Спутник (биология)

Спутник
	На (а) изображен ромбический кристалл вируса спутниковой табачной мозаики (STMV), длина которого превышает 1,5 мм, что примерно в 30 раз превышает объем любого кристалла STMV, когда-либо выращенного на Земле. Он был выращен в «Криостат» приборе Международной лаборатории микрогравитации-1 . На (b) изображен кубический кристалл того же вируса эквивалентного размера, опять же, намного превосходящий по размерам любой, выращенный в земной лаборатории.
Научная классификация
(без рейтинга):	Субвирусные агенты
(без рейтинга):	Спутник
Группы
	Спутниковые вирусы ; Сателлитные нуклеиновые кислоты ;

Сателлит вирусом - — это субвирусный агент которого зависит от коинфекции клетки-хозяина помощником , репликация . Сателлиты можно разделить на два основных класса: сателлитные вирусы и сателлитные нуклеиновые кислоты . ^{[ 1 ]} Сателлитные вирусы , которые чаще всего ассоциируются с растениями, также обнаруживаются у млекопитающих, членистоногих и бактерий. Они кодируют структурные белки, заключающие в себе их генетический материал, которые, следовательно, отличаются от структурных белков их вирусов-помощников. ^{[ 1 ]} Сателлитные нуклеиновые кислоты , напротив, не кодируют свои собственные структурные белки, а вместо этого инкапсулируются белками, кодируемыми их вирусами-помощниками. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} Длина геномов сателлитов варьируется от 359 нуклеотидов для РНК сателлитного вируса кольцевой пятнистости табака (STobRV). ^{[ 3 ]}

Большинство вирусов обладают способностью использовать ферменты хозяина или собственный механизм репликации для независимой репликации собственной вирусной РНК. Сателлиты, напротив, полностью зависят от вируса-помощника для репликации. Симбиотические отношения между сателлитом и вирусом-помощником, катализирующие репликацию сателлитного генома, также зависят от хозяина, предоставляющего такие компоненты, как репликазы. ^{[ 4 ]} осуществлять репликацию. ^{[ 5 ]}

Вирус-сателлит мамавируса , ингибирующий репликацию своего хозяина, получил название вирофага . ^{[ 6 ]} Однако использование этого термина остается спорным из-за отсутствия принципиальных различий между вирофагами и классическими сателлитными вирусами. ^{[ 7 ]}

История и открытия

Вирус некроза табака был вирусом, который привел к открытию первого вируса-спутника в 1962 году. Ученые обнаружили, что у первого спутника были компоненты для создания собственной белковой оболочки. Несколько лет спустя, в 1969 году, ученые обнаружили еще одну симбиотическую связь с неповирусом кольцевой пятнистости табака (TobRV) и другим сателлитным вирусом. ^{[ 8 ]} Считается, что появление сателлитной РНК произошло либо из генома хозяина, либо из его коинфицирующих агентов, а также из любых векторов, ведущих к передаче. ^{[ 9 ]}

Вирус-сателлит, важный для здоровья человека, который демонстрирует необходимость коинфекции для репликации и заражения внутри хозяина, - это вирус, вызывающий гепатит D. Вирус гепатита D или дельта-вирус (HDV) был открыт в 1977 году Марио Риццетто. ^{[ 10 ]} и отличается от гепатита А, В и С, поскольку для репликации и заражения клеток печени требуются вирусные частицы вируса гепатита В (ВГВ). HBV обеспечивает поверхностный антиген HBsAg , который используется HDV для создания суперинфекции, приводящей к печеночной недостаточности. ^{[ 11 ]} HDV встречается по всему миру, но наиболее распространен в Африке, на Ближнем Востоке и на юге Италии. ^{[ 11 ]}

