Модифицированная нуклеозидами информационная РНК
( Модифицированная нуклеозидами информационная РНК модРНК ) представляет собой синтетическую информационную РНК (мРНК), в которой некоторые нуклеозиды заменены другими естественно модифицированными нуклеозидами или синтетическими аналогами нуклеозидов . [1] modRNA используется для индуцирования выработки желаемого белка в определенных клетках. Важным применением является разработка мРНК-вакцин , из которых первыми разрешенными были вакцины против COVID-19 (такие как Комирнати и Спикевакс ).
Фон
[ редактировать ]
мРНК производится путем синтеза цепи рибонуклеиновой кислоты (РНК) из строительных блоков нуклеотидов в соответствии с матрицей дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК). Этот процесс называется транскрипцией . [2] Когда строительные блоки, предоставляемые РНК-полимеразе, включают нестандартные нуклеозиды, такие как псевдоуридин — вместо стандартных нуклеозидов аденозина , цитидина , гуанозина и уридина — полученная мРНК описывается как модифицированная нуклеозидами. [3]
Производство белка начинается со сборки рибосом на мРНК, последняя затем служит основой для синтеза белков , определяя их аминокислотную последовательность на основе генетического кода в процессе биосинтеза белка, называемого трансляцией . [4]
Обзор
[ редактировать ]Чтобы побудить клетки вырабатывать белки, которые они обычно не производят, можно ввести гетерологичную мРНК в цитоплазму клетки, минуя необходимость транскрипции. Другими словами, проект чужеродных белков «проносится» в клетки. Однако для достижения этой цели необходимо обойти клеточные системы, которые предотвращают проникновение и трансляцию чужеродной мРНК. Существуют почти повсеместно распространенные ферменты, называемые рибонуклеазами (также называемые РНКазами), которые расщепляют незащищенную мРНК. [5] Существуют также внутриклеточные барьеры против чужеродной мРНК, такие как рецепторы врожденной иммунной системы , толл-подобные рецепторы (TLR) 7 и TLR8 , расположенные в эндосомальных мембранах. Сенсоры РНК, такие как TLR7 и TLR8, могут резко снижать синтез белка в клетке, вызывать высвобождение цитокинов, таких как интерферон и TNF-альфа , и при достаточной интенсивности приводить к запрограммированной гибели клеток . [6]
Воспалительную природу экзогенной РНК можно замаскировать путем модификации нуклеозидов в мРНК. [7] Например, уридин можно заменить аналогичным нуклеозидом, таким как псевдоуридин (Ψ) или N1-метилпсевдуридин (m1Ψ), [8] а цитозин может быть заменен 5-метилцитозином . [9] Некоторые из них, такие как псевдоуридин и 5-метилцитозин, встречаются в природе у эукариот . [10] в то время как m1Ψ в природе встречается у архей . [11] Включение этих модифицированных нуклеозидов изменяет вторичную структуру мРНК, что может снизить распознавание врожденной иммунной системой, но при этом обеспечить эффективную трансляцию. [9]
Значение непереведенных регионов
[ редактировать ]Нормальная мРНК начинается и заканчивается участками, которые не кодируют аминокислоты реального белка. Эти последовательности на 5'- и 3'-концах цепи мРНК называются нетранслируемыми областями (UTR). Две UTR на концах их цепей необходимы для стабильности мРНК, а также модРНК, а также для эффективности трансляции, т.е. для количества продуцируемого белка. Выбирая подходящие UTR во время синтеза модРНК, можно оптимизировать продукцию целевого белка в клетках-мишенях. [5] [12]
Доставка
[ редактировать ]
Введение modRNA в определенные клетки-мишени сопряжено с различными трудностями. Во-первых, modRNA должна быть защищена от рибонуклеаз . [5] Этого можно добиться, например, обернув его липосомами . Такая «упаковка» также может помочь гарантировать всасывание modRNA в клетки-мишени. Это полезно, например, при использовании в вакцинах , поскольку наночастицы поглощаются дендритными клетками и макрофагами , которые играют важную роль в активации иммунной системы. [13]
Кроме того, может оказаться желательным, чтобы применяемая модРНК вводилась в конкретные клетки организма. Это имеет место, например, если клеток сердечной мышцы необходимо стимулировать размножение . В этом случае упакованную modRNA можно инъецировать непосредственно в артерию, например коронарную артерию . [14]
Приложения
[ редактировать ]Важной областью применения являются мРНК-вакцины .
