Очерк биофизики
Следующий план представляет собой обзор и актуальное руководство по биофизике:
Биофизика – междисциплинарная наука , использующая методы физики для изучения биологических систем. [1]
Природа биофизики
[ редактировать ]Биофизика
[ редактировать ]- Академическая дисциплина – отрасль знаний, которая преподается и исследуется на уровне колледжа или университета. Дисциплины определяются (частично) и признаются академическими журналами, в которых публикуются исследования, а также научными обществами и академическими факультетами или факультетами, к которым принадлежат их практикующие специалисты.
- Научная область (отрасль науки ) – широко признанная категория специализированных знаний в науке, которая обычно включает в себя собственную терминологию и номенклатуру. Такая область обычно представлена одним или несколькими научными журналами, в которых публикуются рецензируемые исследования.
- Естественная наука – наука, которая стремится объяснить законы, управляющие миром природы, используя эмпирические и научные методы .
- Биологическая наука , занимающаяся изучением живых организмов , включая их структуру, функции, рост, эволюцию , распространение и таксономию .
- Раздел физики , занимающийся изучением материи и ее движения в пространстве и времени, а также связанных с ними концепций, таких как энергия и сила .
- Естественная наука – наука, которая стремится объяснить законы, управляющие миром природы, используя эмпирические и научные методы .
- Междисциплинарная область - область науки, которая пересекается с другими науками.
Объем биофизических исследований
[ редактировать ]- Биомолекулярный масштаб
- Организменный масштаб
- Экологический масштаб
Биофизические исследования пересекаются с
[ редактировать ]Отрасли биофизики
[ редактировать ]- Астробиофизика - область пересечения астрофизики и биофизики, изучающая влияние астрофизических явлений на жизнь на планете Земля или какой-либо другой планете в целом.
- Медицинская биофизика — междисциплинарная область, которая применяет методы и концепции от физики к медицине или здравоохранению , от радиологии до микроскопии и наномедицины . См. также: Медицинская физика .
- Клиническая биофизика - изучает процессы и эффекты неионизирующих физических энергий, используемых в диагностических и терапевтических целях. [2] [3]
- Мембранная биофизика - исследование биологических мембран с использованием физических, вычислительных, математических и биофизических методов.
- Молекулярная биофизика - междисциплинарная область, в которой применяются методы и концепции физики, химии, техники, математики и биологии. [4] понимать биомолекулярные системы и объяснять биологические функции с точки зрения молекулярной структуры, структурной организации и динамического поведения на различных уровнях сложности, от отдельных молекул до супрамолекулярных структур, вирусов и небольших живых систем.
Биофизические методы
[ редактировать ]Биофизические методы – методы, используемые для получения информации о биологических системах на атомном или молекулярном уровне. Они пересекаются с методами многих других отраслей науки.
- Биофотоника - сочетание биологии и фотоники, при этом фотоника представляет собой науку и технологию генерации, манипулирования и обнаружения фотонов, квантовых единиц света. Биофотонику также можно охарактеризовать как «разработку и применение оптических методов, особенно изображений, для изучения биологических молекул, клеток и тканей». Одним из основных преимуществ использования оптических методов, составляющих биофотонику, является то, что они сохраняют целостность исследуемых биологических клеток.
- Визуализация кальция – различные оптические методы регистрации местоположения и концентрации кальция. Обычно это делается в образцах клеток и тканей с использованием либо генетически закодированных, либо химически полученных флуоресцентных красителей, указывающих кальций.
- Калориметрия –
- Изотермическая титровальная калориметрия (ITC) – измеряет тепловые эффекты, вызванные взаимодействиями.
- Хроматография - различные методы из этой области используются для очистки и анализа биологических молекул.
- Круговой дихроизм – метод измерения хиральности образца с использованием света с круговой поляризацией . Этот метод обычно используется для определения структуры белка .
- Вычислительная химия - использование численных методов для исследования структуры и динамического равновесия в биологических системах.
- Криобиология - изучает влияние низких температур на живые существа.
- Двойная поляризационная интерферометрия – аналитический метод, используемый для измерения в реальном времени конформации и активности широкого спектра биомолекул и их взаимодействий.
- Электронная микроскопия – используется для получения изображений субклеточных структур и белков с высоким разрешением.
- Электрофизиология - изучает электрические свойства клеточных мембран и предоставляет функциональные данные, часто связанные с систематическими изменениями в структуре.
- Зажим патча - предоставляет временную и электрическую информацию о клетке или части мембраны. Обычно это дает данные об электрогенных процессах, таких как активность ионных каналов или транспортеров .
- Флуоресцентная спектроскопия – для обнаружения структурных перестроек, а также взаимодействий биомолекул. См. также Флуоресценция .
- Силовая спектроскопия - исследует механические свойства отдельных молекул или макромолекулярных ансамблей с использованием небольших гибких кантилеверов, сфокусированного лазерного света или магнитных полей.
