ТРАФ4

ТРАФ4
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	2EOD, 2YUC, 3ZJB, 4K8U, 4M4E
Идентификаторы
Псевдонимы	TRAF4 , CART1, MLN62, RNF83, фактор 4, связанный с рецептором TNF.
Внешние идентификаторы	Опустить : 602464 ; МГИ : 1202880 ; Гомологен : 3173 ; Генные карты : TRAF4 ; ОМА : TRAF4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 17 (human)
End	28,750,956 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 11 (mouse)
End	78,056,415 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	olfactory zone of nasal mucosa; ; right uterine tube; ; mucosa of transverse colon; ; right lobe of thyroid gland; ; minor salivary glands; ; left lobe of thyroid gland; ; right lobe of liver; ; ganglionic eminence; ; gallbladder; ; rectum;
	Top expressed in
	yolk sac; ; right kidney; ; neural tube; ; ganglionic eminence; ; epiblast; ; ventricular zone; ; embryo; ; genital tubercle; ; embryo; ; mandibular prominence;
	More reference expression data
	; ;
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	DNA binding; zinc ion binding; metal ion binding; protein binding; WW domain binding; thioesterase binding; tumor necrosis factor receptor binding; protein kinase binding; ubiquitin protein ligase binding; identical protein binding;
Cellular component	cytoplasm; membrane; bicellular tight junction; plasma membrane; cell junction; perinuclear region of cytoplasm; cytoskeleton; nucleus; protein-containing complex; intracellular anatomical structure;
Biological process	regulation of apoptotic process; activation of NF-kappaB-inducing kinase activity; positive regulation of JNK cascade; positive regulation of protein homodimerization activity; respiratory gaseous exchange by respiratory system; multicellular organism development; respiratory tube development; signal transduction; positive regulation of protein kinase activity; apoptotic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	9618
	22032
	ENSG00000076604
	ENSMUSG00000017386
	Q9BUZ4
	Q61382
	НМ_004295 ; НМ_145751
	НМ_009423
	НП_004286
	НП_033449
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Фактор 4, связанный с рецептором TNF (TRAF4), также известный как белок 83 RING-пальца (RNF83), представляет собой белок , который у людей кодируется TRAF4 геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

TRAF4 является членом семейства факторов, ассоциированных с рецептором TNF (TRAF), семейства каркасных белков . ^{[ 8 ]} Белки TRAF соединяют рецепторы IL-1R /Toll и TNF с сигнальными факторами, которые приводят к активации NF-κB и митоген-активируемых протеинкиназ . Однако неизвестно, как TRAF4 взаимодействует с рецепторами TNF, и его клеточные функции недостаточно изучены. ^{[ 9 ]}

Белковые взаимодействия

Было показано, что TRAF4 взаимодействует с нейротрофина p75 рецептором (NTR/NTSR1), ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]} и негативно регулировать NTR-индуцированную гибель клеток и активацию NF-каппа B. Было обнаружено, что этот белок связывается с p47phox , цитозольным регуляторным фактором, включенным в мультибелковый комплекс, известный как НАД(P)H-оксидаза . Таким образом, считается, что этот белок участвует в окислительной активации MAPK8 /JNK. Наблюдались альтернативно сплайсированные варианты транскриптов, но полноразмерная природа только одного из них была определена. ^{[ 7 ]}

