ЛДБ3

ЛДБ3
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	4YDP
Идентификаторы
Псевдонимы	LDB3 , CMD1C, CMPD3, CYPHER, LDB3Z1, LDB3Z4, LVNC3, MFM4, ORACLE, PDLIM6, ZASP, CMH24, привязка домена LIM 3
Внешние идентификаторы	Опустить : 605906 ; МГИ : 1344412 ; Гомологен : 134626 ; Генные карты : LDB3 ; OMA : LDB3 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 10 (human)
End	86,736,072 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 14 (mouse)
End	34,310,639 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	Skeletal muscle tissue of biceps brachii; ; muscle of thigh; ; apex of heart; ; body of tongue; ; vastus lateralis muscle; ; Skeletal muscle tissue of rectus abdominis; ; left ventricle; ; vena cava; ; myocardium of left ventricle; ; atrium;
	Top expressed in
	triceps brachii muscle; ; muscle of thigh; ; medial head of gastrocnemius muscle; ; temporal muscle; ; sternocleidomastoid muscle; ; ankle; ; quadriceps femoris muscle; ; tibialis anterior muscle; ; digastric muscle; ; vastus lateralis muscle;
	More reference expression data
	; ; ; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	cytoskeletal protein binding; protein binding; metal ion binding; muscle alpha-actinin binding; protein kinase C binding; actin binding;
Cellular component	cytoplasm; perinuclear region of cytoplasm; cell projection; pseudopodium; Z discdkac; cytoskeleton; stress fiber; filamentous actin;
Biological process	sarcomere organization; heart development; actin cytoskeleton organization; muscle structure development;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	11155
	24131
	ENSG00000122367
	ENSMUSG00000021798
	О75112
	Q9JKS4
showНМ_001080114 ; НМ_001080115 ; НМ_001080116 ; НМ_001171610 ; НМ_001171611 ;
	NM_007078; NM_001368063; NM_001368064; NM_001368065; NM_001368066; NM_001368067; NM_001368068
showНМ_001039071 ; НМ_001039072 ; НМ_001039073 ; НМ_001039074 ; НМ_001039075 ;
	NM_001039076; NM_011918
showНП_001073583 ; НП_001073584 ; НП_001073585 ; НП_001165081 ; НП_001165082 ;
	NP_009009; NP_001354992; NP_001354993; NP_001354994; NP_001354995; NP_001354996; NP_001354997
showНП_001034160 ; НП_001034161 ; НП_001034162 ; НП_001034163 ; НП_001034164 ;
	NP_001034165; NP_036048
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

LIM-домен, связывающий 3 ( LDB3 ), также известный как альтернативно сплайсированный PDZ-мотив Z-диапазона ( ZASP ), представляет собой белок , который у людей кодируется LDB3 геном . ^[5]^[6] ZASP принадлежит к подсемейству белков Enigma и стабилизирует саркомер (основную единицу мышц) во время сокращения посредством взаимодействия с актином в сердечных и скелетных мышцах . Мутации в гене ZASP связаны с несколькими мышечными заболеваниями .

Структура

ZASP представляет собой белок, содержащий домен PDZ . PDZ-мотивы представляют собой модульные домены межбелкового взаимодействия, состоящие из 80-120 аминокислотных остатков. Белки, содержащие домен PDZ, взаимодействуют друг с другом при сборке цитоскелета или с другими белками, участвующими в нацеливании и кластеризации мембранных белков. ZASP взаимодействует с альфа- актинином -2 через его N-концевой домен PDZ и с протеинкиназой C через его C-концевые домены LIM . Домен LIM представляет собой богатый цистеином мотив, состоящий из 50-60 аминокислот и содержащий два цинксвязывающих модуля. Этот белок также взаимодействует со всеми тремя членами семейства миозенинов . ^[5]

