✖


Jump to content

Список РНК

(Перенаправлено со сращенной лидерной РНК )

Рибонуклеиновая кислота (РНК) встречается в организме в разных формах и выполняет множество различных функций. Здесь перечислены типы РНК, сгруппированные по функциям. Перечислены и объяснены сокращения для различных типов РНК.

По роли

[ редактировать ]
РНК, участвующие в синтезе белка
Тип Сокр. Функция Распределение Ссылка.
Мессенджер РНК мРНК Коды белка Все организмы
Рибосомальная РНК рРНК Перевод Все организмы
Частица распознавания сигнала РНК 7SL РНК или SRP РНК Мембранная интеграция Все организмы [ 1 ]
Транспортная РНК тРНК Перевод Все организмы
Переносная РНК тмРНК Спасение застрявших рибосом Бактерии [ 2 ]
РНК, участвующие в посттранскрипционной модификации или репликации ДНК.
Тип Сокр. Функция Распределение Ссылка.
Малая ядерная РНК мяРНК Сращивание и другие функции Эукариоты и археи [ 3 ]
Малая ядрышковая РНК мякРНК Нуклеотидная модификация РНК Эукариоты и археи [ 4 ]
SmY RNA смй транссплайсинг мРНК Нематоды [ 5 ]
Малая специфичная для организма РНК Кахаля скаРНК Тип мякРНК; Нуклеотидная модификация РНК
Направляющая РНК гРНК Модификация нуклеотидов мРНК Кинетопластидные митохондрии [ 6 ]
Рибонуклеаза Р РНКаза P созревание тРНК Все организмы [ 7 ]
Рибонуклеаза MRP РНКаза MRP Созревание рРНК, репликация ДНК Эукариоты [ 8 ]
Y РНК Процессинг РНК, репликация ДНК Животные [ 9 ]
Компонент теломеразной РНК ТЕРК теломер Синтез Большинство эукариотов [ 10 ]
Сплайсированная лидерная РНК СЛ РНК Транссплайсинг мРНК, процессинг РНК
Регуляторные РНК
Тип Сокр. Функция Распределение Ссылка.
Антисмысловая РНК аРНК, асРНК Аттенуация транскрипции / деградация мРНК / стабилизация мРНК / блок трансляции Все организмы [ 11 ] [ 12 ]
Цис-природный антисмысловой транскрипт цис-NAT Генная регуляция
CRISPR РНК crRNA Устойчивость к паразитам за счет воздействия на их ДНК Бактерии и археи [ 13 ]
Длинная некодирующая РНК днРНК Регуляция транскрипции генов, эпигенетическая регуляция Эукариоты
микроРНК микроРНК Генная регуляция Большинство эукариотов [ 14 ]
Piwi-взаимодействующая РНК пиРНК Защита транспозонов, возможно, другие функции Большинство животных [ 15 ] [ 16 ]
Малая интерферирующая РНК миРНК Генная регуляция Большинство эукариотов [ 17 ]
Короткая шпилька РНК шРНК Генная регуляция Большинство эукариотов [ 18 ]
Трансдействующая миРНК тазиРНК Генная регуляция Наземные растения [ 19 ]
Повторите связанную миРНК разиРНК Тип пиРНК; транспозонная защита Дрозофила [ 20 ]
7СКНА 7СК негативно регулирующий комплекс CDK9/циклин Т
Энхансерная РНК эРНК Генная регуляция [ 21 ]
Паразитарные РНК
Тип Функция Распределение Ссылка.
Ретротранспозон Саморазмножающийся Эукариоты и некоторые бактерии [ 22 ]
Вирусный геном Информационный носитель Вирусы с двухцепочечной РНК , РНК-вирусы с положительным смыслом , РНК-вирусы с отрицательным смыслом , многие сателлитные вирусы и вирусы с обратной транскрипцией.
Вироид Саморазмножающийся Зараженные растения [ 23 ]
Спутниковая РНК Саморазмножающийся Инфицированные клетки
Другие РНК
Тип Сокр. Функция Распределение Ссылка.
Хранилище РНК вРНК, втРНК Вытеснение ксенобиотиков (предположительно) [ 24 ]
гликоРНК - Неизвестный

