Частица распознавания сигнала

частица распознавания сигнала 14 кДа
частица распознавания сигнала 14 кДа
Идентификаторы
Символ	СРП14
ген NCBI	6727
HGNC	11299
МОЙ БОГ	600708
RefSeq	НМ_003134
ЮниПрот	P37108
Другие данные
Локус	Хр. 15 q22
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

частица распознавания сигнала 9 кДа
частица распознавания сигнала 9 кДа
Идентификаторы
Символ	СРП9
ген NCBI	6726
HGNC	11304
МОЙ БОГ	600707
RefSeq	НМ_003133
ЮниПрот	P49458
Другие данные
Локус	Хр. 1 q42.12
Structures
показывать Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

частица распознавания сигнала 19 кДа

Идентификаторы

Символ

СРП19

Другие данные

5 q21-q22

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

частица распознавания сигнала 54 кДа

Идентификаторы

Символ

СРП54

Другие данные

Хр. 14 q13.2

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

частица распознавания сигнала 68 кДа

Идентификаторы

Символ

СРП68

Другие данные

Хр. 17 q25.1

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

частица распознавания сигнала 72 кДа

Идентификаторы

Символ

СРП72

Другие данные

Хр. 4 кв11

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Белок частицы распознавания сигнала

Идентификаторы

Организм

Escherichia coli (штамм К12)

Символ

ффх

Альт. символы

р48, СРП54

ЮниПрот

P0AGD7

Искать
Structures	Swiss-model
Domains	InterPro

Частица распознавания сигнала ( SRP ) представляет собой распространенный цитозольный, универсально консервативный рибонуклеопротеин ( комплекс белок - РНК ), который распознает и нацеливает специфические белки на эндоплазматический ретикулум у эукариот и плазматическую мембрану у прокариот . ^{[ 1 ]}

История

Функция SRP была обнаружена путем изучения процессированных и непроцессированных секреторных белков, особенно легких цепей иммуноглобулинов ; ^{[ 2 ]} и бычий препролактин. Недавно синтезированные белки у эукариот несут N-концевые гидрофобные сигнальные последовательности , которые связываются SRP, когда они выходят из рибосомы . ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]}

Механизм

У эукариот SRP связывается с сигнальной последовательностью вновь синтезированного пептида, когда он выходит из рибосомы . ^{[ 1 ]} Это связывание приводит к замедлению синтеза белка, известному как «арест элонгации», консервативной функции SRP, которая облегчает соединение процессов трансляции белка и процессов транслокации белка . ^{[ 5 ]} Затем SRP направляет весь этот комплекс ( комплекс рибосома-образующаяся цепь ) в белок-проводящий канал, также известный как транслокон , в мембране эндоплазматического ретикулума (ЭР). Это происходит посредством взаимодействия и стыковки SRP с родственным ему рецептором SRP. ^{[ 6 ]} который расположен в непосредственной близости от транслокона.

У эукариот между SRP и его рецептором есть три домена, которые участвуют в связывании и гидролизе гуанозинтрифосфата (GTP). Они расположены в двух родственных субъединицах рецептора SRP (SRα и SRβ). ^{[ 7 ]} и белок SRP SRP54 (известный у бактерий как Ffh). ^{[ 8 ]} Было показано, что скоординированное связывание GTP с помощью SRP и рецептора SRP является предпосылкой для успешного нацеливания SRP на рецептор SRP. ^{[ 9 ]}^{[ 10 ]}

После стыковки образующаяся пептидная цепь вставляется в канал транслокона, где она входит в ЭР. Синтез белка возобновляется, когда SRP высвобождается из рибосомы. ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]} Комплекс рецепторов SRP-SRP диссоциирует посредством гидролиза GTP, и цикл транслокации белка, опосредованной SRP, продолжается. ^{[ 13 ]}

Попав внутрь ЭР, сигнальная последовательность отщепляется от корового белка сигнальной пептидазой . Таким образом, сигнальные последовательности не являются частью зрелых белков.

Состав и эволюция

Несмотря на то, что функция SRP аналогична у всех организмов, ее состав сильно различается. SRP54- Ядро РНК SRP с активностью ГТФазы является общим для всех клеточных организмов, но некоторые полипептиды субъединиц специфичны для эукариот.

