Малая специфичная для организма РНК Кахаля

Малая специфичная для тела Кахаля РНК 1
Малая специфичная для тела Кахаля РНК 1
	Предсказанная вторичная структура специфичной РНК 1 малого тельца Кахаля
Идентификаторы
Символ	СКАРНА1
Рфам	РФ00553
Другие данные
РНК Тип	ген , мяРНК , мяРНК , скаРНК;
Домен(ы)	Позвоночные животные
PDB Структуры	ПДБе

Малые РНК, специфичные для тела Кахаля ( scaRNA ), представляют собой класс малых ядрышковых РНК (snoRNA), которые специфически локализуются в теле Кахаля , ядерной органелле (клеточной суборганелле), участвующей в биогенезе малых ядерных рибонуклеопротеинов (мяРНП или snurps). ScaRNAs управляют модификацией ( метилированием и псевдоуридилированием ) РНК-полимеразой II транскрибируемых сплайсосомальных РНК U1 , U2 , U4 , U5 и U12 .

Первой идентифицированной скаРНК была U85. ^{[ 1 ]} Он отличается от типичных мякРНК тем, что представляет собой составную мякРНК C/D-бокса и H/ACA-бокса и может управлять как псевдоуридилированием, так и 2'- O -метилированием. Не все scaRNA представляют собой составные snoRNA C/D и H/ACA-бокса, и большинство scaRNA структурно и функционально неотличимы от snoRNA, направляя модификацию рибосомальной РНК (рРНК) в ядрышке .

дрозофилы мРНК

Несколько исследований выявили scaRNA у дрозофилы . ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Одно из исследований показало, что несколько scaRNA дрозофилы могут одинаково хорошо функционировать в нуклеоплазме мутантных мух, у которых отсутствуют тельца Кахаля. ^{[ 4 ]} Дальнейшие исследования показали, что scaRNA pugU6-40 нацелена на мяРНК U6, модификация которой происходит в ядрышке, а не в CB, и что pugU1-6 и pug U2-55 направляют 2 РНК: мяРНК и 28s рРНК. ^{[ 5 ]}

Малая специфичная для организма Кахаля РНК 1

В молекулярной биологии малая специфичная для тела Кахаля РНК 1 (также известная как SCARNA1 или ACA35) представляет собой небольшую ядрышковую РНК, обнаруженную в тельцах Кахаля и, как полагают, участвует в псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U2 по остатку U89.

scaRNA1 представляет собой некодирующую РНК , которая является функциональным продуктом генов, не транслируемых в белки . Такие молекулы РНК обычно содержат важные вторичные структуры лиганды или мотивы, связывающие , и участвуют во многих важных биологических процессах в клетке. ^{[ 6 ]}

scaRNA1 принадлежит к классу мякРНК H/ACA-бокса , поскольку он имеет предсказанную структуру «шпилька-шарнир-шпилька-хвост», консервативные мотивы H/ACA-бокса и обнаруживается, что он связан с GAR1 . белком ^{[ 7 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Жади Б.Е., Kiss T (февраль 2001 г.). «Маленькая ядрышковая направляющая РНК участвует как в метилировании 2'- О -рибозы, так и в псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U5» . Журнал ЭМБО . 20 (3): 541–551. дои : 10.1093/emboj/20.3.541 . ПМЦ 133463 . ПМИД 11157760 .
^ Торториелло Дж., Аккардо МК, Скиало Ф, Ангрисани А, Турано М, Фурия М (май 2009 г.). «Новая антисмысловая скаРНК дрозофилы с предсказанной направляющей функцией». Джин . 436 (1–2): 56–65. дои : 10.1016/j.gene.2009.02.005 . ПМИД 19230845 .
^ Тыковски К.Т., Шу, доктор медицинских наук, Кукойи А., Стейц Дж.А. (апрель 2009 г.). «Консервативный белок WD40 связывает сигнал локализации телец Кахаля частиц scaRNP» . Молекулярная клетка . 34 (1): 47–57. doi : 10.1016/j.molcel.2009.02.020 . ПМК 2700737 . ПМИД 19285445 .
^ Jump up to: ^а ^б Дерюшева С., Галл Дж.Г. (декабрь 2009 г.). «Малые РНК, специфичные для тел Кахаля, дрозофилы функционируют в отсутствие телец Кахаля» . Молекулярная биология клетки . 20 (24): 5250–5259. дои : 10.1091/mbc.E09-09-0777 . ПМЦ 2793299 . ПМИД 19846657 .
^ Jump up to: ^а ^б Дерюшева С., Галл Ю.Г. (декабрь 2013 г.). «Новые малые РНК, специфичные для тела Кахаля, идентифицированные у дрозофилы: исследование функции направляющей РНК» . РНК . 19 (12): 1802–1814. дои : 10.1261/rna.042028.113 . ПМЦ 3884663 . ПМИД 24149844 .
^ Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс 2'-O-метилирования и направляющих псевдоуридилирования РНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–2756. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .
^ Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .

Внешние ссылки

Эта по биохимии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid11157760-1] Jump up to: ^а ^б Жади Б.Е., Kiss T (февраль 2001 г.). «Маленькая ядрышковая направляющая РНК участвует как в метилировании 2'- О -рибозы, так и в псевдоуридилировании сплайсосомальной РНК U5» . Журнал ЭМБО . 20 (3): 541–551. дои : 10.1093/emboj/20.3.541 . ПМЦ 133463 . ПМИД 11157760 .

[2] Торториелло Дж., Аккардо МК, Скиало Ф, Ангрисани А, Турано М, Фурия М (май 2009 г.). «Новая антисмысловая скаРНК дрозофилы с предсказанной направляющей функцией». Джин . 436 (1–2): 56–65. дои : 10.1016/j.gene.2009.02.005 . ПМИД 19230845 .

[3] Тыковски К.Т., Шу, доктор медицинских наук, Кукойи А., Стейц Дж.А. (апрель 2009 г.). «Консервативный белок WD40 связывает сигнал локализации телец Кахаля частиц scaRNP» . Молекулярная клетка . 34 (1): 47–57. doi : 10.1016/j.molcel.2009.02.020 . ПМК 2700737 . ПМИД 19285445 .

[:0-4] Jump up to: ^а ^б Дерюшева С., Галл Дж.Г. (декабрь 2009 г.). «Малые РНК, специфичные для тел Кахаля, дрозофилы функционируют в отсутствие телец Кахаля» . Молекулярная биология клетки . 20 (24): 5250–5259. дои : 10.1091/mbc.E09-09-0777 . ПМЦ 2793299 . ПМИД 19846657 .

[:1-5] Jump up to: ^а ^б Дерюшева С., Галл Ю.Г. (декабрь 2013 г.). «Новые малые РНК, специфичные для тела Кахаля, идентифицированные у дрозофилы: исследование функции направляющей РНК» . РНК . 19 (12): 1802–1814. дои : 10.1261/rna.042028.113 . ПМЦ 3884663 . ПМИД 24149844 .

[darzacq_2002-6] Дарзак X, Жади Б.Е., Верхегген С., Кисс А.М., Бертран Э., Кисс Т. (июнь 2002 г.). «Малые ядерные РНК, специфичные для тела Кахаля: новый класс 2'-O-метилирования и направляющих псевдоуридилирования РНК» . Журнал ЭМБО . 21 (11): 2746–2756. дои : 10.1093/emboj/21.11.2746 . ПМК 126017 . ПМИД 12032087 .

[pmid15199136-7] Kiss AM, Jády BE, Bertrand E, Kiss T (июль 2004 г.). «Человеческий ящик H / ACA, направляющий псевдоуридилирование РНК» . Молекулярная и клеточная биология . 24 (13): 5797–5807. дои : 10.1128/MCB.24.13.5797-5807.2004 . ПМК 480876 . ПМИД 15199136 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]