Сигнальная пептидаза

Субъединица 3 комплекса сигнальной пептидазы
Субъединица 3 комплекса сигнальной пептидазы
Идентификаторы
Символ	SP3
Пфам	PF04573
ИнтерПро	ИПР007653
Мембраном	369
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Пептидаза_S26
Пептидаза_S26
Идентификаторы
Символ	Пептидаза_S26
Пфам	ПФ10502
Пфам Клан	CL0299
ИнтерПро	ИПР019533
МЕРОПС	С26
Суперсемейство OPM	137
белок OPM	1t7d
Мембраном	323
Pfam
показывать Доступные белковые структуры:
Pfam	structures / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	structure summary

Структура SPC в виде ленты — Структура комплекса сигнальных пептидаз человека (код PDB 7P2P)

Сигнальная пептидаза I

Идентификаторы

Базы данных

PDB Структуры

Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Сигнальная пептидаза II

Идентификаторы

Базы данных

PDB Структуры

Поиск
PMC	articles
PubMed	articles
NCBI	proteins

Сигнальные пептидазы представляют собой ферменты , которые превращают секреторные и некоторые мембранные белки в их зрелые или проформы путем отщепления их сигнальных пептидов от их N-концев .

Сигнальные пептидазы первоначально наблюдались во эндоплазматического ретикулума фракциях мембран, происходящих из миеломы мышей. (ЭР), выделенных из клеток ^{[ 1 ]} Ключевое наблюдение Сезара Мильштейна и его коллег заключалось в том, что легкие цепи иммуноглобулина продуцировались в форме с более высокой молекулярной массой, которая обрабатывалась мембранной фракцией ER. За этим открытием последовало открытие механизма транслокации . ^{[ 2 ]} Сигнальные пептидазы также обнаружены у прокариот , а также в механизме импорта белка в митохондриях и хлоропластах . ^{[ 3 ]}

Все сигнальные пептидазы, описанные до сих пор, представляют собой сериновые протеазы . Активный центр, эндопротеолитически расщепляющий сигнальные пептиды транслоцированных белков-предшественников, расположен на экстрацитоплазматическом участке мембраны. Эукариотическая сигнальная пептидаза представляет собой интегральный мембранный белковый комплекс. Первой субъединицей, которая была идентифицирована с помощью генетики дрожжей, является Sec11, мембранный белок массой 17 кДа, который связан с тремя субъединицами, называемыми Spc3p (21 кДа), Spc2p (18 кДа) и Spc1p (11 кДа). Sec11 является единственным существенным фактором процессинга сигнального пептида, что можно вывести из дефекта роста после его делеции. ^{[ 4 ]} Комплекс функциональной сигнальной пептидазы сначала очищали из мембранной фракции ЭР собак. ^{[ 5 ]} Пять субъединиц млекопитающих, первоначально названные в соответствии с их молекулярной массой, обозначаются как SPCS1 (SPC12), SEC11A (SPC18), SEC11C (SPC21), SPCS3 (SPC22/23) и SPCS2 (SPC25). Эти субъединицы собираются в два отдельных паралогичных комплекса, различающихся каталитической субъединицей SEC11A и SEC11C соответственно, которые имеют в основном идентичную структуру. ^{[ 6 ]} Структура SPC предполагает, что фермент имеет трансмембранный домен, доступный только для сигнальных пептидов с их характерно коротким спиральным сегментом.

Ссылки

^ Мильштейн С., Браунли Г.Г., Харрисон Т.М., Мэтьюз М.Б. (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа . 239 (91): 117–120. дои : 10.1038/newbio239117a0 . ПМИД 4507519 .
^ Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Наличие протеолитически процессированных и непроцессированных легких цепей растущего иммуноглобулина на мембраносвязанных рибосомах мышиной миеломы» . Журнал клеточной биологии . 67 (3): 835–851. дои : 10.1083/jcb.67.3.835 . ПМК 2111658 . ПМИД 811671 .
^ Паецель М., Карла А., Стринадка Н.К., Далбей Р.Э. (декабрь 2002 г.). «Сигнальные пептидазы». Химические обзоры . 102 (12): 4549–4580. дои : 10.1021/cr010166y . ПМИД 12475201 .
^ Бёни П.С., Деше Р.Дж., Шекман Р.В. (апрель 1988 г.). «SEC11 необходим для обработки сигнальных пептидов и роста дрожжевых клеток» . Журнал клеточной биологии . 106 (4): 1035–1042. дои : 10.1083/jcb.106.4.1035 . ПМК 2115025 . ПМИД 3283143 .
^ Эванс Э.А., Гилмор Р., Блобель Дж. (февраль 1986 г.). «Очистка микросомальной сигнальной пептидазы как комплекса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (3): 581–585. Бибкод : 1986PNAS...83..581E . дои : 10.1073/pnas.83.3.581 . ПМК 322907 . ПМИД 3511473 .
^ Лиачи А.М., Стейгенбергер Б., Теллес де Соуза ПК, Тамара С., Греллерс-Мульдерий М., Огриссек П. и др. (октябрь 2021 г.). «Структура комплекса сигнальной пептидазы человека раскрывает детерминанты расщепления сигнального пептида». Молекулярная клетка . 81 (19): 3934–3948.e11. doi : 10.1016/j.molcel.2021.07.031 . hdl : 1874/412779 . ПМИД 34388369 . S2CID 237010364 .

