Белок, не содержащий домена POU, связывающий октамер
МОЛОКО | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Идентификаторы | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Псевдонимы | NONO , NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, домен, не содержащий POU, связывающий октамер, домен, не содержащий POU, содержащий связывание октамера | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Внешние идентификаторы | Опустить : 300084 ; МГИ : 1855692 ; Гомологен : 7212 ; GeneCards : НЕТ ; ОМА : ДЕВЯТЬ – ортологи | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Викиданные | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
Октамер-связывающий белок, не содержащий домен POU (NonO), представляет собой белок , который у человека кодируется NONO геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]
Белок NonO принадлежит к семейству белков поведения/сплайсинга человека дрозофилы (DBHS). [ 8 ] Белки семейства DHBS включают SFPQ млекопитающих (фактор сплайсинга, богатый пролином и глутамином; также известный как PSF), NONO (не содержащий домен POU октамер-связывающий белок; также известный как p54nrb) и PSPC1 (параспекл-компонент 1; также известный как PSP1) и NONA беспозвоночных (белок no-on-transient A) и Hrp65. [ 9 ]
Взаимодействия
[ редактировать ]Было показано, что NONO взаимодействует с SFPQ , [ 10 ] СПИ1 [ 11 ] и рецептор андрогенов . [ 12 ]
Функции
[ редактировать ]NONO участвует во многих ядерных процессах и связывается как с ДНК , так и с РНК . [ 13 ]
Как и все белки семейства DBHS, семейный белок описывается как многофункциональный ядерный белок. [ 14 ] Было показано, что белок NONO участвует во многих биологических функциях, включая сплайсинг пре-мРНК; активация транскрипции ; прекращение транскрипции; Раскручивание и спаривание ДНК и поддержание правильной циркадных часов . функции [ 13 ] [ 15 ] [ 16 ] [ 17 ] [ 18 ] [ 19 ]
Было обнаружено, что NONO связывается с белком Rasd1 , в результате чего димер Rasd1 может модулировать функцию NONO, снижая экспрессию CREB генов , NR4A1 и Nr4A2 . [ 20 ]
NONO связывается с SFPQ, образуя гетеродимер , который взаимодействует с белком MATR3 . [ 21 ] Взаимодействие этих трех белков может быть частью процесса в ядре, ответственного за удержание дефектных РНК, еще не достаточно зрелых для экспорта или предназначенных для удержания в ядре . [ 21 ]
Расположение гена
[ редактировать ]Белок NONO (человек) кодируется геном NONO , который расположен на плюсовой цепи Х-хромосомы . [ 22 ]
Роль в болезни
[ редактировать ]Меланома
[ редактировать ]Было показано, что NONO более сильно экспрессируется в клеточных линиях меланомы и образцах тканей меланомы по сравнению с нормальными клеточными линиями человека и нормальной тканью кожи. [ 23 ] Исследования показали, что нокаут белка NONO из клеточных линий меланомы приводит как к снижению скорости пролиферации раковых клеток, так и к значительному уменьшению потенциальной миграции раковых клеток. [ 23 ]
Рак молочной железы
[ редактировать ]Исследования рака молочной железы показали, что потеря или изменение NONO в сочетании с потерей рецептора эстрогена hERα приводит к более агрессивному раку молочной железы, который демонстрирует увеличение как опухоли размера , так и метастазов . [ 24 ]
Умственная отсталость, связанная с некомпактной кардиомиопатией
[ редактировать ]Исследования на людях и мышах показали, что нулевые мутации NONO , вероятно, приводят к развитию клинически распознаваемой умственной отсталости с когнитивными и аффективными нарушениями. [ 25 ] Позже было обнаружено, что эти патогенные варианты также тесно связаны с кардиомиопатией с некомпактностью левого желудочка , а иногда и с аномалией Эбштейна . [ 26 ] [ 27 ]
Структура
[ редактировать ]Как и другие белки семейства DBHS, функции белка NONO редко функционируют в одиночку и преимущественно образуют гомо- и гетеродимеры с другими белками DBHS для выполнения различных функций. [ 28 ] Предполагается, что эти димеры могут иметь разные функции, специфичные для типа клетки, в которой они обнаружены. [ 29 ]
Предполагается, что именно состояние фосфорилирования NONO управляет многими разнородными функциями белков внутри ядра. [ 13 ]
Специфичность ткани
[ редактировать ]NONO обнаруживается в ядре большинства клеток млекопитающих и в основном распределяется в нуклеоплазме . Его также можно найти в концентрации в субъядерных доменах, известных как параспеклы . [ 30 ]
NONO также наблюдался в головном мозге, локализованный в цитоплазме нейронов гиппокампа , связанных с транспортными гранулами РНК . [ 31 ] Он также высоко экспрессируется в тканях сердца. [ 27 ]
Открытие
[ редактировать ]Белок NONO был впервые обнаружен в 1993 году исследователями из лаборатории Колд-Спрингс-Харбор . Поскольку белок первоначально был идентифицирован как РНК-связывающий белок, он был назван p54nrb (ядерный РНК-связывающий белок, 54 кДа). [ 8 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000147140 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000031311 – Ensembl , май 2017 г.
- ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
- ^ Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клеток HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами узнавания РНК и обширной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA/BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. дои : 10.1093/нар/21.17.4085 . ПМК 310009 . ПМИД 8371983 .
- ^ Трэиш А.М., Хуанг Ю.Х., Ашба Дж., Проновост М., Павао М., Макэнени Д.Б. и др. (август 1997 г.). «Потеря экспрессии ядерного белка массой 55 кДа (nmt55) при раке молочной железы человека, отрицательном по рецепторам эстрогена». Диагностика молекулярной патологии . 6 (4): 209–21. дои : 10.1097/00019606-199708000-00005 . ПМИД 9360842 . S2CID 1278025 .
- ^ «Ген Энтрез: NONO, не содержащий POU домен, связывающий октамер» .
- ^ Jump up to: а б Донг Б., Горовиц Д.С., Кобаяши Р., Крайнер А.Р. (август 1993 г.). «Очистка и клонирование кДНК клеток HeLa p54nrb, ядерного белка с двумя мотивами узнавания РНК и обширной гомологией с человеческим фактором сплайсинга PSF и Drosophila NONA/BJ6» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (17): 4085–92. дои : 10.1093/нар/21.17.4085 . ПМК 310009 . ПМИД 8371983 .
- ^ Пассон Д.М., Ли М., Рэкхэм О., Стэнли В.А., Садовска А., Филиповска А. и др. (март 2012 г.). «Структура гетеродимера NONO человека и белкового компонента параспекл 1 и анализ его роли в формировании субъядерных телец» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 109 (13): 4846–50. Бибкод : 2012PNAS..109.4846P . дои : 10.1073/pnas.1120792109 . ПМК 3324020 . ПМИД 22416126 .
- ^ Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард Д.К., Томпсон А.Б., Паттон Дж.Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стебель мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. дои : 10.1017/S1355838202022070 . ПМЦ 1370341 . ПМИД 12403470 .
- ^ Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–81. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД 8626664 .
- ^ Ишитани К., Ёсида Т., Китагава Х., Охта Х., Нозава С., Като С. (июль 2003 г.). «p54nrb действует как коактиватор транскрипции для функции активации 1 человеческого андрогенного рецептора». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 306 (3): 660–5. дои : 10.1016/S0006-291X(03)01021-0 . ПМИД 12810069 .
- ^ Jump up to: а б с Шав-Тал Ю., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb/NonO – многофункциональные ядерные белки» . ФЭБС Летт . 531 (2): 109–14. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03447-6 . ПМИД 12417296 .
- ^ Дювиньо Ж.Б., Бедар М., Нагата Т., Муто Ю., Ёкояма С., Ганье С.М. и др. (май 2016 г.). «Структура, динамика и взаимодействие p54 (nrb) / NonO RRM1 с последовательностью РНК 5'-сайта сплайсинга». Биохимия . 55 (18): 2553–66. doi : 10.1021/acs.biochem.5b01240 . ПМИД 27064654 .