Субъединицы SRP в трех сферах жизни
Эукариот	Архея	Бактерии
СРП9 СРП14	Нет	Нет
СРП19	Да	Нет
СРП54	Да	Ффх
СРП68 СРП72	Нет	Нет
7L РНК	Да	6СЛ /4.5SL РНК

Кристаллографические структуры типичных SRP.

SRP19-7S.S Комплекс РНК SRP из M. jannaschii ^{[ 14 ]}
S-домен SRP человека ^{[ 15 ]}

Аутоантитела и болезни

Антитела к частицам, распознающим сигнал, , но не очень специфичны для него в основном связаны с полимиозитом . ^{[ 16 ]} У людей с полимиозитом наличие антител против SRP связано с более выраженной мышечной слабостью и атрофией. ^{[ 16 ]}

См. также

Частица распознавания сигнала РНК

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Тисдейл С., Пеллиццони Л. (01.01.2017). «Глава 7 - Дисфункция процессинга РНК при спинальной мышечной атрофии». В Самнер CJ, Паушкин С, КО CP (ред.). Спинальная мышечная атрофия . Академическая пресса. стр. 113–131. дои : 10.1016/b978-0-12-803685-3.00007-0 . ISBN 978-0-12-803685-3 .
^ Мильштейн С., Браунли Г.Г., Харрисон Т.М., Мэтьюз М.Б. (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа . 239 (91): 117–20. дои : 10.1038/newbio239117a0 . ПМИД 4507519 .
^ Уолтер П., Ибрагими И., Блобель Дж. (ноябрь 1981 г.). «Транслокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Белок распознавания сигнала (SRP) связывается с полисомами, собранными in vitro, синтезирующими секреторный белок» . Журнал клеточной биологии . 91 (2 ч. 1): 545–50. дои : 10.1083/jcb.91.2.545 . ПМК 2111968 . ПМИД 7309795 .
^ Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Наличие протеолитически процессированных и непроцессированных легких цепей растущего иммуноглобулина на мембраносвязанных рибосомах мышиной миеломы» . Журнал клеточной биологии . 67 (3): 835–51. дои : 10.1083/jcb.67.3.835 . ПМК 2111658 . ПМИД 811671 .
^ Уолтер П., Блобель Дж. (декабрь 1983 г.). «Субклеточное распределение частиц распознавания сигнала и 7SL-РНК, определяемое с помощью полипептид-специфичных антител и комплементарного ДНК-зонда» . Журнал клеточной биологии . 97 (6): 1693–9. дои : 10.1083/jcb.97.6.1693 . ПМК 2112735 . ПМИД 6196367 .
^ Гилмор Р., Блобель Дж., Уолтер П. (ноябрь 1982 г.). «Транлокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Обнаружение в микросомальной мембране рецептора частицы, распознающей сигнал» . Журнал клеточной биологии . 95 (2, часть 1): 463–9. дои : 10.1083/jcb.95.2.463 . ПМК 2112970 . ПМИД 6292235 .
^ Рапейко П.Дж., Гилмор Р. (май 1992 г.). «Для транслокации белка через ЭР требуется функциональный сайт связывания GTP в альфа-субъединице рецептора частиц, распознающих сигнал» . Журнал клеточной биологии . 117 (3): 493–503. дои : 10.1083/jcb.117.3.493 . ПМК 2289435 . ПМИД 1315314 .
^ Фрейманн Д.М., Кинан Р.Дж., Страуд Р.М., Уолтер П. (январь 1997 г.). «Структура консервативного домена ГТФазы частицы распознавания сигнала». Природа . 385 (6614): 361–4. Бибкод : 1997Natur.385..361F . дои : 10.1038/385361a0 . ПМИД 9002524 . S2CID 4238766 .
^ Миллер Дж. Д., Вильгельм Х., Гираш Л., Гилмор Р., Уолтер П. (ноябрь 1993 г.). «Связывание GTP и гидролиз частицей распознавания сигнала во время инициации транслокации белка». Природа . 366 (6453): 351–4. Бибкод : 1993Natur.366..351M . дои : 10.1038/366351a0 . ПМИД 8247130 . S2CID 4326097 .
^ Грудник П., Банге Дж., Синнинг И. (август 2009 г.). «Нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала». Биологическая химия . 390 (8): 775–82. дои : 10.1515/BC.2009.102 . ПМИД 19558326 . S2CID 36611716 .
^ Лютке Х (март 1995 г.). «Частица распознавания сигнала (SRP), повсеместный инициатор транслокации белка» . Европейский журнал биохимии . 228 (3): 531–50. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.0531m.x . ПМИД 7737147 . ^{[ мертвая ссылка ]}
^ Луиринк Дж., Синнинг I (ноябрь 2004 г.). «SRP-опосредованное нацеливание на белки: новый взгляд на структуру и функцию» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1694 (1–3): 17–35. дои : 10.1016/j.bbamcr.2004.03.013 . ПМИД 15546655 .
^ Шан С.О., Уолтер П. (февраль 2005 г.). «Котрансляционное нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала». Письма ФЭБС . 579 (4): 921–6. дои : 10.1016/j.febslet.2004.11.049 . ПМИД 15680975 . S2CID 46046514 .
^ Хайнцл Т., Хуанг С., Зауэр-Эрикссон А.Е. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса РНК SRP19 и значение для сборки частиц распознавания сигналов». Природа . 417 (6890): 767–71. Бибкод : 2002Natur.417..767H . дои : 10.1038/nature00768 . ПМИД 12050674 . S2CID 2509475 .
^ Куглстаттер А., Обридж С., Нагай К. (октябрь 2002 г.). «Индуцированные структурные изменения 7SL РНК во время сборки частицы распознавания сигналов человека». Структурная биология природы . 9 (10): 740–4. дои : 10.1038/nsb843 . ПМИД 12244299 . S2CID 9543041 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Као А.Х., Лакомис Д., Лукас М., Фертиг Н., Оддис К.В. (январь 2004 г.). «Аутоантитела к частицам, распознающим антисигнал, у пациентов с идиопатической воспалительной миопатией и без нее». Артрит и ревматизм . 50 (1): 209–15. дои : 10.1002/арт.11484 . ПМИД 14730618 .