Внешние ссылки

сигнал + пептидаза в Национальной медицинской библиотеке США по медицинским предметным рубрикам (MeSH)

Дальнейшее чтение

Кало Д., Эйхлер Дж. (март 2011 г.). «Пересечение мембраны архей, третьей области жизни» . Biochimica et Biophysical Acta (BBA) – Биомембраны . 1808 (3): 885–891. дои : 10.1016/j.bbamem.2010.03.020 . ПМИД 20347718 .

[pmid4507519-1] Мильштейн С., Браунли Г.Г., Харрисон Т.М., Мэтьюз М.Б. (сентябрь 1972 г.). «Возможный предшественник легких цепей иммуноглобулина». Природа . 239 (91): 117–120. дои : 10.1038/newbio239117a0 . ПМИД 4507519 .

[pmid811671-2] Блобель Г., Добберштейн Б. (декабрь 1975 г.). «Перенос белков через мембраны. I. Наличие протеолитически процессированных и непроцессированных легких цепей растущего иммуноглобулина на мембраносвязанных рибосомах мышиной миеломы» . Журнал клеточной биологии . 67 (3): 835–851. дои : 10.1083/jcb.67.3.835 . ПМК 2111658 . ПМИД 811671 .

[pmid12475201-3] Паецель М., Карла А., Стринадка Н.К., Далбей Р.Э. (декабрь 2002 г.). «Сигнальные пептидазы». Химические обзоры . 102 (12): 4549–4580. дои : 10.1021/cr010166y . ПМИД 12475201 .

[pmid3283143-4] Бёни П.С., Деше Р.Дж., Шекман Р.В. (апрель 1988 г.). «SEC11 необходим для обработки сигнальных пептидов и роста дрожжевых клеток» . Журнал клеточной биологии . 106 (4): 1035–1042. дои : 10.1083/jcb.106.4.1035 . ПМК 2115025 . ПМИД 3283143 .

[pmid3511473-5] Эванс Э.А., Гилмор Р., Блобель Дж. (февраль 1986 г.). «Очистка микросомальной сигнальной пептидазы как комплекса» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 83 (3): 581–585. Бибкод : 1986PNAS...83..581E . дои : 10.1073/pnas.83.3.581 . ПМК 322907 . ПМИД 3511473 .

[pmid34388369-6] Лиачи А.М., Стейгенбергер Б., Теллес де Соуза ПК, Тамара С., Греллерс-Мульдерий М., Огриссек П. и др. (октябрь 2021 г.). «Структура комплекса сигнальной пептидазы человека раскрывает детерминанты расщепления сигнального пептида». Молекулярная клетка . 81 (19): 3934–3948.e11. doi : 10.1016/j.molcel.2021.07.031 . hdl : 1874/412779 . ПМИД 34388369 . S2CID 237010364 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

v т и Эндопептидазы : сериновые протеазы/сериновые эндопептидазы ( EC 3.4.21 ).
Пищеварительные ферменты	Энтеропептидаза Трипсин Химотрипсин Эластаза нейтрофил поджелудочная
Коагуляция	факторы: Тромбин Фактор VIIa Фактор IXa Фактор Ха Фактор XIa Фактор XIIa Калликреин СРП КЛК1 КЛК2 КЛК3 КЛК4 КЛК5 КЛК6 КЛК7 КЛК8 КЛК9 КЛК10 КЛК11 КЛК12 КЛК13 КЛК14 КЛК15 фибринолиз : Плазмин Активатор плазминогена Тканевой активатор плазминогена Мочевой активатор плазминогена
Система дополнений	Фактор Б Фактор Д Фактор I МАСП МАСП1 МАСП2 C3-конвертаза
Другая иммунная система	Химаза Гранзим Триптаза Протеиназа 3/миелобластин
Venombin	Ancrod Batroxobin
Other	Acrosin Prolyl endopeptidase Pronase Proprotein convertases 1 2 Prostasin Reelin Subtilisin/Furin/S1P4 Sedolisin/TPP1 Streptokinase Cathepsin A G

v т и Протеазы : аспартатпротеазы ( EC 3.4.23 ).
Vertebrate	Pepsin Chymosin Renin Signal peptide peptidase Beta secretase 1 2
Pathogenic	Plasmepsin HIV-1 protease
Plant	Nepenthesin
Cathepsin	D E

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)