 2 марта 2013 г.
- ^ Бентон, MJ; и др. (2008). «Примитивная птица-конфуциоорнитид из Китая и ее влияние на ранний полет птиц» . Наука в Китае. Серия D: Науки о Земле . 51 (5): 625–639. Бибкод : 2008ScChD..51..625Z . дои : 10.1007/s11430-008-0050-3 . S2CID 84157320 .
- ^ Кьяппе, LM; и др. (2008). «История жизни базальной птицы: морфометрия раннемелового Confuciusornis » . Письма по биологии . 4 (6): 719–723. дои : 10.1098/rsbl.2008.0409 . ПМК 2614169 . ПМИД 18832054 .
- ^ «Домашняя страница: Оксфордский словарь английского языка» . oed.com . Проверено 21 апреля 2018 г.
- ^ Гонсалес Баллестер, Мигель Анхель (1999). «Морфометрический анализ структур головного мозга при МРТ» (PDF) . Национальный институт исследований в области компьютерных наук и автоматизации .
- ^ Шолле, Мадлен Б.; Олдридж, Кристина; Пэнгборн, Николь; Вайнберг, Сет М.; ДеЛеон, Валери Б.; Барон Жан-Клод (28 января 2014 г.). «Ориентиры мозга для геометрическо-морфометрического анализа: исследование ошибок» . ПЛОС ОДИН . 9 (1): e86005. Бибкод : 2014PLoSO...986005C . дои : 10.1371/journal.pone.0086005 . ПМЦ 3904856 . ПМИД 24489689 .
- ^ Маркус, LF (1990). Глава 4. Традиционная морфометрия. В материалах Мичиганского морфометрического семинара. Специальное издание № 2. Ф. Дж. Рольф и Ф. Л. Букштейн. Анн-Арбор, Мичиган, Зоологический музей Мичиганского университета: 77–122.
- ^ Синглтон, М.; Розенбергер, Алабама; Робинсон, К.; О'Нил, Р. (2011). «Аллометрические и метамерные изменения формы моляров нижней челюсти Пана : цифровой морфометрический анализ» . Анатомическая запись . 294 (2): 322–334. дои : 10.1002/ar.21315 . ПМИД 21235007 . S2CID 17561423 .
- ^ Jump up to: а б Букштейн, Флорида (1991). Морфометрические инструменты для ориентировочных данных: геометрия и биология . Кембридж: Издательство Кембриджского университета.
- ^ Зельдич, М.; Вуд, Арканзас; Бонне, РМ; Свидерски, Д.Л. (2008). «Модульность нижней челюсти грызунов: интеграция мышц, костей и зубов» (PDF) . Эволюция и развитие . 10 (6): 756–768. дои : 10.1111/j.1525-142X.2008.00290.x . hdl : 2027.42/73767 . ПМИД 19021747 . S2CID 112076 .
- ^ Миттерёкер, П; Букштейн, Флорида (2008). «Эволюционная роль модульности и интеграции в черепе гуманоида» . Эволюция . 62 (4): 943–958. дои : 10.1111/j.1558-5646.2008.00321.x . ПМИД 18194472 . S2CID 23716467 .
- ^ Кендалл, генеральный директор (1977). «Диффузия формы». Достижения в области прикладной теории вероятности . 9 (3): 428–430. дои : 10.2307/1426091 . JSTOR 1426091 . S2CID 197438611 .
- ^ Рольф, Ф.Дж.; Срез, Д. (1990). «Расширение метода Прокруста для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 39 (1): 40–59. CiteSeerX 10.1.1.547.626 . дои : 10.2307/2992207 . JSTOR 2992207 .
- ^ Уокер, Дж. (2000). «Способность геометрических морфометрических методов оценивать известную ковариационную матрицу» . Систематическая биология . 49 (4): 686–696. дои : 10.1080/106351500750049770 . ПМИД 12116434 .
- ^ Миллер, Майкл И.; Юнес, Лоран; Труве, Ален (18 ноября 2013 г.). «Диффеоморфометрия и системы геодезического позиционирования для анатомии человека» . Технология . 2 (1): 36–43. дои : 10.1142/S2339547814500010 . ISSN 2339-5478 . ПМК 4041578 . ПМИД 24904924 .
- ^ Гренандер, Ульф; Миллер, Майкл И. (1 декабря 1998 г.). «Вычислительная анатомия: новая дисциплина» . В. Прил. Математика . ЛВИ (4): 617–694. дои : 10.1090/qam/1668732 . ISSN 0033-569X .
