Стафилококк
Staphylococcus является родом грамположительных бактерий . в семействе Staphylococcaceae порядка бациллалов из Под микроскопом они кажутся сферическими ( Cocci ) и образуются в виноградам кластерах, подобных Staphylococcus . Виды являются факультативными анаэробными организмами (способными к росту как аэробно, так и анаэробно).
Название было придумано в 1880 году шотландским хирургом и бактериологом Александром Огстоном (1844–1929), после того как пять лет назад, установленная пять лет назад с именованием стрептококка . [ 1 ] Он объединяет префикс "staphylo-" ( древнегреческого : σταφυλή , романизированный : staphylē , lit. от [ 2 ] ) и суффикс новым латинским : кокус , горит. «Сферическая бактерия» (от древнегреческого » , Романизированный : Коккой , горит. « Зерно, просмотр, ягода » [ 3 ] ).
Стафилококк был одной из ведущих инфекций в больницах, и многие штаммы этой бактерии стали устойчивыми к антибиотикам . Несмотря на сильные попытки избавиться от них, бактерии Staphylococcus остаются в больницах, где они могут заразить людей, которые наиболее подвержены риску заражения. [ 4 ]
Staphylococcus включает в себя не менее 44 видов. Из них девять имеют два подвида , один имеет три подвида, а один имеет четыре подвида. [ 5 ] Многие виды не могут вызывать заболевания и обычно находиться на коже и слизистых оболочках людей и других животных . Staphylococcus Было обнаружено, что виды являются нектарными микробами. [ 6 ] Они также являются небольшим компонентом микробиома почвы . [ 7 ]
Таксономия
[ редактировать ]Таксономия основана на последовательностях 16S рРНК , [ 8 ] и большинство стафилококковых видов падают на 11 кластеров:
- S. Golden Group - S. Silver , St. Aureus , S. Schweitzeri , S. Monkeys
- S. auricularis Group - S. auricularis
- S. Carnose Group - S. Carnose , S. Saunenti , S. Debuckii , S. Marseille , S. Piscifermentans , St. Simulans
- S. Epidermis Group - Head , S. S. St. Epidermis , Saccharolyticus
- S. Haemolyticus Group - S. Borealis , S. Devriesei , S. Haemolyticus , S. Hominis
- Saint -Intermediate - St. Agnes , St. Chromogenes , St. Cornwille , S. , Delphini , S. Hyicus St. Intermediate , St. Lutrae , Microti , S. Group S. Pseudintermedius , S. Rostri S. Schleiferi
- St. Lugdunensis Group - St. Lugdunensis
- S. saprophyticus Group - S. arlettae , St. , Cohnius , St. Horses , St. Hens , Kloosii , St. Lee Xylosus S. Nepalensis , S. Saprophyticus , S. St. S.
- S. Sciuli Group - Sasturi , S. Sciri , S. For S. , Thespanici Vitalius
- S. Имитационный группу - Св.
- S. Warneri Group - S. Pasteuri , S. Warneri
Двенадцатая группа - группа S. caseolyticus - теперь была удалена в новый род Macrococcus , вид которого в настоящее время являются самыми близкими известными родственниками Staphylococcus . [ 9 ]
Два вида были описаны в 2015 году - Staphylococcus argenteus и Staphylococcus schweitzeri , оба из которых ранее считались вариантами S. aureus . [ 10 ]
Новые негативные виды коагулазы - staphylococcus edaphicus - были выделены из Антарктиды . [ 11 ] Этот вид, вероятно, является членом группы S. saprophyticus .
Группа
[ редактировать ]На основе анализа содержания ортологичного гена были предложены три группы (A, B и C) были предложены. [ 12 ]
Группа включает в себя St. Aureus , St. Borealis S. , , Epidermis , Haemolyticus , S. Warner Lyon , St. Pettenkoferi S. S. Monkeys и St. .