Человеческий ZASP может существовать в клетках сердца и скелета в виде шести различных изоформ, основанных на альтернативном сплайсинге 16 экзонов. ^[7] Существует 2 короткие формы ZASP (Uniprot ID: O75112-6, 31,0 кДа, 283 аминокислоты; ^[8] и Uniprot ID: O75112-5, 35,6 кДа, 330 аминокислот); ^[9] и 4 длинные формы ZASP (Uniprot ID: O75112-4, 42,8 кДа, 398 аминокислот; ^[10] Uniprot ID: O75112-3, 50,6 кДа, 470 аминокислот; ^[11] Uniprot ID: O75112-2, 66,6 кДа, 617 аминокислот; ^[12] и Uniprot ID: O75112, 77,1 кДа, 727 аминокислот). ^[13]^[14] Все изоформы ZASP имеют N-концевой домен PDZ ; внутренние консервативные последовательности, известные как ZASP-подобные мотивы (ZM); и четыре длинные изоформы имеют три C-концевых домена LIM . ^[7]

Функция

Функция ZASP поддерживает структурную целостность саркомеров во время сокращения и, как было показано, участвует в протеинкиназы А. передаче сигналов ^[15] Также было показано, что ZASP коактивирует интегрины α5β1 вместе с белком TLN1 . ^[16]

Клиническое значение

Мутации в ZASP связаны с миофибриллярной миопатией . ^[17] дилатационная кардиомиопатия , ^[18]^[19] аритмогенная правожелудочковая кардиомиопатия , ^[20] некомпактная кардиомиопатия , ^[18]^[21] и мышечная дистрофия . ^[17]

Взаимодействия

Домен PDZ ZASP связывается с С-концом альфа- актинина -2. ^[6]^[22] и ZM связывают стержневой домен альфа-актинина-2 . ^[23] домены LIM Было показано, что взаимодействуют с протеинкиназой C. ^[22]^[24] Кардиоспецифическая область ZASP, кодируемая экзоном 4, включает мотив ZP и связывает регуляторную субъединицу протеинкиназы А. ^[15]