- ^ Кристенсен, GE; Рэббитт, РД; Миллер, Мичиган (1 января 1996 г.). «Деформируемые шаблоны с использованием кинематики больших деформаций». Транзакции IEEE при обработке изображений . 5 (10): 1435–1447. Бибкод : 1996ITIP....5.1435C . дои : 10.1109/83.536892 . ISSN 1057-7149 . ПМИД 18290061 .
- ^ "стнава/АНЦ" . Гитхаб . Проверено 11 декабря 2015 г.
- ^ Эшбернер, Джон (15 октября 2007 г.). «Быстрый алгоритм регистрации диффеоморфных изображений». НейроИмидж . 38 (1): 95–113. doi : 10.1016/j.neuroimage.2007.07.007 . ISSN 1053-8119 . ПМИД 17761438 . S2CID 545830 .
- ^ «Программное обеспечение — Том Веркаутерен» . сайты.google.com . Проверено 11 декабря 2015 г.
- ^ «NITRC: LDDMM: Информация об инструменте/ресурсе» . www.nitrc.org . Проверено 11 декабря 2015 г.
- ^ «Публикация: Сравнение алгоритмов диффеоморфной регистрации: Стационарный LDDMM и Диффеоморфные Демоны» . www.openaire.eu . Архивировано из оригинала 16 февраля 2016 г. Проверено 11 декабря 2015 г.
- ^ Ф. Бег; М. Миллер; А. Труве; Л. Юнес (февраль 2005 г.). «Вычисление метрических отображений большой деформации с помощью геодезических потоков диффеоморфизмов». Международный журнал компьютерного зрения . 61 (2): 139–157. doi : 10.1023/b:visi.0000043755.93987.aa . S2CID 17772076 .
- ^ Миллер, Мичиган; Юнес, Л. (1 января 2001 г.). «Групповые действия, гомеоморфизмы и сопоставление: общие принципы». Международный журнал компьютерного зрения . 41 : 61–84. CiteSeerX 10.1.1.37.4816 . дои : 10.1023/А:1011161132514 . S2CID 15423783 .
- ^ Миллер, Майкл И.; Труве, Ален; Юнес, Лоран (1 января 2015 г.). «Гамильтоновы системы и оптимальное управление в вычислительной анатомии: 100 лет со времен Д'Арси Томпсона». Ежегодный обзор биомедицинской инженерии . 17 : 447–509. doi : 10.1146/annurev-bioeng-071114-040601 . ISSN 1545-4274 . ПМИД 26643025 .
- ^ Роджерс, Маргарет (1982). «Описание образующей кривой двустворчатых моллюсков с прямым шарниром». Палеонтология . 25 : 109–117.
- ^ Глассберн, штат Техас (1995). «Новый палеонтологический метод, описывающий временные изменения формы двустворчатых моллюсков миоцена». Палеонтология . 38 : 133–151.
- ^ Ломанн, врач общей практики (1983). «Анализ собственной формы микрокаменелостей: общая морфометрическая процедура для описания изменений формы». Математическая геология . 15 (6): 659–672. дои : 10.1007/BF01033230 . S2CID 120295975 .
- ^ Ферсон, С.; Рольф, Ф.Дж.; Коэн, РК (1985). «Измерение изменения формы двумерных контуров». Систематическая зоология . 34 (1): 59–68. дои : 10.2307/2413345 . JSTOR 2413345 .
- ^ Пример «используется» см. Маклауд, Н.; Роуз, К.Д. (1 января 1993 г.). «Вывод о локомоторном поведении млекопитающих палеогена с помощью анализа собственной формы». Американский научный журнал . 293 (А): 300–355. Бибкод : 1993AmJS..293..300M . дои : 10.2475/ajs.293.A.300 .
- ^ например Шмитбюль, М.; Ригер, Дж.; Ле Минор, Ж.М.; Шааф, А.; Гай, Ф. (2007). «Вариации формы нижней челюсти у современных гоминоидов: общая, специфическая и подвидовая количественная оценка с использованием эллиптического анализа Фурье в боковой проекции». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 119–31. дои : 10.1002/ajpa.20476 . ПМИД 17063462 .
- ^ Jump up to: а б с Хейнс, Эй Джей; Крэмптон, Дж. С. (2000). «Усовершенствования метода анализа формы Фурье, применяемого в морфометрических исследованиях». Палеонтология . 43 (4): 765–783. Бибкод : 2000Palgy..43..765H . дои : 10.1111/1475-4983.00148 . S2CID 129091685 .
- ^ Зельдич, МЛ; Свидерски, Д.Л.; Листы, HD; Финк, В.Л. (2004). Геометрическая морфометрия для биологов: учебник для начинающих . Сан-Диего: Elsevier Academic Press.
