Клоацибацилла евриенсис
Клоацибацилла евриенсис | |
---|---|
Научная классификация ![]() | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Синергистота |
Сорт: | синергия |
Заказ: | синергисталес |
Семья: | синергистовые |
Род: | Клоацибацилла |
Разновидность: | C. evryensis
|
Биномиальное имя | |
Клоацибацилла евриенсис Ганесан и др. 2008 год [ 1 ]
| |
Тип штамма | |
штамм 158, DSM 19522, JCM 14828 [ 2 ] [ 3 ] |
Cloacibacillus evryensis — грамотрицательная , анаэробная , мезофильная , палочковидная и неподвижная бактерия из рода Cloacibacillus , выделенная из осадка сточных вод станции очистки сточных вод в Эври , Франция . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ] [ 6 ]
Филогения
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis является частью рода Cloacibacillus и был впервые предложен и опубликован в 2008 году. [ 4 ] В филме 12 родов: Aminiphilus , Aminobacterium , Aminomonas , Anaerobaculum, Cloacibacillus , Dethiosulfovibrio, Fretibacterium , Jonquetella , Pyramidobacter , Synergistes, Thermanaerovibrio и Thermovirga . [ 7 ] Единственным другим описанным соседом этого рода является C. porcorum , который был обнаружен в кишечном тракте свиньи. [ 8 ] Сравнение геномов выявило 90% сходство между двумя видами. [ 8 ]
Открытие
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis была обнаружена на очистных сооружениях в Эври, Франция, и впервые описана исследователями 1 сентября 2008 года. [ 6 ] Конкретным местом хранения изолята был мезофильный анаэробный варочный котел с рабочими параметрами 33 °C, pH 7,2 и временем удерживания 37,5 дней. [ 6 ]
Изоляция
[ редактировать ]Выделение осуществляли методом Хунгейта с использованием обогащенной среды, содержащей такие компоненты, как KH 2 PO 4 , K 2 HPO 4 , NaCl , SO 4 , цитрат натрия , дрожжевой экстракт , казаминокислоты и микроэлементы . [ 6 ] После инокуляции образца обогащенные культуры инкубировали при 33 °С в анаэробных условиях и периодически переносили на свежую среду. [ 6 ] Рост обнаруживали через 5-7 дней, и еще один образец инокулировали на свежую накопительную среду и выращивали в анаэробных банках при 33°C и давлении 2 атм. [ 6 ] Cloacibacillus evryensis был одним из очищенных штаммов, выделенных из образца.
Морфология
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis — грамотрицательный неподвижный организм со палочковидными клетками, которые обычно называют диплококками . [ 6 ] [ 9 ] Бактерия палочковидной формы обычно имеет размер 2,0–3,0 мкм на 0,8–1,0 мкм и обычно выглядит светло-коричневой или прозрачной. [ 6 ] Типичная колония встречается индивидуально или парами, при этом более старые клетки образуют цепочки колоний. [ 6 ]
Геномика
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis в ДНК 158 имеет содержание G+C 55,95%. [ 10 ] Он имеет общее количество 3142 генов , из которых 3072 гена кодируют белки . [ 10 ] Существует 70 РНК генов : 15 рРНК (5 5s рРНК , 5 16s рРНК , 5 23s рРНК), 48 тРНК и 8 других. [ 10 ]
Физиология
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis — мезофил , способный расти при температуре 20–50 °C и значениях pH 6,5–10,0. [ 6 ] Оптимальные условия роста C. evryenis — 37–40 °C и pH 7,0, а рост усиливается дрожжевым экстрактом . [ 6 ] В последних условиях время удвоения организма на среде Казаминокислоты составляет 15 часов. [ 6 ] Культуры, выращенные в среде Casamino при концентрациях NaCl 0,1-2,0% по массе на объем, наблюдали рост до 0,07% NaCl; при любой более высокой концентрации рост подавляется. [ 6 ]
Метаболизм
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis — хемогетеротроф , который обычно расщепляет аминокислоты , но может также использовать муцин в качестве источника углерода . [ 9 ] [ 10 ] Он может ферментировать лизин , гистидин , серин и аргинин с образованием ацетата , пропионата , бутирата , валерата , H 2 и CO 2 , причем ацетат и бутрират . в наибольших количествах образуются [ 6 ]
Важность
[ редактировать ]Cloacibacillus evryensis — это недавно обнаруженная бактерия, которая также принадлежит к новому роду Cloacibacillus , в котором идентифицированы только два представителя: C. evryensis и C. porcorum . [ 8 ] Характеристика этого организма вносит вклад в род и дает дополнительную информацию о его особенностях.