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000122367 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021798 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: привязка домена LDB3 LIM 3» .
^ Jump up to: ^а ^б Фолкнер Г., Паллавичини А., Форментин Е., Комелли А., Иеволелла С., Тревизан С. и др. (июль 1999 г.). «ZASP: новый белок PDZ-мотива с альтернативным сплайсингом Z-диапазона» . J Клеточная Биол . 146 (2): 465–75. дои : 10.1083/jcb.146.2.465 . ПМК 3206570 . ПМИД 10427098 .
^ Jump up to: ^а ^б Шейх Ф., Банг М.Л., Ланге С., Чен Дж. (ноябрь 2007 г.). « Нет подробностей о роли Сайфера в функции поперечно-полосатых мышц, передаче сигналов и заболеваниях человека» . Тенденции сердечно-сосудистой медицины . 17 (8): 258–62. дои : 10.1016/j.tcm.2007.09.002 . ПМК 2134983 . ПМИД 18021935 .
^ «О75112-6» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ «О75112-5» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ «О75112-4» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ «О75112-3» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ «О75112-2» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ «О75112» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.
^ Зонг Н.К., Ли Х., Ли Х., Лам М.П., Хименес Р.К., Ким К.С. и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .
^ Jump up to: ^а ^б Линь С., Го Икс, Ланге С., Лю Дж., Оуян К., Инь Икс и др. (октябрь 2013 г.). «Cypher/ZASP — это новый белок, закрепляющий А-киназу» . Журнал биологической химии . 288 (41): 29403–13. дои : 10.1074/jbc.M113.470708 . ПМЦ 3795241 . ПМИД 23996002 .
^ Буауина М., Яни К., Лонг Дж.Ю., Чернецкий С., Морс Э.М., Эллис С.Дж. и др. (декабрь 2012 г.). «Засп регулирует активацию интегрина» . Журнал клеточной науки . 125 (Часть 23): 5647–57. дои : 10.1242/jcs.103291 . ПМЦ 3575701 . ПМИД 22992465 .
^ Jump up to: ^а ^б Селцен Д., Engel AG (февраль 2005 г.). «Мутации в ZASP определяют новую форму мышечной дистрофии у человека». Анналы неврологии . 57 (2): 269–76. дои : 10.1002/ana.20376 . ПМИД 15668942 . S2CID 25733755 .
^ Jump up to: ^а ^б Ватта М., Мохапатра Б., Хименес С., Санчес Х., Фолкнер Г., Перлес З. и др. (декабрь 2003 г.). «Мутации Cypher/ZASP у пациентов с дилатационной кардиомиопатией и некомпактным левым желудочком» . Журнал Американского колледжа кардиологов . 42 (11): 2014–27. дои : 10.1016/j.jacc.2003.10.021 . ПМИД 14662268 .
^ Аримура Т., Хаяши Т., Терада Х., Ли С.И., Чжоу К., Такахаши М., Уэда К., Ноучи Т., Хода С., Шибутани М., Хиросе М., Чен Дж., Пак Дж.Э., Ясунами М., Хаяши Х., Кимура А. (февраль 2004 г.) ). «Мутация Cypher/ZASP, связанная с дилатационной кардиомиопатией, изменяет аффинность связывания с протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 279 (8): 6746–52. дои : 10.1074/jbc.M311849200 . ПМИД 14660611 .
^ Лопес-Аяла Х.М., Ортис-Дженга М., Гомес-Миланес И., Лопес-Куэнка Д., Руис-Эспехо Ф., Санчес-Муньос Х.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Мутация в белке Z-line Cypher/ZASP связана с аритмогенной кардиомиопатией правого желудочка». Клиническая генетика . 88 (2): 172–6. дои : 10.1111/cge.12458 . ПМИД 25041374 . S2CID 21822009 .
^ Си Ю, Ай Т, Де Ланж Э, Ли З, Ву Г, Брунелли Л и др. (октябрь 2012 г.). «Потеря функции hNav1.5 из-за мутации ZASP1, связанной с нарушениями внутрижелудочковой проводимости при некомпактном состоянии левого желудочка» . Кровообращение: аритмия и электрофизиология . 5 (5): 1017–26. дои : 10.1161/CIRCEP.111.969220 . ПМК 4331025 . ПМИД 22929165 .
^ Jump up to: ^а ^б Чжоу Ц, Руис-Лозано П., Мартоне М.Э., Чен Дж. (июль 1999 г.). «Cypher, ограниченный поперечнополосатой мышцей белок, содержащий домен PDZ и LIM, связывается с альфа-актинином-2 и протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 274 (28): 19807–13. дои : 10.1074/jbc.274.28.19807 . ПМИД 10391924 .
^ Клаавуниеми Т., Юленне Дж. (май 2006 г.). «Фрагменты, содержащие внутренний ZM-мотив Zasp/Cypher, достаточны для совместной локализации с альфа-актинином - анализ мутаций пациента». Экспериментальные исследования клеток . 312 (8): 1299–311. дои : 10.1016/j.yexcr.2005.12.036 . ПМИД 16476425 .
^ Курода С., Токунага С., Киёхара И., Хигучи О., Кониси Х., Мизуно К. и др. (декабрь 1996 г.). «Белково-белковое взаимодействие доменов LIM с цинковыми пальцами и протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 271 (49): 31029–32. дои : 10.1074/jbc.271.49.31029 . ПМИД 8940095 .

