Клостридии

Клостридии
	Клостридия ботулиническая
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Бациллота
Сорт:	Клостридии ; Рейни 2010 г.
Заказы
	« Боркфалкиалес ». ; Клостридиалы ; « Десульфотомакулалес ». ; Эубактерии ; Аэробные бактерии ; « Гелиобактериилес ». ; Колеобактерии ; Муреллалес ; Натранаэробный ; Термоанаэробактерии ; Термоседиминибактериалы ; Тиссьереллалес ;
Синонимы
	«Клостридия» Кавалер-Смит 2020г. ; "Галанаэробия" Кавальер-Смит 2020г. ; «Десульфотомакулия» Ватанабе и др. 2019 год ; «Натранаэробия» Сорокин и др. 2021 год ;

Клостридии класс представляют собой высокополифилетический Bacillota , включающий Clostridium и другие подобные роды. они отличаются От бацилл отсутствием аэробного дыхания . Они являются облигатными анаэробами и кислород для них токсичен. Виды класса Clostridia часто, но не всегда, грамположительны (см. Halanaerobium ) и обладают способностью образовывать споры. ^{[ 1 ]} Исследования показывают, что они не являются монофилетической группой, и их родство не совсем точно. В настоящее время большинство из них отнесено к одному отряду под названием Clostridiales, но это не естественная группа, и, вероятно, в будущем ее определение будет пересмотрено.

Большинство видов рода Clostridium являются сапрофитными организмами, ферментирующими растительные полисахариды. ^{[ 2 ]} и встречаются во многих местах окружающей среды, особенно в почве. Однако этот род содержит некоторые патогены человека (описаны ниже). Токсины, вырабатываемые некоторыми представителями рода Clostridium, являются одними из наиболее опасных из известных. Примерами являются столбнячный токсин (известный как тетаноспазмин ), продуцируемый C. tetani , и ботулинический токсин, продуцируемый C. botulinum . Некоторые виды были выделены от женщин с бактериальным вагинозом . ^{[ 3 ]}

Разновидность

Известные виды этого класса включают: ^{[ нужна ссылка ]}

Clostridium perfringens ( гангрена , пищевое отравление )
Clostridioides difficile ( псевдомембранозный колит )
Clostridium tetani ( столбняк )
Clostridium botulinum ( ботулизм )
Clostridium acetobutylicum ( ферментация ацетон-бутанол-этанол или процесс ABE)
Клостридия гемолитическая
Clostridium novyi ( газовая гангрена , инфекционно-некротический гепатит )
- Clostridium oedematiens (синоним Clostridium novyi )
Clostridium phytofermentans ( ферментация биомассы )

Гелиобактерии и Кристенсенеллы также относятся к классу Clostridia.

Некоторые ферменты, вырабатываемые этой группой, используются в биоремедиации .

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия, основанная на Списке названий прокариот, стоящих в номенклатуре (LPSN). ^{[ 4 ]} и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI). ^{[ 5 ]}

на основе 16S рРНК ДП _08_2023 ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

120 маркерных белков на основе GTDB 08-RS214 ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Фирмикуты 3 ♦

	Диктиогломота

	« Кальдицеллюлосупрессивный »

	« Термоседиминибактерии » [в т.ч. «Аммонификалы», DSM-22653]

	« Термоанаэробактерии » [в т.ч. Терманаэромонас , Десульфовиргула ]

Фирмикуты 2 ♦

	« Сульфобациллия ».

	« Термаэробактерии »

	« Карбоксидотермальные растения ».

	« Термацетогениалы ».

Муреллалес {"Муреллия"}

	" Кальдерихабитанталес "

	« Колеобактерии ».

Жаонелловые

	« Десульфитибактериалы ».

	« Синтрофомонадия ».

Гелрия ♦

	« Симбиобактерии » ♦

	Актиномицетота

Нитроспирота

	« Термодесульфобиота » ♦

	Элюзимикробиота

	« Галанаэробия » ♦

	Ацидобактериота

	Хитинивибриония

	« Планктобактерии

« Фирмикуты » 1 ♦

	Термолитобактерии

	« Карбоксидоцеллалес ».

	« Терминколия »

	« Десульфофундуловые »

	УБА4882

	« Селеномонадия »

Лимнохордия

« Десульфотомакулота »

« Десульфотомакулия ».

