Ортохантавирус Sin Nombre
| Ортохантавирус Sin Nombre | |
|---|---|
| |
| Трансмиссионная электронная микрофотография ортохантавируса Sin Nombre | |
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Эллиовирицетес |
| Заказ: | Буньявирусы |
| Семья: | Хантавирусиды |
| Род: | Ортохантавирус |
| Разновидность: | Ортохантавирус Sin Nombre
|
| Членские вирусы | |
| Синонимы | |
| |
| Безымянный вирус | |
|---|---|
| Специальность | Вирусология |
Ортохантавирус Sin Nombre ( SNV ) (от испанского, что означает «без имени»), представитель рода Orthohantavirus , является прототипным этиологическим агентом хантавирусного сердечно-легочного синдрома (HCPS). [ 1 ]
Обнаруженный в 1993 году недалеко от Каньон-де-ла-Муэрте в резервации навахо , он первоначально был назван хантавирусом Каньона Муэрто, в соответствии с соглашением о наименовании новых патогенов. [ 2 ] Однако в 1994 году народ навахо выступил против этого названия. [ 3 ] Он также находился недалеко от точки Четырех углов в США, поэтому вирусологи попытались назвать его «вирусом Четырех углов». Название было изменено после возражений местных жителей. [ 4 ] В отчаянии вирусологи изменили его на Sin Nombre , что в переводе с испанского означает «без имени».
История
[ редактировать ]Впервые он был выделен в 1993 году от грызунов, собранных возле дома одного из первых пациентов с хантавирусным легочным синдромом (ГЛС) в регионе Четыре угла на западе США. Выделение было достигнуто путем слепого пассажа Peromyscus maniculatus (восточная мышь-олень) и последующей адаптации к росту в клетках Vero E6. Дополнительные вирусные штаммы также были выделены из P. maniculatus, связанного со смертельным случаем в Калифорнии, и P. leucopus из района возможного заражения в Нью-Йорке. Вирус канала Блэк-Крик был выделен из S. hispidus, собранного недалеко от места проживания больного человека в округе Дейд, Флорида. Другой этиологический агент HCPS, вирус Байу , был впервые выделен в окрестностях Монро, штат Луизиана. [ 5 ]
Эпидемиология
[ редактировать ]SNV встречается везде, где его резервуарным грызун носителем является -мышь Peromyscus maniculatus . [ 6 ] Обнаружен, включающий практически всю населенную территорию Северной Америки, за исключением крайнего юго-восточного региона от восточного Техаса до Флориды , Аляски и крайних северных пределов Канады. SNV и HCPS особенно распространены в западных штатах; пик заболеваемости HCPS был зарегистрирован в регионах, где существует много контактов между людьми и мышами ( Нью-Мексико , Аризона ), а также в штатах с исключительно большой численностью сельского населения, таких как Калифорния . во всех западных провинциях Канады Случаи заболевания также зарегистрированы . Заразиться SNV можно при вдыхании зараженных вирусом экскрементов оленей-мышей. [ нужна ссылка ]
Хотя считается, что передача от мыши-оленя человеку происходит в первую очередь через контакт с мочой и фекалиями мышей, считается, что передача внутри популяции векторов происходит через прямой контакт, в отличие от известной передачи векторами для других видов рода Orthohantavirus. [ 7 ]
Сообщается, что коэффициент смертности от HCPS, вызванного SNV, в США составляет около 66,7% (CDC, 1993). Однако с тех пор коэффициент летальности неуклонно снижался по мере того, как стали регистрироваться более легкие случаи. К 2007 году CFR снизился примерно до 35%. [ нужна ссылка ]
Секвенирование вирусов
[ редактировать ]Как и другие виды ортохантавирусов, SNV имеет трехчастный геном из одноцепочечной РНК с отрицательным смыслом. Полная геномная последовательность SNV впоследствии была определена с использованием РНК, выделенной из аутопсийного материала, а также РНК, выделенной из вируса, адаптированного к клеточной культуре. Длина L-РНК составляет 6562 нуклеотида (нт); длина М-РНК составляет 3696 нт; а S-РНК имеет длину от 2059 до 2060 нт. Когда прототипную последовательность (NMH15) SNV, обнаруженную в тканях случая HPS, сравнивали с последовательностью изолята SNV (NMR11; выделен в клетках Vero E6 из Peromyscus maniculatus , пойманных в месте проживания того же случая), изменилось только 16 нуклеотидов. были обнаружены, и ни одно из этих изменений не привело к изменению аминокислотных последовательностей вирусных белков. Предполагалось, что в процессе адаптации к культуре клеток будет происходить отбор вариантов SNV, которые оптимально растут в культуре клеток, и отобранные варианты будут генетически отличаться от родительского вируса. Хотя NMH10 и NMR11 идентичны по белковой последовательности, нуклеотидные замены в нетранслируемых областях генома могут быть ответственны за измененные вирусные фенотипы, равно как и изменения в белках. гликозилирование или компоненты вирусной мембраны. [ нужна ссылка ]
Вложенный анализ RT-PCR, разработанный во время первоначальной вспышки HCPS, предоставил быстрый метод генетической характеристики новых хантавирусов, не требующий выделения вируса. Многочисленные новые хантавирусы были обнаружены с помощью RT-PCR в тканях грызунов, но еще не были связаны с заболеваниями человека. К ним относятся вирус Каньона Эль-Моро, связанный с западной промысловой мышью, Reithrodontomys megalotis , вирус Тула с Microtus arvalis и M. rossiaemeridionalis , вирус Рио-Сегундо с мексиканской промысловой мышью, R. mexicanus , вирус Исла-Виста с калифорнийской полевкой, M.californicus и вирусы типа Prospect Hill у видов Microtus . [ нужна ссылка ]
Морфология вириона
[ редактировать ]В отличие от представителей рода Orthohantavirus, эндемичных за пределами Америки, чьи вирионы преимущественно имеют округлую или плеоморфную форму, вирионы SNV имеют большую склонность к трубчатой и неправильной морфологии вирионов. Это открытие предполагает, что этот род более разнообразен с точки зрения морфологии, чем предполагалось ранее, что может помочь объяснить различия в эпидемиологии между видами. Внутри видов Sin Nombre между штаммами существует морфологическая изменчивость: вирионы удлиненного фенотипа связаны с более высокой вирулентностью. Вирионы Sin Nombre имеют средний диаметр 90 нм для круглых частиц и 85 нм для трубчатых частиц, со средней длиной 180 нм для трубчатых частиц, что делает их несколько меньше, чем близкородственные представители этого рода. [ 8 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Йе С., Прескотт Дж., Нофчисси Р., Гоуд Д., Хьелле Б. (март 2004 г.). «Нейтрализующие антитела и РНК вируса Sin Nombre после выздоровления от хантавирусного сердечно-легочного синдрома» . Возникающая инфекция. Дис . 10 (3): 478–82. doi : 10.3201/eid1003.020821 (неактивен 31 января 2024 г.). ПМЦ 3322788 . ПМИД 15109416 .
{{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на январь 2024 г. ( ссылка ) - ^ Ван Хук, Чарльз Дж. (ноябрь 2018 г.). «Хантавирусный легочный синдром — 25-я годовщина вспышки в Четырех углах» . Новые инфекционные заболевания . 24 (11): 2056–2060. дои : 10.3201/eid2411.180381 . ПМК 6199996 .
- ^ «Навахо осуждают место хантавируса в каньоне Муэрто» . Лос-Анджелес Таймс . 24 апреля 1994 года . Проверено 3 июля 2019 г.
- ^ Штраус, Эллен Г.; Штраус, Джеймс Х. (2002). Вирусы и болезни человека . Бостон: Академическая пресса. п. 161 . ISBN 978-0-12-673050-0 .
- ^ «Хантавирусы с упором на хантавирус четырех углов» . Bvs.insp.mx. Архивировано из оригинала 20 апреля 2013 г. Проверено 17 ноября 2016 г.
- ^ Лемер Э.М., Клэй К.А., Пирс-Дюве Дж., Сент-Джор С., Диринг, доктор медицинских наук (март 2008 г.). «Дифференциальная регуляция патогенов: роль нарушения среды обитания в прогнозировании распространенности вируса Sin Nombre». Экология . 155 (3): 429–39. Бибкод : 2008Oecol.155..429L . дои : 10.1007/s00442-007-0922-9 . ПМИД 18064494 . S2CID 19495085 .
- ^ Уорнер, Брайс (2 декабря 2019 г.). «Разработка и характеристика модели передачи вируса Sin Nombre Peromyscus maniculatus» . Вирусы . 11 (2): 183. дои : 10.3390/v11020183 . ПМК 6409794 . ПМИД 30795592 .
- ^ Парвате, Амар (16 сентября 2019 г.). «Разнообразная морфология и структурные особенности хантавирусов Старого и Нового Света» . Вирусы . 11 (9): 862. дои : 10.3390/v11090862 . ПМК 6783877 . ПМИД 31527500 .