Трепонема сокранская
| Трепонема сокранская | |
|---|---|
Научная классификация 
| |
| Домен: | Бактерии |
| Тип: | Спирохетата |
| Сорт: | Спирохета |
| Заказ: | Спирохеты |
| Семья: | Трепонемовые |
| Род: | Трепонема |
| Разновидность: | Т. Сокранский
|
| Биномиальное имя | |
| Трепонема сокранская Смайберт и др. 1984 г. [ 1 ]
| |
Трепонема сокранская была выделена из мазков с десен людей с пародонтитом и клинически вызванным пародонтитом. [ 2 ] Это подвижный , спирально свернутый облигатный анаэроб , который лучше всего растет при 37 °C и является новым представителем своего рода из-за своей способности ферментировать молекулы, чего не могут сделать другие виды трепонем . [ 2 ] [ 3 ] Рост T. socranski положительно коррелирует с воспалением десен , что указывает на то, что он является основной причиной гингивита и пародонтита. [ 4 ]
Открытие и изоляция
[ редактировать ]Роберт Смайберт, Джон Джонсон и Ричард Рэнни выделили Treponema socranski в Вирджинии в 1984 году. [ 2 ] Добровольцы с пародонтитом и клинически вызванным пародонтитом предоставили образцы из-под и над деснами для сравнения с образцами, полученными от добровольцев со здоровыми деснами. [ 2 ] Культуру образцов , выделяли T. socrancial из полученных от группы добровольцев с пародонтитом и клинически индуцированным пародонтитом. [ 2 ] Пародонтит — это длительное вредное воспаление линии десен, а клинически индуцированный пародонтит — это состояние, при котором здоровые добровольцы прекращают гигиену полости рта , чтобы вызвать пародонтит для контролируемого научного исследования . [ 4 ] Исследователи использовали среду , содержащую мясо и соленую воду , насыщенную углекислым газом , чтобы очистить образец от кислорода . [ 2 ] Эти образцы культивировали в двух экземплярах на чашках с селективной твердой средой после серийных разведений для обеспечения чистоты. [ 2 ] Эти пластины были помещены в банки GasPak для удаления любого кислорода, который мог присутствовать в банке. [ 2 ] [ 5 ] Исследователи инокулировали колонии из чашек в бульон OTI (пероральная изоляция трепонем) и помещали их в другую банку GasPak. [ 2 ] Банки хранили при температуре 37°C, и каждую неделю образцы проверяли с помощью темнопольной микроскопии . [ 2 ]
Таксономия
[ редактировать ]Таксономическая линия Treponema socranskie : Bacteria , Spirochaetes , Spirochaetia , Spirochaetales , Spirochaetaceae , Treponema , socranskie . [ 6 ] Подвиды . были названы socrancial, buccale и paredis [ 6 ] [ 2 ] Treponema socrancial уникальна для своего рода благодаря сочетанию более высокого среднего содержания GC и отсутствия потребности в сыворотке в питательной среде. [ 2 ] Три других вида этого рода не используют сыворотку и имеют содержание GC около 36-39 мол.%, тогда как у socrannaya содержание GC составляет 50-52 мол.%. [ 2 ] По сравнению с другими культивируемыми Treponema видами : denticola , pectinovorum и vincentii , основным фактором, уникальным для socranskie, является способность ферментировать различные молекулы. [ 3 ] Система RapID-ANA, представляющая собой серию качественных тестов, используемых для идентификации различных анаэробных бактерий, широко используется для различения различных оральных спирохет. [ 7 ] [ 8 ] Этот метод отличает сокранского от других видов, поскольку его единственный положительный тест - это тест на щелочную фосфатазу , тогда как другие виды по этому тесту отрицательны. [ 7 ]
Характеристика
[ редактировать ]Оптима
[ редактировать ]Характеристика этого организма была сделана, когда его впервые культивировали в 1984 году. [ 2 ] T. s ocranskie — облигатный анаэроб , растущий на средах, содержащих сбраживаемые углеводы . [ 2 ] Среда также должна содержать жидкость из неуточненного рубца или жирные кислоты с короткой цепью . [ 2 ] Предпочтительная температура для T. socranski составляет 37 °C, но она все равно может немного повышаться в диапазоне от 25 до 42 °C. [ 2 ]
Морфология
[ редактировать ]Трепонема сокранская свернута спирально и подвижна с помощью периплазматических жгутиков . [ 6 ] [ 2 ] В жидких средах он может двигаться линейно или винтово-закручивающе. [ 2 ] Размер клеток колеблется от 6-15 мкм в длину и 0,16-0,18 мкм в ширину. [ 6 ] [ 2 ] Клетки в центре шире, чем на концах, слегка изогнуты. [ 2 ] При посеве колонии T. socranski формируются через 7–10 дней после инокуляции и кажутся белыми, полупрозрачными , неправильной формы, с плотным центром. [ 2 ] [ 9 ]