Спутник в сравнении с вирусом

Спутник в сравнении с вирусом
	Спутник	Вирус
Репликация	Зависят от присутствия клеток-хозяев и вирусов-помощников для репликации своих геномов.	Зависят от присутствия клеток-хозяев для репликации их геномов.
Нуклеиновая кислота	Содержат ДНК или РНК	Содержат ДНК или РНК или и то, и другое в разные моменты жизненного цикла.
Размер генома	от 0,22 до 1,5 КБ	от 10 Кб до 1,5 Мб
Структура	Сателлитные вирусы кодируют собственные белковые капсиды с помощью вирусов-помощников. Сателлитные нуклеиновые кислоты не имеют капсидов, но для заключения своих геномов в них используются вирусы-помощники.	Упакуйте их геном в капсид (белковую оболочку). Имейте конверт (не все вирусы)
Диапазон хостов	Растения (наиболее распространенные), млекопитающие, членистоногие, бактерии.	Может инфицировать все типы организмов; животные, растения, грибы, бактерии, археи

Классификация

Классификация субвирусных агентов продолжается. Ниже используется схема субвирусных агентов из отчета ICTV за 2011 год. ^{[ 1 ]} С тех пор в 2019 году многим таксонам были присвоены более формальные названия, поэтому они включены, когда это возможно.

Спутниковые вирусы

Некоторым сателлитным вирусам присвоен таксон. Ниже отражены результаты предложения 2015 года, которое с тех пор было принято (Taxoprop 2015.009a). ^{[ 12 ]}

-сателлиты с одноцепочечной РНК Вирусы
- (не закреплен за семьей)
  - Альбетовирус - сателлитный вирус некроза табака 1, 2 и C.
  - Aumaivirus - спутниковый вирус мозаики белой линии кукурузы.
  - Папанивирус - сателлитный вирус мозаики Panicum.
  - Виртовирус – сателлитный вирус табачной мозаики , он же сателлитный вирус некроза табака.
- Семейство Сартровирусиды.
  - Макроновирус - сателлитный вирус Macrobrachium 1 (очень маленький вирус)
- (безымянный род) - комменсальный X-вирус скорбящих Нилапарвата.
- (безымянный род) - сателлитный вирус хронического паралича пчел.
с двухцепочечной ДНК Вирусы-сателлиты
- Семейство Lavidaviridae – Вирофаги.
с одноцепочечной ДНК Вирусы-сателлиты
- Род Dependoparvovirus - аденоассоциированных вирусов. группа

Сателлитные нуклеиновые кислоты

Следующее, возможно, не является исчерпывающим в освещении ICTV. В номенклатуре сателлитных РНК к названию вируса-хозяина добавляется префикс «sat».

Спутниковые нуклеиновые кислоты напоминают сателлитные нуклеиновые кислоты тем, что они реплицируются с помощью вирусов-помощников. Однако они отличаются тем, что могут кодировать функции, которые могут способствовать успеху их вспомогательных вирусов; хотя иногда их считают геномными элементами своих вирусов-помощников, они не всегда обнаруживаются внутри их вирусов-помощников.

Одноцепочечные сателлитные ДНК
- Семейство Alphasatellitidae (кодирующее белок-инициатор репликации) ^{[ 13 ]}
- Семейство Tolecusatellitidae ^{[ 14 ]}
  - Род Betasatellites (кодирующий детерминанту патогенности βC1)
  - Род Deltasatellites (кажется дефектным по βC1, но представляет собой отдельную группу)
Двухцепочечные сателлитные РНК
- Спутник вируса Saccharomyces cerevisiae M
- Вирус Ustilago maydis H, спутник M
- Сателлитный вирус Trichomonas vaginalis T1
- Partitiviridae Спутники вируса, ассоциированного с
  - дсРНК1
  - дсРНК1
- Вирус Zygosaccharomyces balii Satellite M / Zybavirus balii Satellite M
Одноцепочечные сателлитные РНК
- Большие линейные сателлитные РНК
- Малые линейные сателлитные РНК
- Кольцевые сателлитные РНК или « вирусоиды ».
  - Малая сателлитная РНК вируса мозаики арабиса
  - Спутниковая РНК вируса кольцевой пятнистости табака (satTRsV) выше двух образует кладу.
  - Спутниковая РНК вируса желтой крапчатости цикория (satCYMoV)
  - Сателлитная РНК вируса крапчатости Solanum nodiflorum
  - Спутниковая РНК вируса крапчатости подземного клевера
  - Спутниковая РНК вируса бархатной табачной крапчатости выше четырех образует кладу.
  - Спутниковая РНК вируса транзиторной полоски люцерны (satLTSV)
  - Спутниковая РНК вируса желтой карликов зерновых и вируса птичьего гриппа
  - Маленькая кольцевая виродоподобная РНК вишни
- Царство Ribozyviria / Семейство Kolmioviridae – дельтавирусоподобные сателлитные РНК
  - Род Deltavirus - гепаднавирусами. сателлитные РНК, ассоциированные с
- полеровирусом РНК, ассоциированные с

См. также

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «3 – Сателлиты и другие вирусозависимые нуклеиновые кислоты – Субвирусные агенты – Субвирусные агенты (2011)» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . ( более новая версия; не упоминаются спутники ^{[ мертвая ссылка ]})
^ Баэз, Джон. «Субклеточные формы жизни» . Калифорнийский университет, Риверсайд . Проверено 4 июня 2020 г.
^ Уэйн Л. Герлах; Джамал М. Бузаян; Ирвинг Р. Шнайдер; Джордж Брюнинг (1986). «РНК вируса кольцевой пятнистости табака: биологическая активность клонов ДНК и их транскриптов in vitro». Вирусология . 151 (2): 172–185. дои : 10.1016/0042-6822(86)90040-1 . ПМИД 18640636 .
^ Ху, Чунг-Чи; Сюй, Яу-Хейу; Линь, На-Шэн (18 декабря 2009 г.). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений» . Вирусы . 1 (3): 1325–1350. дои : 10.3390/v1031325 . ПМК 3185516 . ПМИД 21994595 .
^ Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Матиас Г. (1 января 2016 г.). «Система классификации вирофагов и сателлитных вирусов» . Архив вирусологии . 161 (1): 233–247. дои : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . ISSN 0304-8608 . ПМИД 26446887 .
^ Бернар Ла Скола; Кристель Десню; Изабель Панье; Кэтрин Роберт; Лина Баррасси; Гислен Фурнус; Мишель Мерша; Мари Сюзан-Монти; Патрик Фортер ; Евгений Кунин и Дидье Рауль (2008). «Вирофаг как уникальный паразит гигантского мимивируса». Природа . 455 (7205): 100–4. Бибкод : 2008Natur.455..100L . дои : 10.1038/nature07218 . ПМИД 18690211 . S2CID 4422249 .
^ Крупович М; Цвиркайте-Крупович В (2011). «Вирофаги или сателлитные вирусы?». Nat Rev Микробиол . 9 (11): 762–763. дои : 10.1038/nrmicro2676 . ПМИД 22016897 . S2CID 41271832 .
^ Руссинк, MJ; Слит, Д.; Палукайтис, П. (июнь 1992 г.). «Сателлитные РНК вирусов растений: структуры и биологические эффекты» . Микробиологические обзоры . 56 (2): 265–279. дои : 10.1128/MMBR.56.2.265-279.1992 . ISSN 0146-0749 . ПМЦ 372867 . ПМИД 1620065 .
^ Ху, Чунг-Чи; Сюй, Яу-Хейу; Линь, На-Шэн (2009). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений» . Вирусы . 1 (3): 1325–1350. дои : 10.3390/v1031325 . ПМК 3185516 . ПМИД 21994595 .
^ «Вирус гепатита Д» . веб-сайт Stanford.edu . Проверено 1 декабря 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б «Гепатит Д: История вопроса, этиология, эпидемиология» . Медскейп . Проверено 1 декабря 2017 г.
^ Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Матиас Г. (7 октября 2015 г.). «Система классификации вирофагов и сателлитных вирусов» . Архив вирусологии . 161 (1): 233–247. дои : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . ПМИД 26446887 .
^ Таксопроп 2017.004P
^ Таксопроп 2016.021a-kP