« Десульфитобактерии ».

« Пептококция »

	« Детиобактерии ».

	" Натранаэробия "

Фузобактерии { Fusobacteriota }

Микоплазматота

	Ахолеплазмалес

	Рожипелотрихия

Молликуты

Бациллия {Bacillota ss}

«Клостридии» сс (в т.ч. Тиссиереллии)

♦ Парафилетические «Клостридии».

Бациллота Е ♦

« Термаэробактерии »

" Ca. Acetocimmeria " {UBA3575}

	« Симбиобактерии »

	« Сульфобациллия ».

Бациллота G

	Лимнохордия

	« Гидрогениспория » [UBA4882]

«Халанаэробиота»	« Галанаэробия » ♦

Бациллота Д ♦

« Протеиниворация ».

	« Детиобактерии ».

	" Натранаэробия "

Бациллота сс	« Бацилии » (в т.ч. Erysipelotrichia , Mollicutes )

«Селенобактерии»

Селеномонадия

«Десульфотомакулота» ♦

« Синтрофомонадия ».

« Пептококция »

	« Дегалобактерии »

	« Десульфитобактерии ».

	" Термацетогениалы " {DSM-12270}

	" Муреллия "

	" Карбоксидоцеллалес " {GCA-003054495}

	« Терминколия »

	" Карбоксидотермальные растения " {Z-2901}

	« Десульфотомакулия ».

Бациллота А ♦

« Термоседиминибактерии ».

	« Термоанаэробактерии ».

	Clostridiia ss (в т.ч. Tissierellia)

Эпидемиология

Поскольку они обычно обнаруживаются в почвах и микробиоте людей и животных, раны и инфекции Clostridia встречаются во всем мире. Защитные механизмы хозяина против микроба практически отсутствуют, а врожденный иммунитет практически отсутствует. Клостридии можно диагностировать, распознав особенности поражения инфекцией, а также окраску по Граму ткани и бактериальной культуры. ^{[ 1 ]} Хотя организм сам по себе не обладает адекватной защитой, с этим микробом можно бороться с помощью антибиотиков, таких как пенициллин, и хирургической обработки тканей в более тяжелых случаях. ^{[ нужна ссылка ]}

Клостридии и здоровье

Бактерии Clostridia обычно встречаются в микробиоме кишечника . ^{[ нужна медицинская ссылка ]}

Clostridioides difficile

Чрезмерное использование антибиотиков может вызвать дисбаланс микробиома кишечника, что приводит к чрезмерному росту видов Clostridioides difficile, вызывающих серьезную инфекцию (CDI). ^{[ 12 ]} Последствия этой инфекции включают тяжелую диарею, а в результате инфекции также увеличивается тяжесть многих заболеваний кишечника. Другие бактерии Clostridium в кишечнике связаны с связями мозга и его здоровым функционированием. ^{[ 13 ]}

