Морфометрия


Морфометрия (от греческого μορмоби -морфа , «форма, форма» и -μετρία metria , «Измерение») или морфометрия [ 5 ] относится к количественному анализу формы , концепции, которая охватывает размер и форму. Морфометрический анализ обычно проводится на организмах и полезны для анализа их ископаемого записи, влияния мутаций на форму, изменения в форме, ковариации между экологическими факторами и формой, а также для оценки количественных параметров формы. Морфометрия может использоваться для количественной оценки черты эволюционной значимости и, обнаруживая изменения в форме, выводят что -то из их онтогенерии , функции или эволюционных отношений. Основной целью морфометрии является статистически проверка гипотез о факторах, которые влияют на форму.
«Морфометрика», в более широком смысле, также используется для точно определения определенных областей органов, таких как мозг, [ 6 ] [ 7 ] и в описании форм других вещей.
Формы
[ редактировать ]
Три общих подхода к формированию обычно различаются: традиционная морфометрия, морфометрия на основе значений и морфометрия на основе оборотов.
«Традиционная» морфометрия
[ редактировать ]Традиционные морфометрические анализа длины, ширину, массы, углы, соотношения и области. [ 8 ] В целом, традиционные морфометрические данные являются измерениями размера. Недостаток использования многих измерений размера заключается в том, что большинство будет сильно коррелировать; В результате существует мало независимых переменных, несмотря на множество измерений. Например, длина большеберцовой кости будет варьироваться в зависимости от продолжительности бедренной кости, а также с длиной плечевой кости и локтевой кости и даже с измерениями головы. Традиционные морфометрические данные, тем не менее, полезны, когда абсолютные или относительные размеры представляют особый интерес, например, в исследованиях роста. Эти данные также полезны, когда измерения размера имеют теоретическое значение, такое как масса тела и площадь поперечного сечения конечностей и длина в исследованиях функциональной морфологии. Однако эти измерения имеют одно важное ограничение: они содержат мало информации о пространственном распределении изменений формы по организму. Они также полезны при определении степени, в которой определенные загрязнители повлияли на человека. Эти индексы включают гепатосоматический индекс, гонадосоматический индекс , а также факторы состояния (Shakumbila, 2014).
Геометрическая морфометрия на основе знаковой
[ редактировать ]
В «Геометрической морфометрии на основе значений пространственная информация», отсутствующая в традиционной морфометрии, содержатся в данных, поскольку данные являются координатами достопримечательностей : дискретные анатомические локусы, которые, возможно, гомологичны для всех людей в анализе (то есть они могут рассматриваться как « Та же «точка в каждом образце в исследовании»). Например, когда два специфических шва пересекают ориентир, как и пересечения между венами на крыле насекомого или листа, или на форамин , небольшие отверстия, через которые проходят вены и кровеносные сосуды. Исследования, основанные на достопримечательностях, традиционно анализировали 2D-данных, но с увеличением доступности трехмерных методов визуализации 3D-анализ становятся более возможными даже для небольших структур, таких как зубы. [ 9 ] Поиск достаточного количества достопримечательностей, чтобы дать полное описание формы может быть затруднено при работе с окаменелостями или легко поврежденными образцами. Это связано с тем, что все достопримечательности должны присутствовать во всех образцах, хотя могут быть оценены координаты пропущенных ориентиров. Данные для каждого человека состоит из конфигурации ориентиров.