Дальнейшее чтение

Марзилиано Н., Маннарино С., Несполи Л., Диеголи М., Пасотти М., Малаттиа С. и др. (май 2007 г.). «Синдром Барта, связанный со сложной гемизиготностью и гетерозиготностью генов TAZ и LDB3». Американский журнал медицинской генетики, часть A. 143А (9): 907–15. дои : 10.1002/ajmg.a.31653 . hdl : 2434/45968 . ПМИД 17394203 . S2CID 20328643 .
Клаавуниеми Т., Юленне Дж. (май 2006 г.). «Фрагменты, содержащие внутренний ZM-мотив Zasp/Cypher, достаточны для совместной локализации с альфа-актинином - анализ мутаций пациента». Экспериментальные исследования клеток . 312 (8): 1299–311. дои : 10.1016/j.yexcr.2005.12.036 . ПМИД 16476425 .
Кимура К., Вакамацу А., Судзуки Й., Ота Т., Нишикава Т., Ямашита Р. и др. (январь 2006 г.). «Диверсификация транскрипционной модуляции: крупномасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека» . Геномные исследования . 16 (1): 55–65. дои : 10.1101/гр.4039406 . ПМК 1356129 . ПМИД 16344560 .
Фрей Н., Олсон Э.Н. (апрель 2002 г.). «Кальсарцин-3, новый представитель семейства кальсарцинов, специфичный для скелетных мышц, взаимодействует с множеством белков Z-диска» . Журнал биологической химии . 277 (16): 13998–4004. дои : 10.1074/jbc.M200712200 . ПМИД 11842093 .
Хартли Дж.Л., Темпл Г.Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro» . Геномные исследования . 10 (11): 1788–95. дои : 10.1101/гр.143000 . ПМК 310948 . ПМИД 11076863 .
Пассир Р., Ричардсон Дж. А., Олсон Э. Н. (апрель 2000 г.). «Oracle, новый белок домена PDZ-LIM, экспрессируемый в сердце и скелетных мышцах» . Механизмы развития . 92 (2): 277–84. дои : 10.1016/S0925-4773(99)00330-5 . ПМИД 10727866 . S2CID 18254892 .
Исикава К., Нагасе Т., Суяма М., Миядзима Н., Танака А., Котани Х., Номура Н., Охара О (июнь 1998 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неопознанных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК головного мозга, которые могут кодировать крупные белки in vitro» . Исследование ДНК . 5 (3): 169–76. дои : 10.1093/dnares/5.3.169 . ПМИД 9734811 .
Ланфранчи Г., Мураро Т., Кальдара Ф., Паччиони Б., Паллавичини А., Пандольфо Д. и др. (январь 1996 г.). «Идентификация 4370 меток экспрессируемых последовательностей из библиотеки кДНК, специфичной к 3'-концу скелетных мышц человека, путем секвенирования ДНК и гибридизации фильтров» . Геномные исследования . 6 (1): 35–42. дои : 10.1101/гр.6.1.35 . ПМИД 8681137 .

Внешние ссылки

Запись GeneReviews/NIH/NCBI/UW о миофибриллярной миопатии
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : O75112 (белок 3, связывающий домен LIM человека) на PDBe-KB .
Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q9JKS4 (мышиный белок 3, связывающий домен LIM) на PDBe-KB .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000122367 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021798 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: привязка домена LDB3 LIM 3» .

[pmid10427098-6] Jump up to: ^а ^б Фолкнер Г., Паллавичини А., Форментин Е., Комелли А., Иеволелла С., Тревизан С. и др. (июль 1999 г.). «ZASP: новый белок PDZ-мотива с альтернативным сплайсингом Z-диапазона» . J Клеточная Биол . 146 (2): 465–75. дои : 10.1083/jcb.146.2.465 . ПМК 3206570 . ПМИД 10427098 .

[Sheikh_F_2007-7] Jump up to: ^а ^б Шейх Ф., Банг М.Л., Ланге С., Чен Дж. (ноябрь 2007 г.). « Нет подробностей о роли Сайфера в функции поперечно-полосатых мышц, передаче сигналов и заболеваниях человека» . Тенденции сердечно-сосудистой медицины . 17 (8): 258–62. дои : 10.1016/j.tcm.2007.09.002 . ПМК 2134983 . ПМИД 18021935 .

[8] «О75112-6» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[9] «О75112-5» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[10] «О75112-4» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[11] «О75112-3» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[12] «О75112-2» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[13] «О75112» . Архивировано из оригинала 13 июня 2015 г. Проверено 11 июня 2015 г.

[14] Зонг Н.К., Ли Х., Ли Х., Лам М.П., Хименес Р.К., Ким К.С. и др. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии и медицины сердечного протеома с помощью специализированной базы знаний» . Исследование кровообращения . 113 (9): 1043–53. дои : 10.1161/CIRCRESAHA.113.301151 . ПМК 4076475 . ПМИД 23965338 .

[ReferenceB-15] Jump up to: ^а ^б Линь С., Го Икс, Ланге С., Лю Дж., Оуян К., Инь Икс и др. (октябрь 2013 г.). «Cypher/ZASP — это новый белок, закрепляющий А-киназу» . Журнал биологической химии . 288 (41): 29403–13. дои : 10.1074/jbc.M113.470708 . ПМЦ 3795241 . ПМИД 23996002 .