Аббревиатуры РНК

[ редактировать ]
Сокр. Имя Семья Описание Ссылка.
нкРНК некодирующая РНК -
нмРНК непосредственная РНК - синоним нкРНК
мРНК малая РНК - синоним нкРНК
смнРНК малая непосредственная РНК - синоним нкРНК
тРНК транспортная РНК RF00005
мРНК растворимая РНК - синоним тРНК
мРНК информационная РНК -
пкРНК белок, кодирующий РНК - синоним мРНК
рРНК рибосомальная РНК несколько семей
5S рРНК 5S рибосомальная РНК RF00001
5.8S рРНК 5.8S рибосомальная РНК RF00002
СГУ рРНК малая субъединица рибосомальной РНК CL00111
LSU рРНК большая субъединица рибосомальной РНК CL00112
NoRC РНК РНК, связанная с комплексом ремоделирования ядрышка РФ01518
мРНК промоторная РНК РФ01518 синоним NoRC РНК
6S РНК 6S РНК RF00013
SsrS РНК RF00013 синоним 6S РНК
аРНК антисмысловая РНК - синоним асРНК
асРНК антисмысловая РНК -
асмиРНК антисмысловая микроРНК -
цис-NAT цис-природный антисмысловой транскрипт - Природные антисмысловые транскрипты транскрибируются из того же геномного локуса, что и их мишень, но с противоположной цепи ДНК, и образуют идеальные пары.
crRNA CRISPR РНК -
тракрРНК трансактивирующая crRNA -
CRISPR РНК CRISPR-Cas РНК несколько семей
ДД РНК Реакция на повреждение ДНК РНК - РНК, которая активирует реакцию повреждения ДНК
диРНК Малые РНК, индуцированные DSB -
дсРНК двухцепочечная РНК -
эндо-миРНК эндогенная малая интерферирующая РНК -
бывшаяРНК внеклеточная РНК -
гРНК направляющая РНК -
hc-миРНК гетерохроматическая малая интерферирующая РНК -
hcsiРНК гетерохроматическая малая интерферирующая РНК - синоним hc-siRNA
гнРНК гетерогенная ядерная РНК - синоним пре-мРНК (в строгом смысле слова может включать транскрипты ядерной РНК, которые не превращаются в цитоплазматическую мРНК)
РНКи РНК-интерференция - Процесс, при котором РНК ингибирует экспрессию или трансляцию генов путем нейтрализации целевых мРНК. молекул
линкРНК длинная межгенная некодирующая РНК -
днРНК длинная некодирующая РНК -
микроРНК микро РНК несколько семей
мрРНК рибонуклеаза, процессирующая митохондриальную РНК - синоним РНКазы MRP
натурная миРНК природная антисмысловая короткая интерферирующая РНК - синоним нациРНК
нациРНК природная антисмысловая короткая интерферирующая РНК - Эндогенные регуляторы РНК длиной от 21 до 24 нт генерируются из комплементарных транскриптов мРНК , которые далее процессируются в миРНК.
ОксиS РНК РНК ответа на окислительный стресс RF00035 Малая некодирующая РНК, индуцируемая в ответ на окислительный стресс у Escherichia coli.
пиРНК piwi-взаимодействующая РНК несколько семей Малые РНК, образующие РНК-белковые комплексы с белками piwi в клетках животных.
киРНК QDE-2 интерферирующая РНК -
разиРНК Повторите связанную миРНК - Малая РНК, которая участвует в пути РНК-интерференции , тип пиРНК.
РНКаза MRP рибонуклеаза, процессирующая митохондриальную РНК RF00030
РНКаза P рибонуклеаза P RF00010 Тип рибонуклеазы, расщепляющей РНК.
скаРНК малая специфичная для организма РНК Кахаля РФ00553
скнРНК малосканированная РНК -
scRNA малая цитоплазматическая РНК -
scRNA малая условная РНК -
SgrS РНК мРНК, связанная с транспортом сахара RF00534 Малая РНК, активируемая SgrR в Escherichia coli во время глюкозо-фосфатного стресса.
шРНК короткая шпилька РНК -
миРНК малая интерферирующая РНК -
СЛ РНК сплайсированная лидерная РНК несколько семей
SmY RNA транссплайсинг мРНК RF01844 Малые ядерные РНК, обнаруженные у некоторых видов нематод, предположительно участвуют в транссплайсинге мРНК.
мякРНК малая ядрышковая РНК несколько семей
мяРНК малая ядерная РНК несколько семей
мяРНП малые ядерные рибонуклеиновые белки -
СПА днРНК 5'-малая ядрышковая РНК, кэпированная и 3'-полиаденилированная длинная некодирующая РНК -
SRP РНК частица распознавания сигнала РНК CL00003
оцРНК одноцепочечная РНК -
звезда малая височная РНК -
тазиРНК трансдействующая миРНК -
тмРНК РНК-переносчик RF00023 Молекула бактериальной РНК с двойными тРНК-подобными и матричными РНК-подобными свойствами.
мРНК U сплайсосомная РНК несколько семей
вРНК хранилище РНК - синоним втРНК
втРНК хранилище РНК RF00006
Существующая РНК X-неактивный специфический транскрипт -
Y РНК Y РНК RF00019 Компоненты рибонуклеопротеиновой частицы Ro60, необходимые для репликации ДНК посредством взаимодействия с хроматином и белками инициации.
NAT естественные антисмысловые транскрипты - Природные антисмысловые транскрипты, кодируемые внутри клетки и обладающие транскриптом, комплементарным другим транскриптам РНК.
пре-мРНК предшественник информационной РНК - Незрелая одноцепочечная информационная РНК
циркРНК кольцевая РНК -
мсРНК мультикопийная одноцепочечная РНК - (RT) , кодируемой ретроном Продукты обратной транскриптазы , которые образуют комплекс RT-мсДНК, который действует как антифаговый антитоксин. [ 25 ] [ 26 ]
вкРНК внеклеточная РНК -