Есть три признанные категории достопримечательностей. [ 10 ] Пядообразования типа 1 определены локально, т.е. с точки зрения структур, близких к этой точке; Например, пересечение между тремя швами или пересечения между венами на крыле насекомых локально определено и окружено тканью со всех сторон. Достопримечательности типа 3 , напротив, определены с точки зрения точек, далеко от ориентира и часто определяются с точки зрения точки «самого дальнего» от другой точки. Отношения типа 2 являются промежуточными; Эта категория включает в себя такие точки, как структура наконечника или локальные минимумы и максимумы кривизны. Они определены с точки зрения местных функций, но они не окружены со всех сторон. В дополнение к достопримечательностям, есть полулодчики , точки, позиция которого вдоль кривой является произвольной, но предоставляя информацию о кривизности во двух [ 11 ] или три измерения. [ 12 ]
Геометрическая морфометрия на основе Procrustes
[ редактировать ]
Анализ формы начинается с удаления информации, которая не касается формы. По определению, форма не изменяется путем перевода, масштабирования или вращения. [ 13 ] Таким образом, для сравнения форм, информация о не-форме удаляется из координат достопримечательностей. Есть несколько способов выполнить эти три операции. Один из методов состоит в том, чтобы исправить координаты двух точек на (0,0) и (0,1), которые являются двумя концами базовой линии. На одном шаге формы переводятся в одну и ту же положение (те же два координата прикреплены к этим значениям), формы масштабируются (к базовой длине единицы), а формы вращаются. [ 10 ] Альтернативой и предпочтительным методом является наложение . Этот метод переводит центроид форм в (0,0); x координата координата центроида -это среднее значение x координат достопримечательностей, а Y центроид -это среднее значение y -координатов. Формы масштабируются до размера центрального центра, который представляет собой квадратный корень из суммированных квадратных расстояний каждого ориентира до центроида. Конфигурация поворачивается, чтобы минимизировать отклонение между ним и ссылкой, как правило, средней формы. В случае полузащитных знаков вариация в положении вдоль кривой также удаляется. Поскольку пространство формы изогнута, анализ проводится путем проецирования фигур на космическую тангенс для формы пространства. В пределах касательного пространства традиционные многомерные статистические методы, такие как многомерный дисперсионный анализ и многомерная регрессия, могут использоваться для проверки статистических гипотез о форме.
Анализы на основе Procrustes имеют некоторые ограничения. Одним из них является то, что наложение Procrustes использует критерий наименьших квадратов, чтобы найти оптимальное вращение; Следовательно, вариации, которые локализуются на одну достопримечательность, будут размазываются по многим. Это называется «эффект Пиноккио». Другое заключается в том, что наложение может само по себе навязывать схему ковариации на достопримечательности. [ 14 ] [ 15 ] Кроме того, не может быть проанализирована любая информация, которая не может быть получена достопримечательностями и полузвуковыми значениями, включая классические измерения, такие как «наибольшая ширина черепа». Более того, существуют критические замечания о методах, основанных на Procrustes, которые мотивируют альтернативный подход к анализу данных знаковых.
Анализ евклидовой матрицы расстояния
[ редактировать ]Диффеоморфометрия
[ редактировать ]Диффеоморфометрия [ 16 ] сосредоточено на сравнении форм и форм с метрической структурой, основанной на диффеоморфизмах, и является центральным в области вычислительной анатомии . [ 17 ] Диффеоморфная регистрация, [ 18 ] Представлено в 90 -х годах, теперь является важным игроком с существующими кодовыми базами, организованными вокруг муравьев, [ 19 ] Дротик, [ 20 ] Демоны, [ 21 ] LDDMM , [ 22 ] Startyarylddmm [ 23 ] являются примерами активно используемых вычислительных кодов для построения соответствий между системами координат на основе редких функций и плотных изображений. Морфометрия на основе вокселей (VBM) является важной технологией, основанной на многих из этих принципов. Методы, основанные на диффеоморфных потоках, используются, например, деформации могут быть диффеоморфизмом окружающего пространства, что приводит к структуре LDDMM ( большая деформация диффеоморфного метрического картирования ) для сравнения формы. [ 24 ] На таких деформациях есть правильный инвариантный метрика вычислительной анатомии , которая обобщает метрику некомпрессируемых эйлеровских потоков, но включает в себя норму соболева, обеспечивающую плавность потоков, [ 25 ] Метрики теперь определены, связанные с гамильтонианскими контролями диффеоморфных потоков. [ 26 ]