Дальнейшее чтение

Уайлд К., Беккер М.М., Кемпф Дж., Синнинг И. (декабрь 2019 г.). «Структура, динамика и взаимодействие крупных вариантов SRP» . Биологическая химия . 401 (1): 63–80. дои : 10.1515/hsz-2019-0282 . ПМИД 31408431 .
Фаоро С, Атаиде СФ (25 мая 2021 г.). «Неканонические функции и клеточная динамика компонентов частиц распознавания сигналов млекопитающих» . Границы молекулярной биологии . 8 : 679584. doi : 10.3389/fmolb.2021.679584 . ПМЦ 8185352 . ПМИД 34113652 .

Внешние ссылки

Сигнал + распознавание + частица в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)
База данных частиц для распознавания сигналов ^{[ постоянная мертвая ссылка ]}
Видео на сайте www.dnaTube.com, показывающее SRP в действии.
Еще одно видео SRP на www.dnaTube.com.
Нобелевская премия по физиологии и медицине 1999 года «за открытие того, что белки обладают внутренними сигналами, управляющими их транспортом и локализацией в клетке», Гюнтеру Блобелю, США. Пресс-релиз, Иллюстрированная презентация, Презентационная речь

[:0-1] Перейти обратно: ^а ^б Тисдейл С., Пеллиццони Л. (01.01.2017). «Глава 7 - Дисфункция процессинга РНК при спинальной мышечной атрофии». В Самнер CJ, Паушкин С, КО CP (ред.). Спинальная мышечная атрофия . Академическая пресса. стр. 113–131. дои : 10.1016/b978-0-12-803685-3.00007-0 . ISBN 978-0-12-803685-3 .

[2] Мильштейн С., Браунли Г.Г., Харрисон Т.М., Мэтьюз М.Б. (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа . 239 (91): 117–20. дои : 10.1038/newbio239117a0 . ПМИД 4507519 .

[3] Уолтер П., Ибрагими И., Блобель Дж. (ноябрь 1981 г.). «Транслокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Белок распознавания сигнала (SRP) связывается с полисомами, собранными in vitro, синтезирующими секреторный белок» . Журнал клеточной биологии . 91 (2 ч. 1): 545–50. дои : 10.1083/jcb.91.2.545 . ПМК 2111968 . ПМИД 7309795 .

[4] Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Наличие протеолитически процессированных и непроцессированных легких цепей растущего иммуноглобулина на мембраносвязанных рибосомах мышиной миеломы» . Журнал клеточной биологии . 67 (3): 835–51. дои : 10.1083/jcb.67.3.835 . ПМК 2111658 . ПМИД 811671 .