См. также

[ редактировать ]
См. Также: Категория: РНК

Ссылки

[ редактировать ]
  1. ^ Грибальдо С., Брошье-Армане С (2006). «Происхождение и эволюция архей: современное состояние» . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 361 (1470): 1007–22. дои : 10.1098/rstb.2006.1841 . ПМЦ   1578729 . ПМИД   16754611 .
  2. ^ Жилле Р., Фельден Б. (2001). «Новые взгляды на маркировку белков, опосредованную тмРНК, и спасение рибосом» . Молекулярная микробиология . 42 (4): 879–85. дои : 10.1046/j.1365-2958.2001.02701.x . ПМИД   11737633 . S2CID   45056681 .
  3. ^ Тор С., Майер С., Сотер С., Уикс С., Сак Д. (2003). «Кристаллические структуры ядра Pyrococcus abyssi Sm и его комплекса с РНК» . Ж. Биол. Хим . 278 (2): 1239–47. дои : 10.1074/jbc.M207685200 . ПМИД   12409299 .
  4. ^ Поцелуй Т (2001). «Посттранскрипционная модификация клеточных РНК под контролем малых ядрышковых РНК» . Журнал ЭМБО . 20 (14): 3617–22. дои : 10.1093/emboj/20.14.3617 . ПМК   125535 . ПМИД   11447102 .
  5. ^ Джонс Т.А., Отто В., Марц М., Эдди С.Р., Стадлер П.Ф. (2009). «Обзор SmY-РНК нематод» . РНК Биол . 6 (1): 5–8. дои : 10.4161/rna.6.1.7634 . ПМИД   19106623 . S2CID   32095624 .
  6. ^ Альфонсо Дж.Д., Тиманн О., Симпсон Л. (1997). «Механизм редактирования U-инсерции/делеции РНК в митохондриях кинетопластид» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (19): 3751–59. doi : 10.1093/nar/25.19.3751 (неактивен 22 февраля 2024 г.). ПМЦ   146959 . ПМИД   9380494 . {{cite journal}}: CS1 maint: DOI неактивен по состоянию на февраль 2024 г. ( ссылка )
  7. ^ Паннуччи Дж.А., Хаас Э.С., Холл Т.А., Харрис Дж.К., Браун Дж.В. (1999). «РНКазы P РНК некоторых архей каталитически активны» . Proc Natl Acad Sci США . 96 (14): 7803–08. Бибкод : 1999PNAS...96.7803P . дои : 10.1073/pnas.96.14.7803 . ПМК   22142 . ПМИД   10393902 .
  8. ^ Доктор Вудхэмс, Стадлер П.Ф., Пенни Д., Коллинз Л.Дж. (2007). «РНКаза MRP и каскад обработки РНК у эукариотического предка» . Эволюционная биология BMC . 7 (Приложение 1): S13. Бибкод : 2007BMCEE...7S..13W . дои : 10.1186/1471-2148-7-S1-S13 . ПМК   1796607 . ПМИД   17288571 .
  9. ^ Перро Ж, Перро ЖП, Буар Дж (2007). «Ro-ассоциированные Y-РНК у многоклеточных животных: эволюция и диверсификация» . Молекулярная биология и эволюция . 24 (8): 1678–89. дои : 10.1093/molbev/msm084 . ПМИД   17470436 .
  10. ^ Люстиг Эй Джей (1999). «Кризисное вмешательство: роль теломеразы» . Proc Natl Acad Sci США . 96 (7): 3339–41. Бибкод : 1999PNAS...96.3339L . дои : 10.1073/pnas.96.7.3339 . ПМК   34270 . ПМИД   10097039 .
  11. ^ Брантл С. (2002). «Регуляция антисмысловой РНК и РНК-интерференция». Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Структура и экспрессия генов . 1575 (1–3): 15–25. дои : 10.1016/S0167-4781(02)00280-4 . ПМИД   12020814 .
  12. ^ Брантл С. (2007). «Регуляторные механизмы, используемые цис-кодируемыми антисмысловыми РНК». Курс. Мнение. Микробиол . 10 (2): 102–9. дои : 10.1016/j.mib.2007.03.012 . ПМИД   17387036 .
  13. ^ Браунс С.Дж., Джор М.М., Лундгрен М. и др. (август 2008 г.). «Маленькие РНК CRISPR обеспечивают противовирусную защиту прокариот» . Наука . 321 (5891): 960–4. Бибкод : 2008Sci...321..960B . дои : 10.1126/science.1159689 . ПМЦ   5898235 . ПМИД   18703739 .
  14. ^ Лин С.Л., Миллер Дж.Д., Ин С.Ю. (2006). «Интронная микроРНК (миРНК)» . Журнал биомедицины и биотехнологии . 2006 (4): 1–13. дои : 10.1155/JBB/2006/26818 . ПМК   1559912 . ПМИД   17057362 .
