C2orf16

C2orf16
Идентификаторы
Псевдонимы	C2orf16 , хромосома 2, открытая рамка считывания 16
Внешние идентификаторы	Гомологен : 82476 ; Генные карты : C2orf16 ; OMA : C2orf16 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 2 (human)
End	27,582,720 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	sperm; ; right testis; ; left testis; ; stromal cell of endometrium; ; muscle tissue; ; ganglionic eminence; ; islet of Langerhans; ; ventricular zone; ; right lobe of liver; ; right adrenal cortex;
	n/a
	More reference expression data
	n/a
hideОртологи
	84226
	102635566
	ENSG00000221843
	н/д
	Q68DN1
	н/д
	НМ_032266
	XM_017321194
	НП_115642
	н/д
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

C2orf16 — это белок, который у человека кодируется геном C2orf16. Изоформа 2 этого белка (NCBI ID: CAH18189.1 ^{[ 4 ]} (далее именуемый C2orf16) имеет длину 1984 аминокислоты. ^{[ 5 ]} Ген содержит 1 экзон и расположен по адресу 2p23.3. ^{[ 6 ]} Псевдонимы C2orf16 включают открытую рамку считывания 16 на хромосоме 2 и повторы PSERSHHS, содержащие последовательность. ^{[ 7 ]}

68 ортологов Известно этого гена, в том числе у мышей и овец, но паралогов не обнаружено. ^{[ 8 ]}

Ген

Изоформа 2 C2orf16 представляет собой ген размером 6,2 т.п.н., 1 экзон в локусе 2p23.3 и содержит повторы PSERSHHS на С-концевой стороне гена от аминокислот с 1559 по 1903. Эти повторы, по-видимому, возникли из- за мобильного элемента . У приматов обнаружено больше повторов PSERSHHS, чем у других ортологов млекопитающих . ^{[ 6 ]}

Выражение

Обнаружено, что C2orf16 высоко экспрессируется в семенниках. ^{[ 9 ]} и ретиноевой кислотой и митогеном , обработанную линию эмбриональных стволовых клеток человека , ^{[ 10 ]} но неизвестно, будет ли оно по-разному выражаться в зависимости от возраста или фенотипа заболевания . ^{[ 11 ]} Также видно, что C2orf16 имеет высокую экспрессию в предимплантационном эмбрионе от стадии 4-клеточного эмбриона до стадии бластоцисты . ^{[ 12 ]}

Не обнаружено экспрессии C2orf16, чувствительной к рапамицину . ^{[ 13 ]} Также замечено, что C2orf16 значительно увеличивает экспрессию в клетках рака молочной железы с нокдауном c-MYC . ^{[ 14 ]}

мРНК

Изоформы

Существуют две изоформы C2orf16. Изоформа 1 состоит из 5388 аминокислот, кодируемых в 5 экзонах длиной более 16 401 пары оснований . Изоформа 2 использует альтернативный сайт начала транскрипции и значительно короче: 1984 аминокислоты, длина которых кодируется в 1 экзоне более 6200 пар оснований. ^{[ 8 ]}

Регуляция экспрессии

одна микроРНК Предполагается, что будет связываться с 3'UTR C2orf16, номер доступа MI0005564. ^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Белок

C2orf16 имеет прогнозируемую молекулярную массу 224 кДа и прогнозируемую изоэлектрическую точку 10,08. ^{[ 17 ]} значения, которые относительно постоянны между ортологами. Белок включает в себя содержание серина, гистидина и аргинина выше среднего и содержание аланина ниже среднего. ^{[ 18 ]}

Композиционные особенности

Кластер положительного заряда обнаруживается в аминокислотных остатках с 1274 по 1302. ^{[ 18 ]}

Богатая аргинином богатая область обнаруживается в аминокислотах с 1545 по 1933, богатая серином область обнаруживается в аминокислотах с 1568 по 1934, а гистидином область обнаруживается в аминокислотах с 1630 по 1853. ^{[ 18 ]}

Матричный анализ ^{[ 19 ]} обнаруживает сильно повторяющуюся область примерно от остатка 1500 до 1984, это повтор PSERSHHS. небольшая полоска точек примерно у аминокислоты 1200 обозначает половину повтора последовательности PSERSHHS.