- ^ Басу А., Донг Б., Крайнер А.Р., Хоу К.С. (февраль 1997 г.). «Интрацистернальный проксимальный энхансер-связывающий белок А-частицы активирует транскрипцию и идентичен РНК- и ДНК-связывающему белку p54nrb/NonO» . Молекулярная и клеточная биология . 17 (2): 677–86. дои : 10.1128/mcb.17.2.677 . ПМК 231793 . ПМИД 9001221 .
- ^ Данквардт С., Кауфманн И., Генцель М., Ферстнер К.Ю., Ганцерт А.С., Геринг Н.Х. и др. (июнь 2007 г.). «Факторы сплайсинга стимулируют полиаденилирование посредством USE по неканоническим сигналам образования 3'-конца» . Журнал ЭМБО . 26 (11): 2658–69. дои : 10.1038/sj.emboj.7601699 . ПМЦ 1888663 . ПМИД 17464285 .
- ^ Халлиер М., Лерга А., Барнаш С., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (февраль 1998 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 взаимодействует с потенциальным фактором сплайсинга TLS» . Журнал биологической химии . 273 (9): 4838–42. дои : 10.1074/jbc.273.9.4838 . ПМИД 9478924 .
- ^ Камеока С., Дуке П., Конарска М.М. (апрель 2004 г.). «p54(nrb) ассоциируется с 5'-сайтом сплайсинга в больших комплексах транскрипции/сплайсинга» . Журнал ЭМБО . 23 (8): 1782–91. дои : 10.1038/sj.emboj.7600187 . ПМЦ 394241 . ПМИД 15057275 .
- ^ Ковальска Э., Риппергер Дж.А., Хёггер Д.С., Брюггер П., Бух Т., Бирхлер Т. и др. (январь 2013 г.). «NONO связывает циркадные часы с клеточным циклом» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (5): 1592–9. дои : 10.1073/pnas.1213317110 . ПМЦ 3562797 . ПМИД 23267082 .
- ^ Онг С.А., Тан Дж.Дж., Тью В.Л., Чен К.С. (01 января 2011 г.). «Rasd1 модулирует коактиваторную функцию NonO в пути циклического АМФ» . ПЛОС ОДИН . 6 (9): e24401. Бибкод : 2011PLoSO...624401O . дои : 10.1371/journal.pone.0024401 . ПМК 3168489 . ПМИД 21915321 .
- ^ Jump up to: а б Чжан Цзы, Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: комплекс, содержащий p54(nrb), опосредует удержание в ядре беспорядочно отредактированных РНК от A до I» . Клетка . 106 (4): 465–75. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . ПМИД 11525732 .
- ^ «NONO - октамер-связывающий белок, не содержащий домен POU - Homo sapiens (человек) - ген и белок NONO» . www.uniprot.org . Проверено 14 октября 2016 г.
- ^ Jump up to: а б Шиффнер С., Зимара Н., Шмид Р., Боссерхофф А.К. (август 2011 г.). «p54nrb — новый регулятор прогрессирования злокачественной меланомы» . Канцерогенез . 32 (8): 1176–82. дои : 10.1093/carcin/bgr103 . ПМИД 21642354 .
- ^ Павао М., Хуан Й.Х., Хафер Л.Дж., Морленд Р.Б., Трейш А.М. (01.01.2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55/p54nrb при раке молочной железы человека» . БМК Рак . 1:15 . дои : 10.1186/1471-2407-1-15 . ПМК 59838 . ПМИД 11710964 .
- ^ Мирксоф Д., Лангуэ М., Рио М., Муттон С., Сикье-Перне К., Боле-Фейсо С. и др. (декабрь 2015 г.). «Мутации в NONO приводят к синдромальной умственной отсталости и тормозным синаптическим дефектам» . Природная неврология . 18 (12): 1731–6. дои : 10.1038/nn.4169 . ПМЦ 5392243 . ПМИД 26571461 .
- ^ Райнштейн Э., Цур С., Коэн Р., Борманс К., Бехар Д.М. (ноябрь 2016 г.). «Умственная отсталость и некомпактная кардиомиопатия с мутацией NONO de novo, выявленной с помощью секвенирования экзома» . Европейский журнал генетики человека . 24 (11): 1635–1638. дои : 10.1038/ejhg.2016.72 . ПМК 5110068 . ПМИД 27329731 .