- ^ Зельдич, М.; Финк, В.Л.; Свидерски, Д.Л. (1995). «Морфометрика, гомология и филогенетика - Количественные признаки как синапоморфии». Систематическая биология . 44 (2): 179–189. дои : 10.1093/sysbio/44.2.179 .
- ^ Маклауд, Норман (1999). «Обобщение и расширение метода собственных форм визуализации и анализа пространства форм». Палеобиология . 25 (1): 107–38. ISSN 1938-5331 . JSTOR 2665995 .
- ^ Вольфрам, Стивен (2002). Новый вид науки . Wolfram Media, Inc. с. 1010 . ISBN 978-1-57955-008-0 .
- ^ Парсонс, К.Дж.; Листы, HD; Скуласон, С.; Фергюсон, ММ (2011). «Фенотипическая пластичность, гетерохрония и онтогенетическое изменение структуры во время ювенильного развития дивергентного арктического гольца ( Salvelinus alpinus )» . Журнал эволюционной биологии . 24 (8): 1640–1652. дои : 10.1111/j.1420-9101.2011.02301.x . ПМИД 21599773 . S2CID 9741179 .
- ^ Холландер, Дж.; Коллайер, ML; Адамс, округ Колумбия; Йоханнессон, К. (2006). «Фенотипическая пластичность двух морских улиток: ограничения, заменяющие историю жизни» . Журнал эволюционной биологии . 19 (6): 1861–1872. дои : 10.1111/j.1420-9101.2006.01171.x . ПМИД 17040383 . S2CID 17342939 .
- ^ Гонсалес, ПН; Халлгримссон, Б.; Ойхенарт, Э.Э. (2011). «Пластичность развития ковариационной структуры черепа: влияние пренатального стресса» . Журнал анатомии . 218 (2): 243–257. дои : 10.1111/j.1469-7580.2010.01326.x . ПМК 3042757 . ПМИД 21138433 .
- ^ Монтейро, ЛР; Ногейра, MR (2009). «Адаптивная радиация, экологическая специализация и эволюционная интеграция сложных морфологических структур» . Эволюция . 64 (3): 724–743. дои : 10.1111/j.1558-5646.2009.00857.x . ПМИД 19804403 . S2CID 5256038 .
- ^ Дрейк, AG; Клингенберг, КП (2008). «Темпы морфологических изменений: историческая трансформация формы черепа собак сенбернара» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 275 (1630): 71–76. дои : 10.1098/rspb.2007.1169 . ПМК 2562403 . ПМИД 17956847 .
- ^ Бернер, Д.; Адамс, округ Колумбия; Граншан, AC; Хендри, AP (2008). «Естественный отбор определяет закономерности расхождения озер и ручьев в морфологии кормления колюшки» . Журнал эволюционной биологии . 21 (6): 1653–1665. дои : 10.1111/j.1420-9101.2008.01583.x . ПМИД 18691241 . S2CID 11184677 .
- ^ Свидерски, Д.Л.; Зельдич, МЛ (2010). «Морфологическое разнообразие, несмотря на изометрическое масштабирование плеч рычагов». Эволюционная биология . 37 : 1–18. дои : 10.1007/s11692-010-9081-8 . S2CID 39484740 .
- ^ Миттерёкер, П.; Гунц, П.; Букштейн, Флорида (2005). «Гетерохрония и геометрическая морфометрия: сравнение роста черепа Pan paniscus и Pan troglodyte s». Эволюция и развитие . 7 (3): 244–258. CiteSeerX 10.1.1.460.8419 . дои : 10.1111/j.1525-142x.2005.05027.x . ПМИД 15876197 . S2CID 14370905 .
- ^ Фредерих, Б.; Адрианс, Д.; Вандевалле, П. (2008). «Онтогенетические изменения формы Pomacentridae (Teleostei, Perciformes) и их связь со стратегиями питания: геометрический морфометрический подход» . Биологический журнал Линнеевского общества . 95 : 92–105. дои : 10.1111/j.1095-8312.2008.01003.x .
- ^ Зельдич, МЛ; Листы, HD; Финк, WL (2003). «Онтогенетическая динамика различия форм». Палеобиология . 29 : 139–156. doi : 10.1666/0094-8373(2003)029<0139:todosd>2.0.co;2 . S2CID 85774503 .
- ^ Халлгримссон, Б.; Браун, JJY; Форд-Хатчинсон, AF; Листы, HD; Зельдич, МЛ; Жирик, Франция (2006). «Брахиморфная мышь и онтогенетическая основа канализации и морфологической интеграции» (PDF) . Эволюция и развитие . 8 (1): 61–73. дои : 10.1111/j.1525-142x.2006.05075.x . hdl : 2027.42/71779 . ПМИД 16409383 . S2CID 42887577 .