Схема анализа
[ редактировать ]
Анализ наброска является еще одним подходом к анализу формы. Что различает анализ наброска, так это то, что коэффициенты математических функций подходят к точкам, выбранным вдоль контура. Есть ряд способов количественной оценки контура. Старые методы, такие как «соответствие к полиномиальной кривой» [ 27 ] и основные компоненты количественный анализ [ 28 ] были заменены двумя основными современными подходами: анализ эйджиша , [ 29 ] и эллиптический анализ Фурье (EFA), [ 30 ] Используя контуры рук или компьютер. Первый включает в себя установку заданного количества полулодных знаков с равными промежутками вокруг контура формы, записывая отклонение каждого шага от полулодного знака до полулодного знака от того, каким был угол этого шага, был объектом простым кругом. [ 31 ] Последний определяет контур как сумму минимального количества эллипсов, необходимых для имитации формы. [ 32 ]
Оба метода имеют свои слабости; Наиболее опасным (и легко преодолеть) является их восприимчивость к шуму в схеме. [ 33 ] Аналогичным образом, ни один из них не сравнивает гомологичные точки, а глобальные изменения всегда получают больший вес, чем локальные вариации (которые могут иметь большие биологические последствия). Анализ собственности требует, чтобы эквивалентная отправная точка была установлена для каждого образца, который может быть источником ошибки EFA также страдает от избыточности тем, что не все переменные являются независимыми. [ 33 ] С другой стороны, можно применить их к сложным кривым без необходимости определения центроида; Это делает удаление эффекта местоположения, размера и вращения намного проще. [ 33 ] Воспринимаемые недостатки набросок морфометрии состоит в том, что он не сравнивает точки гомологичного происхождения и что он упрощает сложные формы, ограничивая себя рассмотрением контура, а не внутренних изменений. Кроме того, поскольку он работает, приближаясь к контуру серией эллипсов, он плохо справляется с заостренными формами. [ 34 ]
Одна критика методов, основанных на оборотах, заключается в том, что они игнорируют гомологию-известным примером того, как это игнорирование является способностью основанных на очертаниях методов сравнивать лопату с картофельной чипом. [ 35 ] Такое сравнение, которое было бы невозможно, если бы данные были ограничены биологически гомологичными точками. Аргумент против этой критики заключается в том, что, если знаковые подходы к морфометрии могут быть использованы для проверки биологических гипотез в отсутствие гомологических данных, не подходит для неисправностей подходов, основанных на общих чертах для обеспечения тех же самых типов исследований. [ 36 ]
Анализ данных
[ редактировать ]Многофакторные статистические методы могут быть использованы для проверки статистических гипотез о факторах, которые влияют на форму и визуализировать их эффекты. Чтобы визуализировать шаблоны изменений в данных, данные необходимо уменьшить до понятной (низкоразмерной) формы. Анализ основных компонентов (PCA) является общепринятым инструментом для обобщения вариаций. Проще говоря, техника проецирует как можно большую часть общего вариации в несколько измерений. Смотрите фигуру справа для примера. Каждая ось на графике PCA является собственным вектором ковариационной матрицы переменных формы. Первая ось объясняет максимальное изменение в образце, при этом дополнительные оси представляют дополнительные способы, которыми образцы различаются. Паттерн кластеризации образцов в этом морфопросении представляет сходство и различия в формах, которые могут отражать филогенетические отношения . Помимо изучения моделей вариации, многомерные статистические методы могут использоваться для проверки статистических гипотез о факторах, которые влияют на форму, и для визуализации их эффектов, хотя PCA не требуется для этой цели, если метод не требует инвертирования матрицы дисперсионной ковариации.
Знаковые данные позволяют различие между средним населением или отклонением, которое означает, что человек от своего населения означает визуализироваться как минимум двумя способами. Один из них изображает векторы на достопримечательностях, которые показывают величину и направление, в котором этот достопримечательность смещена по сравнению с другими. Второе изображает разницу с помощью тонких сплайнов с пластиной , функции интерполяции, которая моделирует изменение между ориентирами из данных изменений в координатах достопримечательностей . Эта функция создает то, что выглядит как деформированные сетки; Там, где регионы, которые относительно вытянуты, сетка будет выглядеть растянутой, и там, где эти области относительно сокращены, сетка будет выглядеть сжатой.