Группа B включает в себя S. arlettae , St. Cohnii , St. Horse , S. Saprophyticus и St. Xylosus .
Группа C включает S. delphini , S. Intermedius и S. pseudintermedius .
Примечания
[ редактировать ]Группы S. saprophytticus и S. sciuri, как правило, устойчивы к новопоцину , как и S. hominis subsp. Novobiossepticus
Члены группы S. sciuri являются оксидазой -позитивными из -за их владения ферментом цитохрома С оксидазы . Эта группа является единственной кладкой в стафилококках, которая обладает этим геном.
Группа S. sciuri , по -видимому, является наиболее близким отношением к роду Macrococcus .
S. pulvereri Было показано, что является младшим синонимом S. vitulinus . [ 13 ]
В рамках этих клад группы S. hemolyticus и S. simulans , по -видимому, связаны, как и группы S. aureus и S. epidermidis . [ 14 ]
S. lugdunensis, по -видимому, связан с группой S. heamolyticus .
S. Petrasii может быть связан с S. heamolyticus , но это должно быть подтверждено.
Таксономическая позиция S. lyticoars , S. Petrasii и S. pseudolugdunensis еще не выяснена. Опубликованные описания этих видов, по -видимому, не были обоснованно опубликованы.
Биохимическая идентификация
[ редактировать ]Назначение штамма на род Staphylococcus требует, чтобы он был граммаположительным кокком [ 15 ] Это формирует кластеры, имеет подходящую структуру клеточной стенки (включая тип пептидогликана и присутствие тейхойной кислоты) и содержание G + C в ДНК в диапазоне 30–40 моль.
Виды Staphylococcus могут быть дифференцированы от других аэробных и факультативных анаэробных, грамположительных кокки на несколько простых тестов. [ 15 ] Виды Staphylococcus представляют собой факультативные анаэробные (способные к росту как аэробно, так и анаэробно). [ 15 ] Все виды растут в присутствии желчных солей .
Все виды Staphylococcus aureus когда-то считались коагулазой-позитивными, но с тех пор это было опровергнуто. [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ]
Рост также может произойти в 6,5% растворе NaCl. [ 15 ] На Baird-Parker среде виды Staphylococcus растут ферментативно, за исключением S. saprophyticus , который окислительно растет. Виды Staphylococcus устойчивы к бацитрацину (0,04 U DISC: устойчивость = <10 мМ зона ингибирования) и подвержены фаразолидону (100 мкг диск: устойчивость = <15 мМ зона ингибирования). Дальнейшее биохимическое тестирование необходимо для идентификации уровня видов.
Производство коагулазы
[ редактировать ]Одной из наиболее важных фенотипических признаков, используемых в классификации стафилококков, является их способность продуцировать коагулазу , фермент, который вызывает образование сгустка крови .
Семь видов в настоящее время признаны коагулазо-позитивными: S. aureus , S. Delphini , S. Hyicus , S. Intermedius , S. Lutrae , S. Pseudintermedius и S. Schleiferi subsp. Коагуланы . Эти виды принадлежат к двум отдельным группам- группе S. aureus ( только S. aureus ) и группе S. Hyicus-Intermedius (оставшиеся пять).
Также был описан восьмой вид - Staphylococcus leii - от пациентов с гастритом . [ 19 ]
S. aureus является коагулазой положительным, что означает, что он производит коагулазу. Однако, хотя большинство штаммов S. aureus являются коагулазой положительными, некоторые могут быть нетипичными в том смысле, что они не производят коагулазу. S. aureus является каталазой -позитивной (что означает, что он может продуцировать ферментативную каталазу) и способен преобразовать перекись водорода (H 2 O 2 ) в воду и кислород, что делает тест каталазы полезным для различения стафилококков от энтерококков и стрептококков .
S. pseudintermedius обитает и иногда заражает кожу домашних собак и кошек. Этот организм также может нести генетический материал, который придает множественную бактериальную устойчивость. Это редко связано с инфекциями у людей, как зооноз .
