Онтология ячейки
(Перенаправлено из онтологии ячейки )
Клеточная онтология — это онтология , целью которой является отражение разнообразия типов клеток у животных . [ 1 ] Он является частью Открытой биомедицинской и биологической онтологий (OBO) Foundry . [ 2 ] Идентификаторы и организационная структура Cell Ontology используются для аннотирования данных на уровне типов клеток, например, в исследованиях секвенирования РНК одной клетки . [ 3 ] Это один из важных ресурсов при создании Атласа клеток человека . [ 4 ]
Клеточная онтология была впервые описана в научной статье в 2005 году. [ 5 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Диль А.Д., Михан Т.Ф., Брэдфорд Ю.М., Браш М.Х., Дадул В.М., Дугалл Д.С. и др. (июль 2016 г.). «Онтология клеток 2016: расширенный контент, модульность и совместимость онтологий» . Журнал биомедицинской семантики . 7 (1): 44. дои : 10.1186/s13326-016-0088-7 . ПМЦ 4932724 . ПМИД 27377652 .
- ^ Смит Б., Эшбернер М., Росс С., Бард Дж., Баг В., Цестерс В. и др. (ноябрь 2007 г.). «The OBO Foundry: скоординированная эволюция онтологий для поддержки интеграции биомедицинских данных» . Природная биотехнология . 25 (11): 1251–5. дои : 10.1038/nbt1346 . ПМК 2814061 . ПМИД 17989687 .
- ^ Бернштейн М.Н., Ма З., Глейхер М., Дьюи К.Н. (январь 2021 г.). «CellO: комплексная иерархическая классификация типов клеток человека с помощью Cell Ontology» . iScience . 24 (1): 101913. Бибкод : 2021iSci...24j1913B . bioRxiv 10.1101/634097 . дои : 10.1016/j.isci.2020.101913 . ПМЦ 7753962 . ПМИД 33364592 .
- ^ Осуми-Сазерленд, Дэвид; Сюй, Чуан; Кейс, Мария К.; Харченко Петр Владимирович; Регев, Авив; Лейн, Эд С.; Тейхманн, Сара (28 июня 2021 г.). «Онтологии клеточных типов Атласа клеток человека» . Природная клеточная биология . 23 (11): 1129–1135. arXiv : 2106.14443 . дои : 10.1038/s41556-021-00787-7 . S2CID 235658396 .
- ^ Бард, Джонатан; Ри, Сын Ю.; Эшбернер, Майкл (2005). «Онтология типов клеток» . Геномная биология . 6 (2): Р21. дои : 10.1186/gb-2005-6-2-r21 . ПМЦ 551541 . ПМИД 15693950 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]