Экология и эволюционная биология
[ редактировать ]D'Arcy Thompson в 1917 году предположил, что формы во многих различных видах также могут быть связаны таким образом. В случае снарядов и рогов он дал довольно точный анализ ... но он также нарисовал различные фотографии рыб и черепов и утверждал, что они были связаны деформациями координат. [ 37 ]
Анализ формы широко используется в экологии и эволюционной биологии для изучения пластичности, [ 38 ] [ 39 ] [ 40 ] Эволюционные изменения в форме [ 41 ] [ 42 ] [ 43 ] [ 44 ] и в эволюционной биологии развития для изучения эволюции онтогенерии формы, [ 45 ] [ 46 ] [ 47 ] а также происхождение развития стабильности развития, канализации и модульности. [ 48 ] [ 49 ] [ 50 ] [ 51 ] [ 52 ] Многие другие применения анализа форм в экологии и эволюционной биологии можно найти во вводном тексте: Zelditch, ML; Swiderski, DL; Листы, HD (2012). Геометрическая морфометрия для биологов: праймер . Лондон: Elsevier: Academic Press.
Нейровизуализация
[ редактировать ]В нейровизуализации наиболее распространенными вариантами являются морфометрия на основе вокселей , морфометрия на основе деформации и основе поверхности мозга морфометрия на . [ нужно разъяснения ]
![]() | Этот раздел нуждается в расширении . Вы можете помочь, добавив к этому . ( Июнь 2008 г. ) |
Костяная гистоморфометрия
[ редактировать ]Гистоморфометрия кости включает в себя получение образца биопсии кости и обработку образцов кости в лаборатории, получение оценки пропорциональных объемов и поверхностей, занятых различными компонентами кости. Сначала кость разбивается ваннами в высококонцентрированном этаноле и ацетоне . Затем кость встроена и окрашивается , чтобы ее можно было визуализировать/проанализировать под микроскопом . [ 53 ] Получение биопсии кости осуществляется с использованием биопсии кости. [ 54 ]
Смотрите также
[ редактировать ]- Аллометрия
- Аллометрическая инженерия
- Морфометрия мозга
- Д'Арси Вентворт Томпсон
- Геометрическая морфометрия в антропологии
- Геоморфометрика
- Меристика
- Филогенетические сравнительные методы
Примечания
[ редактировать ]^1 от греческого: «морф», значение формы или формы и «метрона», измерение
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Chiappe, LM; и др. (1999). «Новая поздняя мезозойская конфузиузинортидная птица из Китая» (PDF) . Журнал палеонтологии позвоночных . 19 (1): 1–7. Bibcode : 1999jvpal..19 .... 1q . doi : 10.1080/02724634.1999.10011117 . [ Постоянная мертвая ссылка ]
- ^ Норелл, Массачусетс; и др. (1999). «Анатомия и систематика Confuciusornithidae (Theropoda: Aves) из позднего мезозоя северо -восточного Китая» (PDF) . Бюллетень Американского музея естественной истории . 242 : 10. Архивировано из оригинала (PDF) 2011-11-19 . Получено 2013-03-02 .
- ^ Бентон, MJ; и др. (2008). «Примитивная птица конфуциузинозинета из Китая и ее последствия для раннего птичьего полета» . Science in China Series D: Науки Земли . 51 (5): 625–639. BIBCODE : 2008 SCCHD..51..625Z . doi : 10.1007/s11430-008-0050-3 . S2CID 84157320 .
- ^ Chiappe, LM; и др. (2008). «История жизни базальной птицы: морфометрия раннего мела конфуциусиузинса » . Биологические письма . 4 (6): 719–723. doi : 10.1098/rsbl.2008.0409 . PMC 2614169 . PMID 18832054 .
- ^ «Дом: Оксфордский английский словарь» . OED.com . Получено 21 апреля 2018 года .
- ^ González Ballester, Miguel Angel (1999). «Морфометрический анализ структур мозга в МРТ» (PDF) . Национальный институт исследований в области компьютерных наук и автоматического .
- ^ Чолле, Мадлен Б.; Олдридж, Кристина; Пангборн, Николь; Вайнберг, Сет М.; Делеон, Валери Б.; Барон, Жан-Клод (28 января 2014 г.). «Достопримечательности мозга для геометрического морфометрического анализа: исследование ошибок» . Plos один . 9 (1): E86005. BIBCODE : 2014PLOSO ... 986005C . doi : 10.1371/journal.pone.0086005 . PMC 3904856 . PMID 24489689 .