Замена уридина псевдоуридином . для обхода врожденной иммунной системы была впервые предложена Карико и Вайсманом в 2005 году [15] [16] За свою работу они получили Нобелевскую премию по физиологии и медицине 2023 года. [17]
Еще одна веха была достигнута, когда команда Корманна и других в 2011 году продемонстрировала жизненно важную эффективность модифицированной нуклеозидами мРНК на мышиной модели летального заболевания легких. [18]
N1-метил-псевдоуридин использовался в испытаниях вакцины против вируса Зика . [19] [20] [21] ВИЧ-1 , [21] грипп , [21] и Эбола [22] в 2017–2018 гг. [23] : 5
Первыми разрешенными для использования на людях были вакцины против COVID-19 вакцинами против SARS-CoV-2 . [24] [25] [26] [27] [28] [29] [30] Примеры вакцин против COVID-19, использующих модРНК, включают вакцины, разработанные в сотрудничестве BioNTech / Pfizer ( BNT162b2 ) и Moderna ( мРНК-1273 ). [31] [32] [33] Однако в вакцине зорецимеран , разработанной Curevac , используется немодифицированная РНК. [34] вместо этого полагаясь на оптимизацию кодонов, чтобы минимизировать присутствие уридина. Однако эта вакцина менее эффективна. [35] [16]
Другие возможные применения modRNA включают регенерацию поврежденной ткани сердечной мышцы, [36] [37] средство для замены ферментов [38] и терапия рака. [39] [40]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Чиен К.Р., Занги Л., Луи КО (октябрь 2014 г.). «Синтетическая химически модифицированная мРНК (модРНК): к новой технологической платформе для сердечно-сосудистой биологии и медицины» . Перспективы Колд-Спринг-Харбора в медицине . 5 (1): а014035. doi : 10.1101/cshperspect.a014035 . ПМК 4292072 . ПМИД 25301935 .
- ^ Альбертс Б., Джонсон А., Льюис Дж., Рафф М., Робертс К., Уолтер П. (2002). От ДНК к РНК (4-е изд.). Гирляндная наука.
- ^ Парди Н., Вайсман Д. (2017). «Нуклеозид-модифицированные мРНК-вакцины для инфекционных заболеваний». РНК-вакцины . Методы молекулярной биологии. Том. 1499. Клифтон, Нью-Джерси, стр. 109–121. дои : 10.1007/978-1-4939-6481-9_6 . ISBN 978-1-4939-6479-6 . ПМИД 27987145 .
{{cite book}}
: CS1 maint: отсутствует местоположение издателя ( ссылка ) - ^ Лодиш Х., Берк А., Зипурски С.Л., Мацудайра П., Балтимор Д., Дарнелл Дж. (2000). Три роли РНК в синтезе белка (4-е изд.). Нью-Йорк: WH Freeman. п. п. 4.4.
- ^ Jump up to: а б с Шлейк Т., Тесс А., Фотин-Млечек М., Каллен К.Дж. (ноябрь 2012 г.). «Разработка технологий мРНК-вакцины» . Биология РНК . 9 (11): 1319–1330. дои : 10.4161/rna.22269 . ПМЦ 3597572 . ПМИД 23064118 .
- ^ Далпке А., Хелм М. (июнь 2012 г.). «РНК-опосредованная стимуляция Toll-подобных рецепторов в норме и при заболеваниях» . Биология РНК . 9 (6): 828–842. дои : 10.4161/rna.20206 . ПМЦ 3495747 . ПМИД 22617878 .
- ^ Карико К., Бакштейн М., Ни Х., Вайсман Д. (август 2005 г.). «Подавление распознавания РНК Toll-подобными рецепторами: влияние модификации нуклеозидов и эволюционное происхождение РНК» . Иммунитет . 23 (2): 165–175. doi : 10.1016/j.immuni.2005.06.008 . ПМИД 16111635 .
- ^ Андрис О., Мак Кафферти С., Де Смедт С.К., Вайс Р., Сандерс Н.Н., Китада Т. (ноябрь 2015 г.). «МРНК, включенная в N(1)-метилпсевдуридин, превосходит мРНК, включенную в псевдоуридин, обеспечивая повышенную экспрессию белка и снижение иммуногенности в клеточных линиях млекопитающих и мышах» . Журнал контролируемого выпуска . 217 : 337–344. дои : 10.1016/j.jconrel.2015.08.051 . hdl : 1854/LU-6993270 . ПМИД 26342664 .
