Jump to content

РАБ7А

(Перенаправлено с RAB7 )
РАБ7А
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы RAB7A , PRO2706, RAB7, член семейства онкогенов RAS, CMT2B
Внешние идентификаторы Опустить : 602298 ; МГИ : 105068 ; Гомологен : 3408 ; Генные карты : RAB7A ; ОМА : RAB7A – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_004637

НМ_001293652
НМ_001293653
НМ_001293654
НМ_001293655
НМ_009005

RefSeq (белок)

НП_004628

НП_001280581
НП_001280582
НП_001280583
НП_001280584
НП_033031

Местоположение (UCSC) Chr 3: 128,69 – 128,83 Мб Чр 6: 87,98 – 88,02 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Связанный с Ras белок Rab-7a представляет собой белок , который у человека кодируется RAB7A геном . [ 5 ] [ 6 ]

Связанный с Ras белок Rab-7a участвует в эндоцитозе — процессе, в ходе которого вещества попадают в клетку. Процесс эндоцитоза заключается в складывании клеточной мембраны вокруг вещества вне клетки (например, белка), а затем образует везикулу . Затем везикула попадает в клетку и отрывается от клеточной мембраны. RAB7A играет важную роль в перемещении везикул в клетку, а также в транспортировке везикул. [ 7 ]

Различные мутации RAB7A связаны с наследственной сенсорной нейропатией типа 1C (HSN IC), также известной как синдром Шарко-Мари-Тута типа 2B (CMT2B). [ 8 ]

Эндоцитарный путь животных клеток
Показана роль RAB7 во время эндоцитоза.

Члены семейства RAB связанных с RAS GTP-связывающих белков являются важными регуляторами везикулярного транспорта и расположены в специфических внутриклеточных компартментах. RAB7 локализован в поздних эндосомах и, как было показано, играет важную роль в позднем эндоцитозном пути. Кроме того, было показано, что он играет фундаментальную роль в клеточной вакуолизации, индуцированной цитотоксином VacA Helicobacter pylori . [ 9 ]

RAB7A действует как ключевой регулятор эндолизосомального транспорта, управляет ранним и поздним эндосомальным созреванием, направленной миграцией и положением минус-конца микротрубочек, а также плюс-конца, а также транспортом эндосома-лизосома через различные каскады белок-белковых взаимодействий .

RAB7A также участвует в регуляции некоторых специализированных эндосомальных мембранных перемещений , таких как созревание меланосом посредством модуляции SOX10 и онкогена MYC . Мутации лизосомального пути приводят к прогрессированию опухоли в клетках меланомы.

Распределение тканей

[ редактировать ]

RAB7 широко выражен; высокая экспрессия обнаружена в скелетных мышцах [ 10 ] поскольку он играет роль в ретроградном транспорте сигнальных эндосом в аксонах на большие расстояния .

Получено из Национальной медицинской библиотеки США по ссылке http://ghr.nlm.nih.gov/gene/RAB7A.

Ген RAB7A расположен на хромосоме 3 у человека, а именно на длинном плече q от пары оснований 128 726 135 до 128 814 797. Местоположение было обнаружено с помощью картографирования , которое впервые было выполнено Дэвисом и др. в 1997 году для картирования гена RAB7A на хромосоме 3 с помощью ПЦР-анализа . [ 5 ] В 1995 году Barbosa et al. картировали его на хромосоме 9 у мышей. Наконец, используя флуоресцентную гибридизацию in situ (FISH), Kashuba et al. смогли сопоставить ген RAB7A с 3q21 в 1997 году. [ 6 ]

RAB7a был клонирован путем скрининга библиотеки кДНК плаценты человека с кДНК Rab7 крысы, чтобы показать, что кДНК RAB7a кодирует белок из 207 аминокислот, последовательность которого на 99% идентична последовательности Rab7a мыши, крысы и собаки и на 61% идентична последовательности. дрожжей Rab7a. Используя нозерн-блот-анализ , Vitelli et al. (1996) обнаружили, что RAB7a экспрессируется в виде транскриптов размером 1,7 и 2,5 т.п.н. во всех исследованных клеточных линиях, но существует большая разница в общем количестве мРНК RAB7a среди клеточных линий. [ 11 ]

Регулирование

[ редактировать ]
MYC и SOX10 регулируют RAB7 в зависимости от онкогена и линии соответственно.