- ^ Jump up to: а б Скотт Д.А., Эрнандес-Гарсия А., Азамян М.С., Джордан В.К., Ким Б.Дж., Старкович М. и др. (январь 2017 г.). «Врожденные пороки сердца и некомпактность левого желудочка у мужчин с вариантами потери функции в NONO». Журнал медицинской генетики . 54 (1): 47–53. doi : 10.1136/jmedgenet-2016-104039 . ПМИД 27550220 . S2CID 206998226 .
- ^ Fox AH, Bond CS, Lamond AI (ноябрь 2005 г.). «P54nrb образует гетеродимер с PSP1, который локализуется в параспеклах РНК-зависимым образом» . Молекулярная биология клетки . 16 (11): 5304–15. doi : 10.1091/mbc.E05-06-0587 . ПМК 1266428 . ПМИД 16148043 .
- ^ Нотт Дж.Дж., Бонд CS, Fox AH (май 2016 г.). «Белки DBHS SFPQ, NONO и PSPC1: многоцелевой молекулярный каркас» . Исследования нуклеиновых кислот . 44 (9): 3989–4004. дои : 10.1093/nar/gkw271 . ПМЦ 4872119 . ПМИД 27084935 .
- ^ Фокс А.Х., Ламонд А.И. (июль 2010 г.). «Параспеклы» . Перспективы Колд-Спринг-Харбор в биологии . 2 (7): а000687. doi : 10.1101/cshperspect.a000687 . ПМК 2890200 . ПМИД 20573717 .
- ^ Канаи Ю, Домаэ Н, Хирокава Н (август 2004 г.). «Кинезин транспортирует РНК: выделение и характеристика гранулы, транспортирующей РНК» . Нейрон . 43 (4): 513–25. дои : 10.1016/j.neuron.2004.07.022 . ПМИД 15312650 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Шав-Тал Ю., Зипори Д. (ноябрь 2002 г.). «PSF и p54(nrb)/NonO — многофункциональные ядерные белки» . Письма ФЭБС . 531 (2): 109–14. дои : 10.1016/S0014-5793(02)03447-6 . ПМИД 12417296 .
- Чжан В.В., Чжан Л.К., Буш Р.К., Фаррес Дж., Буш Х. (февраль 1993 г.). «Очистка и характеристика ДНК-связывающего гетеродимера 52 и 100 кДа из клеток HeLa» . Биохимический журнал . 290 (Часть 1): 267–72. дои : 10.1042/bj2900267 . ПМЦ 1132410 . ПМИД 8439294 .
- Халлиер М., Тавитян А., Моро-Гашлен Ф. (май 1996 г.). «Фактор транскрипции Spi-1/PU.1 связывает РНК и взаимодействует с РНК-связывающим белком p54nrb» . Журнал биологической химии . 271 (19): 11177–81. дои : 10.1074/jbc.271.19.11177 . ПМИД 8626664 .
- Петерс У, Хаберхаузен Г, Костшева М, Нольте Д, Мюллер У (октябрь 1997 г.). «AFX1 и p54nrb: точное картирование, геномная структура и исключение в качестве генов-кандидатов Х-сцепленной дистонии-паркинсонизма». Генетика человека . 100 (5–6): 569–72. дои : 10.1007/s004390050553 . ПМИД 9341872 . S2CID 35332593 .
- Кларк Дж., Лу Ю.Дж., Сидхар С.К., Паркер С., Гилл С., Смедли Д. и др. (октябрь 1997 г.). «Слияние генов факторов сплайсинга PSF и NonO (p54nrb) с геном TFE3 при папиллярной почечно-клеточной карциноме» . Онкоген . 15 (18): 2233–9. дои : 10.1038/sj.onc.1201394 . ПМИД 9393982 .
- Штрауб Т., Гру П., Узе А., Лисби М., Кнудсен Б.Р., Танге Т.О. и др. (октябрь 1998 г.). «Фактор сплайсинга РНК PSF/p54 контролирует активность ДНК-топоизомеразы I путем прямого взаимодействия» . Журнал биологической химии . 273 (41): 26261–4. дои : 10.1074/jbc.273.41.26261 . PMID 9756848 .