- ^ Marcus, LF (1990). Глава 4. Традиционная морфометрия. В материалах морфометрической мастерской Мичигана. Специальная публикация № 2. FJ Rohlf и FL Bookstein. Энн Арбор Ми, Музей зоологии Мичиганского университета: 77–122.
- ^ Singleton, M.; Розенбергер, Ал; Робинсон, C.; О'Нил Р. (2011). «Аллометрическая и метамерная вариация формы в панорамировании нижнечелюстной моляры: цифровой морфометрический анализ» . Анатомическая запись . 294 (2): 322–334. doi : 10.1002/ar.21315 . PMID 21235007 . S2CID 17561423 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Bookstein, FL (1991). Морфометрические инструменты для знаковых данных: геометрия и биология . Кембридж: издательство Кембриджского университета.
- ^ Zelditch, M.; Вуд, Ар; Bonnet, RM; Swiderski, DL (2008). «Модульность нижней челюсти грызунов: интеграция мышц, костей и зубов» (PDF) . Эволюция и развитие . 10 (6): 756–768. doi : 10.1111/j.1525-142x.2008.00290.x . HDL : 2027,42/73767 . PMID 19021747 . S2CID 112076 .
- ^ Mitteroecker, P; Bookstein, FL (2008). «Эволюционная роль модульности и интеграции в черепке гомеиноида» . Эволюция 62 (4): 943–958. doi : 10.1111/j.1558-5646.2008.00321.x . PMID 18194472 . S2CID 23716467 .
- ^ Кендалл, Д.Г. (1977). «Распространение формы». Достижения в прикладной вероятности . 9 (3): 428–430. doi : 10.2307/1426091 . JSTOR 1426091 . S2CID 197438611 .
- ^ Rohlf, FJ; Slice, D. (1990). «Расширение метода Procrustes для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 39 (1): 40–59. Citeseerx 10.1.1.547.626 . doi : 10.2307/2992207 . JSTOR 2992207 .
- ^ Уокер Дж. (2000). «Способность геометрических морфометрических методов оценить известную ковариационную матрицу» . Систематическая биология . 49 (4): 686–696. doi : 10.1080/106351500750049770 . PMID 12116434 .
- ^ Миллер, Майкл I.; Юнес, Лоран; Truvé, Alain (2013-11-18). «Диффеоморфометрия и геодезические системы позиционирования для анатомии человека» . Технология . 2 (1): 36–43. doi : 10.1142/s2339547814500010 . ISSN 2339-5478 . PMC 4041578 . PMID 24904924 .
- ^ Гренандер, Ульф; Миллер, Майкл И. (1998-12-01). «Вычислительная анатомия: новая дисциплина» . Q. Appl. Математика LVI (4): 617–694. doi : 10.1090/QAM/1668732 . ISSN 0033-569X .
- ^ Кристенсен, GE; Rabbitt, Rd; Miller, MI (1996-01-01). «Деформируемые шаблоны с использованием кинематики большой деформации». IEEE транзакции по обработке изображений . 5 (10): 1435–1447. Bibcode : 1996itip .... 5.1435c . doi : 10.1109/83.536892 . ISSN 1057-7149 . PMID 18290061 .
- ^ "Стнава/Муравьи" . GitHub . Получено 2015-12-11 .
- ^ Ashburner, John (2007-10-15). «Быстрый алгоритм регистрации диффеоморфного изображения». Нейроамиж . 38 (1): 95–113. doi : 10.1016/j.neuroimage.2007.07.007 . ISSN 1053-8119 . PMID 17761438 . S2CID 545830 .
- ^ «Программное обеспечение - Том Веркаутерен» . sites.google.com . Получено 2015-12-11 .
- ^ «NITRC: LDDMM: Информация о инструменте/ресурсе» . www.nitrc.org . Получено 2015-12-11 .
- ^ «Публикация: сравнение алгоритмов для диффеоморфной регистрации: стационарные LDDMM и диффеоморфные демоны» . www.openaire.eu . Архивировано с оригинала 2016-02-16 . Получено 2015-12-11 .