Это связано с тем, что уровни и функция RAB7a не зависели от для меланоцитов , специфичных факторов транскрипции ( MITF ), но недавние исследования показали, что SOX10 (нейроэктодермальный главный модулятор) и MYC (онкоген) являются основными регуляторами. Rab7a регулируется SOX10 и MYC соответственно в зависимости от линии связи. Исследования показывают, что RAB7a можно специфически повышать с помощью независимых от MITF способов, таких как изменение уровней SOX10 или MYC, чтобы влиять на пролиферацию опухоли, особенно при меланоме. [14] .

В исследованиях с использованием антисмысловой РНК снижение экспрессии гена RAB7 в клетках HeLa с использованием антисмысловой РНК вызывает тяжелую вакуолизацию клеток, которая напоминает фенотип , наблюдаемый в фибробластах пациентов с синдромом Чедиака-Хигаси . [ 12 ]

В присутствии фактора роста ингибирование Rab7 млекопитающих фактором роста не влияло на экспрессию переносчика питательных веществ в про-В-лимфоцитах мыши. Однако в клетках, лишенных фактора роста, блокирование функции Rab7 предотвращало клиренс белков-переносчиков глюкозы и аминокислот с поверхности клетки. Когда Rab7 был ингибирован, клетки, лишенные фактора роста, сохраняли свой потенциал митохондриальной мембраны и демонстрировали длительное, независимое от фактора роста и зависимое от питательных веществ выживание клеток. Авторы пришли к выводу, что RAB7 действует как проапоптотический белок, ограничивая автономное клеточное поглощение питательных веществ. [ 13 ]

Взаимодействия

[ редактировать ]

Было показано, что RAB7A взаимодействует с RILP. [ 14 ] [ 15 ] и ЧМ . [ 16 ] [ 17 ] Было показано, что RILP играет ключевую роль в контроле транспорта к деградационным компартментам наряду с Rab7 и может связывать функцию Rab7 с цитоскелетом . RILP играет роль нижестоящего эффектора для Rab7, и вместе оба этих белка регулируют поздний эндоцитарный трафик. [ 18 ]

RAB7A напрямую взаимодействует с Рубиконом , когда RAB7A связан с GTP. Рубикон является негативным регулятором аутофагии . [ 19 ]

Другие ключевые взаимодействия включают RAC1 (по сходству), NTRK1/TRKA (по сходству), C9orf72 (по сходству), CHM (субъединица, связывающая субстрат комплекса Rab геранилгеранилтрансферазы) и RILP. [ 20 ] а также PSMA7 , RNF115 и FYCO1 . Взаимодействует с комплексом PIK3C3/VPS34-PIK3R4. Форма, связанная с GTP, взаимодействует с OSBPL1A и CLN3 . [ 21 ] Также было показано, что Rab7A взаимодействует с ретромерным комплексом, скорее всего, через субъединицу Vps35 . [ 22 ]

Клиническое значение

[ редактировать ]

RAB7 представляет собой небольшую ГТФазу , которая потенциально может вызывать злокачественные новообразования более чем 35 типов опухолей. Обнаружено, что RAB7 является ранним индуцируемым драйвером меланомы, уровни которого могут определять метастатический риск. Ген RAB7A принадлежит к семейству генов RAB , которое является членом семейства онкогенов RAS . Эти гены семейства RAB обеспечивают инструкции, необходимые для создания белков для транспортировки везикул. Эти белки представляют собой GTPases и действуют как переключатель, который включается и выключается молекулами GTP и GDP . [ 7 ]

Меланома

[ редактировать ]