Изоформа 2 C2orf16 не имеет трансмембранных доменов . ^{[ 20 ]} и, как ожидается, будет локализован в ядре после трансляции благодаря двум последовательностям ядерной локализации, предсказанным в остатках 1233 и 1281. ^{[ 21 ]} Среди ортологов не последовательность ядерного экспорта . сохраняется ^{[ 22 ]} предполагая, что C2orf16 не должен покидать ядро после импорта. Никаких N- или C-концевых модификаций не было предсказано. ^{[ 23 ]}^{[ 24 ]}^{[ 25 ]}^{[ 26 ]}

Субклеточная локализация

Предполагается, что C2orf16 после транскрипции локализуется в ядре. ^{[ 8 ]}

Структура

Предполагается, что трехмерная структура C2orf16 будет состоять из трех основных доменов. Домен 1 состоит из аминокислот с 1 по 662, домен 2 состоит из аминокислот с 674 по 1487, а домен 3 состоит из аминокислот с 1488 по 1984. ^{[ 27 ]} Предполагается, что домены 1 и 2 связаны посредством участка из 12 аминокислот, иначе не организованных во вторичную структуру, обеспечивающую гибкость между доменами 1 и 2. Предполагается, что домен 2 будет иметь взаимодействующие с белками домены для факторов транскрипции . ^{[ 27 ]} Предполагается, что домен 3 будет следовать структуре «шарики на веревке». ^{[ 27 ]} и имеет множество сайтов возможного фосфорилирования. ^{[ 28 ]}

Белковые взаимодействия

Было показано, что C2orf16 физически взаимодействует с протоонкогеном Myc посредством тандемной аффинной очистки . ^{[ 29 ]}

Ортологическая филогения

Для C2orf16 известно 68 ортологов. ^{[ 8 ]} Этот белок, по-видимому, появился в истории эволюции млекопитающих 320 миллионов лет назад, во время отделения млекопитающих от рептилий. Эта история могла бы объяснить, почему ортологи не существуют у амфибий , рептилий , птиц и других более отдаленно родственных видов. ^{[ 30 ]}

Любые ортологи видов, более отдаленных от человека, чем от других млекопитающих, вероятно, не связаны по функциям, однако повтор PSERSHHS присутствует у костных рыб , ракообразных , страменопилезов, включая фитофтороз картофеля , растений и прокариот . ^{[ 30 ]}

мог Повтор транспозона быть повторно введен млекопитающим с помощью вирусного вектора .

Повторить последовательность

Логотип повторной последовательности PSERSHHS

Последовательность повторов PSERSHHS консервативна в ортологах C2orf16 и сохраняется в столь отдаленных родственных организмах, как оомицетовая слизевиковая плесень. ^{[ 31 ]} и растения, включая хлоропласты плетня Эшби . ^{[ 32 ]} Часть повтора SPSER считается наиболее важной для сохранения, о чем свидетельствует согласование с этими ортологами и создание логотипа. ^{[ 33 ]}

Консервативный анализ повтора показывает, что исходный SPS высококонсервативен, возможно, в отношении фосфорилирования (S) и структуры (P), а R почти полностью консервативен, мутируя в лизин в некоторых ортологах. ^{[ 32 ]} подразумевая, что положительный заряд необходим для повторения.

Трехмерная форма повторяющейся последовательности неясна, поскольку было предсказано, что это либо шарики на веревке, либо шарики на веревке. ^{[ 34 ]} или антипараллельный бета-лист ^{[ 6 ]} структура.

