АЛОКС15Б

АЛОКС15Б
Доступные структуры ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB showСписок идентификационных кодов PDB 4NRE
Идентификаторы
Псевдонимы	ALOX15B , 15-LOX-2, арахидонат-15-липоксигеназа типа B, арахидонат-15-липоксигеназа типа B
Внешние идентификаторы	Опустить : 603697 ; МГИ : 1098228 ; Гомологен : 886 ; Генные карты : ALOX15B ; ОМА : ALOX15B – ортологи
showМестоположение гена ( человек ) Chr. Chromosome 17 (human) Band 17p13.1 Start 8,039,034 bp End 8,049,134 bp
showМестоположение гена ( Мышь ) Chr. Chromosome 11 (mouse) Band 11|11 B3 Start 69,074,758 bp End 69,088,669 bp
show экспрессии РНК Характер Bgee Human Mouse (ortholog) Top expressed in skin of thigh skin of arm vulva prostate right lung nipple vagina skin of abdomen upper lobe of lung upper lobe of left lung Top expressed in lip dentate gyrus of hippocampal formation granule cell embryo hair follicle skin of external ear superior frontal gyrus primary visual cortex otic vesicle cerebellar cortex skin of abdomen More reference expression data BioGPS More reference expression data
showГенная онтология Molecular function iron ion binding calcium ion binding dioxygenase activity metal ion binding arachidonate 8(S)-lipoxygenase activity linoleate 13S-lipoxygenase activity oxidoreductase activity oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen lipid binding arachidonate 15-lipoxygenase activity Cellular component intracellular anatomical structure extracellular exosome extrinsic component of membrane cytosol nucleus membrane cytoskeleton plasma membrane cytoplasm Biological process apoptotic process linoleic acid metabolic process negative regulation of growth lipid metabolism positive regulation of keratinocyte differentiation negative regulation of cell cycle prostate gland development lipoxygenase pathway hepoxilin biosynthetic process positive regulation of macrophage derived foam cell differentiation negative regulation of cell migration positive regulation of peroxisome proliferator activated receptor signaling pathway regulation of epithelial cell differentiation negative regulation of cell population proliferation arachidonic acid metabolic process Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи Разновидность Человек Мышь Входить 247 11688 Вместе ENSG00000179593 ENSMUSG00000020891 ЮниПрот О15296 О35936 RefSeq (мРНК) НМ_001141 НМ_001039130 НМ_001039131 НМ_009661 RefSeq (белок) НП_001034219 НП_001034220 НП_001132 НП_033791 Местоположение (UCSC) Чр 17: 8.04 – 8.05 Мб Чр 11: 69.07 – 69.09 Мб в PubMed Поиск
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши

Арахидонат-15-липоксигеназа типа II — это фермент , который у человека кодируется ALOX15B геном . ALOX15B, также известная как 15-липоксигеназа-2 ( 15-LO-2 или 15-LOX-2 ), отличается от родственной ей оксигеназы, ALOX15 или 15-липоксигеназы-1.

Функция

Этот ген кодирует члена семейства липоксигеназ, структурно родственных негемовых диоксигеназ железа, участвующих в производстве гидропероксидов жирных кислот. 15-LOX-2 имеет 38-39% идентичность аминокислотной последовательности с человеческими 15-LOX-1 и 12-липоксигеназой и 44% идентичность аминокислотной последовательности с человеческой 5-липоксигеназой . 15-LOX-2 превращает арахидоновую кислоту почти исключительно в S -стереоизомер 15-гидропероксиикозатетраеновой кислоты, который обычно восстанавливается до S -стереоизомера 15-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты повсеместно распространенными клеточными пероксидазами ; он менее эффективно метаболизирует линолевую кислоту, превращая эту жирную кислоту в S -стереоизомер 13-гидропероксиоктадекадиеновой кислоты, который также быстро восстанавливается до S -стереоизомера 13-гидроксиоктадекадиеновой кислоты . Ген ALOX15B расположен в кластере родственных генов и псевдогене, который охватывает примерно 100 тысяч оснований на коротком плече хромосомы 17. Альтернативно были описаны варианты сплайсированных транскриптов, кодирующие различные изоформы.

См. также

• Арахидонат-15-липоксигеназа
• 15-гидроксикозатетраеновая кислота
• АЛОКС15

Внешние ссылки

• человека Расположение генома ALOX15B и страница сведений о гене ALOX15B в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