Экология
[ редактировать ]Трепонема сокранская обнаруживается в межзубном пространстве у больных различными формами пародонтита. [ 2 ] Из образцов, взятых из разных точек линии десен, T. socranskie оказался одним из наиболее многочисленных представителей своего рода. [ 2 ] Исследования микробиома полости рта человека показывают, что грамотрицательные микроорганизмы, включая роды Treponema , Prevotella , Selenomonas , Tannerella , Haemophilus и Catonella , не только присутствуют в образцах пациентов с пародонтитом, но и фактически отбираются и имеют гораздо более высокую численность, чем здоровые образцы. [ 10 ] После лечения пародонтита происходит сдвиг микробного сообщества от грамотрицательных микроорганизмов, перечисленных выше, и отбор грамположительных микроорганизмов. [ 11 ] Здоровые десны, как правило, характеризуются низким разнообразием микроорганизмов у одного пациента, но таксоны сильно различаются у разных людей. [ 10 ] У людей с пародонтитом наблюдается большое разнообразие микробов, но структура сообщества одинакова у всех больных пациентов. [ 10 ] Эти тенденции обусловлены анаэробными и олиготрофными условиями в больных деснах, из-за которых анаэробные бактерии могут конкурировать с аэробными копиотрофами, которые обычно составляют здоровые сообщества. [ 10 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Treponema socranskie отличается от других представителей этого рода, отчасти из-за своего метаболизма . [ 3 ] T. socranskie способен ферментировать соединения, на которые другие неспособны. [ 3 ] Соединениями, которые он может метаболизировать, являются арабиноза , декстрин , фруктоза , галактоза , глюкоза , гликоген , мальтоза , манноза , пектин , раффиноза , рамноза , рибоза , крахмал , сахароза , трегалоза и ксилоза . [ 2 ] Продуктами брожения являются уксусная , молочная и янтарная кислоты , муравьиная кислота . второстепенным продуктом является [ 2 ]
Геномика
[ редактировать ]Геном Дж . T. socranski был секвенирован Институтом Крейга Вентера (JCVI) с использованием секвенирования Illumina . [ 6 ] Геном содержит 2 804 628 пар оснований , из которых 2 547 778 являются кодирующими . [ 6 ] Содержание GC составляет 50-52 мол.%. [ 2 ] ДНК также содержит 2563 гена, из которых 2509 кодируют белки . [ 6 ]
Подразумеваемое
[ редактировать ]Treponema socranskie и 11 других организмов демонстрируют повышенную скорость роста, что коррелирует с увеличением показателя GI (индекса десен). [ 4 ] Показатель GI измеряет интенсивность воспаления десневой щели. [ 4 ] Эта корреляция между ростом и высокими показателями желудочно-кишечного тракта в сочетании с частотой T. socranski в десневой щели у людей с клинически индуцированным пародонтитом и умеренным/тяжелым пародонтитом имеет значение, указывающее на то, что T. socranski является возбудителем пародонтита и гингивита. [ 4 ] Пародонтит – это состояние, которое возникает после того, как гингивит не лечится. [ 12 ] У взрослых пародонтит может стать основной причиной ускорения потери зубов , поскольку он повреждает основание зубов и нарушает их соединение с черепом . [ 12 ] Это состояние легко предотвратить с помощью ежедневной гигиены полости рта, такой как чистка зубов щеткой и зубной нитью . [ 12 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Часть, АЦ «Трепонема» . ЛПСН
- ^ Jump up to: а б с д и ж г час я дж к л м н тот п д р с т в v В х и С аа Смайберт, Р.М., Джонсон, Дж.Л., и Рэнни, Р.Р. (октябрь 1984 г.). «Treponema socrancial sp. nov. Treponema socrancial subsp. socranski subsp. nov. Treponema socranski subsp. buccale subsp. nov. и Treponema socrancial subsp. paredis subsp. nov. Выделены из пародонта человека» . Международный журнал систематической бактериологии . 34 (4): 457–462. дои : 10.1099/00207713-34-4-457 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с д Чан, Э.К. и Маклафлин, Р. (2000). «Таксономия и вирулентность оральных спирохет». Оральная микробиология и иммунология . 15 (1): 1–9. дои : 10.1034/j.1399-302x.2000.150101.x . ПМИД 11155157 .