S. epidermidis , коагулаза-отрицательный вид, является комменсалом кожи, но может вызвать тяжелые инфекции у пациентов с иммуносупрессией и пациентов с центральными венозными катетерами . S. saprophyticus , еще один коагулаз-отрицательный вид, который является частью нормальной влагалищной флоры , преимущественно участвует в инфекциях по мочеиспусканию у молодых женщин, сексуально активных. В последние годы несколько других видов Staphylococcus были вовлечены в инфекции человека, в частности, S. lugdunensis , S. Schleiferi и S. Caprae .
Обыльными аббревиатурами для коагулаз-негативных стафилококков являются минусы, ЦНС или CNST. [ 20 ] Американское общество микробиологии сокращает коагулаз-негативные стафилококки как «минусы».
Геномика и молекулярная биология
[ редактировать ]Первыми S. aureus геномами , которые были секвенированы, были геновы N315 и MU50, в 2001 году. S. aureus В общедоступных базах данных были представлены много более полных геномов , что делает его одним из наиболее широко секвенированных бактерий. Использование геномных данных в настоящее время широко распространено и обеспечивает ценный ресурс для исследователей, работающих с S. aureus . Технологии целого генома, такие как проекты секвенирования и микрочипы , показали огромное разнообразие штаммов S. aureus . Каждый содержит различные комбинации поверхностных белков и разных токсинов . Отношение этой информации с патогенным поведением является одной из основных областей стафилококковых исследований. Разработка методов молекулярного типирования позволила отслеживать различные штаммы S. aureus . Это может привести к лучшему контролю от штаммов вспышки. Более высокое понимание того, как развивается стафилококки, особенно из -за приобретения мобильных генетических элементов, кодирующих устойчивость и гены вирулентности, помогает выявить новые штаммы вспышек и даже предотвратить их появление. [ 21 ]
Широко распространенная частота устойчивости к антибиотикам в различных штаммах S. aureus или среди различных видов стафилококка была отнесена к горизонтальному переносу генов генов, кодирующих устойчивость к антибиотикам/металлам и вирулентность. Недавнее исследование продемонстрировало степень горизонтального переноса генов среди стафилококков, чтобы быть намного больше, чем ожидалось ранее, и охватывает гены с функциями за пределами устойчивости к антибиотикам и вирулентности, а также за пределами генов, проживающих в мобильных генетических элементах . [ 22 ]
Различные штаммы Staphylococcus доступны в биологических исследовательских центрах, таких как национальная коллекция типовых культур .
Хост диапазон
[ редактировать ]
Члены рода Staphylococcus часто колонизируют кожу и верхние дыхательные пути млекопитающих и птиц, а также в морской губке . [ 15 ] Морские губки, связанные с стафилококками , очень устойчивы к соле. [ 15 ] Некоторая видовая специфичность наблюдалась в диапазоне хозяев, так что виды Staphylococcus , наблюдаемые на некоторых животных, появляются более редко на более отдаленных видах хозяев. [ 23 ] Некоторые из наблюдаемых специфичности хозяина включают:
- S. arlattae - цыплята , козы , морская губка [ 15 ]
- S. aureus - люди, [ 24 ] крупный рогатый скот
- S. auricularis - олень , собаки , люди
- S. Borealis - люди , крупный рогатый скот
- S. Top - Люди
- Святой козы - козы, люди
- S. Cohnii - цыплята, люди
- С. Дельфини - Дельфины
- S. Devriesei - крупный рогатый скот
- S. epidermidis - люди, морская губка [ 15 ]
- Св. Лошадь - Лошади
- С. Фелис - кошки
- S. fleuriatii - козы
- S. gallinarum - цыплята, козы, фазаны