Функция

Предполагается, что изоформа 2 C2orf16 может участвовать в регуляции митоза благодаря своей ядерной локализации. ^{[ 8 ]}^{[ 21 ]} предсказанный сайт связывания фактора транскрипции, ^{[ 27 ]} физическая связь с Myc , ^{[ 29 ]} и повышенная экспрессия в клетках рака молочной железы с нокдауном c-MYC. ^{[ 14 ]}

Клиническое значение

На C2orf16 зарегистрировано четыре патента, каждый из которых касается: раковых PPP2RIA и ARID1A , мутаций ^{[ 35 ]} предрасположенность к болезни Альцгеймера , ^{[ 36 ]} вирусных вакцин , разнообразие ^{[ 37 ]} и связь вариаций числа копий с общим вариабельным иммунодефицитом . ^{[ 38 ]} Также показано, что C2orf16 имеет повышенную экспрессию в некоторых линиях рака молочной железы. ^{[ 14 ]} а также участие в Myc ^{[ 29 ]} который является распространенным онкогеном , что делает C2orf16 возможным онкогеном, на который можно воздействовать при лечении рака.

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000221843 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «гипотетический белок [Homo sapiens] – Белок – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.
^ «Ген C2orf16» . База данных генов человека GeneCards . Научный институт Вейцмана, Науки о картах жизни . Проверено 5 февраля 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с «C2orf16 - Неохарактеризованный белок C2orf16 - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок C2orf16» . www.uniprot.org . Проверено 2 мая 2019 г.
^ «Ген C2orf16» . База данных генов человека GeneCards . Научный институт Вейцмана, Науки о картах жизни . Проверено 5 февраля 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Зербино Д.Р., Ачутан П., Аканни В., Амоде М.Р., Баррелл Д., Бхаи Дж. и др. (январь 2018 г.). «Ансамбль 2018» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д754–Д761. дои : 10.1093/нар/gkx1098 . ПМК 5753206 . ПМИД 29155950 .
^ Джонсон Дж. М., Касл Дж., Гарретт-Энгеле П., Кан З., Лёрч П. М., Armor CD, Сантос Р., Шадт Э., Стоутон Р., Шумейкер Д. Д. (декабрь 2003 г.). «Полногеномное исследование альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов экзонных соединений». Наука . 302 (5653): 2141–4. Бибкод : 2003Sci...302.2141J . дои : 10.1126/science.1090100 . ПМИД 14684825 . S2CID 10007258 .
^ «Ген C2orf16 человека разумного, кодирующий открытую рамку считывания 16 хромосомы 2» . ЭйсВью . NCBI Национальный институт здравоохранения . Проверено 5 февраля 2019 г.
^ «Профиль EST – Hs.131021» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Се Д., Чен CC, Пташек Л.М., Сяо С., Цао X, Фанг Ф, Нг Х.Х., Левин Х.А., Коуэн С., Чжун С. (июнь 2010 г.). «Перестраиваемые генные регуляторные сети в предимплантационном эмбриональном развитии трех видов млекопитающих» . Геномные исследования . 20 (6): 804–15. дои : 10.1101/гр.100594.109 . ПМЦ 2877577 . ПМИД 20219939 .
^ Петрич А.М., Лещенко В., Куо П.Ю., Ся Б., Тируконда В.К., Улаханнан Н., Гордон С., Фаззари М.Дж., Йе Б.Х., Спарано Дж.А., Парех С. (май 2012 г.). «Ингибиторы Akt МК-2206 и нелфинавир преодолевают резистентность к ингибитору mTOR при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме» . Клинические исследования рака . 18 (9): 2534–44. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-11-1407 . ПМЦ 3889476 . ПМИД 22338016 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Каппеллен Д., Шланге Т., Бауэр М., Маурер Ф., Хайнс Н.Е. (январь 2007 г.). «Новые гены-мишени c-MYC опосредуют различное воздействие на пролиферацию и миграцию клеток» . Отчеты ЭМБО . 8 (1): 70–6. дои : 10.1038/sj.embor.7400849 . ПМЦ 1796762 . ПМИД 17159920 .
^ Агарвал В., Белл Г.В., Нам Дж.В., Бартель Д.П. (август 2015 г.). Изаурральде Э (ред.). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих» . электронная жизнь . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ПМЦ 4532895 . ПМИД 26267216 .
^ «Запись микроРНК для MI0005564» . www.mirbase.org . Архивировано из оригинала 23 сентября 2020 г. Проверено 5 мая 2019 г.
