Стигиальный

Стигиальный
Научная классификация
Домен:	Эукариота
Сорт:	Джейкоб
Заказ:	Якобида
Семья:	Stygiellidae
Род:	Стигиальный ; Pánek, Táborský & čepiicka 2015.
Тип видов
	Неточная Стигиэлла ; (Bernard, Simpson and Patterson 2000) Panek, Class & Cap 2015
Разновидность
	С. Прилип ; S. Agilis ; S. Cryptica ; С. заключен в тюрьму ;

Stygiella /ˌstɪ.d͡ʒiˈɛ.lə/-род свободных морских жгутиков, принадлежащих к семейству Stygiellidae в Jakobids ( Excavata ). ^{[ 1 ]}

Род в настоящее время включает в себя четыре вида, все из которых являются вторичными облигационными анаэробными . ^{[ 1 ]} Все виды одноклеточные и в форме полумесяца. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Все члены обладают водородосомами , тип акристической органелле , полученной из митохондриона (MRO), которая производит газ водорода в качестве метаболического продукта. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]} Stygiella-это глубоковосстанавливающаяся линия в рамках раскопок, а гены водородных средств иногда демонстрируют эубактерий, похожие на механизмы, которые были полезны для изучения эволюционной истории эукариотических митохондрий. ^{[ 1 ]}^{[ 3 ]}

Этимология

Stygiella - это недавно придуманный миниатюрный, основанный на имени греческой богини реки Стикс , которая в греческой мифологии сформировала границу между землей и подземным миром. ^{[ 4 ]}

История

Вид Stygiella Incarcerata был впервые описан Bernard et al. В 2000 году отобрана из залива Quirbray, Австралия и залив Ниво, Дания; Но вид, возможно, был ранее виден Fentel et al. В 1995 году в датском фьорде. ^{[ 2 ]}^{[ 5 ]} Первоначально этот вид был классифицирован в роду Jakoba с названием Jakoba Incarcerata . ^{[ 2 ]} Позже 18S анализ рРНК от Lara et al. показали сильную филогенетическую связь между J. Icarcerata и Andalucia Godoyi , недавно описанным бифлагерированным якобидом из почвы; Поэтому исследователи перенесли виды под новым родом Andalucia в 2006 году. ^{[ 6 ]}

В 2015 году Pánek et al. Проанализировали анаэробные линии Jakobid с помощью ДНК SSU и шесть кодирующих генов белка. ^{[ 1 ]} Результаты указывают на сильную кладу для всех анаэробных якобидов, образующих новые семейства Stygiellidae с двумя новыми родами: Velundella и Stygiella ; A. Icarcerata, таким образом, была классифицирована в Stygiella , а также три недавно обнаруженных вида. ^{[ 1 ]}

Среда обитания

Все виды Stygiella были обнаружены в аноксическом, сульфидном и аммиачном осадке в океанском плане или в солоноватой воде. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]} Виды Stygiella переносят соленость между 19 и 56 ppt. ^{[ 1 ]} Все четыре вида были успешно культивированы в лабораторных условиях при комнатной температуре. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Морфология

Все виды Stygiella имеют аналогичную морфологию: они являются в боковой форме полумесяца или яйца, алорикатные клетки с заостренными концами ( S. incarcerata ), а вентральная канавка в форме алмаза покрывает большую часть вентральной стороны до заднего конца. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} В каждом виде присутствуют два различных типа форм тела: клетки с широко открытыми канавками и плавательные клетки с укороченными, более узкими канавками. ^{[ 1 ]} Тела плавательных клеток обычно сужаются от середины до конца, тогда как катящиеся клетки являются более яйцевидными. ^{[ 1 ]} Зарегистрированные длины клеток обычно варьируются от 6,0 до 9,0 мкм ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Клетки раздваиваются, с жгутиками, происходящими близко к переднему концу канавки и простирающимися в направлении передней и задней концы клетки. ^{[ 1 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Передняя жгутика обычно короче длины тела, в то время как задние жгутики обычно более чем в два раза дольше, чем клетка; Задняя жгутика S. incarcerata , как правило, короче, обычно примерно в 1,5 раза превышает длину клетки. ^{[ 1 ]}

Передний жгутичок S. incarcerata имеет одиночный корень, изготовленный из двух слегка разделенных микротрубочек , которые происходят близко к переднему базальному телу в вентральном, заднем конце. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Задний жгутичок имеет два основных микротрубочных корня: левый, связанный с тремя различными не-микротрубными волокнами, а также составным волокном и правым одним из одного типа. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Кроме того, синглет «корень» окружает задний базальный корпус и поддерживает форму канавки. ^{[ 7 ]}

