Белок, инактивирующий рибосомы
| Белок, инактивирующий рибосомы | |||
|---|---|---|---|
 Структура противовирусного белка покевида. [1] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | РВАТЬ | ||
| Пфам | PF00161 | ||
| ИнтерПро | ИПР001574 | ||
| PROSITE | PDOC00248 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1паф / СКОПе / СУПФАМ | ||
| |||
Белок , инактивирующий рибосомы ( RIP ), представляет собой ингибитор синтеза белка , который действует на эукариот рибосому . [2] Это семейство белков описывает большое семейство таких белков, которые действуют как N-гликозилаза рРНК (EC 3.2.2.22). высвобождается специфическое адениновое Они инактивируют субъединицы рибосомы 60S путем N-гликозидного расщепления, в результате чего из сахарофосфатного остова 28S рРНК основание . [3] [4] [5] RIP существуют у бактерий и растений. [6]
Члены этого семейства включают шига-токсины , типа I (например, трихосантин и люффин ) и типа II (например, рицин , агглютинин и абрин , а также белки, инактивирующие рибосомы (RIP) ). Все эти токсины структурно родственны. RIPs представляют значительный интерес из-за их потенциального использования, конъюгированного с моноклональными антителами , в качестве иммунотоксинов для лечения рака. Кроме того, трихосантин было показано, что обладает мощной активностью против ВИЧ-1 -инфицированных Т-клеток и макрофагов . [7] Таким образом, выяснение структурно-функциональных отношений RIP стало серьезной исследовательской задачей. Теперь известно, что RIP структурно связаны. Консервативный глутаминовый остаток участвует в каталитическом механизме; [8] это находится рядом с консервативным остатком аргинина , который также играет роль в катализе. [9]
Лишь небольшая часть RIP токсичны для человека при употреблении, а белки этого семейства обнаруживаются в подавляющем большинстве растений, используемых в пищу человеком, таких как рис, кукуруза и ячмень. Считается, что у растений они защищают от патогенов и насекомых. [10]
Классификация
[ редактировать ]Белки, инактивирующие рибосомы (RIP), подразделяются на следующие типы в зависимости от состава белковых доменов: [11]
- Тип I (А): RIP-I представляют собой полипептиды, состоящие из домена А. Это место активности N-гликозидазы.
- Тип II (AB): RIP-II состоят из домена A с каталитической активностью, аналогичной RIP типа I, и домена B со свойствами связывания углеводов (лектинов). Домен B способен связывать галактозильные фрагменты на поверхности клетки, что облегчает проникновение в клетку, что делает тип II особенно цитотоксичным. Домены А и В соединены дисульфидными связями. [11] [12] В эту группу не входят бактериальные токсины AB5 , такие как шига-токсин, поскольку способность связывать углеводы развивалась отдельно, и эти токсины больше похожи на RIP типа I. [11]
- Тип III: RIP-III разделены на две подгруппы. Одна подгруппа (AC) содержит тот же исходный домен RIP (A) и C-терминал с неизвестной функциональностью. Другая подгруппа (AD) аналогична типу I, но содержит сайт инактивации. [11]
Примеры
[ редактировать ]Примеры включают в себя:
- Абрин
- Беатин
- Рицин
- Сапорин
- Введите токсин
- спироплазмы Токсин [13]
- Трихосантин
- Вискумин ( омела европейская )
- Противовирусный белок рябины ( Phytolacca americana ) [14]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Монзинго А.Ф., Коллинз Э.Дж., Эрнст С.Р., Ирвин Дж.Д., Робертус Дж.Д. (октябрь 1993 г.). «Структура 2,5 А противовирусного белка покевида». Журнал молекулярной биологии . 233 (4): 705–15. дои : 10.1006/jmbi.1993.1547 . ПМИД 8411176 .
- ^ Рибосома + инактивация + белки Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
- ^ Эндо Й., Цуруги К., Юцудо Т., Такеда Й., Огасавара Т., Игараси К. (январь 1988 г.). «Место действия токсина Веро (VT2) из Escherichia coli O157:H7 и токсина Шига на эукариотические рибосомы. РНК-N-гликозидазная активность токсинов» . Европейский журнал биохимии . 171 (1–2): 45–50. дои : 10.1111/j.1432-1033.1988.tb13756.x . ПМИД 3276522 .