^ «ExPASy – инструмент расчета pi/Mw» . web.expasy.org . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Мадейра Ф., Пак Ю.М., Ли Дж., Бусо Н., Гур Т., Мадхусуданан Н., Басуткар П., Тиви А.Р., Поттер СК, Финн Р.Д., Лопес Р. (апрель 2019 г.). «API-интерфейсы инструментов поиска и анализа последовательностей EMBL-EBI в 2019 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (П1): W636–W641. дои : 10.1093/nar/gkz268 . ПМК 6602479 . ПМИД 30976793 .
^ «ЭМБОСС: сопоставление точек» . www.bioinformatics.nl . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Черзо М., Эйзенхабер Ф., Эйзенхабер Б., Саймон I (сентябрь 2002 г.). «О фильтрации ложноположительных предсказаний трансмембранных белков» . Белковая инженерия . 15 (9): 745–52. дои : 10.1093/протеин/15.9.745 . ПМИД 12456873 .
^ Jump up to: ^а ^б Сигрист С.Дж., Черутти Л., де Кастро Э., Лангендейк-Женево П.С., Буллиард В., Байрох А., Хуло Н. (январь 2010 г.). «PROSITE, база данных белковых доменов для функциональной характеристики и аннотации» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (Проблема с базой данных): D161-6. дои : 10.1093/nar/gkp885 . ПМК 2808866 . ПМИД 19858104 .
^ ла Кур Т., Кимер Л., Мёлгаард А., Гупта Р., Скривер К., Брунак С. (июнь 2004 г.). «Анализ и прогноз сигналов ядерного экспорта, богатых лейцином» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 17 (6): 527–36. дои : 10.1093/протеин/gzh062 . ПМИД 15314210 .
^ Кимер Л., Бендцен Дж.Д., Блом Н. (апрель 2005 г.). «NetAcet: предсказание сайтов N-концевого ацетилирования» . Биоинформатика . 21 (7): 1269–70. doi : 10.1093/биоинформатика/bti130 . ПМИД 15539450 .
^ Болонья Г., Ивон С., Дюво С., Вьети А.Л. (июнь 2004 г.). «Прогнозирование N-концевого миристоилирования ансамблями нейронных сетей». Протеомика . 4 (6): 1626–32. дои : 10.1002/pmic.200300783 . ПМИД 15174132 . S2CID 20289352 .
^ Чуанг Г.И., Бойингтон Дж.К., Джойс М.Г., Чжу Дж., Набель Г.Дж., Квонг П.Д., Георгиев И. (сентябрь 2012 г.). «Вычислительное предсказание N-связанного гликозилирования с учетом структурных свойств и закономерностей» . Биоинформатика . 28 (17): 2249–55. doi : 10.1093/биоинформатика/bts426 . ПМЦ 3426846 . ПМИД 22782545 .
^ Юлениус К. (август 2007 г.). «NetCGlyc 1.0: предсказание сайтов C-маннозилирования млекопитающих» . Гликобиология . 17 (8): 868–76. дои : 10.1093/гликоб/cwm050 . ПМИД 17494086 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ян Дж, Чжан Ю (июль 2015 г.). «Сервер I-TASSER: новая разработка для прогнозирования структуры и функций белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (П1): В174–81. дои : 10.1093/нар/gkv342 . ПМЦ 4489253 . ПМИД 25883148 .
^ Блом Н., Гаммельтофт С., Брунак С. (декабрь 1999 г.). «Предсказание на основе последовательности и структуры сайтов фосфорилирования эукариотических белков». Журнал молекулярной биологии . 294 (5): 1351–62. дои : 10.1006/jmbi.1999.3310 . ПМИД 10600390 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с «ПСИКИКВИД» . www.ebi.ac.uk. Проверено 2 мая 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б Мэдден, Том (13 августа 2003 г.). Инструмент анализа последовательности BLAST . Национальный центр биотехнологической информации (США).
^ «Предшественник белка-предшественника кислого повтора, специфичного для прорастания кисты [Phytophthora infestans]» . НКБИ . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Jump up to: ^а ^б «accD (хлоропласт) [Acacia ashbyae] – Белок – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.
^ «WebLogo — создание последовательных логотипов» . weblogo.berkeley.edu . Проверено 2 мая 2019 г.
^ Чжан Ю (январь 2008 г.). «Сервер I-TASSER для прогнозирования 3D-структуры белков» . БМК Биоинформатика . 9 (1): 40. дои : 10.1186/1471-2105-9-40 . ПМК 2245901 . ПМИД 18215316 .
^ US 9982304 , Фогельштейн, Берт; Кинзлер, Кеннет В.; Велкулеску, Виктор; Пападопулос, Николас; Джонс, Сиан, «Мутации ARID1A и PPP2R1A при раке», опубликовано 29 мая 2018 г.
^ США 9944986 , Надь, Жужанна, «Терапевтические мишени для лечения болезни Альцгеймера», опубликовано 29 мая 2018 г.
^ США 9439960 , Шенк, Томас и Ван Дай, «Цитомегаловирусные вакцины и способы производства», опубликовано 13 сентября 2016 г.
^ US 9109254 , Хаконарсон, Хакон; Глесснер, Джозеф; Оранж, Иордания, опубликовано 1 августа 2015 г.