Дорсальный лопак прикрепляется к задней жгутике, который поддерживается параксинемальной ламеллой, которая возникает вблизи аксонеми . ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Аксонемема состоит из типичного эукариотического мотива 9 x 2. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Ламелла поднимается против аксонеемы и соединяется как минимум к двум аксонимным дублетам через приблизительно 100 нм, кроме аксонемы. ^{[ 7 ]} Его ширина постепенно расширяется до 700 нм. ^{[ 7 ]}

Виды Stygiella в основном имеют грушевидное или иногда округлое ядро, близкое к переднему конце клетки, с ядром диаметром 0,5 мкм. ^{[ 1 ]}^{[ 7 ]} Одна диктиосома Гольджи , в целом с 3-8 цистернами, расположена непосредственно позади базальных тел. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} Цитоскелет напоминает другие раскопки. ^{[ 7 ]} Концентрация рибосомов очень низкая в цитозоле . ^{[ 3 ]}

Все виды в Stygiella обладают акристическими водородными водородосомами , которые могут выполнять только анаэробный АТФ-синтез и терять большинство своих белков для цепочек транспорта электронов . ^{[ 3 ]} Эти водородосомы, как правило, от 300 до 500 нм в поперечнике и от 0,75 до 1 мкм в длину, лежат близко к ядру и часто ассоциируются с основными жгутиковыми микротрубочными корнями. ^{[ 3 ]}^{[ 7 ]}

Поведение

Клетки могут прикрепляться к субстрату их жгутиком (в основном передней жгутией) или боковым или дорсальным клеточным телом через заднюю цитоплазматическую проекцию. ^{[ 1 ]} Основными морфотипами в S. incarcerata и S. agilis являются плавающие клетки, которые движутся в спиральном движении с лишь случаем приверженности субстрату. ^{[ 1 ]}^{[ 7 ]} Гроувированные морфотипы этих видов прикрепляются к подложке сначала передней жгутией, который тянет тело к субстрату и высвобождается, когда придерживается задней цитоплазматической проекции. S. Adhaerens и S. cryptica - это в основном клетки, которые почти всегда прикрепляются к субстрату передней или редко задней жгутией; Немногие плавательные клетки наблюдались у этих видов. ^{[ 1 ]}

Метаболизм

Водорожных гидросомов Stygiella , по-видимому, отсутствуют органеллярному геному и большинству субъединиц комплекса I для цепи переноса электронов, но содержат белки для эубактерий-подобного пируват-декарбоксилирования, таких как пируват: оксидоредуктаза [ FEFE] , которые также существуют в Другие анаэробные раскопки разных линий. ^{[ 3 ]} Эта сходящаяся эволюция может быть результатом аналогичного бокового переноса генов. ^{[ 3 ]}

По сравнению с некоторыми паразитическими анаэробными раскопами, такими как Trichomonas vaginalis , водородные водородосомы S. incarcerata сохраняют больше импортных белков и более функциональный аминокислотный механизм. ^{[ 3 ]} Кроме того, он имеет реакцию окислительного стресса, аналогичную реакции других анаэробных протистов. ^{[ 3 ]} Узел кластеров железа присутствует в водородных условиях, что согласуется со всеми другими органеллами, полученными из митохондриона. ^{[ 3 ]}

Список видов

Четыре вида Stygiella признаются: ^{[ 1 ]}

Stygiella incarcerata (Bernard, Simpson and Patterson 2000) Pánek, Tábosky and Cap 2015.
Stygiella Adhaerens Pánek, Táborský & čepička 2015
Stygiella Cryptica Pánek, Táborský & čepička 2015
Stygiella Agilis Pánek, Táborský & čepička 2015