- ^ Jump up to: а б Свиткин Ю.В., Ченг Ю.М., Чакраборти Т., Пресняк В., Джон М., Соненберг Н. (июнь 2017 г.). «N1-метилпсевдуридин в мРНК усиливает трансляцию посредством eIF2α-зависимых и независимых механизмов за счет увеличения плотности рибосом» . Исследования нуклеиновых кислот . 45 (10): 6023–6036. дои : 10.1093/нар/gkx135 . ПМЦ 5449617 . ПМИД 28334758 .
- ^ Хорнес Т.П., Клементи Н., Фазерл К., Гласнер Х., Брейкер К., Линднер Х. и др. (январь 2016 г.). «Нуклеотидные модификации бактериальных информационных РНК регулируют их трансляцию и способны перемонтировать генетический код» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (2): 852–862. дои : 10.1093/nar/gkv1182 . ПМЦ 4737146 . ПМИД 26578598 .
- ^ Вурм Дж.П., Гриз М., Бахр У., Хелд М., Хекель А., Карас М. и др. (март 2012 г.). «Идентификация фермента, ответственного за N1-метилирование псевдоуридина 54 в тРНК архей» . РНК . 18 (3): 412–420. дои : 10.1261/rna.028498.111 . ПМК 3285930 . ПМИД 22274954 .
Напротив, у большинства архей это положение занимает другой гипермодифицированный нуклеотид: изостерический N1-метилированный псевдоуридин.
- ^ Орландини фон Ниссен А.Г., Полеганов М.А., Рехнер С., Плашке А., Кранц Л.М., Фессер С. и др. (апрель 2019 г.). «Улучшение доставки терапевтических генов на основе мРНК путем увеличения экспрессии 3'-UTR, идентифицированных с помощью скрининга клеточной библиотеки» . Молекулярная терапия . 27 (4): 824–836. дои : 10.1016/j.ymthe.2018.12.011 . ПМК 6453560 . ПМИД 30638957 .
- ^ Чжао Л., Сет А., Вибово Н., Чжао С.Х., Миттер Н., Ю.С., Мидделберг А.П. (январь 2014 г.). «Наночастичные вакцины» . Вакцина . 32 (3): 327–337. doi : 10.1016/j.vaccine.2013.11.069 . ПМИД 24295808 .
- ^ Карлссон Л., Кларк Дж.К., Йен С., Грегуар Ф., Олбери Т., Биллгер М. и др. (июнь 2018 г.). «Биосовместимая, очищенная мРНК VEGF-A улучшает функцию сердца после внутрисердечной инъекции через 1 неделю после инфаркта миокарда у свиней» . Молекулярная терапия. Методы и клинические разработки . 9 : 330–346. дои : 10.1016/j.omtm.2018.04.003 . ПМК 6054703 . ПМИД 30038937 .
- ^ Карико К., Бакштейн М., Ни Х., Вайсман Д. (август 2005 г.). «Подавление распознавания РНК Toll-подобными рецепторами: влияние модификации нуклеозидов и эволюционное происхождение РНК» . Иммунитет . 23 (2): 165–175. doi : 10.1016/j.immuni.2005.06.008 . ПМИД 16111635 .
- ^ Jump up to: а б Долгин Э. (сентябрь 2021 г.). «Запутанная история мРНК-вакцин». Природа . 597 (7876): 318–324. Бибкод : 2021Natur.597..318D . дои : 10.1038/d41586-021-02483-w . ПМИД 34522017 . S2CID 237515383 .
- ^ «Нобелевская премия по физиологии и медицине 2023 года» .
- ^ Корманн, Майкл С.Д.; Хазенпуш, Гюнтер; Анея, Маниш К.; Ника, Габриэла; Флеммер, Андреас В.; Гербер-Жонат, Сюзанна; Хуппманн, Марселин; Мэйс, Лорен Э.; Иллени, Марта; Шамс, Андреа; Гриз, Матиас; Биттманн, Ирис; Хэндгретингер, Руперт; Хартл, Доминик; Рознекер, Джозеф (февраль 2011 г.). «Экспрессия терапевтических белков после доставки химически модифицированной мРНК мышам» . Природная биотехнология . 29 (2): 154–157. дои : 10.1038/nbt.1733 . ISSN 1546-1696 . ПМИД 21217696 . S2CID 205275040 .
- ^ Парди Н., Хоган М.Дж., Пелк Р.С., Мурамацу Х., Андерсен Х., ДеМасо Ч.Р. и др. (март 2017 г.). «Защита от вируса Зика с помощью однократной вакцинации мРНК с модифицированной нуклеозидами низкой дозой» . Природа . 543 (7644): 248–251. Бибкод : 2017Natur.543..248P . дои : 10.1038/nature21428 . ПМК 5344708 . ПМИД 28151488 .