Клетки меланомы сохраняют память развития, которая отражает уникальную структуру путей транспортировки везикул. Видно, что Rab7 контролирует пролиферативный и инвазивный потенциал этих агрессивных опухолей при идентификации кластера эндолизосомных генов, обогащенного меланомой . Лизосомальная деградация, универсальная особенность эукариотических клеток , может быть подавлена ​​в зависимости от типа опухоли и стадии. Обнаружение того, что RAB7 контролируется SOX10 и MYC независимым от MITF образом, имеет важные базовые и трансляционные последствия. [ 23 ] Sox10 не ингибируется механизмами, подавляющими MITF, некоторые из которых, включая мутации BRAF , относительно часто встречаются в злокачественных меланомах. Это может обеспечить память развития при экспрессии RAB7. Предполагается, что подавление RAB7 в инвазивном фронте агрессивных меланом модулируется механизмами, подобными эпителиально-мезенхимальному, например, недавно описанными, которые лежат в основе переключения транскрипции, связанного с прометастатическими фенотипами. Другими словами, существует присущая клеткам меланомы зависимость от небольшой ГТФазы RAB7, идентифицированной в кластере лизосомальных генов, которая отличает это злокачественное новообразование от более чем 35 типов опухолей. Анализы клеток человека, клинических образцов и моделей на мышах показали, что RAB7 является ранним индуцируемым драйвером меланомы, уровни которого можно настроить так, чтобы способствовать инвазии опухоли, что в конечном итоге определяет риск метастазирования. Важно отметить, что уровни и функция RAB7 не зависели от MITF, и вместо этого ключевыми регуляторами RAB7a являются главный нейроэктодермальный модулятор SOX10 и онкоген MYC. [ 23 ]

Шарко-Мари-Тут 2B

[ редактировать ]
Стопа Шарко-Мари-Зуб

Также известна как невропатия Шарко-Мари-Тута, наследственная моторная и сенсорная невропатия (HMSN) и малоберцовая мышечная атрофия (PMA). Это генетически и клинически гетерогенная группа наследственных заболеваний, характеризующаяся выраженной потерей чувствительности, часто осложняющаяся тяжелыми язвенными повреждениями пальцев ног или стоп, а также различными двигательными нарушениями. [ 24 ] [ 25 ] Миссенс-мутации в RAB7A, гене, кодирующем малую ГТФазу Rab7, вызывают CMT2B и повышают активность Rab7. Rab7 экспрессируется повсеместно и участвует в деградации лизосомальным путем. В настоящее время это неизлечимое заболевание является одним из наиболее распространенных наследственных неврологических заболеваний, которым страдает примерно 1 из 2500 человек, что составляет примерно 23 000 человек в Соединенном Королевстве и 125 000 человек в Соединенных Штатах. ШМТ ранее классифицировалась как подтип мышечной дистрофии . [ 26 ]