- ^ Ф. Бег; М. Миллер; А. Прувэ; Л. Юнес (февраль 2005 г.). «Вычисление больших показателей деформации с помощью геодезических потоков диффеоморфизмов». Международный журнал компьютерного видения . 61 (2): 139–157. doi : 10.1023/b: visi.0000043755.93987.aa . S2CID 17772076 .
- ^ Миллер, Мичиган; Юнес, Л. (2001-01-01). «Групповые действия, гомеоморфизмы и сопоставление: общая структура». Международный журнал компьютерного видения . 41 : 61–84. Citeseerx 10.1.1.37.4816 . doi : 10.1023/a: 1011161132514 . S2CID 15423783 .
- ^ Миллер, Майкл I.; Прувэ, Ален; Юнес, Лоран (2015-01-01). «Гамильтонианские системы и оптимальный контроль в вычислительной анатомии: 100 лет с момента D'Arcy Thompson». Ежегодный обзор биомедицинской инженерии . 17 : 447–509. doi : 10.1146/annurev-bioeng-071114-040601 . ISSN 1545-4274 . PMID 26643025 .
- ^ Роджерс, Маргарет (1982). «Описание генерирующей кривой двустворчатых моллюсков с прямой стрижкой». Палеонтология . 25 : 109–117.
- ^ Glassburn, TA (1995). «Новая палеонтологическая техника, описывающая временную изменение формы в миоценовых двустворчатых моллюсках». Палеонтология . 38 : 133–151.
- ^ Lohmann, GP (1983). «Анализ эйгеншапов микрофоссилий: общая морфометрическая процедура для описания изменений в форме». Математическая геология . 15 (6): 659–672. doi : 10.1007/bf01033230 . S2CID 120295975 .
- ^ Ferson, S.; Rohlf, FJ; Koehn, RK (1985). «Измерение изменения формы двумерных контуров». Систематическая зоология . 34 (1): 59–68. doi : 10.2307/2413345 . JSTOR 2413345 .
- ^ Для примера «Использование», см. Macleod, N.; Роуз, KD (1 января 1993 г.). «Вывод локомоторного поведения у палеогеновых млекопитающих с помощью анализа собственного эйджиша». Американский журнал науки . 293 (а): 300–355. Bibcode : 1993amjs..293..300M . doi : 10.2475/ajs.293.a.300 .
- ^ например Schmittbuhl, M.; Rieger, J.; Le Minor, JM; Schaaf, A.; Гай, Ф. (2007). «Изменения формы нижней челюсти в существующих гоминоидах: общее, специфическое и субспецифическое количественное определение с использованием эллиптического анализа Фурье в боковом взгляде». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 119–31. doi : 10.1002/ajpa.20476 . PMID 17063462 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в Хейнс, AJ; Crampton, JS (2000). «Улучшения метода анализа формы Фурье, применяемых в морфометрических исследованиях». Палеонтология . 43 (4): 765–783. Bibcode : 2000palgy..43..765H . doi : 10.1111/1475-4983.00148 . S2CID 129091685 .
- ^ Zelditch, ML; Swiderski, DL; Простыни, HD; Финк, WL (2004). Геометрическая морфометрия для биологов: праймер . Сан -Диего: Elsevier Academic Press.
- ^ Zelditch, M.; Финк, В. Л; Swiderski, D. L (1995). «Морфометрия, гомология и филогенетика - количественные признаки как синапоморфии». Систематическая биология . 44 (2): 179–189. doi : 10.1093/sysbio/44.2.179 .
- ^ Macleod, Norman (1999). «Обобщение и расширение метода эйгеншапа визуализации и анализа пространства формы». Палеобиология . 25 (1): 107–38. ISSN 1938-5331 . JSTOR 2665995 .
- ^ Wolfram, Stephen (2002). Новый вид науки . Wolfram Media, Inc. с. 1010 . ISBN 978-1-57955-008-0 .