- Гель-электрофорез – определяет массу, заряд и взаимодействие биологических молекул.
- Визуализация – научная визуализация биологических материалов, обычно с помощью той или иной формы микроскопии , а иногда и косвенно, например, с помощью рентгеновской кристаллографии или компьютерной визуализации; в широком диапазоне увеличений, чтобы увидеть макромолекулы , клетки , ткани или организмы.
- Масс-спектрометрия – метод, позволяющий определить молекулярную массу с большой точностью.
- Микромасштабный термофорез (MST) – метод измерения сродства связывания, ферментативной активности, изменений конформации молекул и изменений размера, заряда или энтропии гидратации.
- Микроскопия – используется во многих отношениях, например, для возможности использования лазерных инструментов для сканирования и передачи.
- Нейровизуализация –
- Нейтронная спин-эхо -спектроскопия –
- Спектроскопия ядерного магнитного резонанса - метод измерения локального окружения атомных ядер внутри образца. Может использоваться для получения как структурной, так и кинетической информации о белках и малых молекулах.
- ЯМР-спектроскопия белков - дает информацию о точной структуре биологических молекул, а также о динамике.
- Оптические пинцеты и магнитные пинцеты — позволяют манипулировать отдельными молекулами, предоставляя информацию о ДНК и ее взаимодействии с белками и молекулярными моторами , такими как хеликаза и РНК-полимераза .
- Реология и микрореология
- Спектроскопия одиночных молекул – это метод, достаточно чувствительный для обнаружения отдельных молекул и часто включающий обнаружение флуоресценции.
- Малоугловое рентгеновское рассеяние (SAXS) – метод, позволяющий получить грубую молекулярную структуру с низким разрешением.
- Спектрофотометрия – измерение пропускания света через различные растворы или вещества на разных длинах волн света.
- Спектроскопия и круговой дихроизм - метод обнаружения хиральных групп в молекулах, особенно для определения вторичной структуры белков .
- Ультрацентрифугирование – дает информацию о форме и массе молекул.
- Рентгеновская кристаллография - метод определения точной структуры молекул с атомным разрешением.
Приложения
[ редактировать ]Биофизические структуры и явления
[ редактировать ]В молекулярной биофизике
[ редактировать ]- Молекулярная биофизика
- Биологические мембраны
- Клеточные мембраны
- Биоэнергетика
- Каналы , рецепторы и транспортеры
- Кинетика ферментов
- Молекулярные моторы
- фосфолипиды
- Белки
- Биопленки
- Супрамолекулярные сборки
- Нуклеиновые кислоты
В клеточной биофизике
[ редактировать ]- Клеточная биология
- Деление клеток
- Миграция клеток
- Передача сигналов ячейки
- Динамические системы
- Электрофизиология
- Сигнализация
- Теория биохимических систем
- Анализ метаболического контроля
Биофизические организации
[ редактировать ]- Американская кристаллографическая ассоциация
- Биофизическое общество
- Биофизическое общество Канады
- Ассоциация европейских биофизических обществ
- Индийское биофизическое общество
- Институт биофизики ( Китайская академия наук )
- Международный союз теоретической и прикладной биофизики
- Международный союз кристаллографии
- Национальный институт химической физики и биофизики , Эстония
Публикации по биофизике
[ редактировать ]- Ежегодный обзор биофизики
- Библиография биофизики
- Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями
- Биофизический журнал
- Биофизические обзоры и письма
- Европейский биофизический журнал
- Индийский журнал биохимии и биофизики
- Журнал биохимических и биофизических методов
- Мягкая материя
Лица, влиятельные в биофизике
[ редактировать ]См. также
[ редактировать ]- Биоакустика
- Биологические мембраны
- Бионика
- Вычислительная биология
- Эволюционные алгоритмы
- Эволюционные вычисления
- Эволюционная теория
- Гравитационная биология
- Ионные каналы
- Математическая биология
- Морфогенез
- Мышцы и сократимость
- Негэнтропия
- Нейронное кодирование
- Нейрофизика
- Физиомика
- Радиобиология
- Сенсорные системы
- Структурная биология
- Системная нейробиология
- Тенсегрити
- Теоретическая биология
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Брошюра «Карьера в биофизике», Биофизическое общество https://www.biophysical Society.org/Portals/1/PDFs/Career%20Center/Careers%20In%20Biophysical.pdf . Архивировано 30 октября 2011 г. в Wayback Machine.
- ^ Аарон РК, Чьомбор Д.М., Ван С., Саймон Б. Клиническая биофизика: содействие восстановлению скелета с помощью физических сил. Энн, Нью-Йоркская академия наук. Апрель 2006 г.; 1068: 513-31. Обзор.
- ^ Анбар, М. Клиническая биофизика: новая концепция высшего медицинского образования. J Medical Education, 56, 443–444 (1981).
- ^ «Что такое молекулярная биофизика?» . Архивировано из оригинала 21 августа 2016 г. Проверено 3 ноября 2011 г.