Недавние исследования выделили C. evryensis из образцов мягких тканей, крови и перитонеальной жидкости человека , что определило его как возможный агент, который может вызывать заболевания у людей. [ 7 ] В четырех различных тематических исследованиях было обнаружено, что C. evryensis в кровотоке вызывает такие симптомы, как лихорадка, рвота, кровотечение из прямой кишки и боль, связанная с нарушением контроля над кишечником. [ 7 ] Каждому пациенту было проведено несколько тестов, чтобы определить причину симптомов, прежде чем выяснилось, что причиной были эти бактерии. Штамм 158 чувствителен и поддается лечению пенициллином , ампициллином и канамицином , но он устойчив к ванкомицину . [ 6 ] В исследованиях на людях штамм также был чувствителен к клиндамицину , цефокситину , меропенему , метронидазолу и пиперациллин-тазобактаму , но устойчив к ванкомицину. [ 7 ] Эти данные вызывают обеспокоенность по поводу будущего развития устойчивости к антибиотикам . Однако эти случаи позволяют предположить, что бактерии могут быть низковирулентными и представлять большую угрозу для пожилых людей и групп населения с ослабленным иммунитетом . [ 7 ] Проводятся дальнейшие исследования, чтобы понять его роль как патогена для человека .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б «Клоацибацилла» . ЛПСН .
- ^ «Паспорт таксона Cloacibacillus evryensis - StrainInfo» . www.straininfo.net . [ мертвая ссылка ]
- ^ Перейти обратно: а б «Клоацибацилла евриенсис» . www.uniprot.org .
- ^ Перейти обратно: а б Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (1 августа 2008 г.). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (ред.). «Таксономическое резюме вида». ИмейсфорЛайф, ООО. doi : 10.1601/tx.13700 (неактивен 17 апреля 2024 г.).
{{cite journal}}
: Для цитирования журнала требуется|journal=
( помощь ) CS1 maint: DOI неактивен с апреля 2024 г. ( ссылка ) - ^ «Подробности: DSM-19522» . www.dsmz.de.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г час я дж к л м н тот Ганесан, А; Шоссоннери, С; Таррад, А; Дауга, Ц; Буше, Т; Пеллетье, Э; Ле Паслье, Д; Сгир, А (сентябрь 2008 г.). «Cloacibacillus evryensis gen. nov., sp. nov., новая асахаролитическая, мезофильная, разлагающая аминокислоты бактерия типа Synergistetes, выделенная из анаэробного шламового варочного котла» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 58 (Часть 9): 2003–12. дои : 10.1099/ijs.0.65645-0 . ПМИД 18768595 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и Доминго, М.-К.; Янсуни, К.; Годро, К.; Ламот, Ф.; Левеск, С.; Трамбле, К.; Гарсо, Р. (октябрь 2015 г.). Рихтер, СС (ред.). «Cloacibacillus sp., потенциальный человеческий патоген, связанный с бактериемией в Квебеке и Нью-Брансуике» . Журнал клинической микробиологии . 53 (10): 3380–3383. дои : 10.1128/JCM.01137-15 . ISSN 0095-1137 . ПМЦ 4572539 . ПМИД 26224843 .
- ^ Перейти обратно: а б с Лофт, Т.; Левин, UY; Стэнтон, ТБ (2013). «Cloacibacillus porcorum sp. nov., бактерия, разлагающая муцин, из кишечного тракта свиней и исправленное описание рода Cloacibacillus» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 63 (Pt_6): 1960–1966. дои : 10.1099/ijs.0.044719-0 . ISSN 1466-5034 . ПМЦ 3709534 . ПМИД 23041639 .
- ^ Перейти обратно: а б Буй, Тхи Фуонг Нам; Труаз, Антонио Дарио; Фольяно, Винченцо; де Вос, Виллем М. (12 июня 2019 г.). «Анаэробная деградация N-ε-карбоксиметиллизина, основного конечного продукта гликирования, кишечными бактериями человека» . Журнал сельскохозяйственной и пищевой химии . 67 (23): 6594–6602. doi : 10.1021/acs.jafc.9b02208 . ISSN 0021-8561 . ПМК 6566499 . ПМИД 31091091 .
- ^ Перейти обратно: а б с д «ИМГ» . img.jgi.doe.gov . Проверено 30 апреля 2024 г.