• Сигал Э., Грюнбергер Д., Хайленд Э., Гросс С., Диксон Р.А., Крейк К.С. (март 1990 г.). «Экспрессия клонированной 15-липоксигеназы ретикулоцитов человека и иммунологические доказательства того, что 15-липоксигеназы разных типов клеток связаны» . Журнал биологической химии . 265 (9): 5113–20. дои : 10.1016/S0021-9258(19)34092-X . ПМИД   2318885 .
• Килти И., Логан А., Викерс П.Дж. (ноябрь 1999 г.). «Дифференциальные характеристики изоферментов 15-липоксигеназы человека и нового сплайс-варианта 15S-липоксигеназы» . Европейский журнал биохимии . 266 (1): 83–93. дои : 10.1046/j.1432-1327.1999.00818.x . ПМИД   10542053 .
• Криг П., Маркс Ф., Фюрстенбергер Г. (май 2001 г.). «Кластер генов, кодирующий липоксигеназы эпидермисного типа человека на хромосоме 17p13.1: клонирование, физическое картирование и экспрессия». Геномика . 73 (3): 323–30. дои : 10.1006/geno.2001.6519 . ПМИД   11350124 .
• Тан С., Бхатия Б., Мальдонадо С.Дж., Ян П., Ньюман Р.А., Лю Дж., Чандра Д., Трааг Дж., Кляйн Р.Д., Фишер С.М., Чопра Д., Шен Дж., Чжау Х.Э., Чунг Л.В., Тан Д.Г. (май 2002 г.). «Доказательства того, что арахидонат-15-липоксигеназа 2 является негативным регулятором клеточного цикла в нормальных эпителиальных клетках простаты» . Журнал биологической химии . 277 (18): 16189–201. дои : 10.1074/jbc.M111936200 . ПМИД   11839751 .
• Сюй XC, Шаппелл С.Б., Лян З., Сонг С., Ментер Д., Суббараян В., Айенгар С., Тан Д.Г., Липпман С.М. (2003). «Снижение экспрессии 15S-липоксигеназы-2 в образцах и клетках рака пищевода и усиление in vitro ингибитором циклооксигеназы-2, NS398» . Неоплазия . 5 (2): 121–7. дои : 10.1016/s1476-5586(03)80003-9 . ПМК   1502398 . ПМИД   12659684 .
• Бхатия Б, Мальдонадо С.Дж., Тан С., Чандра Д., Кляйн Р.Д., Чопра Д., Шаппелл С.Б., Ян П., Ньюман Р.А., Тан Д.Г. (июль 2003 г.). «Субклеточная локализация и опухолесупрессирующие функции 15-липоксигеназы 2 (15-LOX2) и ее сплайсинговых вариантов» . Журнал биологической химии . 278 (27): 25091–100. дои : 10.1074/jbc.M301920200 . ПМИД   12704195 .
• Тан С., Бхатия Б., Чжоу Дж., Мальдонадо Си.Дж., Чандра Д., Ким Э., Фишер С.М., Батлер А.П., Фридман С.Л., Тан Д.Г. (сентябрь 2004 г.). «Доказательства того, что Sp1 положительно и Sp3 отрицательно регулируют, а андрогены не регулируют напрямую функциональную экспрессию гена опухолевого супрессора 15-липоксигеназы 2 (15-LOX2) в нормальных эпителиальных клетках простаты человека» . Онкоген . 23 (41): 6942–53. дои : 10.1038/sj.onc.1207913 . ПМИД   15247906 .
• Сузуки Ю., Ямасита Р., Широта М., Сакакибара Ю., Тиба Дж., Мидзусима-Сугано Дж., Накаи К., Сугано С. (сентябрь 2004 г.). «Сравнение последовательностей генов человека и мыши обнаруживает гомологичную блочную структуру в областях промотора» . Геномные исследования . 14 (9): 1711–8. дои : 10.1101/гр.2435604 . ПМК   515316 . ПМИД   15342556 .
• Лимор Р., Каплан М., Савамура Т., Шэрон О., Кейдар С., Вайзингер Г., Нолл Э., Найдич М., Стерн Н. (март 2005 г.). «Ангиотензин II увеличивает экспрессию лектиноподобного окисленного рецептора липопротеина низкой плотности-1 в гладкомышечных клетках сосудов человека посредством липоксигеназно-зависимого пути» . Американский журнал гипертонии . 18 (3): 299–307. дои : 10.1016/j.amjhyper.2004.09.008 . ПМИД   15797645 .
• Суббараян В., Сюй XC, Ким Дж., Ян П., Хок А., Сабичи А.Л., Лланса Н., Мендоса Г., Логотетис С.Дж., Ньюман Р.А., Липпман С.М., Ментер Д.Г. (март 2005 г.). «Обратная зависимость между экспрессией гена 15-липоксигеназы-2 и PPAR-гамма в нормальном эпителии по сравнению с опухолевым эпителием» . Неоплазия . 7 (3): 280–93. дои : 10.1593/neo.04457 . ПМК   1501140 . ПМИД   15799828 .
• Цзян В.Г., Уоткинс Г., Дуглас-Джонс А., Мансел Р.Э. (апрель 2006 г.). «Уменьшение изоформ 15-липоксигеназы (15-LOX)-1 и 15-LOX-2 при раке молочной железы человека». Простагландины, лейкотриены и незаменимые жирные кислоты . 74 (4): 235–45. дои : 10.1016/j.plefa.2006.01.009 . ПМИД   16556493 .
• Суббараян В., Криг П., Си Л.С., Ким Дж., Ян П., Сабичи А.Л., Лланса Н., Мендоса Г., Логотетис С.Дж., Ньюман Р.А., Липпман С.М., Ментер Д.Г. (сентябрь 2006 г.). «Регуляция гена 15-липоксигеназы-2 с помощью ее продукта 15-(S)-гидроксиэйкозатетраеновой кислоты посредством механизма отрицательной обратной связи, который включает гамма-рецептор, активируемый пролифератором пероксисомы» . Онкоген . 25 (44): 6015–25. дои : 10.1038/sj.onc.1209617 . ПМИД   16682954 .
• Лесюёр Ф, Буажар Б, Лефевр С, Джобар Ф, Одебер С, Лахдар Х, Мартин Л, Тадини Г, Карадуман А, Эмре С, Сакер С, Латроп М, Фишер Дж (апрель 2007 г.). «Новые мутации в ALOX12B у пациентов с аутосомно-рецессивным врожденным ихтиозом и доказательства генетической гетерогенности хромосомы 17p13» . Журнал исследовательской дерматологии . 127 (4): 829–34. дои : 10.1038/sj.jid.5700640 . ПМИД   17139268 .