Jump to content

Белок, не содержащий домена POU, связывающий октамер

МОЛОКО
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы NONO , NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, домен, не содержащий POU, связывающий октамер, домен, не содержащий POU, содержащий связывание октамера
Внешние идентификаторы Опустить : 300084 ; МГИ : 1855692 ; Гомологен : 7212 ; GeneCards : НЕТ ; ОМА : ДЕВЯТЬ – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_007363
НМ_001145408
НМ_001145409
НМ_001145410

НМ_001252518
НМ_023144

RefSeq (белок)

НП_001138880
НП_001138881
НП_001138882
НП_031389

НП_001239447
НП_075633

Местоположение (UCSC) Chr X: 71,25 – 71,3 Мб Chr X: 100,47 – 100,49 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Октамер-связывающий белок, не содержащий домен POU (NonO), представляет собой белок , который у человека кодируется NONO геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]

Белок NonO принадлежит к семейству белков поведения/сплайсинга человека дрозофилы (DBHS). [ 8 ] Белки семейства DHBS включают SFPQ млекопитающих (фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином; также известный как PSF), NONO (не содержащий домен POU октамер-связывающий белок; также известный как p54nrb) и PSPC1 (параспекл-компонент 1; также известный как PSP1) и NONA беспозвоночных (белок no-on-transient A) и Hrp65. [ 9 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что NONO взаимодействует с SFPQ , [ 10 ] СПИ1 [ 11 ] и рецептор андрогенов . [ 12 ]

NONO участвует во многих ядерных процессах и связывается как с ДНК , так и с РНК . [ 13 ]

Как и все белки семейства DBHS, семейный белок описывается как многофункциональный ядерный белок. [ 14 ] Было показано, что белок NONO участвует во многих биологических функциях, включая сплайсинг пре-мРНК; активация транскрипции ; прекращение транскрипции; Раскручивание и спаривание ДНК и поддержание правильной циркадных часов . функции [ 13 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]

Было обнаружено, что NONO связывается с белком Rasd1 , в результате чего димер Rasd1 может модулировать функцию NONO, снижая экспрессию CREB генов , NR4A1 и Nr4A2 . [ 20 ]

NONO связывается с SFPQ, образуя гетеродимер , который взаимодействует с белком MATR3 . [ 21 ] Взаимодействие этих трех белков может быть частью процесса в ядре, ответственного за удержание дефектных РНК, еще не достаточно зрелых для экспорта или предназначенных для удержания в ядре . [ 21 ]

Расположение гена

[ редактировать ]

Белок NONO (человек) кодируется геном NONO , который расположен на плюсовой цепи Х-хромосомы . [ 22 ]

Роль в болезни

[ редактировать ]

Меланома

[ редактировать ]

Было показано, что NONO более сильно экспрессируется в клеточных линиях меланомы и образцах тканей меланомы по сравнению с нормальными клеточными линиями человека и нормальной тканью кожи. [ 23 ] Исследования показали, что нокаут белка NONO из клеточных линий меланомы приводит как к снижению скорости пролиферации раковых клеток, так и к значительному уменьшению потенциальной миграции раковых клеток. [ 23 ]

Рак молочной железы

[ редактировать ]

Исследования рака молочной железы показали, что потеря или изменение NONO в сочетании с потерей рецептора эстрогена hERα приводит к более агрессивному раку молочной железы, который демонстрирует увеличение как опухоли размера , так и метастазов . [ 24 ]

Умственная отсталость, связанная с некомпактной кардиомиопатией

[ редактировать ]

Исследования на людях и мышах показали, что нулевые мутации NONO , вероятно, приводят к развитию клинически распознаваемой умственной отсталости с когнитивными и аффективными нарушениями. [ 25 ] Позже было обнаружено, что эти патогенные варианты также тесно связаны с кардиомиопатией с некомпактностью левого желудочка , а иногда и с аномалией Эбштейна . [ 26 ] [ 27 ]

Структура

[ редактировать ]

Как и другие белки семейства DBHS, функции белка NONO редко функционируют в одиночку и преимущественно образуют гомо- и гетеродимеры с другими белками DBHS для выполнения различных функций. [ 28 ] Предполагается, что эти димеры могут иметь разные функции, специфичные для типа клетки, в которой они обнаружены. [ 29 ]

Предполагается, что именно состояние фосфорилирования NONO управляет многими разнородными функциями белков внутри ядра. [ 13 ]

Специфичность ткани

[ редактировать ]

NONO обнаруживается в ядре большинства клеток млекопитающих и в основном распределяется в нуклеоплазме . Его также можно найти в концентрации в субъядерных доменах, известных как параспеклы . [ 30 ]