У пациентов, которым была проведена трансплантация фекальной микробиоты для лечения ИКД, наблюдалось улучшение настроения и психического здоровья . ^{[ 12 ]} Это предварительное исследование, по-видимому, предполагает предварительную связь между присутствием клостридий в микробиоме кишечника и общим психическим здоровьем, а трансплантация микробиома кишечника является направлением будущих исследований новых методов лечения некоторых психических расстройств. ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Барон, Сэмюэл (1996). Медицинская микробиология (4-е изд.). Галвестон: Медицинское отделение Техасского университета. ISBN 0-9631172-1-1 .
^ Бутар, Магали; Серизи, Тристан; Ног, Пьер-Ив (2014). «Функциональное разнообразие углеводоактивных ферментов, позволяющее бактериям ферментировать растительную биомассу» . ПЛОС Генетика . 10 (11): e1004773. дои : 10.1371/journal.pgen.1004773 . ПМЦ 4230839 . ПМИД 25393313 .
^ Африка, Шарлин; Нел, Янске; Стеммет, Меган (2014). «Анаэробы и бактериальный вагиноз во время беременности: факторы вирулентности, способствующие колонизации влагалища» . Международный журнал экологических исследований и общественного здравоохранения . 11 (7): 6979–7000. дои : 10.3390/ijerph110706979 . ISSN 1660-4601 . ПМЦ 4113856 . ПМИД 25014248 .
^ Ж. П. Эзеби. «Клостридия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июня 2022 г.
^ Сэйерс; и др. «Клостридия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июня 2022 г.
^ «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.
^ «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.
^ Jump up to: ^а ^б Джаланка, Дж.; Хилламаа, А.; Сатокари, Р.; Маттила, Э.; Анттила, В.-Дж.; Арккила, П. (2018). «Долгосрочные эффекты трансплантации фекальной микробиоты на желудочно-кишечные симптомы и общее состояние здоровья у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile» . Алиментарная фармакология и терапия . 47 (3): 371–379. дои : 10.1111/кв.14443 . ISSN 1365-2036 . ПМИД 29226561 .
^ Лабус, Дженнифер С.; Сяо, Элейн; Тэп, Жюльен; Дерриен, Мюриэл; Гупта, Арпана; Ле Неве, Борис; Бразель, Реми; Гринсвалль, Сесилия; Оман, Лена; Торнблом, Ганс; Тиллиш, Кирстен; Симрен, Магнус; Майер, Эмеран А. (2017). «Клостридии из кишечного микробиома связаны с функциональными связями мозга и вызванными симптомами при СРК». Гастроэнтерология . 152 (5): С40. дои : 10.1016/S0016-5085(17)30496-1 .

Внешние ссылки

клостридий Эталонные последовательности кластера

[Clostridia:_Sporeforming_Anaerobic_Bacilli-1] Jump up to: ^а ^б Барон, Сэмюэл (1996). Медицинская микробиология (4-е изд.). Галвестон: Медицинское отделение Техасского университета. ISBN 0-9631172-1-1 .

[Boutard2014-2] Бутар, Магали; Серизи, Тристан; Ног, Пьер-Ив (2014). «Функциональное разнообразие углеводоактивных ферментов, позволяющее бактериям ферментировать растительную биомассу» . ПЛОС Генетика . 10 (11): e1004773. дои : 10.1371/journal.pgen.1004773 . ПМЦ 4230839 . ПМИД 25393313 .

[AfricaNel2014-3] Африка, Шарлин; Нел, Янске; Стеммет, Меган (2014). «Анаэробы и бактериальный вагиноз во время беременности: факторы вирулентности, способствующие колонизации влагалища» . Международный журнал экологических исследований и общественного здравоохранения . 11 (7): 6979–7000. дои : 10.3390/ijerph110706979 . ISSN 1660-4601 . ПМЦ 4113856 . ПМИД 25014248 .

[4] Ж. П. Эзеби. «Клостридия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 20 июня 2022 г.

[5] Сэйерс; и др. «Клостридия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 20 июня 2022 г.

[LTP-6] «ЛТП» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[7] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Проверено 20 ноября 2023 г.

[8] «Примечания к выпуску LTP_08_2023» (PDF) . Проверено 20 ноября 2023 г.

[about-9] «Выпуск GTDB 08-RS214» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[tree-10] "bac120_r214.sp_label" . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[taxon_history-11] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 10 мая 2023 г.

[:0-12] Jump up to: ^а ^б Джаланка, Дж.; Хилламаа, А.; Сатокари, Р.; Маттила, Э.; Анттила, В.-Дж.; Арккила, П. (2018). «Долгосрочные эффекты трансплантации фекальной микробиоты на желудочно-кишечные симптомы и общее состояние здоровья у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile» . Алиментарная фармакология и терапия . 47 (3): 371–379. дои : 10.1111/кв.14443 . ISSN 1365-2036 . ПМИД 29226561 .

[13] Лабус, Дженнифер С.; Сяо, Элейн; Тэп, Жюльен; Дерриен, Мюриэл; Гупта, Арпана; Ле Неве, Борис; Бразель, Реми; Гринсвалль, Сесилия; Оман, Лена; Торнблом, Ганс; Тиллиш, Кирстен; Симрен, Магнус; Майер, Эмеран А. (2017). «Клостридии из кишечного микробиома связаны с функциональными связями мозга и вызванными симптомами при СРК». Гастроэнтерология . 152 (5): С40. дои : 10.1016/S0016-5085(17)30496-1 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]