Тибровирус Нижнего Конго
| Тибровирус Нижнего Конго | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область : | Рибовирия |
| Королевство: | Орторнавиры |
| Тип: | Негарнавирикота |
| Сорт: | Монхивирицетес |
| Заказ: | Мононегавирусы |
| Семья: | Рабдовирусиды |
| Род: | Тибровирус |
| Разновидность: | Тибровирус Нижнего Конго
|
| Синонимы | |
| |
Тибровирус Нижнего Конго (BASV) — плохо охарактеризованный рабдовирус, обнаруженный в крови пациента, перенесшего тяжелое заболевание, напоминающее геморрагическую лихорадку. [ 1 ] Вирус был назван в честь бывшей провинции Нижнее Конго (ныне Центральное Конго ) Демократической Республики Конго. BASV был обнаружен с помощью секвенирования следующего поколения, и попытки изолировать вирус не увенчались успехом. РНК BASV была обнаружена только у одного человека, и ее роль как патогена для человека не установлена. [ 2 ]
Открытие
[ редактировать ]Весной 2009 года у двух подростков, живущих в Мангале, небольшой деревне, расположенной в самой западной провинции Демократической Республики Конго, развилось тяжелое заболевание с симптомами, которые включали: лихорадку, головную боль, боль в животе, кровотечение изо рта и носа, кровавую рвоту, и кровавый понос. Оба подростка умерли через несколько дней после появления симптомов. [ 1 ]
Более чем через неделю заболела 32-летняя медсестра, которая ухаживала за двумя подростками. Его симптомы были аналогичны симптомам двух подростков: кровотечение из носа, глаз и полости рта; кровавая рвота и кровавый понос. Ему была оказана поддерживающая помощь, и он выздоровел. Образец крови был собран и подвергнут секвенированию нового поколения. Анализ выявил наличие нового рабдовируса BASV, который был похож на других представителей плохо изученного рода тибровирусов. [ 1 ]
Ассоциация заболеваний
[ редактировать ]BASV присутствовал в крови инфицированного человека в количестве более 1 миллиона копий РНК/мл плазмы, что указывает на активную инфекцию. [ 1 ]
Хотя секвенирование нового поколения является мощным инструментом для обнаружения новых вирусов, оно не позволяет однозначно установить BASV как причину заболевания пациента. Действительно, другие эксперты предположили, что BASV не является причиной болезни пациента, и отметили, что в то же время в этом районе произошла вспышка шигелл. [ 2 ]
Геном
[ редактировать ]Полный геном BASV недоступен. Сообщалось о геноме размером 11 892 п.н. [ 3 ] который, вероятно, завершен на 95–98%. Геном BASV состоит из пяти типичных генов рабдовируса (N, P, M, G и L), а также трех открытых рамок считывания неизвестной функции (U1, U2 и U3). [ 4 ]
Заболеваемость и распространенность
[ редактировать ]Мало что известно о заболеваемости или распространенности BASV. Антитела к BASV были обнаружены у инфицированного пациента, а также у близкого контакта, у которого не было проявлений симптомов заболевания. [ 1 ] Серологическое обследование 50 случайно выбранных доноров крови в провинции Восточное Касаи в Демократической Республике Конго не выявило ни одного положительного образца. [ 5 ] Однако эта провинция находится примерно в 2000 километрах от города, где впервые был обнаружен BASV. [ нужна ссылка ]
Передача инфекции
[ редактировать ]Естественный резервуар и путь передачи BASV неизвестны. Алгоритм машинного обучения, предназначенный для прогнозирования животных-резервуаров и членистоногих-переносчиков, предполагает, что естественным хозяином может быть крупный рогатый скот, а насекомым-переносчиком - мокрец. [ 6 ] Этот прогноз согласуется с тем, что в настоящее время известно о цикле передачи других тибровирусов . [ нужна ссылка ]
Связь с другими рабдовирусами
[ редактировать ]Филогенетический анализ выявленного белка полимеразы (L) указывает на то, что BASV наиболее тесно связан с представителями рода тибровирусов . [ 7 ] Известно восемь тибровирусов, включая BASV. [ 8 ] Четыре тибровируса были выделены от мокрецов ( Culicoides ), три от человека и один от здорового бычка. За исключением Нижнего Конго, ни один из других тибровирусов не был связан с каким-либо заболеванием. Экспериментальное заражение крупного рогатого скота различными тибровирусами не вызывает симптомов заболевания. [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д и Грард Дж., Фэйр Дж.Н., Ли Д. и др. Новый рабдовирус, вызывающий острую геморрагическую лихорадку в Центральной Африке [опубликованная поправка появилась в PLoS Pathog. Март 2016 г.;12(3):e1005503] [опубликованное исправление появляется в PLoS Pathog. 7 сентября 2017 г.; 13(9):e1006583]. PLoS Патог. 2012;8(9):e1002924. doi:10.1371/journal.ppat.1002924
- ^ Перейти обратно: а б «Вирус Нижнего Конго – не установленный патоген | Наука» . science.sciencemag.org . Архивировано из оригинала 30 января 2020 г.
- ^ «Изолят вируса Бас-Конго, ген белка N BASV-1, частичные cds...» 28 июня 2019 г. . Проверено 29 января 2020 г.
- ^ Кун Дж.С., Пан Х., Чиу С.И., Стремлау М. (25 февраля 2020 г.). «Тибровирусы человека: комменсалы или смертельные патогены?» . Вирусы . 12 (3): 252. дои : 10.3390/v12030252 . ПМК 7150972 . ПМИД 32106547 .
- ^ Штеффен И., Лисс Н.М., Шнайдер Б.С., Фэйр Дж.Н., Чиу С.И., Симмонс Г. Характеристика гликопротеина вируса Нижнего Конго и его функции в псевдотипированных вирусах. Дж Вирол. 2013;87(17):9558–9568. doi:10.1128/JVI.01183-13
- ^ С.А. Бабаян и др., Прогнозирование резервуарных хозяев и переносчиков членистоногих на основе эволюционных признаков в геномах РНК-вирусов. Наука 362, 577-580 (2018)
- ^ Уокер П.Дж., Ферт С., Уайден С.Г. и др. Эволюция размера и сложности генома рабдовирусов. PLoS Патог. 2015;11(2):e1004664. Опубликовано 13 февраля 2015 г. doi:10.1371/journal.ppat.1004664.
- ^ «Род: Tibrovirus - Rhabdoviridae - РНК-вирусы с отрицательным смыслом - ICTV» . Архивировано из оригинала 8 августа 2019 года.
- ^ Цибински, Д.Х., Сент-Джордж, Т.Д., Стэндфаст, Х.А. и МакГрегор, А. Выделение вируса тиброгарган, нового австралийского рабдовируса, из Culicoides brevitarsis. Ветеринарная микробиология 5, 301–308 (1980).