мы разработали мощную вакцину против ZIKV… содержащую модифицированный нуклеозид 1-метилпсевдоуридин (m1Ψ)
- ^ Ричнер Дж.М., Химансу С., Дауд К.А., Батлер С.Л., Салазар В., Фокс Дж.М. и др. (март 2017 г.). «Вакцины с модифицированной мРНК защищают от инфекции вируса Зика» . Клетка . 168 (6): 1114–1125.e10. дои : 10.1016/j.cell.2017.02.017 . ПМЦ 5388441 . ПМИД 28222903 .
Была синтезирована мРНК… где UTP был заменен на 1-метилпсевдоUTP.
- ^ Jump up to: а б с Парди Н., Хоган М.Дж., Нарадикян М.С., Паркхаус К., Кейн Д.В., Джонс Л. и др. (июнь 2018 г.). «Вакцины с модифицированной нуклеозидами мРНК индуцируют мощные реакции Т-фолликулярных хелперов и В-клеточных ответов зародышевого центра» . Журнал экспериментальной медицины . 215 (6): 1571–1588. дои : 10.1084/jem.20171450 . ПМЦ 5987916 . ПМИД 29739835 .
В этом исследовании мы характеризуем иммуногенность трех вакцин, состоящих из m1Ψ-модифицированных, FPLC-очищенных мРНК-LNP, кодирующих оболочку ВИЧ-1 (Env), ZIKV prM-E и гемагглютинина вируса гриппа (HA).
- ^ Мейер М, Хуанг Э, Южаков О, Раманатан П, Чиарамелла Г, Букреев А (январь 2018 г.). «Модифицированные вакцины на основе мРНК вызывают устойчивые иммунные реакции и защищают морских свинок от болезни, вызванной вирусом Эбола» . Журнал инфекционных болезней . 217 (3): 451–455. дои : 10.1093/infdis/jix592 . ПМЦ 5853918 . ПМИД 29281112 .
Были синтезированы две мРНК-вакцины... в которых УТФ были заменены на 1-метилпсевдоУТФ.
- ^ Мораис П., Адачи Х., Ю.Т. (04.11.2021). «Критический вклад псевдоуридина в мРНК вакцин против COVID-19» . Границы клеточной биологии и биологии развития . 9 : 789427. doi : 10.3389/fcell.2021.789427 . ПМК 8600071 . ПМИД 34805188 .
- ^ «Pfizer и BioNTech празднуют историческое первое разрешение на использование вакцины для профилактики COVID-19 в США» . www.businesswire.com . 12 декабря 2020 г.
- ^ Полак Ф.П., Томас С.Дж., Китчин Н., Абсалон Дж., Гуртман А., Локхарт С. и др. (декабрь 2020 г.). «Безопасность и эффективность вакцины мРНК BNT162b2 Covid-19» . Медицинский журнал Новой Англии . 383 (27): 2603–2615. дои : 10.1056/NEJMoa2034577 . ПМЦ 7745181 . ПМИД 33301246 . S2CID 228087117 .
- ^ Хоманн-Джедди С (10 ноября 2020 г.). «Надежда BNT162b2: как работают мРНК-вакцины?» . Фармацевтическая газета (на немецком языке) . Проверено 28 ноября 2020 г.
- ^ Аббаси Дж. (сентябрь 2020 г.). «COVID-19 и мРНК-вакцины — первое крупное испытание нового подхода» . ДЖАМА . 324 (12): 1125–1127. дои : 10.1001/jama.2020.16866 . ПМИД 32880613 . S2CID 221476409 .
- ^ Фогель А., Каневский И., Че Ю., Суонсон К., Муик А., Формер М. и др. (8 сентября 2020 г.). «Префузионная РНК-вакцина SARS-CoV-2 обладает высокой иммуногенностью и предотвращает легочную инфекцию у приматов, кроме человека» (PDF) . биоRxiv . дои : 10.1101/2020.09.08.280818 . S2CID 221589144 .
- ^ «Условия авторизации вакцины Pfizer/BioNTech против COVID-19» (Решение). Агентство по регулированию лекарственных средств и товаров медицинского назначения. 8 декабря 2020 г.
- ^ Офис комиссара (14 декабря 2020 г.). «Вакцина Pfizer-BioNTech против COVID-19» . www.fda.gov (Решение). США FDA .