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Ensembl выпуск 89: ENSG00000221843 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «гипотетический белок [Homo sapiens] – Белок – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.

[5] «Ген C2orf16» . База данных генов человека GeneCards . Научный институт Вейцмана, Науки о картах жизни . Проверено 5 февраля 2019 г.

[:1-6] Jump up to: ^а ^б ^с «C2orf16 - Неохарактеризованный белок C2orf16 - Homo sapiens (Человек) - Ген и белок C2orf16» . www.uniprot.org . Проверено 2 мая 2019 г.

[7] «Ген C2orf16» . База данных генов человека GeneCards . Научный институт Вейцмана, Науки о картах жизни . Проверено 5 февраля 2019 г.

[:2-8] Jump up to: ^а ^б ^с ^д ^и Зербино Д.Р., Ачутан П., Аканни В., Амоде М.Р., Баррелл Д., Бхаи Дж. и др. (январь 2018 г.). «Ансамбль 2018» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д754–Д761. дои : 10.1093/нар/gkx1098 . ПМК 5753206 . ПМИД 29155950 .

[9] Джонсон Дж. М., Касл Дж., Гарретт-Энгеле П., Кан З., Лёрч П. М., Armor CD, Сантос Р., Шадт Э., Стоутон Р., Шумейкер Д. Д. (декабрь 2003 г.). «Полногеномное исследование альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов экзонных соединений». Наука . 302 (5653): 2141–4. Бибкод : 2003Sci...302.2141J . дои : 10.1126/science.1090100 . ПМИД 14684825 . S2CID 10007258 .

[10] «Ген C2orf16 человека разумного, кодирующий открытую рамку считывания 16 хромосомы 2» . ЭйсВью . NCBI Национальный институт здравоохранения . Проверено 5 февраля 2019 г.

[11] «Профиль EST – Hs.131021» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.

[12] Се Д., Чен CC, Пташек Л.М., Сяо С., Цао X, Фанг Ф, Нг Х.Х., Левин Х.А., Коуэн С., Чжун С. (июнь 2010 г.). «Перестраиваемые генные регуляторные сети в предимплантационном эмбриональном развитии трех видов млекопитающих» . Геномные исследования . 20 (6): 804–15. дои : 10.1101/гр.100594.109 . ПМЦ 2877577 . ПМИД 20219939 .