Недавний отчет показывает, что TRAF4 связывается с NOD-подобными рецепторами NOD1 и NOD2 и специфически ингибирует активацию NF-κB активированным комплексом NOD2-RIP2. ^{[ 12 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000076604 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017386 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Ренье CH, Томасетто C, Муг-Лутц C, Шенар MP, Вендлинг C, Бассет П, Рио MC (декабрь 1995 г.). «Наличие нового консервативного домена в CART1, нового члена семейства белков, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, который экспрессируется при карциноме молочной железы» . J Биол Хим . 270 (43): 25715–21. дои : 10.1074/jbc.270.43.25715 . ПМИД 7592751 .
^ Томасетто К., Ренье К., Муг-Лутц К., Маттеи М.Г., Шенар М.П., Лидеро Р., Бассет П., Рио М.К. (январь 1996 г.). «Идентификация четырех новых человеческих генов, амплифицированных и сверхэкспрессируемых при карциноме молочной железы и локализованных в области q11-q21.3 хромосомы 17». Геномика . 28 (3): 367–76. дои : 10.1006/geno.1995.1163 . ПМИД 7490069 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: фактор 4, связанный с рецептором TNF TRAF4» .
^ Вадант Х., Хенклер Ф., Шойрих П. (июнь 2001 г.). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: каркасные молекулы для цитокиновых рецепторов, киназ и их регуляторов». Клетка. Сигнал . 13 (6): 389–400. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00160-7 . ПМИД 11384837 .
^ Кедингер В., Рио MC (2007). «TRAF4, уникальный член семьи». Факторы, ассоциированные с рецептором TNF (TRAF) . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 597. стр. 60–71. дои : 10.1007/978-0-387-70630-6_5 . ISBN 978-0-387-70629-0 . ПМИД 17633017 .
^ Йе Х, Мелен П., Рабизаде С., ВанАрсдейл Т., Чжан Х., Шин Х., Ван Дж.Дж., Лео Э., Сапата Дж., Хаузер К.А., Рид Дж.К., Бредесен Д.Е. (октябрь 1999 г.). «Белки семейства TRAF взаимодействуют с общим рецептором нейротрофинов и модулируют индукцию апоптоза» . Ж. Биол. Хим . 274 (42): 30202–8. дои : 10.1074/jbc.274.42.30202 . ПМИД 10514511 .
^ Краевска М., Краевски С., Сапата Дж.М., Ван Арсдейл Т., Гаскойн Р.Д., Берерн К., Макфадден Д., Шабайк А., Хью Дж., Рейнольдс А., Клевенджер К.В., Рид Дж.К. (июнь 1998 г.). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого человека, плода и опухоли» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (6): 1549–61. ПМЦ 1858434 . ПМИД 9626059 .
^ Маринис Дж. М., Гомер Ч. Р., Макдональд С., Эбботт Д. В. (2011). «Новый мотив в белке восприимчивости к болезни Крона, NOD2, позволяет TRAF4 подавлять врожденные иммунные реакции» . Ж. Биол. Хим . 286 (3): 1938–1950. дои : 10.1074/jbc.M110.189308 . ПМК 3023490 . ПМИД 21097508 .

Дальнейшее чтение

Брэдли-младший, Побер Дж.С. (2001). «Факторы, связанные с рецепторами фактора некроза опухоли (TRAF)» . Онкоген . 20 (44): 6482–91. дои : 10.1038/sj.onc.1204788 . ПМИД 11607847 .
Массон Р., Ренье Ч., Шенар М.П. и др. (1998). «Характер экспрессии фактора 4, связанного с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF4), во время развития мышей» . Мех. Дев . 71 (1–2): 187–91. дои : 10.1016/S0925-4773(97)00192-5 . ПМИД 9507120 . S2CID 13877166 .
Сапата Дж.М., Павловски К., Хаас Э. и др. (2001). «Разнообразное семейство белков, содержащих домены факторов, связанных с рецептором фактора некроза опухоли» . Ж. Биол. Хим . 276 (26): 24242–52. дои : 10.1074/jbc.M100354200 . ПМИД 11279055 .
Ренье Ч., Массон Р., Кедингер В. и др. (2002). «Нарушение закрытия нервной трубки, пороки развития осевого скелета и разрушение кольца трахеи у мышей с дефицитом TRAF4» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (8): 5585–90. Бибкод : 2002PNAS...99.5585R . дои : 10.1073/pnas.052124799 . ПМК 122813 . ПМИД 11943846 .
Сюй Ю.К., Ву РФ, Гу Ю и др. (2002). «Участие TRAF4 в окислительной активации N-концевой киназы c-Jun» . Ж. Биол. Хим . 277 (31): 28051–7. дои : 10.1074/jbc.M202665200 . ПМИД 12023963 .
Глаунер Х., Зигмунд Д., Мотехаддед Х. и др. (2002). «Внутриклеточная локализация и регуляция транскрипции фактора 4, связанного с рецептором фактора некроза опухоли (TNF) (TRAF4)». Евро. Дж. Биохим . 269 (19): 4819–29. дои : 10.1046/j.1432-1033.2002.03180.x . ПМИД 12354113 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2003). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Сакс Дж.К., Эль-Дейри В.С. (2003). «Идентификация и характеристика цитоплазматического белка TRAF4 как проапоптотического гена, регулируемого р53» . Ж. Биол. Хим . 278 (38): 36435–44. дои : 10.1074/jbc.M303191200 . ПМИД 12788948 .
Флекенштейн Д.С., Диркс В.Г., Дрекслер Х.Г., Квентмайер Х. (2003). «Фактор, связанный с рецептором фактора некроза опухоли (TRAF) 4, является новым партнером по связыванию серин / треонин киназы p70S6». Лейк. Рез . 27 (8): 687–94. дои : 10.1016/S0145-2126(02)00325-9 . ПМИД 12801526 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Ма Б.Я., Миколайчак С.А., Данеш А. и др. (2005). «Экспрессия и регуляторная роль гетеродимера OX40 и 4-1BB в активированных Т-клетках человека» . Кровь . 106 (6): 2002–10. дои : 10.1182/blood-2004-04-1622 . ПМИД 15941918 .
Такешита Ф., Исии К.Дж., Кобияма К. и др. (2005). «TRAF4 действует как глушитель в передаче сигналов, опосредованной TLR, посредством ассоциации с TRAF6 и TRIF». Евро. Дж. Иммунол . 35 (8): 2477–85. дои : 10.1002/eji.200526151 . ПМИД 16052631 . S2CID 560536 .
Абель А.Н., Джонсон Г.Л. (2006). «MEKK4 является эффектором эмбрионального TRAF4 для активации JNK» . Ж. Биол. Хим . 280 (43): 35793–6. дои : 10.1074/jbc.C500260200 . ПМИД 16157600 .