- ^ Мэй М.Дж., Хартли М.Р., Робертс Л.М., Криг П.А., Осборн Р.В., Лорд Дж.М. (январь 1989 г.). «Инактивация рибосом цепью А рицина: чувствительный метод оценки активности полипептидов дикого типа и мутантных полипептидов» . Журнал ЭМБО . 8 (1): 301–8. дои : 10.1002/j.1460-2075.1989.tb03377.x . ПМК 400803 . ПМИД 2714255 .
- ^ Фунацу Г., Ислам М.Р., Минами Ю., Сунг-Сил К., Кимура М. (1991). «Консервативные аминокислотные остатки в инактивирующих рибосомы белках растений». Биохимия . 73 (7–8): 1157–61. дои : 10.1016/0300-9084(91)90160-3 . ПМИД 1742358 .
- ^ Мак А.Н., Вонг Ю.Т., Ан Ю.Дж., Ча С.С., Сзе К.Х., Ау С.В. и др. (2007). «Исследование структуры и функции белка, инактивирующего рибосомы кукурузы: значение для внутренней области инактивации и единственного глутамата в активном центре» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (18): 6259–67. дои : 10.1093/нар/gkm687 . ПМК 2094058 . ПМИД 17855394 .
- ^ Чжоу К., Фу З., Чен М., Линь Ю., Пан К. (май 1994 г.). «Структура трихозантина при разрешении 1,88 А». Белки . 19 (1): 4–13. дои : 10.1002/прот.340190103 . ПМИД 8066085 . S2CID 21524411 .
- ^ Ховде С.Дж., Колдервуд С.Б., Мекаланос Дж.Дж., Коллиер Р.Дж. (апрель 1988 г.). «Доказательства того, что глутаминовая кислота 167 является остатком активного центра шигаподобного токсина I» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 85 (8): 2568–72. Бибкод : 1988PNAS...85.2568H . дои : 10.1073/pnas.85.8.2568 . ПМК 280038 . ПМИД 3357883 .
- ^ Монзинго А.Ф., Коллинз Э.Дж., Эрнст С.Р., Ирвин Дж.Д., Робертус Дж.Д. (октябрь 1993 г.). «Структура 2,5 А противовирусного белка покевида». Журнал молекулярной биологии . 233 (4): 705–15. дои : 10.1006/jmbi.1993.1547 . ПМИД 8411176 .
- ^ Чжу, Фэн; Чжоу, Ян-Кай; Цзи, Чжао-Линь; Чен, Сяо-Рен (9 февраля 2018 г.). «Растительные белки, инактивирующие рибосомы, играют важную роль в защите от патогенов и атак насекомых-вредителей» . Границы в науке о растениях . 9 : 146. дои : 10.3389/fpls.2018.00146 . ПМК 5811460 . ПМИД 29479367 .
- ^ Jump up to: а б с д Лападула В.Дж., Аюб М.Дж. (сентябрь 2017 г.). «Белки, инактивирующие рибосомы, с эволюционной точки зрения». Токсикон . 136 : 6–14. дои : 10.1016/j.токсикон.2017.06.012 . ПМИД 28651991 . S2CID 9814488 .
- ^ Фредрикссон, Стен-Оке; Артурссон, Элизабет; Бергстрем, Томас; Остин, Андерс; Нильссон, Калле; Остот, Кристер (декабрь 2014 г.). «Идентификация токсинов RIP-II путем аффинного обогащения, ферментативного расщепления и ЖХ-МС». Аналитическая химия . 87 (2): 967–974. дои : 10.1021/ac5032918 . ISSN 0003-2700 . ПМИД 25496503 .
- ^ Гамильтон П.Т., Пэн Ф., Буланже М.Дж., Перлман С.Дж. (январь 2016 г.). «Белок, инактивирующий рибосомы, в защитном симбионте дрозофилы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (2): 350–5. Бибкод : 2016PNAS..113..350H . дои : 10.1073/pnas.1518648113 . ПМЦ 4720295 . ПМИД 26712000 .
- ^ Домашевский А.В., Goss DJ (январь 2015). «Противовирусный белок рябины, белок, инактивирующий рибосомы: активность, ингибирование и перспективы» . Токсины . 7 (2): 274–98. дои : 10.3390/toxins7020274 . ПМЦ 4344624 . ПМИД 25635465 .