[13] Петрич А.М., Лещенко В., Куо П.Ю., Ся Б., Тируконда В.К., Улаханнан Н., Гордон С., Фаззари М.Дж., Йе Б.Х., Спарано Дж.А., Парех С. (май 2012 г.). «Ингибиторы Akt МК-2206 и нелфинавир преодолевают резистентность к ингибитору mTOR при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме» . Клинические исследования рака . 18 (9): 2534–44. дои : 10.1158/1078-0432.CCR-11-1407 . ПМЦ 3889476 . ПМИД 22338016 .

[:3-14] Jump up to: ^а ^б ^с Каппеллен Д., Шланге Т., Бауэр М., Маурер Ф., Хайнс Н.Е. (январь 2007 г.). «Новые гены-мишени c-MYC опосредуют различное воздействие на пролиферацию и миграцию клеток» . Отчеты ЭМБО . 8 (1): 70–6. дои : 10.1038/sj.embor.7400849 . ПМЦ 1796762 . ПМИД 17159920 .

[15] Агарвал В., Белл Г.В., Нам Дж.В., Бартель Д.П. (август 2015 г.). Изаурральде Э (ред.). «Прогнозирование эффективных целевых участков микроРНК в мРНК млекопитающих» . электронная жизнь . 4 : e05005. doi : 10.7554/eLife.05005 . ПМЦ 4532895 . ПМИД 26267216 .

[16] «Запись микроРНК для MI0005564» . www.mirbase.org . Архивировано из оригинала 23 сентября 2020 г. Проверено 5 мая 2019 г.

[17] «ExPASy – инструмент расчета pi/Mw» . web.expasy.org . Проверено 2 мая 2019 г.

[:4-18] Jump up to: ^а ^б ^с Мадейра Ф., Пак Ю.М., Ли Дж., Бусо Н., Гур Т., Мадхусуданан Н., Басуткар П., Тиви А.Р., Поттер СК, Финн Р.Д., Лопес Р. (апрель 2019 г.). «API-интерфейсы инструментов поиска и анализа последовательностей EMBL-EBI в 2019 году» . Исследования нуклеиновых кислот . 47 (П1): W636–W641. дои : 10.1093/nar/gkz268 . ПМК 6602479 . ПМИД 30976793 .

[19] «ЭМБОСС: сопоставление точек» . www.bioinformatics.nl . Проверено 2 мая 2019 г.

[20] Черзо М., Эйзенхабер Ф., Эйзенхабер Б., Саймон I (сентябрь 2002 г.). «О фильтрации ложноположительных предсказаний трансмембранных белков» . Белковая инженерия . 15 (9): 745–52. дои : 10.1093/протеин/15.9.745 . ПМИД 12456873 .

[:5-21] Jump up to: ^а ^б Сигрист С.Дж., Черутти Л., де Кастро Э., Лангендейк-Женево П.С., Буллиард В., Байрох А., Хуло Н. (январь 2010 г.). «PROSITE, база данных белковых доменов для функциональной характеристики и аннотации» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (Проблема с базой данных): D161-6. дои : 10.1093/nar/gkp885 . ПМК 2808866 . ПМИД 19858104 .

[22] ла Кур Т., Кимер Л., Мёлгаард А., Гупта Р., Скривер К., Брунак С. (июнь 2004 г.). «Анализ и прогноз сигналов ядерного экспорта, богатых лейцином» . Белковая инженерия, проектирование и отбор . 17 (6): 527–36. дои : 10.1093/протеин/gzh062 . ПМИД 15314210 .

[23] Кимер Л., Бендцен Дж.Д., Блом Н. (апрель 2005 г.). «NetAcet: предсказание сайтов N-концевого ацетилирования» . Биоинформатика . 21 (7): 1269–70. doi : 10.1093/биоинформатика/bti130 . ПМИД 15539450 .