NONO также наблюдался в головном мозге, локализованный в цитоплазме нейронов гиппокампа , связанных с транспортными гранулами РНК . [ 31 ] Он также высоко экспрессируется в тканях сердца. [ 27 ]

Открытие

[ редактировать ]

Белок NONO был впервые обнаружен в 1993 году исследователями из лаборатории Колд-Спрингс-Харбор . Поскольку белок первоначально был идентифицирован как РНК-связывающий белок, он был назван p54nrb (ядерный РНК-связывающий белок, 54 кДа). [ 8 ]

  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147140 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031311 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клеток HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами узнавания РНК и обширной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA/BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. дои : 10.1093/нар/21.17.4085 . ПМК   310009 . ПМИД   8371983 .
  6. ^ Трэиш А.М., Хуанг Ю.Х., Ашба Дж., Проновост М., Павао М., Макэнени Д.Б. и др. (август 1997 г.). «Потеря экспрессии ядерного белка массой 55 кДа (nmt55) при раке молочной железы человека, отрицательном по рецепторам эстрогена». Диагностика молекулярной патологии . 6 (4): 209–21. дои : 10.1097/00019606-199708000-00005 . ПМИД   9360842 . S2CID   1278025 .
  7. ^ «Ген Энтрез: NONO, не содержащий POU домен, связывающий октамер» .
  8. ^ Jump up to: а б Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клеток HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами узнавания РНК и обширной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA/BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. дои : 10.1093/нар/21.17.4085 . ПМК   310009 . ПМИД   8371983 .
  9. ^ Пассон Д.М., Ли М., Рэкхэм О., Стэнли В.А., Садовска А., Филиповска А. и др. (март 2012 г.). «Структура гетеродимера NONO человека и белкового компонента параспекл 1 и анализ его роли в формировании субъядерных телец» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (13): 4846–50. Бибкод : 2012PNAS..109.4846P . дои : 10.1073/pnas.1120792109 . ПМК   3324020 . ПМИД   22416126 .
  10. ^ Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард Д.К., Томпсон А.Б., Паттон Дж.Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стебель мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. дои : 10.1017/S1355838202022070 . ПМЦ   1370341 . ПМИД   12403470 .
  11. ^ Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–81. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД   8626664 .
  12. ^ Ишитани К., Ёсида Т., Китагава Х., Охта Х., Нозава С., Като С. (июль 2003 г.). «p54nrb действует как коактиватор транскрипции для функции активации 1 человеческого андрогенного рецептора». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 306 (3): 660–5. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01021-0 . ПМИД   12810069 .
  13. ^ Jump up to: а б с Шав-Тал Ю., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb/NonO – многофункциональные ядерные белки» . ФЭБС Летт . 531 (2): 109–14. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03447-6 . ПМИД   12417296 .
  14. ^ Дювиньо Ж.Б., Бедар М., Нагата Т., Муто Ю., Ёкояма С., Ганье С.М. и др. (май 2016 г.). «Структура, динамика и взаимодействие p54 (nrb) / NonO RRM1 с последовательностью РНК 5'-сайта сплайсинга». Биохимия . 55 (18): 2553–66. doi : 10.1021/acs.biochem.5b01240 . ПМИД   27064654 .
  15. ^ Басу А., Донг Б., Крайнер А.Р., Хоу К.С. (февраль 1997 г.). «Интрацистернальный проксимальный энхансер-связывающий белок А-частицы активирует транскрипцию и идентичен РНК- и ДНК-связывающему белку p54nrb/NonO» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (2): 677–86. дои : 10.1128/mcb.17.2.677 . ПМК   231793 . ПМИД   9001221 .
  16. ^ Данквардт С., Кауфманн И., Генцель М., Ферстнер К.Ю., Ганцерт А.С., Геринг Н.Х. и др. (июнь 2007 г.). «Факторы сплайсинга стимулируют полиаденилирование посредством USE по неканоническим сигналам образования 3'-конца» . Журнал ЭМБО . 26 (11): 2658–69. дои : 10.1038/sj.emboj.7601699 . ПМЦ   1888663 . ПМИД   17464285 .
  17. ^ Халлиер М., Лерга А., Барнаш С., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–42. дои : 10.1074/jbc.273.9.4838 . ПМИД   9478924 .