- S. heamolyticus - Люди, Cercocebus , Erythrocebus , Lemur , Macca , Microcebus , Pan
- S. Hyicus - свиньи
- Сент -Лей - люди
- S. Lentus - козы, кролики , овцы
- Святой Лион - Люди, козы
- S. lutrae - выдры
- S. Microti - Повол ( Arvalis Microtus )
- S. nepalensis - козы
- S. pasteuri - люди, козы
- С. Петтенкофер - Люди
- S. pseudintermedius - собаки
- С. Ростра - свиньи
- S. Schleiferi - люди
- S. Sciuri - люди, собаки, козы
- С. обезьяны - Южноамериканская белка обезьяны ( Saimiri Sciureus )
- Святой имитирует - люди
- S. Warneri - люди, Cercopithecoidea , Pongidae
- S. Xylosus - люди
Популяции, подверженные риску Staphylococcus aureus инфекции
[ редактировать ]Говорят, что у любого может развиться стафи -инфекция, хотя некоторые группы людей подвержены большему риску, включая людей с хроническими состояниями, такими как диабет, рак, сосудистые заболевания, экзема, заболевание легких и люди, которые вводят лекарства. В учреждениях здравоохранения риск более серьезной стафилокологической инфекции выше, потому что многие пациенты ослабевают иммунную систему или прошли процедуры. В здравоохранении риск более серьезной стафиологической инфекции выше для пациентов в отделениях интенсивной терапии (отделения интенсивной терапии), пациентов, которые перенесли определенные типы операций, и пациенты с медицинскими устройствами, вставленными в их организм. [ 25 ]
Staphylococcus aureus стал ведущим агентом сепсиса . Это облегчает такие факторы, как адгезия ткани, уклонение от иммунитета и повреждение клеток -хозяина. В кровотоке эти факторы вызывают воспаление, нарушают функцию иммунных клеток, изменение коагуляции и компромисс сосудистой целостность. Когда остается необработанным, S. aureus запускает патофизиологические нарушения, которые дополнительно усиливаются воспалительным ответом хозяина, кульминацией которых является тяжелые клинические проявления сепсиса и септического шока . [ 26 ]
Клинический
[ редактировать ]Стафилококк может вызвать широкий спектр заболеваний у людей и животных за счет производства токсина или проникновения. Стафилококковые токсины являются распространенной причиной пищевого отравления, потому что они могут производиться бактериями, растущими в неправильно хранимых продуктах питания. Наиболее распространенный сиаладенит вызван стафилококками, как бактериальные инфекции. [ 27 ] Стафилококки разбивают лейцин в изовалеристую кислоту , основной запах запаха ног. [ 28 ]
Смотрите также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Стафилококк | Происхождение и значение стафилококка с помощью онлайн -этимологического словаря» . www.etymonline.com . Получено 2018-07-25 .
- ^ stafulh/ в Лидделле, Генри Джордж ; Скотт, Роберт (1940) Грек -английский лексикон , пересмотренный и дополненный Джонс, сэр Генри Стюарт , с помощью Маккензи, Родерика. Оксфорд: Clarendon Press. В цифровой библиотеке Персея , Университета Тафтса.
- ^ ko) kkos в Лидделле и Скотте
- ^ "Стафные инфекции" . Mayoclinic.org . Получено 2022-11-27 .
- ^ Харрис Л.Г., Фостер С.Дж., Ричардс Р.Г. (декабрь 2002 г.). «Введение в Staphylococcus aureus и методы идентификации и количественной оценки адгезинов S. aureus по отношению к адгезии к биоматериалам: обзор» . Европейские ячейки и материалы . 4 : 39–60. doi : 10.22203/ecm.v004a04 . PMID 14562246 .
- ^ Jacquemyn H, Lenaerts M, Brys R, Willems K, Honnay O, Lievens B (2013). «Изменения в структуре микробного сообщества в структуре микробного сообщества в цветочном нектаре пчелиной лесной травы Pulmonaria officinalis L.» Plos один . 8 (3): E56917. BIBCODE : 2013PLOSO ... 856917J . doi : 10.1371/journal.pone.0056917 . PMC 3594240 . PMID 23536759 .