- ^ Парсонс, KJ; Простыни, HD; Skulason, S.; Фергюсон, М.М. (2011). «Фенотипическая пластичность, гетерохронность и онтогенетическое повторение во время ювенильного развития расходящегося арктического чара ( Salvelinus alpinus )» . Журнал эволюционной биологии . 24 (8): 1640–1652. doi : 10.1111/j.1420-9101.2011.02301.x . PMID 21599773 . S2CID 9741179 .
- ^ Холландер, Дж.; Collyer, ML; Адамс, округ Колумбия; Йоханнессон, К. (2006). «Фенотипическая пластичность у двух морских улиток: ограничения заменяют историю жизни» . Журнал эволюционной биологии . 19 (6): 1861–1872. doi : 10.1111/j.1420-9101.2006.01171.x . PMID 17040383 . S2CID 17342939 .
- ^ Гонсалес, Пн; Hallgrimsson, B.; Oyhenart, EE (2011). «Пластичность развития в ковариационной структуре черепа: эффекты пренатального стресса» . Журнал анатомии . 218 (2): 243–257. doi : 10.1111/j.1469-7580.2010.01326.x . PMC 3042757 . PMID 21138433 .
- ^ Монтейро, LR; Nogueira, MR (2009). «Адаптивное излучение, экологическая специализация и эволюционная интеграция сложных морфологических структур» . Эволюция 64 (3): 724–743. doi : 10.1111/j.1558-5646.2009.00857.x . PMID 19804403 . S2CID 5256038 .
- ^ Дрейк, Аг; Клингенберг, CP (2008). «Темпы морфологических изменений: историческая трансформация формы черепа у собак Святого Бернарда» . Труды Королевского общества B: Биологические науки . 275 (1630): 71–76. doi : 10.1098/rspb.2007.1169 . PMC 2562403 . PMID 17956847 .
- ^ Бернер, Д.; Адамс, округ Колумбия; Дедушка, AC; Хендри, AP (2008). «Естественный отбор приводит к моделям дивергенции потока озера в морфологии щипы» . Журнал эволюционной биологии . 21 (6): 1653–1665. doi : 10.1111/j.1420-9101.2008.01583.x . PMID 18691241 . S2CID 11184677 .
- ^ Swiderski, DL; Zelditch, ML (2010). «Морфологическое разнообразие, несмотря на изометрическое масштабирование рычагов». Эволюционная биология . 37 (1): 1–18. Bibcode : 2010evbio..37 .... 1s . doi : 10.1007/s11692-010-9081-8 . S2CID 39484740 .
- ^ Mitteroecker, P.; Gunz, P.; Bookstein, FL (2005). «Гетерохрония и геометрическая морфометрия: сравнение краниального роста в паникусе против троглодита Pan ». Эволюция и развитие . 7 (3): 244–258. Citeseerx 10.1.1.460.8419 . doi : 10.1111/j.1525-142x.2005.05027.x . PMID 15876197 . S2CID 14370905 .
- ^ Фредерих, Б.; Adriaens, D.; Vandewalle, P. (2008). «Онтогенетические изменения формы в Pomacentridae (Teleostei, Perciformes) и их отношения со стратегиями кормления: геометрический морфометрический подход» . Биологический журнал Линневого общества . 95 : 92–105. doi : 10.1111/j.1095-8312.2008.01003.x .
- ^ Zelditch, ML; Простыни, HD; Финк, WL (2003). «Онтогенетическая динамика неравенства формы». Палеобиология . 29 (1): 139–156. Bibcode : 2003pbio ... 29..139Z . doi : 10.1666/0094-8373 (2003) 029 <0139: todosd> 2,0.co; 2 . S2CID 85774503 .
- ^ Hallgrímsson, B.; Браун, JJY; Ford-Hutchinson, AF; Простыни, HD; Zelditch, ML; Джирик, FR (2006). «Мышь брахиморф и основание для развития для канализации и морфологической интеграции» (PDF) . Эволюция и развитие . 8 (1): 61–73. doi : 10.1111/j.1525-142x.2006.05075.x . HDL : 2027.42/71779 . PMID 16409383 . S2CID 42887577 .