  18. ^ Камеока С., Дуке П., Конарска М.М. (апрель 2004 г.). «p54(nrb) ассоциируется с 5'-сайтом сплайсинга в больших комплексах транскрипции/сплайсинга» . Журнал ЭМБО . 23 (8): 1782–91. дои : 10.1038/sj.emboj.7600187 . ПМЦ   394241 . ПМИД   15057275 .
  19. ^ Ковальска Э., Риппергер Дж.А., Хёггер Д.С., Брюггер П., Бух Т., Бирхлер Т. и др. (январь 2013 г.). «NONO связывает циркадные часы с клеточным циклом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (5): 1592–9. дои : 10.1073/pnas.1213317110 . ПМЦ   3562797 . ПМИД   23267082 .
  20. ^ Онг С.А., Тан Дж.Дж., Тью В.Л., Чен К.С. (01 января 2011 г.). «Rasd1 модулирует коактиваторную функцию NonO в пути циклического АМФ» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24401. Бибкод : 2011PLoSO...624401O . дои : 10.1371/journal.pone.0024401 . ПМК   3168489 . ПМИД   21915321 .
  21. ^ Jump up to: а б Чжан Цзы, Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: комплекс, содержащий p54(nrb), опосредует удержание в ядре беспорядочно отредактированных РНК от A до I» . Клетка . 106 (4): 465–75. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . ПМИД   11525732 .
  22. ^ «NONO - октамер-связывающий белок, не содержащий домен POU - Homo sapiens (человек) - ген и белок NONO» . www.uniprot.org . Проверено 14 октября 2016 г.
  23. ^ Jump up to: а б Шиффнер С., Зимара Н., Шмид Р., Боссерхофф А.К. (август 2011 г.). «p54nrb — новый регулятор прогрессирования злокачественной меланомы» . Канцерогенез . 32 (8): 1176–82. дои : 10.1093/carcin/bgr103 . ПМИД   21642354 .
  24. ^ Павао М., Хуан Й.Х., Хафер Л.Дж., Морленд Р.Б., Трейш А.М. (01.01.2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55/p54nrb при раке молочной железы человека» . БМК Рак . 1:15 . дои : 10.1186/1471-2407-1-15 . ПМК   59838 . ПМИД   11710964 .
  25. ^ Мирксоф Д., Лангуэ М., Рио М., Муттон С., Сикье-Перне К., Боле-Фейсо С. и др. (декабрь 2015 г.). «Мутации в NONO приводят к синдромальной умственной отсталости и тормозным синаптическим дефектам» . Природная неврология . 18 (12): 1731–6. дои : 10.1038/nn.4169 . ПМЦ   5392243 . ПМИД   26571461 .
  26. ^ Райнштейн Э., Цур С., Коэн Р., Борманс К., Бехар Д.М. (ноябрь 2016 г.). «Умственная отсталость и некомпактная кардиомиопатия с мутацией NONO de novo, выявленной с помощью секвенирования экзома» . Европейский журнал генетики человека . 24 (11): 1635–1638. дои : 10.1038/ejhg.2016.72 . ПМК   5110068 . ПМИД   27329731 .
  27. ^ Jump up to: а б Скотт Д.А., Эрнандес-Гарсия А., Азамян М.С., Джордан В.К., Ким Б.Дж., Старкович М. и др. (январь 2017 г.). «Врожденные пороки сердца и некомпактность левого желудочка у мужчин с вариантами потери функции в NONO». Журнал медицинской генетики . 54 (1): 47–53. doi : 10.1136/jmedgenet-2016-104039 . ПМИД   27550220 . S2CID   206998226 .
  28. ^ Fox AH, Bond CS, Lamond AI (ноябрь 2005 г.). «P54nrb образует гетеродимер с PSP1, который локализуется в параспеклах РНК-зависимым образом» . Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5304–15. doi : 10.1091/mbc.E05-06-0587 . ПМК   1266428 . ПМИД   16148043 .
  29. ^ Нотт Дж.Дж., Бонд CS, Fox AH (май 2016 г.). «Белки DBHS SFPQ, NONO и PSPC1: многоцелевой молекулярный каркас» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (9): 3989–4004. дои : 10.1093/nar/gkw271 . ПМЦ   4872119 . ПМИД   27084935 .
  30. ^ Фокс А.Х., Ламонд А.И. (июль 2010 г.). «Параспеклы» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): а000687. doi : 10.1101/cshperspect.a000687 . ПМК   2890200 . ПМИД   20573717 .
  31. ^ Канаи Ю, Домаэ Н, Хирокава Н (август 2004 г.). «Кинезин транспортирует РНК: выделение и характеристика гранулы, транспортирующей РНК» . Нейрон . 43 (4): 513–25. дои : 10.1016/j.neuron.2004.07.022 . ПМИД   15312650 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 8df3699ff9e2ca6e34ae8205686b84ea__1724409900
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/8d/ea/8df3699ff9e2ca6e34ae8205686b84ea.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Non-POU domain-containing octamer-binding protein - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)