- ^ Халлгримссон, Б.; Либерман, Делавэр; Лю, В.; Форд-Хатчинсон, AF; Жирик, Франция (2007). «Эпигенетические взаимодействия и структура фенотипической изменчивости черепа» . Эволюция и развитие (Представлена рукопись). 9 (1): 76–91. дои : 10.1111/j.1525-142x.2006.00139.x . ПМИД 17227368 . S2CID 14230925 .
- ^ Клингенберг, CP; Мебус, К.; Офре, Дж. К. (2003). «Интеграция развития в сложной морфологической структуре: насколько различны модули нижней челюсти мыши?». Эволюция и развитие . 5 (5): 522–531. дои : 10.1046/j.1525-142x.2003.03057.x . ПМИД 12950630 . S2CID 17447408 .
- ^ Клингенберг, CP; Заклан, С.Д. (2000). «Морфологическая интеграция между отделами развития крыла дрозофилы ». Эволюция . 54 (4): 1273–1285. дои : 10.1111/j.0014-3820.2000.tb00560.x . ПМИД 11005294 . S2CID 221539997 .
- ^ Маршалл, Эшли Ф.; Бардуа, Карла; Гауэр, Дэвид Дж.; Уилкинсон, Марк; Шерратт, Эмма; Госвами, Анджали (2019). «Трехмерный морфометрический анализ высокой плотности подтверждает сохраненную статическую (внутривидовую) модульность в черепах червячих (амфибий: Gymnophiona)» . Биологический журнал Линнеевского общества . 126 (4): 721–742. дои : 10.1093/biolinnean/blz001 . hdl : 2440/123277 .
- ^ Ревелл, Пенсильвания (декабрь 1983 г.). «Гистоморфометрия кости» . Дж. Клин. Патол . 36 (12): 1323–31. дои : 10.1136/jcp.36.12.1323 . ПМЦ 498562 . ПМИД 6361070 .
- ^ Ходжсон С.Ф.; Джонсон, Калифорния; Мухс, Дж. М.; Луфкин, Э.Г.; Маккарти, Джей Ти (январь 1986 г.). «Амбулаторная чрескожная биопсия гребня подвздошной кости: методы, заболеваемость и прием пациентов». Мэйо Клин Proc . 61 (1): 28–33. дои : 10.1016/s0025-6196(12)61395-0 . ПМИД 3941566 .
Библиография
[ редактировать ]- Адамс, Дин С.; Майкл Л. Коллайер (2009). «Общая основа анализа фенотипических траекторий в эволюционных исследованиях». Эволюция . 63 (5): 1143–1154. дои : 10.1111/j.1558-5646.2009.00649.x . ПМИД 19210539 . S2CID 1873905 .
- Букштейн, Фред (1991). Морфометрические инструменты для данных об ориентирах: геометрия и биология . Кембридж: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-58598-9 .
- Кадрин, Стивен X. (2000). «Достижения в морфометрической идентификации рыбных запасов». Обзоры по биологии рыб и рыболовству . 10 : 91–112. дои : 10.1023/А:1008939104413 . S2CID 25658507 .
- Элева, АМТ, изд. (2004). Морфометрия: приложения в биологии и палеонтологии . Берлин: Шпрингер. ISBN 978-3-540-21429-8 .
- Клингенберг, CP; Н. А. Гидашевский (2010). «Тестирование и количественная оценка филогенетических сигналов и гомоплазии в морфометрических данных» . Систематическая биология . 59 (3): 245–261. дои : 10.1093/sysbio/syp106 . ПМИД 20525633 .
- Маклеллан, Трейси; Эндлер, Джон А. (1998). «Относительный успех некоторых методов измерения и описания формы сложных объектов» . Систематическая биология . 47 (2): 264–81. дои : 10.1080/106351598260914 . hdl : 10536/DRO/DU:30094507 . ISSN 1076-836X . JSTOR 2585371 .
- Рольф, Ф.Дж.; Д. Слайс (1990). «Расширение метода Прокруста для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 10 (39): 40–59. CiteSeerX 10.1.1.547.626 . дои : 10.2307/2992207 . JSTOR 2992207 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Дикинсон, Т.А. (2001). «Морфометрические методы» . Проверено 9 октября 2016 г.
- ПРОШЛОЕ
- SHAPE – эллиптические дескрипторы Фурье
- Морфометрическое программное обеспечение . Архив множества различных типов программного обеспечения для использования в морфометрии, особенно в геометрической морфометрии.