- ^ Hallgrímsson, B.; Либерман, де; Лю, W.; Ford-Hutchinson, AF; Джирик, FR (2007). «Эпигенетические взаимодействия и структура фенотипических изменений в черепке» . Эволюция и разработка (представленная рукопись). 9 (1): 76–91. doi : 10.1111/j.1525-142x.2006.00139.x . PMID 17227368 . S2CID 14230925 .
- ^ Клингенберг, CP; Mebus, K.; Auffray, JC (2003). «Интеграция развития в сложной морфологической структуре: насколько различны модули в нижней челюсти мыши?». Эволюция и развитие . 5 (5): 522–531. doi : 10.1046/j.1525-142x.2003.03057.x . PMID 12950630 . S2CID 17447408 .
- ^ Клингенберг, CP; Заклан, С.Д. (2000). «Морфологическая интеграция между компартментами развития в крыле дрозофилы ». Эволюция 54 (4): 1273–1285. doi : 10.1111/j.0014-3820.2000.tb00560.x . PMID 11005294 . S2CID 221539997 .
- ^ Маршалл, Эшли Ф.; Бардуа, Карла; Gower, David J.; Уилкинсон, Марк; Шерратт, Эмма; Госвами, Анджали (2019). «Трехмерный морфометрический анализ высокой плотности подтверждает консервативную статическую (внутривидовую) модульность в крании caecilian (амфибия: гимнофиона)» . Биологический журнал Линневого общества . 126 (4): 721–742. doi : 10.1093/biolinnean/blz001 . HDL : 2440/123277 .
- ^ Revell PA (декабрь 1983 г.). «Гистоморфометрия кости» . J. Clin. Патоль 36 (12): 1323–31. doi : 10.1136/jcp.36.12.1323 . PMC 498562 . PMID 6361070 .
- ^ Ходжсон SF; Джонсон, Ка; Muhs, JM; Луфкин, например; Маккарти, JT (январь 1986 г.). «Амбулаторная чрескожная биопсия подвздошного гребня: методы, заболеваемость и принятие пациентов». Mayo Clin Proc . 61 (1): 28–33. doi : 10.1016/s0025-6196 (12) 61395-0 . PMID 3941566 .
Библиография
[ редактировать ]- Адамс, Дин С.; Майкл Л. Коллиер (2009). «Общая структура для анализа фенотипических траекторий в эволюционных исследованиях». Эволюция 63 (5): 1143–1154. doi : 10.1111/j.1558-5646.2009.00649.x . PMID 19210539 . S2CID 1873905 .
- Bookstein, Fred (1991). Морфометрические инструменты для знаковых данных: геометрия и биология . Кембридж: издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-58598-9 .
- Кадрин, Стивен X. (2000). «Достижения в морфометрической идентификации рыболовных запасов». Отзывы о биологии рыб и рыболовства . 10 : 91–112. doi : 10.1023/a: 10089391044413 . S2CID 25658507 .
- Elewa, Amt, ed. (2004). Морфометрия: применение в области биологии и палеонтологии . Берлин: Спрингер. ISBN 978-3-540-21429-8 .
- Клингенберг, CP; Na Gidaszewski (2010). «Тестирование и количественное определение филогенетических сигналов и гомоплазии в морфометрических данных» . Систематическая биология . 59 (3): 245–261. doi : 10.1093/sysbio/syp106 . PMID 20525633 .
- Маклеллан, Трейси; Эндлер, Джон А. (1998). «Относительный успех некоторых методов измерения и описания формы сложных объектов» . Систематическая биология . 47 (2): 264–81. doi : 10.1080/106351598260914 . HDL : 10536/dro/du: 30094507 . ISSN 1076-836X . JSTOR 2585371 .
- Rohlf, FJ; D. Slice (1990). «Расширение метода Procrustes для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 10 (39): 40–59. Citeseerx 10.1.1.547.626 . doi : 10.2307/2992207 . JSTOR 2992207 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
- Дикинсон, Т.А. (2001). «Морфометрические методы» . Архивировано из оригинала 2020-02-22 . Получено 2016-10-09 .
- ПРОШЛОЕ
- Форма - эллиптические дескрипторы Фурье
- Морфометрическое программное обеспечение - архив многих различных типов программного обеспечения для использования в морфометрии - особенно геометрической морфометрии.