  15. ^ Хорвич М.Д., Ли С., Матранга С., Вагин В., Фарли Г., Ван П., Замор П.Д. (2007). « РНК-метилтрансфераза дрозофилы , DmHen1, модифицирует piRNA зародышевой линии и одноцепочечные siRNA в RISC» . Современная биология . 17 (14): 1265–72. Бибкод : 2007CBio...17.1265H . дои : 10.1016/j.cub.2007.06.030 . ПМИД   17604629 . S2CID   18880444 .
  16. ^ Гильдьял М., Замор П.Д. (февраль 2009 г.). «Маленькие молчащие РНК: расширяющаяся Вселенная» . Нат. Преподобный Жене . 10 (2): 94–108. дои : 10.1038/nrg2504 . ПМЦ   2724769 . ПМИД   19148191 .
  17. ^ Ахмад К., Хеникофф С. (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом» . Клетка . 111 (3): 281–84. дои : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . ПМИД   12419239 . S2CID   17735718 .
  18. ^ Ахмад К., Хеникофф С. (2002). «Эпигенетические последствия динамики нуклеосом» . Клетка . 111 (3): 281–84. дои : 10.1016/S0092-8674(02)01081-4 . ПМИД   12419239 . S2CID   17735718 .
  19. ^ Васкес Ф., Вошере Х. (2004). «Эндогенные транс-действующие миРНК регулируют накопление мРНК Arabidopsis» . Мол. Клетка . 16 (1): 69–79. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.028 . ПМИД   15469823 .
  20. ^ Дессе С., Бюшон Н., Мейнен С., Койффе М., Вори С. (2008). Вольф Дж.Н. (ред.). «У Drosophila melanogaster локус COM управляет соматическим молчанием двух ретротранспозонов как по Piwi-зависимому, так и по независимому пути» . ПЛОС ОДИН . 3 (2): e1526. Бибкод : 2008PLoSO...3.1526D . дои : 10.1371/journal.pone.0001526 . ПМК   2211404 . ПМИД   18253480 .
  21. ^ Ли, Вэньбо; Нотани, Димпл; Розенфельд, Майкл Г. (07 марта 2016 г.). «Энхансеры как некодирующие единицы транскрипции РНК: последние открытия и перспективы на будущее». Обзоры природы. Генетика . 17 (4). Спрингер Природа: 207–223. дои : 10.1038/nrg.2016.4 . ISSN   1471-0056 . ПМИД   26948815 . S2CID   215371 .
  22. ^ Буке Дж.Д. (2003). «Необычное филогенетическое распределение ретротранспозонов: гипотеза» . Геномные исследования . 13 (9): 1975–83. дои : 10.1101/гр.1392003 . ПМИД   12952870 .
  23. ^ Флорес Р., Эрнандес С., Мартинес де Альба А.Е., Дарос Х.А., Ди Серио Ф (2005). «Вироиды и взаимодействие вироидов с хозяином». Ежегодный обзор фитопатологии . 43 : 117–39. doi : 10.1146/annurev.phyto.43.040204.140243 . ПМИД   16078879 .
  24. ^ Гопинатх С.К., Мацугами А., Катахира М., Кумар П.К. (2005). «Некодирующие РНК, связанные со сводом человека, связываются с митоксантроном, химиотерапевтическим соединением» . Нуклеиновые кислоты Рез . 33 (15): 4874–81. дои : 10.1093/nar/gki809 . ПМК   1201340 . ПМИД   16150923 .
  25. ^ Саймон, Дон М.; Циммерли, Стивен (12 ноября 2008 г.). «Разнообразие нехарактерных обратных транскриптаз у бактерий» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (22): 7219–7229. дои : 10.1093/нар/gkn867 . ISSN   1362-4962 . ПМК   2602772 . ПМИД   19004871 .
  26. ^ Бобонис, Джейкоб; Митош, Карин; Матеуш, Андре; Керхер, Николай; Критикос, Джордж; Селкриг, Джоэл; Зитек, Матильда; Монзон, Вивиан; Пфальц, Биргит; Гарсия-Сантамарина, Сарела; Галардини, Марко; Суэки, Анна; Кобаяши, Кэлли; Штейн, Фрэнк; Бейтман, Алекс (01 сентября 2022 г.). «Бактериальные ретроны кодируют трехсторонние системы токсин-антитоксин, защищающие фага» (PDF) . Природы . 609 (7925): 144–150. Бибкод : 2022Natur.609..144B . дои : 10.1038/s41586-022-05091-4 . ISSN   0028-0836 . ПМИД   35850148 . S2CID   250643138 .
[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_RNAs&oldid=1209554338"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 1aaf1ce3d5234dd44dd77fd0865d7c78__1708597200
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/1a/78/1aaf1ce3d5234dd44dd77fd0865d7c78.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
List of RNAs - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)