[24] Болонья Г., Ивон С., Дюво С., Вьети А.Л. (июнь 2004 г.). «Прогнозирование N-концевого миристоилирования ансамблями нейронных сетей». Протеомика . 4 (6): 1626–32. дои : 10.1002/pmic.200300783 . ПМИД 15174132 . S2CID 20289352 .

[25] Чуанг Г.И., Бойингтон Дж.К., Джойс М.Г., Чжу Дж., Набель Г.Дж., Квонг П.Д., Георгиев И. (сентябрь 2012 г.). «Вычислительное предсказание N-связанного гликозилирования с учетом структурных свойств и закономерностей» . Биоинформатика . 28 (17): 2249–55. doi : 10.1093/биоинформатика/bts426 . ПМЦ 3426846 . ПМИД 22782545 .

[26] Юлениус К. (август 2007 г.). «NetCGlyc 1.0: предсказание сайтов C-маннозилирования млекопитающих» . Гликобиология . 17 (8): 868–76. дои : 10.1093/гликоб/cwm050 . ПМИД 17494086 .

[:6-27] Jump up to: ^а ^б ^с ^д Ян Дж, Чжан Ю (июль 2015 г.). «Сервер I-TASSER: новая разработка для прогнозирования структуры и функций белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 43 (П1): В174–81. дои : 10.1093/нар/gkv342 . ПМЦ 4489253 . ПМИД 25883148 .

[28] Блом Н., Гаммельтофт С., Брунак С. (декабрь 1999 г.). «Предсказание на основе последовательности и структуры сайтов фосфорилирования эукариотических белков». Журнал молекулярной биологии . 294 (5): 1351–62. дои : 10.1006/jmbi.1999.3310 . ПМИД 10600390 .

[:7-29] Jump up to: ^а ^б ^с «ПСИКИКВИД» . www.ebi.ac.uk. Проверено 2 мая 2019 г.

[:8-30] Jump up to: ^а ^б Мэдден, Том (13 августа 2003 г.). Инструмент анализа последовательности BLAST . Национальный центр биотехнологической информации (США).

[31] «Предшественник белка-предшественника кислого повтора, специфичного для прорастания кисты [Phytophthora infestans]» . НКБИ . Проверено 2 мая 2019 г.

[:0-32] Jump up to: ^а ^б «accD (хлоропласт) [Acacia ashbyae] – Белок – NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 2 мая 2019 г.

[33] «WebLogo — создание последовательных логотипов» . weblogo.berkeley.edu . Проверено 2 мая 2019 г.

[34] Чжан Ю (январь 2008 г.). «Сервер I-TASSER для прогнозирования 3D-структуры белков» . БМК Биоинформатика . 9 (1): 40. дои : 10.1186/1471-2105-9-40 . ПМК 2245901 . ПМИД 18215316 .

[35] US 9982304 , Фогельштейн, Берт; Кинзлер, Кеннет В.; Велкулеску, Виктор; Пападопулос, Николас; Джонс, Сиан, «Мутации ARID1A и PPP2R1A при раке», опубликовано 29 мая 2018 г.

[36] США 9944986 , Надь, Жужанна, «Терапевтические мишени для лечения болезни Альцгеймера», опубликовано 29 мая 2018 г.

[37] США 9439960 , Шенк, Томас и Ван Дай, «Цитомегаловирусные вакцины и способы производства», опубликовано 13 сентября 2016 г.

[38] US 9109254 , Хаконарсон, Хакон; Глесснер, Джозеф; Оранж, Иордания, опубликовано 1 августа 2015 г.

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

[ 23 ]

[ 24 ]

[ 25 ]

[ 26 ]

[ 27 ]

[ 28 ]

[ 29 ]

[ 30 ]

[ 31 ]

[ 32 ]

[ 33 ]

[ 34 ]

[ 35 ]

[ 36 ]

[ 37 ]

[ 38 ]