- ^ Мэдиган М., Мартинко Дж, ред. (2005). Брок Биомлогия микроорганизмов (11 -е изд.). Прентис Холл. ISBN 978-0-13-144329-7 . [ страница необходима ]
- ^ Takahashi T, Satoh I, Kikuchi N (апрель 1999 г.). «Филогенетические отношения 38 таксонов рода Staphylococcus , основанные на анализе последовательности генов 16S рРНК» . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (2): 725–8. doi : 10.1099/00207713-49-2-725 . PMID 10319495 .
- ^ Клуос В.Е., Баллард Д.Н., Джордж К.Г., Вебстер Дж. А., Хубнер Р.Дж., Людвиг В., Шлейфер К.Х., Фидлер Ф., Шуберт К (июль 1998 г.). «Разграничение рода Staphylococcus через описание Macrococcus Caseolyticus Gen. Nov., Comb. Nov. И Macrococcus eaffercicus sp. Nov. И Macrococcus bovicus sp. №. И Macrococcus carouselicus sp. Nov» . Международный журнал систематической бактериологии . 48 (3): 859–77. doi : 10.1099/00207713-48-3-859 . PMID 9734040 .
- ^ Тонг Си, Шаумбург Ф., Эллингтон М.Дж., Корандер Дж., Пикчон Б., Лендерц Ф., Бентли С.Д., Пархилл Дж., Холт Д.К., Петерс Г., Гиффард Прем (январь 2015). «Новые стафилококковые виды, которые образуют часть комплекса, связанного с Staphylococus aureus: непигментированный Staphylococus arguenteus . Nov. и нечеловеческий стафилокок Schweitziri sp. Nov. Nov. sp Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 65 (Pt 1): 15–2 Doi : 10.1099/ ijs.062752-0 4298100PMC 25269845PMID
- ^ Pantůůek R, Sedláček I, Indráková A, Vrbovská V, Mašlňová I, Kovarovic V, Chvec P, Králová S, Kriushtofová L, Kekláková J, Petáush P, DoШКА -J (октябрь 2017 г.). «Меккан и геномные острова с роли Сутинь в адаптации к экстремальной среде» . Прикладная и экологическая микробиология . 84 (2): E01746–17. Doi : 10.1128/aem.01746-17 . PMC 5752872 . PMID 29079617 .
- ^ Coates-Brown R, Moran JC, Pongchaikul P, Darby AC и MJ Horsburgh MJ (2018) «Сравнительная геномика стафилококка показывает детерминанты видообразования и диверсификации антимикробной защиты». Передний микробиол
- ^ SVEC P, Vancanneyt M, Sedlácek I, Engelbeen K, Stetana V, Swings J, Petrás P (ноябрь 2004 г.). «Реклассификация Staphylococcucus pulverererire zakrzewska-czerwinska et . al Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии 54 (Pt 6): 2213–5 Doi : 10.1099/ ijs.0.63080-0 15545460PMID
- ^ Ghebremedhin B, Layer F, König W, König B (март 2008 г.). «Генетическая классификация и различие видов Staphylococcus , основанных на различных частичных разрывах, 16S рРНК, HSP60, RPOB, Soda и последовательностей генов TUF» . Журнал клинической микробиологии . 46 (3): 1019–25. doi : 10.1128/jcm.02058-07 . PMC 2268370 . PMID 18174295 .
- ^ Jump up to: а беременный в дюймовый и фон глин час Пол, Сулав Индра; Рахман, доктор медицины Махбубур; Салам, Мохаммад Абдус; Хан, Мэриленд Арифур Рахман; Ислам, Md. Tofazzal (2021-12-15). «Идентификация морских губчатых бактерий на острове Бенгалии Святого Мартина, подчеркивающего профилактику сепсиса Aeromonas в Labeo Rohita» . Аквакультура . 545 : 737156. DOI : 10.1016/j.aquaculture.2021.737156 . ISSN 0044-8486 .