- Кархумаа П., Парккила С., Вахид А., Парккила А.К., Каунисто К., Такер П.В. и др. (май 2000 г.). «Ядерный белок NonO/p54(nrb) представляет собой неклассическую карбоангидразу» . Журнал биологической химии . 275 (21): 16044–9. дои : 10.1074/jbc.275.21.16044 . ПМИД 10821857 .
- Штрауб Т., Кнудсен Б.Р., Боге Ф. (июнь 2000 г.). «PSF/p54(nrb) стимулирует «перепрыгивание» ДНК-топоизомеразы I между отдельными спиралями ДНК». Биохимия . 39 (25): 7552–8. дои : 10.1021/bi992898e . ПМИД 10858305 .
- Матур М., Такер П.В., Сэмюэлс Х.Х. (апрель 2001 г.). «PSF — это новый корепрессор, действие которого осуществляется через Sin3A и ДНК-связывающий домен ядерных рецепторов гормонов» . Молекулярная и клеточная биология . 21 (7): 2298–311. дои : 10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001 . ПМЦ 86864 . ПМИД 11259580 .
- Чжан Цзы, Кармайкл Г.Г. (август 2001 г.). «Судьба дцРНК в ядре: комплекс, содержащий p54(nrb), опосредует удержание в ядре беспорядочно отредактированных РНК от A до I» . Клетка . 106 (4): 465–75. дои : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . ПМИД 11525732 .
- Павао М., Хуан Й.Х., Хафер Л.Дж., Морленд Р.Б., Трейш А.М. (2001). «Иммунодетекция изоформ nmt55/p54nrb при раке молочной железы человека» . БМК Рак . 1:15 . дои : 10.1186/1471-2407-1-15 . ПМК 59838 . ПМИД 11710964 .
- Андерсен Дж.С., Лион К.Э., Фокс А.Х., Люнг А.К., Лам Ю.В., Стин Х. и др. (январь 2002 г.). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека» . Современная биология . 12 (1): 1–11. Бибкод : 2002CBio...12....1A . дои : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . ПМИД 11790298 .
- Сьюер М.Б., Нгуен В.К., Хуанг С.Дж., Такер П.В., Кагава Н., Уотерман М.Р. (апрель 2002 г.). «Транкрипционная активация человеческого CYP17 в адренокортикальных клетках H295R зависит от образования комплекса между p54(nrb)/NonO, белково-ассоциированным фактором сплайсинга, и SF-1, комплекса, который также участвует в репрессии транскрипции» . Эндокринология . 143 (4): 1280–90. дои : 10.1210/endo.143.4.8748 . ПМИД 11897684 .
- Охта С., Сиоми Ю., Сугимото К., Обусе С., Цуримото Т. (октябрь 2002 г.). «Протеомный подход к идентификации белков, связывающих ядерный антиген пролиферирующих клеток (PCNA), в лизатах клеток человека. Идентификация комплекса CHL12/RFCs2-5 человека как нового PCNA-связывающего белка» . Журнал биологической химии . 277 (43): 40362–7. дои : 10.1074/jbc.M206194200 . ПМИД 12171929 .
- Эмили А., Шейлс М., Маккракен С., Се В., Такер П.В., Кобаяши Р. и др. (сентябрь 2002 г.). «Белки PSF и p54nrb/nonO, связанные со сплайсингом и транскрипцией, связываются с РНК-полимеразой II CTD» . РНК . 8 (9): 1102–11. дои : 10.1017/S1355838202025037 . ПМЦ 1370324 . ПМИД 12358429 .
- Пэн Р., Дай Б.Т., Перес И., Барнард Д.К., Томпсон А.Б., Паттон Дж.Г. (октябрь 2002 г.). «PSF и p54nrb связывают консервативный стебель мяРНК U5» . РНК . 8 (10): 1334–47. дои : 10.1017/S1355838202022070 . ПМЦ 1370341 . ПМИД 12403470 .