- ^ Краммер Ф. (октябрь 2020 г.). «Вакцина против SARS-CoV-2 находится в разработке» . Природа . 586 (7830): 516–527. Бибкод : 2020Natur.586..516K . дои : 10.1038/s41586-020-2798-3 . ПМИД 32967006 . S2CID 221887746 .
- ^ «Трубопровод Модерны» . Модерна . Проверено 28 ноября 2020 г.
- ^ Долгин Э (ноябрь 2020 г.). «Вакцины против COVID-19 готовы к выпуску, но влияние на пандемию неясно». Природная биотехнология : d41587–020–00022-у. дои : 10.1038/d41587-020-00022-y . ПМИД 33239758 . S2CID 227176634 .
- ^ "COVID-19" . КюрВак . Проверено 21 декабря 2020 г.
- ^ Долгин Э (июнь 2021 г.). «Ухудшение качества вакцины CureVac против COVID подчеркивает проблемы разработки мРНК» . Природа . 594 (7864): 483. Бибкод : 2021Natur.594..483D . дои : 10.1038/d41586-021-01661-0 . ПМИД 34145413 . S2CID 235480198 .
- ^ Каур К., Занги Л. (декабрь 2020 г.). «Модифицированная мРНК как терапевтический инструмент для сердца» . Сердечно-сосудистые препараты и терапия . 34 (6): 871–880. дои : 10.1007/s10557-020-07051-4 . ПМЦ 7441140 . ПМИД 32822006 .
- ^ Занги Л., Луи КО, фон Гиз А., Ма К., Эбина В., Пташек Л.М. и др. (октябрь 2013 г.). «Модифицированная мРНК управляет судьбой клеток-предшественников сердца и индуцирует регенерацию сосудов после инфаркта миокарда» . Природная биотехнология . 31 (10): 898–907. дои : 10.1038/nbt.2682 . ПМК 4058317 . ПМИД 24013197 .
- ^ Тер Хуурне, Менно; Паркер, Бенджамин Л.; Лю, Нин Цин; Цянь, Элизабет Линг; Вивьен, Селин; Каравендзас, Кэти; Миллс, Ричард Дж.; Сэвилл, Дженнифер Т.; Абу-Бонсра, папа; Уайз, Андреа Ф.; Хадсон, Джеймс Э.; Талбот, Эндрю С.; Финн, Патрик Ф.; Мартини, Паоло Г.В.; Фуллер, Мария (07 сентября 2023 г.). «Обработка GLA-модифицированной РНК снижает уровни GB3 в кардиомиоцитах, полученных из ИПСК, у людей, пораженных болезнью Фабри» . Американский журнал генетики человека . 110 (9): 1600–1605. дои : 10.1016/j.ajhg.2023.07.013 . ISSN 1537-6605 . ПМЦ 10502840 . ПМИД 37607539 .
- ^ Макнамара М.А., Наир С.К., Холл Е.К. (2015). «РНК-вакцины в иммунотерапии рака» . Журнал иммунологических исследований . 2015 : 794528. doi : 10.1155/2015/794528 . ПМЦ 4668311 . ПМИД 26665011 .
- ^ Вербеке Р., Лентакер И., Уэйтек Л., Брекпот К., Ван Бокстал М., Декамп Б. и др. (ноябрь 2017 г.). «Совместная доставка нуклеозид-модифицированной мРНК и агонистов TLR для иммунотерапии рака: восстановление иммуногенности иммунотихой мРНК». Журнал контролируемого выпуска . 266 : 287–300. дои : 10.1016/j.jconrel.2017.09.041 . ПМИД 28987878 . S2CID 20794075 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Бадеян З.С., Эванс Т. (август 2019 г.). «Краткий обзор: применение химически модифицированной мРНК в преобразовании клеточной судьбы и тканевой инженерии» . Трансляционная медицина стволовых клеток . 8 (8): 833–843. дои : 10.1002/sctm.18-0259 . ПМК 6646692 . ПМИД 30891922 .
- Эспесет А.С., Сехас П.Дж., Цитрон М.П., Ван Д., ДиСтефано Д.Д., Каллахан С. и др. (2020). «Вакцины на основе модифицированных мРНК/липидных наночастиц, экспрессирующие варианты белка F респираторно-синцитиального вируса, являются иммуногенными и защитными в моделях инфекции RSV на грызунах» . НПЖ Вакцины . 5 (1): 16. дои : 10.1038/s41541-020-0163-z . ПМК 7021756 . ПМИД 32128257 .