Внешние ссылки

ICTV
«Субклеточный» . Субклеточные формы жизни

[ICTV-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с ^д «3 – Сателлиты и другие вирусозависимые нуклеиновые кислоты – Субвирусные агенты – Субвирусные агенты (2011)» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV) . ( более новая версия; не упоминаются спутники ^{[ мертвая ссылка ]})

[2] Баэз, Джон. «Субклеточные формы жизни» . Калифорнийский университет, Риверсайд . Проверено 4 июня 2020 г.

[3] Уэйн Л. Герлах; Джамал М. Бузаян; Ирвинг Р. Шнайдер; Джордж Брюнинг (1986). «РНК вируса кольцевой пятнистости табака: биологическая активность клонов ДНК и их транскриптов in vitro». Вирусология . 151 (2): 172–185. дои : 10.1016/0042-6822(86)90040-1 . ПМИД 18640636 .

[4] Ху, Чунг-Чи; Сюй, Яу-Хейу; Линь, На-Шэн (18 декабря 2009 г.). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений» . Вирусы . 1 (3): 1325–1350. дои : 10.3390/v1031325 . ПМК 3185516 . ПМИД 21994595 .

[5] Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Матиас Г. (1 января 2016 г.). «Система классификации вирофагов и сателлитных вирусов» . Архив вирусологии . 161 (1): 233–247. дои : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . ISSN 0304-8608 . ПМИД 26446887 .

[6] Бернар Ла Скола; Кристель Десню; Изабель Панье; Кэтрин Роберт; Лина Баррасси; Гислен Фурнус; Мишель Мерша; Мари Сюзан-Монти; Патрик Фортер ; Евгений Кунин и Дидье Рауль (2008). «Вирофаг как уникальный паразит гигантского мимивируса». Природа . 455 (7205): 100–4. Бибкод : 2008Natur.455..100L . дои : 10.1038/nature07218 . ПМИД 18690211 . S2CID 4422249 .

[7] Крупович М; Цвиркайте-Крупович В (2011). «Вирофаги или сателлитные вирусы?». Nat Rev Микробиол . 9 (11): 762–763. дои : 10.1038/nrmicro2676 . ПМИД 22016897 . S2CID 41271832 .

[8] Руссинк, MJ; Слит, Д.; Палукайтис, П. (июнь 1992 г.). «Сателлитные РНК вирусов растений: структуры и биологические эффекты» . Микробиологические обзоры . 56 (2): 265–279. дои : 10.1128/MMBR.56.2.265-279.1992 . ISSN 0146-0749 . ПМЦ 372867 . ПМИД 1620065 .

[:02-9] Ху, Чунг-Чи; Сюй, Яу-Хейу; Линь, На-Шэн (2009). «Сателлитные РНК и сателлитные вирусы растений» . Вирусы . 1 (3): 1325–1350. дои : 10.3390/v1031325 . ПМК 3185516 . ПМИД 21994595 .

[10] «Вирус гепатита Д» . веб-сайт Stanford.edu . Проверено 1 декабря 2017 г.

[:0-11] Перейти обратно: ^а ^б «Гепатит Д: История вопроса, этиология, эпидемиология» . Медскейп . Проверено 1 декабря 2017 г.

[12] Крупович, Март; Кун, Йенс Х.; Фишер, Матиас Г. (7 октября 2015 г.). «Система классификации вирофагов и сателлитных вирусов» . Архив вирусологии . 161 (1): 233–247. дои : 10.1007/s00705-015-2622-9 . hdl : 11858/00-001M-0000-0028-DC34-F . ПМИД 26446887 .

[13] Таксопроп 2017.004P

[14] Таксопроп 2016.021a-kP

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]