[16] Буауина М., Яни К., Лонг Дж.Ю., Чернецкий С., Морс Э.М., Эллис С.Дж. и др. (декабрь 2012 г.). «Засп регулирует активацию интегрина» . Журнал клеточной науки . 125 (Часть 23): 5647–57. дои : 10.1242/jcs.103291 . ПМЦ 3575701 . ПМИД 22992465 .

[pmid15668942-17] Jump up to: ^а ^б Селцен Д., Engel AG (февраль 2005 г.). «Мутации в ZASP определяют новую форму мышечной дистрофии у человека». Анналы неврологии . 57 (2): 269–76. дои : 10.1002/ana.20376 . ПМИД 15668942 . S2CID 25733755 .

[pmid14662268-18] Jump up to: ^а ^б Ватта М., Мохапатра Б., Хименес С., Санчес Х., Фолкнер Г., Перлес З. и др. (декабрь 2003 г.). «Мутации Cypher/ZASP у пациентов с дилатационной кардиомиопатией и некомпактным левым желудочком» . Журнал Американского колледжа кардиологов . 42 (11): 2014–27. дои : 10.1016/j.jacc.2003.10.021 . ПМИД 14662268 .

[pmid14660611-19] Аримура Т., Хаяши Т., Терада Х., Ли С.И., Чжоу К., Такахаши М., Уэда К., Ноучи Т., Хода С., Шибутани М., Хиросе М., Чен Дж., Пак Дж.Э., Ясунами М., Хаяши Х., Кимура А. (февраль 2004 г.) ). «Мутация Cypher/ZASP, связанная с дилатационной кардиомиопатией, изменяет аффинность связывания с протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 279 (8): 6746–52. дои : 10.1074/jbc.M311849200 . ПМИД 14660611 .

[20] Лопес-Аяла Х.М., Ортис-Дженга М., Гомес-Миланес И., Лопес-Куэнка Д., Руис-Эспехо Ф., Санчес-Муньос Х.Дж. и др. (июль 2014 г.). «Мутация в белке Z-line Cypher/ZASP связана с аритмогенной кардиомиопатией правого желудочка». Клиническая генетика . 88 (2): 172–6. дои : 10.1111/cge.12458 . ПМИД 25041374 . S2CID 21822009 .

[21] Си Ю, Ай Т, Де Ланж Э, Ли З, Ву Г, Брунелли Л и др. (октябрь 2012 г.). «Потеря функции hNav1.5 из-за мутации ZASP1, связанной с нарушениями внутрижелудочковой проводимости при некомпактном состоянии левого желудочка» . Кровообращение: аритмия и электрофизиология . 5 (5): 1017–26. дои : 10.1161/CIRCEP.111.969220 . ПМК 4331025 . ПМИД 22929165 .

[ReferenceC-22] Jump up to: ^а ^б Чжоу Ц, Руис-Лозано П., Мартоне М.Э., Чен Дж. (июль 1999 г.). «Cypher, ограниченный поперечнополосатой мышцей белок, содержащий домен PDZ и LIM, связывается с альфа-актинином-2 и протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 274 (28): 19807–13. дои : 10.1074/jbc.274.28.19807 . ПМИД 10391924 .

[23] Клаавуниеми Т., Юленне Дж. (май 2006 г.). «Фрагменты, содержащие внутренний ZM-мотив Zasp/Cypher, достаточны для совместной локализации с альфа-актинином - анализ мутаций пациента». Экспериментальные исследования клеток . 312 (8): 1299–311. дои : 10.1016/j.yexcr.2005.12.036 . ПМИД 16476425 .

[24] Курода С., Токунага С., Киёхара И., Хигучи О., Кониси Х., Мизуно К. и др. (декабрь 1996 г.). «Белково-белковое взаимодействие доменов LIM с цинковыми пальцами и протеинкиназой C» . Журнал биологической химии . 271 (49): 31029–32. дои : 10.1074/jbc.271.49.31029 . ПМИД 8940095 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]