- ^ Jump up to: а б с д и Мур, В.Е., Холдеман, Л.В., Смайберт, Р.М., Катон, Е.П., Бурмейстер, Дж.А., Палканис, К.Г., и Рэнни, Р.Р. (октябрь 1984 г.). «Бактериология экспериментальных гингивитов у детей» . Инфекция и иммунитет . 46 (1): 1–6. дои : 10.1128/IAI.46.1.1-6.1984 . ПМК 261412 . ПМИД 6480100 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Умэмото Т., Наказава Ф., Хосино Э., Окада К., Фукунага М. и Намикава И. (январь 1997 г.). «Среда Treponema sp. nov., выделенная из поддесневого зубного налета человека» (PDF) . Международный журнал систематической бактериологии . 47 (1): 67–72. дои : 10.1099/00207713-47-1-67 . ПМИД 8995804 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с д и ж г «IMG: интегрированная база данных микробных геномов и система сравнительного анализа. Трепонема сокранская. Виктор М. Марковиц1, И-Мин А. Чен, Кришна Паланиаппан, Кен Чу, Эрнест Сзето, Юрий Гречкин, Анна Ратнер, Биджу Джейкоб, Цзинхуа Хуанг, Питер Уильямс, Марсель Хантеманн, Иэн Андерсон, Константинос Мавроматис, Наталья Н. Иванова и Никос К. Кирпидес» .
- ^ Jump up to: а б Сайед, С.А., Сальвадор, С.Л., и Леше, В.Дж. (октябрь 1988 г.). «Ферментные профили оральных спирохет в системе RapID-ANA» . Журнал клинической микробиологии . 26 (10): 2226–2228. doi : 10.1128/JCM.26.10.2226-2228.1988 . ПМК 266857 . ПМИД 3183013 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ «Thermo Fisher Scientific [Интернет]. Уолтем (Массачусетс): Thermo Fisher Scientific; © 2015. RapID ANA; [обновлено 27 августа 2015 г.; цитировано 23 апреля 2016 г.];» .
- ^ Уордл, Х.М., Роял, С., Траст, Х., Госпиталь, Х., Лейн, С. и Салфорд, М. (1997). «Проблема выращивания оральных спирохет» . Журнал медицинской микробиологии . 46 (2): 104–116. дои : 10.1099/00222615-46-2-104 . ПМИД 9060869 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с д Лю, Бо, Фаллер, Лина Л., Клитгорд, Нильс, Мазумдар, Варун, Годси, Мохаммед, Соммер, Дэниел Д., Гиббонс, Теодор Р., Треанген, Тодд Дж., Чанг, И Чиен, Ли, Шан, Стайн , О. Колин, Хастурк, Хатидже, Касиф, Симон, Сегре, Даниэль, Поп, Михай, Амар, Саломон (июнь 2012 г.). «Глубокое секвенирование микробиома полости рта выявляет признаки заболеваний пародонта» . ПЛОС ОДИН . 7 (6): e37919. Бибкод : 2012PLoSO...737919L . дои : 10.1371/journal.pone.0037919 . ПМК 3366996 . ПМИД 22675498 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Джунманн, Себастьян, Приор, Карола, Щепановски, Рафаэль, Харкс Инга, Эмке Беньямин, Гёсманн, Александр, Стой, Йенс, Хармсен, Даг (август 2012 г.). «Сдвиг бактериального сообщества у пролеченных пациентов с пародонтитом, выявленный с помощью ампликонного секвенирования гена 16S рРНК Ion Torrent» . ПЛОС ОДИН . 7 (8): е41606. Бибкод : 2012PLoSO...741606J . дои : 10.1371/journal.pone.0041606 . ПМЦ 3411582 . ПМИД 22870235 .
{{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) - ^ Jump up to: а б с «Медицинская энциклопедия ADAM [Интернет]. Атланта (Джорджия): ADAM, Inc.; © 2005. Периодонтит; [обновлено 25 февраля 2014 г.; цитировано 7 марта 2016 г.];» .