Протокатехиница 3,4-диоксигеназы
| Протокатехиница 3,4-диоксигеназы | |||
|---|---|---|---|
 Протокатехтуат 3,4-диоксигеназы hetero24mer, pseudomonas putida | |||
| Идентификаторы | |||
| ЕС №. | 1.13.11.3 | ||
| CAS №. | 9029-47-4 | ||
| Базы данных | |||
| Intenz | Intenz View | ||
| Бренда | Бренда вход | ||
| Расширение | Вид Nicezyme | ||
| Кегг | Кегг вход | ||
| Метатический | Метаболический путь | ||
| Напрямую | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBE PDBSUM | ||
| Джин Онтология | Друг / Quickgo | ||
| |||
В фермерке ( 3,4-диоксигеназа протокатеховой 3,4-диоксигеназы EC 1.13.11.3 ) -это фермент , который катализирует химическую реакцию
- 3,4-дигидроксибензоат + O 2 3-карбокси-CIS, CIS-муконат
Таким образом, двумя субстратами этого фермента представляют собой 3,4-дигидроксибензоат ( протокатехновая кислота ) и O 2 , тогда как его продукт - 3-карбокси-CIS, цис-муконат .
Этот фермент относится к семейству оксидоредуктаз , в частности, те, которые действуют на отдельных донорах с O 2 в качестве окислителя и включения двух атомов кислорода в субстрат (оксигеназы). Систематическим названием этого класса ферментов является протокатехтет: кислород 3,4окидоректаза (дециклирование) . Другие общие названия включают протокатехно-оксигеназу , протокатехно-кислотную кислоту , протокатехическую 3,4-диоксигеназу и протокатехическую 3,4-оксигеназу . Этот фермент участвует в деградации бензоата посредством гидроксилирования и 2,4-дихлорбензоата . Он использует один кофактор , железо .
Этот фермент был обнаружен эффективным при улучшении органических флуорофорных стабильности в одномолекулярных экспериментах. [ 1 ] Коммерческие препараты фермента, выделенного из Pseudomonas spp. Как правило, требует дальнейшей очистки для удаления сильной загрязняющей нуклеазной активности.
Структурные исследования
[ редактировать ]В конце 2007 года 37 структур для этого класса ферментов было решено PDB , с кодами вступления 1EO2 , 1EO9 , 1EOA , 1EOC 1EOB , 1YKK , 1YKL , 1YKM , 1YKN , 1YKO , 1YKP , 2BUM , 2BUQ , 2BUT , 2BUT , , в 2buu , 2buv , 2buw , 2bux , 2Buy , 2Buz , 2BV0 , 2PCD , 3PCA , 3PCB , 3PCC , 3PCD , 3PCE , 3PCF , 3PCG , 3PCH , 3PCI , 3PCJ , 3PCK , 3PCL , 3PCM и 3PCN .
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Aitken CE, Marshall RA, Puglisi JD (2008). «Система удаления кислорода для улучшения стабильности красителя в экспериментах с флуоресценцией в одной молекуле» . Биофиз. Дж . 94 (5): 1826–1835. Bibcode : 2008bpj .... 94.1826a . doi : 10.1529/biophysj.107.117689 . PMC 2242739 . PMID 17921203 .
- Fujisawa H, Hayaishi O (1968). «Протокатехиница 3,4-диоксигеназы. I. Кристаллизация и характеристика». Дж. Биол. Химический 243 (10): 2673–81. PMID 4967959 .
- Гросс С.Р., Гаффорд Р.Д., Татум Эль (1956). «Метаболизм протокатехновой кислоты с помощью нейроспоры». Дж. Биол. Химический 219 (2): 781–96. PMID 13319299 .
- Stanier Ry, Ingraham JL (1954). «Протокатехно -кислотная оксидаза». Дж. Биол. Химический 210 (2): 799–820. PMID 13211618 .