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т ^в ^v Pánek, T., Táborský, P., Pachiadaki, MG, Hrudova, M., Vlcek, No, Edgcomb, VP, & Cepička, I. (2015). Объединенные культурные и независимые от культуры подходы дают представление о разнообразии якобидов, экстремелостно-плезиоморфной эукариотической линии . Границы в микробиологии, 6, 1288. Получено 28 апреля 2020 года. Doi: 10.3389/2ffmicb.2015.01288.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Bernard, C, Simpson, Agb & Patterson, DJ (2000). Некоторые свободные жгутики (Protista) из аноксических мест обитания, Ophelia, 52: 2, 113-142, doi: 10.1080/00785236.1999.10409422.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Leger, MM, Eme, L., Hug, La, & Roger, AJ (2016). [Новые водородосомы в микроаэрофильных якобидных stigiella incarcerata ]. Молекулярная биология и эволюция, 33 (9), 2318-2336. Получено 28 апреля 2020 года. DOI: doi.org/10.1093/2fmolbev/2fmsw103.
^ Pánek, T., Táborský, P., Pachiadaki, MG, Hrudova, M., Vlcek, NO, Edgcomb, VP, & Cepička, I. (2015). Объединенные культурные и независимые от культуры подходы дают представление о разнообразии якобидов, чрезвычайно плезиоморфной эукариотической линии (DataSheet 2) . Границы в микробиологии, 6, 1288. Получено 28 апреля 2020 года. Doi: 10.3389/2ffmicb.2015.01288.
^ Fenchel, T., Bernard, C., Esteban, G., Finlay, BJ, Hansen, PJ, & Iversen, N. (1995). Микробное разнообразие и активность в датском фьорде с аноксической глубокой водой. Офелия, 43 (1), 45–100.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Лара Э., Чазинотас, А. и Симпсон, А.Г. (2006). Andalucia (n. Gen.) - самая глубокая ветвь в якобидах (Jakobida; Excavata), основанная на морфологическом и молекулярном исследовании нового жгутикового из почвы. Журнал эукариотической микробиологии, 53 (2), 112–120. doi: 10.1111/j.1550-7408.2005.00081.x.
^ Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Simpson, AG, & Patterson, DJ (2001). На основных якобидах и таксонах раскопок: ультраструктура Jakoba Incarcerata . Журнал эукариотической микробиологии , 48 (4), 480–492. doi: 10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x.

[pk-1] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м ^не ^а ^п ^Q. ^{ведущий} ^с ^Т ^в ^v Pánek, T., Táborský, P., Pachiadaki, MG, Hrudova, M., Vlcek, No, Edgcomb, VP, & Cepička, I. (2015). Объединенные культурные и независимые от культуры подходы дают представление о разнообразии якобидов, экстремелостно-плезиоморфной эукариотической линии . Границы в микробиологии, 6, 1288. Получено 28 апреля 2020 года. Doi: 10.3389/2ffmicb.2015.01288.

[bernard-2] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Bernard, C, Simpson, Agb & Patterson, DJ (2000). Некоторые свободные жгутики (Protista) из аноксических мест обитания, Ophelia, 52: 2, 113-142, doi: 10.1080/00785236.1999.10409422.

[leger-3] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k Leger, MM, Eme, L., Hug, La, & Roger, AJ (2016). [Новые водородосомы в микроаэрофильных якобидных stigiella incarcerata ]. Молекулярная биология и эволюция, 33 (9), 2318-2336. Получено 28 апреля 2020 года. DOI: doi.org/10.1093/2fmolbev/2fmsw103.

[4] Pánek, T., Táborský, P., Pachiadaki, MG, Hrudova, M., Vlcek, NO, Edgcomb, VP, & Cepička, I. (2015). Объединенные культурные и независимые от культуры подходы дают представление о разнообразии якобидов, чрезвычайно плезиоморфной эукариотической линии (DataSheet 2) . Границы в микробиологии, 6, 1288. Получено 28 апреля 2020 года. Doi: 10.3389/2ffmicb.2015.01288.

[5] Fenchel, T., Bernard, C., Esteban, G., Finlay, BJ, Hansen, PJ, & Iversen, N. (1995). Микробное разнообразие и активность в датском фьорде с аноксической глубокой водой. Офелия, 43 (1), 45–100.

[lara-6] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин Лара Э., Чазинотас, А. и Симпсон, А.Г. (2006). Andalucia (n. Gen.) - самая глубокая ветвь в якобидах (Jakobida; Excavata), основанная на морфологическом и молекулярном исследовании нового жгутикового из почвы. Журнал эукариотической микробиологии, 53 (2), 112–120. doi: 10.1111/j.1550-7408.2005.00081.x.

[simpson-7] Jump up to: ^а ^{беременный} ^в ^{дюймовый} ^и ^фон ^глин ^час ^я ^Дж ^k ^л ^м Simpson, AG, & Patterson, DJ (2001). На основных якобидах и таксонах раскопок: ультраструктура Jakoba Incarcerata . Журнал эукариотической микробиологии , 48 (4), 480–492. doi: 10.1111/j.1550-7408.2001.tb00183.x.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]