Эта статья о гене на й хромосоме человека незавершена 17 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000076604 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017386 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7592751-5] Ренье CH, Томасетто C, Муг-Лутц C, Шенар MP, Вендлинг C, Бассет П, Рио MC (декабрь 1995 г.). «Наличие нового консервативного домена в CART1, нового члена семейства белков, связанных с рецептором фактора некроза опухоли, который экспрессируется при карциноме молочной железы» . J Биол Хим . 270 (43): 25715–21. дои : 10.1074/jbc.270.43.25715 . ПМИД 7592751 .

[pmid7490069-6] Томасетто К., Ренье К., Муг-Лутц К., Маттеи М.Г., Шенар М.П., Лидеро Р., Бассет П., Рио М.К. (январь 1996 г.). «Идентификация четырех новых человеческих генов, амплифицированных и сверхэкспрессируемых при карциноме молочной железы и локализованных в области q11-q21.3 хромосомы 17». Геномика . 28 (3): 367–76. дои : 10.1006/geno.1995.1163 . ПМИД 7490069 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: фактор 4, связанный с рецептором TNF TRAF4» .

[pmid11384837-8] Вадант Х., Хенклер Ф., Шойрих П. (июнь 2001 г.). «Семейство факторов, связанных с рецептором TNF: каркасные молекулы для цитокиновых рецепторов, киназ и их регуляторов». Клетка. Сигнал . 13 (6): 389–400. дои : 10.1016/S0898-6568(01)00160-7 . ПМИД 11384837 .

[pmid17633017-9] Кедингер В., Рио MC (2007). «TRAF4, уникальный член семьи». Факторы, ассоциированные с рецептором TNF (TRAF) . Достижения экспериментальной медицины и биологии. Том. 597. стр. 60–71. дои : 10.1007/978-0-387-70630-6_5 . ISBN 978-0-387-70629-0 . ПМИД 17633017 .

[pmid10514511-10] Йе Х, Мелен П., Рабизаде С., ВанАрсдейл Т., Чжан Х., Шин Х., Ван Дж.Дж., Лео Э., Сапата Дж., Хаузер К.А., Рид Дж.К., Бредесен Д.Е. (октябрь 1999 г.). «Белки семейства TRAF взаимодействуют с общим рецептором нейротрофинов и модулируют индукцию апоптоза» . Ж. Биол. Хим . 274 (42): 30202–8. дои : 10.1074/jbc.274.42.30202 . ПМИД 10514511 .

[pmid9626059-11] Краевска М., Краевски С., Сапата Дж.М., Ван Арсдейл Т., Гаскойн Р.Д., Берерн К., Макфадден Д., Шабайк А., Хью Дж., Рейнольдс А., Клевенджер К.В., Рид Дж.К. (июнь 1998 г.). «Экспрессия TRAF-4 в эпителиальных клетках-предшественниках. Анализ в нормальных тканях взрослого человека, плода и опухоли» . Являюсь. Дж. Патол . 152 (6): 1549–61. ПМЦ 1858434 . ПМИД 9626059 .

[pmid21097508-12] Маринис Дж. М., Гомер Ч. Р., Макдональд С., Эбботт Д. В. (2011). «Новый мотив в белке восприимчивости к болезни Крона, NOD2, позволяет TRAF4 подавлять врожденные иммунные реакции» . Ж. Биол. Хим . 286 (3): 1938–1950. дои : 10.1074/jbc.M110.189308 . ПМК 3023490 . ПМИД 21097508 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]