[5] Уолтер П., Блобель Дж. (декабрь 1983 г.). «Субклеточное распределение частиц распознавания сигнала и 7SL-РНК, определяемое с помощью полипептид-специфичных антител и комплементарного ДНК-зонда» . Журнал клеточной биологии . 97 (6): 1693–9. дои : 10.1083/jcb.97.6.1693 . ПМК 2112735 . ПМИД 6196367 .

[6] Гилмор Р., Блобель Дж., Уолтер П. (ноябрь 1982 г.). «Транлокация белков через эндоплазматический ретикулум. I. Обнаружение в микросомальной мембране рецептора частицы, распознающей сигнал» . Журнал клеточной биологии . 95 (2, часть 1): 463–9. дои : 10.1083/jcb.95.2.463 . ПМК 2112970 . ПМИД 6292235 .

[7] Рапейко П.Дж., Гилмор Р. (май 1992 г.). «Для транслокации белка через ЭР требуется функциональный сайт связывания GTP в альфа-субъединице рецептора частиц, распознающих сигнал» . Журнал клеточной биологии . 117 (3): 493–503. дои : 10.1083/jcb.117.3.493 . ПМК 2289435 . ПМИД 1315314 .

[8] Фрейманн Д.М., Кинан Р.Дж., Страуд Р.М., Уолтер П. (январь 1997 г.). «Структура консервативного домена ГТФазы частицы распознавания сигнала». Природа . 385 (6614): 361–4. Бибкод : 1997Natur.385..361F . дои : 10.1038/385361a0 . ПМИД 9002524 . S2CID 4238766 .

[9] Миллер Дж. Д., Вильгельм Х., Гираш Л., Гилмор Р., Уолтер П. (ноябрь 1993 г.). «Связывание GTP и гидролиз частицей распознавания сигнала во время инициации транслокации белка». Природа . 366 (6453): 351–4. Бибкод : 1993Natur.366..351M . дои : 10.1038/366351a0 . ПМИД 8247130 . S2CID 4326097 .

[10] Грудник П., Банге Дж., Синнинг И. (август 2009 г.). «Нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала». Биологическая химия . 390 (8): 775–82. дои : 10.1515/BC.2009.102 . ПМИД 19558326 . S2CID 36611716 .

[11] Лютке Х (март 1995 г.). «Частица распознавания сигнала (SRP), повсеместный инициатор транслокации белка» . Европейский журнал биохимии . 228 (3): 531–50. дои : 10.1111/j.1432-1033.1995.0531m.x . ПМИД 7737147 . ^{[ мертвая ссылка ]}

[12] Луиринк Дж., Синнинг I (ноябрь 2004 г.). «SRP-опосредованное нацеливание на белки: новый взгляд на структуру и функцию» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) - Исследования молекулярных клеток . 1694 (1–3): 17–35. дои : 10.1016/j.bbamcr.2004.03.013 . ПМИД 15546655 .

[13] Шан С.О., Уолтер П. (февраль 2005 г.). «Котрансляционное нацеливание на белок с помощью частицы распознавания сигнала». Письма ФЭБС . 579 (4): 921–6. дои : 10.1016/j.febslet.2004.11.049 . ПМИД 15680975 . S2CID 46046514 .

[pmid12050674-14] Хайнцл Т., Хуанг С., Зауэр-Эрикссон А.Е. (июнь 2002 г.). «Структура комплекса РНК SRP19 и значение для сборки частиц распознавания сигналов». Природа . 417 (6890): 767–71. Бибкод : 2002Natur.417..767H . дои : 10.1038/nature00768 . ПМИД 12050674 . S2CID 2509475 .

[pmid12244299-15] Куглстаттер А., Обридж С., Нагай К. (октябрь 2002 г.). «Индуцированные структурные изменения 7SL РНК во время сборки частицы распознавания сигналов человека». Структурная биология природы . 9 (10): 740–4. дои : 10.1038/nsb843 . ПМИД 12244299 . S2CID 9543041 .

[Kao2004-16] Перейти обратно: ^а ^б Као А.Х., Лакомис Д., Лукас М., Фертиг Н., Оддис К.В. (январь 2004 г.). «Аутоантитела к частицам, распознающим антисигнал, у пациентов с идиопатической воспалительной миопатией и без нее». Артрит и ревматизм . 50 (1): 209–15. дои : 10.1002/арт.11484 . ПМИД 14730618 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle