Линейный эпитоп
В иммунологии линейный эпитоп (также последовательный эпитоп ) представляет собой эпитоп — участок связывания антигена — который распознается антителами по линейной последовательности аминокислот (т. е. первичной структуре ). Напротив, большинство антител распознают конформационный эпитоп , имеющий специфическую трехмерную форму ( третическую структуру ).
Антиген – это любое вещество, которое иммунная система может распознать как чужеродное и которое вызывает иммунный ответ . Поскольку антигены обычно представляют собой белки, которые слишком велики, чтобы полностью связываться с каким-либо рецептором , только определенные сегменты, образующие антиген, связываются со специфическим антителом. Такие сегменты называются эпитопами . Аналогично, только паратоп антитела контактирует с эпитопом.
Белки состоят из повторяющихся азотсодержащих субъединиц, называемых аминокислотами . Линейная последовательность аминокислот, составляющих белок, называется его первичной структурой , которая обычно не представляет собой простую линию последовательных белков (больше похожую на узел, чем на прямую нить). Но когда антиген расщепляется в лизосоме , он образует небольшие пептиды , которые можно распознать по аминокислотам, расположенным непрерывно в линии и, следовательно, называемым линейными эпитопами . [1]
Значение
[ редактировать ]При проведении молекулярных анализов с использованием антител, таких как вестерн-блоттинг , иммуногистохимия и ELISA , следует тщательно выбирать антитела, которые распознают линейные или конформационные эпитопы. [2] [3] [4]
Например, если образец белка кипятят, обрабатывают бета-меркаптоэтанолом и проводят в SDS-PAGE для вестерн-блоттинга, белки существенно денатурируются и, следовательно, не могут принять свои естественные трехмерные конформации. Поэтому для иммунодетекции выбирают антитела, которые распознают линейные эпитопы, а не конформационные. Напротив, в иммуногистохимии, где структура белка сохраняется, предпочтительны антитела, распознающие конформационные эпитопы.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Голдсби, Ричард; Киндт, Ти Джей; Осборн, бакалавр; Янис Куби (2003). «Антигены (глава 3)» . Иммунология (Пятое изд.). Нью-Йорк: WH Freeman and Company. стр. 57–75 . ISBN 0716749475 .
- ^ «EMD - Calbiochem: Технические советы/иммунохимические применения» . Архивировано из оригинала 11 апреля 2008 г. Проверено 6 мая 2008 г.
- ^ Ахмад, Т.А.; Эвейда, А; Шевейта, Ю.А. (2016). «Картирование эпитопов В-клеток для разработки вакцин и эффективной диагностики» . Исследования в вакцинологии . 5 : 71–83. дои : 10.1016/j.trivac.2016.04.003 .
- ^ Ахмад, Т.А.; Эвейда, А; Эль-Сайед, Л.Х. (2016). «Картирование эпитопов Т-клеток для разработки мощных вакцин» . Отчеты о вакцинах . 6 : 13–22. дои : 10.1016/j.vacrep.2016.07.002 .