  1. ^ Перейти обратно: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000075785 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Перейти обратно: а б с GRCm38: Ensembl, выпуск 89: ENSMUSG00000079477 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Перейти обратно: а б Дэвис Дж. П., Коттер П. Д., Иоанну Ю. А. (апрель 1997 г.). «Клонирование и картирование последовательностей кДНК человека Rab7 и Rab9 и идентификация псевдогена Rab9». Геномика . 41 (1): 131–4. дои : 10.1006/geno.1997.4644 . ПМИД   9126495 .
  6. ^ Перейти обратно: а б Кашуба В.И., Гизатуллин Р.З., Протопопов А.И., Алликметс Р., Королев С., Ли Дж., Болдог Ф., Тори К., Забаровска В., Марчек З., Сумеги Дж., Кляйн Г., Забаровский Э.Р., Киселев Л. (декабрь 1997 г.). «NotI-связывающие/перепрыгивающие клоны человеческой хромосомы 3: картирование генов TFRC, RAB7 и HAUSP с областями, реаранжированными при лейкемии и удаленными в солидных опухолях». Письма ФЭБС . 419 (2–3): 181–5. дои : 10.1016/S0014-5793(97)01449-X . ПМИД   9428630 . S2CID   10164824 .
  7. ^ Перейти обратно: а б «Домашний справочник по генетике RAB7A» . Национальная медицинская библиотека США . Архивировано из оригинала 27 июня 2020 года . Проверено 21 октября 2014 г.
  8. ^ Ауэр-Грумбах М. (март 2008 г.). «Наследственная сенсорная нейропатия I типа» . Сиротский журнал редких заболеваний . 3 (7): 7. дои : 10.1186/1750-1172-3-7 . ПМК   2311280 . ПМИД   18348718 .
  9. ^ «Ген Энтреза: RAB7A RAB7A, член семейства онкогенов RAS» .
  10. ^ Верховен К., Де Йонге П., Коэн К., Верпортен Н., Ауэр-Грумбах М., Квон Дж.М., ФитцПатрик Д., Шмеддинг Э., Де Вриендт Э., Джейкобс А., Ван Гервен В., Вагнер К., Хартунг Х.П., Тиммерман В. (март 2003 г.) . «Мутации в позднем эндосомальном белке малой ГТФ-азы RAB7 вызывают невропатию Шарко-Мари-Тута типа 2B» . Американский журнал генетики человека . 72 (3): 722–727. дои : 10.1086/367847 . ПМК   1180247 . ПМИД   12545426 .
  11. ^ Вителли Р., Кьяриелло М., Латтеро Д., Бруни С.Б., Буччи С. (декабрь 1996 г.). «Молекулярное клонирование и анализ экспрессии человеческой Rab7 GTP-азы, комплементарной дезоксирибонуклеиновой кислоте». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 229 (3): 887–890. дои : 10.1006/bbrc.1996.1897 . ПМИД   8954989 .
  12. ^ Дэвис Дж. П., Коттер П. Д., Иоанну Ю. А. (апрель 1997 г.). «Клонирование и картирование последовательностей кДНК человека Rab7 и Rab9 и идентификация псевдогена Rab9». Геномика . 41 (1): 131–134. дои : 10.1006/geno.1997.4644 . ПМИД   9126495 .
  13. ^ Эдингер А.Л., Чиналли Р.М., Томпсон С.Б. (октябрь 2003 г.). «Rab7 предотвращает независимое от фактора роста выживание, ингибируя экспрессию клеточно-автономного переносчика питательных веществ» . Развивающая клетка . 5 (4): 571–82. дои : 10.1016/s1534-5807(03)00291-0 . ПМИД   14536059 .
  14. ^ Канталупо Дж., Алифано П., Роберти В., Бруни С.Б., Буччи С. (февраль 2001 г.). «Rab-взаимодействующий лизосомальный белок (RILP): эффектор Rab7, необходимый для транспорта в лизосомы» . Журнал ЭМБО . 20 (4): 683–93. дои : 10.1093/emboj/20.4.683 . ПМК   145419 . ПМИД   11179213 .
  15. ^ Каплан С., Хартнелл Л.М., Агилар Р.К., Наславский Н., Бонифачино Дж.С. (июль 2001 г.). «Человеческий Vam6p способствует кластеризации и слиянию лизосом in vivo» . Журнал клеточной биологии . 154 (1): 109–22. дои : 10.1083/jcb.200102142 . ПМК   2196876 . ПМИД   11448994 .
  16. ^ Рак А., Пилипенко О., Николае А., Гуди Р.С., Александров К. (январь 2003 г.). «Кристаллизация и предварительный рентгеноструктурный анализ монопренилированной ГТФазы Rab7 в комплексе с белком сопровождения Rab 1». Журнал структурной биологии . 141 (1): 93–5. дои : 10.1016/S1047-8477(02)00634-2 . ПМИД   12576024 .