- ^ Райан К.Дж., Рэй К.Г., ред. (2004). Шеррис Медицинская микробиология (4 -е изд.). МакГроу Хилл. ISBN 978-0-8385-8529-0 . [ страница необходима ]
- ^ Предварительный тест, хирургия, 12 -е изд., С. 88
- ^ Мэтьюз К.Р., Роберсон Дж., Гиллеспи Б.Е., Лютер Д.А., Оливер С.П. (1997). «Идентификация и дифференциация коагулаз-негативной стафилококки aureus с помощью полимеразной цепной реакции» . Журнал защиты от еды . 60 (6): 686–8. doi : 10.4315/0362-028x-60.6.686 . PMID 31195568 .
- ^ Джин М., Росарио В., Уотлер Э., Калхун Д.Х. (март 2004 г.). «Разработка крупномасштабной очистки на основе ВЭЖХ для уреазы от staphylococcus leii и определение структуры субъединицы». Экспрессия и очистка белка . 34 (1): 111–7. doi : 10.1016/j.pep.2003.10.012 . PMID 14766306 .
- ^ Беккер К, Хейлманн С, Петерс Г. (октябрь 2014 г.). «Коагулаза-отрицательный стафилококки» . Клинические обзоры микробиологии . 27 (4): 870–926. doi : 10.1128/cmr.00109-13 . PMC 4187637 . PMID 25278577 .
- ^ Линдси Дж, ред. (2008). Стафилококк : молекулярная генетика . Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-29-5 . [ страница необходима ]
- ^ Chan CX, Beiko RG, Ragan Ma (август 2011 г.). «Боковой перенос генов и фрагментов генов в Staphylococcus выходит за рамки мобильных элементов» . Журнал бактериологии . 193 (15): 3964–77. doi : 10.1128/jb.01524-10 . PMC 3147504 . PMID 21622749 .
- ^ Клуос мы (1980). «Природные популяции рода Staphylococcus ». Ежегодный обзор микробиологии . 34 : 559–92. doi : 10.1146/annurev.mi.34.100180.003015 . PMID 7002032 .
- ^ «Симптомы и лечение стафилокоза (целлюлит)» . Just-Health.net . 14 декабря 2013 г.
- ^ «Staphylococcus aureus в медицинских учреждениях | Хай» . CDC . 2020-12-10 . Получено 2022-04-23 .
- ^ Powers, Michael E.; Варденбург, Джулиан Бубек (13 февраля 2014 г.). «Зажигание огня: факторы вирулентности стафилококка в патогенезе сепсиса» . PLO -патогены . 10 (2): E1003871. doi : 10.1371/journal.ppat.1003871 . ISSN 1553-7374 . PMC 3923759 . PMID 24550724 .
- ^ «Сиалоаденит: воспаление слюнных желез» . Защитник медицинского потребителя. 2001-01-04 . Получено 2011-01-04 .
- ^ Стивенс Д., Корнмелл Р., Тейлор Д., Гримшоу С.Г., Риазанскайа С., Арнольд Д.С., Фернстад С.Дж., Смит А.М., Хини Л.М., Рейнольдс Дж.С., Томас К.Л., Харкер М. ассоциируется с производством пахотных летучих веществ. FEMS Microbiol Ecol. 2015 январь; 91 (1): 1-11. doi: 10.1093/femsec/fiu018. Epub 2014 декабрь 8. PMID: 25764539.
Внешние ссылки
[ редактировать ]
СМИ, связанные со стафилококком в Wikimedia Commons 
Данные, связанные со стафилококком в Wikispecies - Геномы Staphylococcus и связанная с ним информация в Patric , ресурсном центре биоинформатики, финансируемый Niaid