  17. ^ Александров К., Саймон И., Яковенко А., Хольц Б., Гуди Р.С., Шайдиг А.Дж. (апрель 1998 г.). «Умеренная дискриминация REP-1 между Rab7 x GDP и Rab7 x GTP возникает из-за разницы в скорости диссоциации на порядок» . Письма ФЭБС . 425 (3): 460–4. дои : 10.1016/S0014-5793(98)00290-7 . ПМИД   9563513 . S2CID   39125409 .
  18. ^ Ву М, Ван Т, Ло Э, Хун В, Сон Х (апрель 2005 г.). «Структурная основа рекрутирования RILP небольшой ГТФазой Rab7» . Журнал ЭМБО . 24 (8): 1491–1501. дои : 10.1038/sj.emboj.7600643 . ПМЦ   1142575 . ПМИД   15933719 .
  19. ^ Бхаргава, Херш К.; Табата, Кейсуке; Бик, Джордан М.; Хамасаки, Махо; Фаррелл, Дэниел П.; Анищенко Иван; ДиМайо, Фрэнк; Я, Ён Джун; Ёсимори, Тамоцу; Херли, Джеймс Х. (21 июля 2020 г.). «Структурная основа ингибирования аутофагии человеческим комплексом Рубикон-Rab7» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 117 (29): 17003–17010. Бибкод : 2020PNAS..11717003B . дои : 10.1073/pnas.2008030117 . ISSN   1091-6490 . ПМЦ   7382272 . ПМИД   32632011 .
  20. ^ Ван Т., Вонг К.К., Хонг В. (февраль 2004 г.). «Уникальная область RILP отличает его от родственных ему белков в регуляции лизосомальной морфологии и взаимодействии с Rab7 и Rab34» . Молекулярная биология клетки . 15 (2): 815–826. дои : 10.1091/mbc.E03-06-0413 . ПМК   329395 . PMID   14668488 .
  21. ^ Ууси-Раува К., Кюттяля А., ван дер Кант Р., Веса Дж., Танхуанпяя К., Нефьес Дж., Олкконен В.М., Яланко А. (июнь 2012 г.). «Нейрональный белок цероидного липофусциноза CLN3 взаимодействует с моторными белками и изменяет расположение поздних эндосомальных компартментов» . Клеточные и молекулярные науки о жизни . 69 (12): 2075–2089. дои : 10.1007/s00018-011-0913-1 . ПМЦ   11114557 . ПМИД   22261744 . S2CID   5733226 .
  22. ^ Рохас Р., ван Влеймен Т., Мардонес Г.А., Прабху Ю., Рохас А.Л., Мохаммед С., Хек А.Дж., Рапосо Г., ван дер Слуйс П., Бонифачино Дж.С. (ноябрь 2008 г.). «Регуляция рекрутирования ретромеров в эндосомы путем последовательного действия Rab5 и Rab7» . Журнал клеточной биологии . 183 (3): 513–26. дои : 10.1083/jcb.200804048 . ПМЦ   2575791 . ПМИД   18981234 .
  23. ^ Перейти обратно: а б Алонсо-Курбело Д, Ривейро-Фалькенбах Е, Перес-Гихарро Е, Сифдалос М, Каррас П, Остерло Л, Мегиас Д, Каньон Е, Кальво Т.Г., Ольмеда Д, Гомес-Лопес Г, Гранья О, Санчес-Аревало Лобо В.Дж., Пизано Д.Г., Ван Х.В., Ортис-Ромеро П., Тормо Д., Хук К., Родригес-Перальто Х.Л., Джойс Х.А., Соенгас М.С. (июль 2014 г.). «RAB7 контролирует прогрессирование меланомы, используя специфичную для линии связь эндолизосомного пути» . Раковая клетка . 26 (1): 61–76. дои : 10.1016/j.ccr.2014.04.030 . ПМИД   24981740 .
  24. ^ «Физическая медицина и реабилитация при болезни Шарко-Мари-Тута» . Медскейп . Проверено 4 ноября 2014 г.
  25. ^ Краевски К.М., Льюис Р.А., Фюрст Д.Р., Туранский С., Хиндерер С.Р., Гарберн Дж., Камхольц Дж., Шай М.Е. (июль 2000 г.). «Неврологическая дисфункция и аксональная дегенерация при болезни Шарко-Мари-Тута типа 1А». Мозг . 123 (7): 1516–27. дои : 10.1093/мозг/123.7.1516 . ПМИД   10869062 .
  26. ^ Янссенс К., Готалс С., Аткинсон Д., Эрманоска Б., Франсен Е., Иорданова А., Ауэр-Грумбах М., Ассельберг Б., Тиммерман В. (май 2014 г.). «Мутация человека Rab7 имитирует особенности невропатии Шарко-Мари-Тута типа 2B у дрозофилы». Нейробиология болезней . 65 : 211–9. дои : 10.1016/j.nbd.2014.01.021 . ПМИД   24521780 . S2CID   140204654 .
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: c6caa3ecaa765214c298adf105a932b9__1716777000
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/c6/b9/c6caa3ecaa765214c298adf105a932b9.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
RAB7A - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)