Jump to content

Катепсин Е

CTSE
Доступные структуры
ПДБ Поиск ортологов: PDBe RCSB
Идентификаторы
Псевдонимы CTSE , Ctse, A430072O03Rik, C920004C08Rik, CE, CatE, катепсин E
Внешние идентификаторы ОМИМ : 116890 ; МГИ : 107361 ; Гомологен : 37551 ; GeneCards : CTSE ; ОМА : CTSE – ортологи
Ортологи
Разновидность Человек Мышь
Входить
Вместе
ЮниПрот
RefSeq (мРНК)

НМ_001910
НМ_148964
НМ_001317331

НМ_007799

RefSeq (белок)

НП_001304260
НП_001901
НП_683865

НП_031825

Местоположение (UCSC) Чр 1: 206.01 – 206.02 Мб Chr 1: 131,57 – 131,6 Мб
в PubMed Поиск [ 3 ] [ 4 ]
Викиданные
Просмотр/редактирование человека Просмотр/редактирование мыши
Катепсин Е
Идентификаторы
Номер ЕС. 3.4.23.34
Номер CAS. 110910-42-4
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
ЭксПАСи Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins

Катепсин Е представляет собой фермент ( EC 3.4.23.34 ), который у человека кодируется CTSE геном . [ 5 ] [ 6 ] [ 7 ] Фермент также известен как медленнодвижущаяся протеиназа , аспарагиновая протеиназа мембраны эритроцитов , SMP , EMAP , непепсиновая протеиназа , катепсин D-подобная кислая протеиназа , катепсин E-подобная кислая протеиназа , катепсин D-тип протеиназа ) — фермент . [ 8 ] [ 9 ] [ 10 ] [ 6 ]

Катепсин Е — это протеаза , обнаруженная у животных, а также у различных других организмов, принадлежащая к группе аспарагиновых протеаз . У человека он кодируется геном CTSE , расположенным в положении 1q32 на хромосоме 1 . [ 11 ] [ 12 ] [ 6 ] [ 13 ] Это внутриклеточный нелизосомный гликопротеин , который в основном содержится в коже и иммунных клетках. [ 14 ] Белок представляет собой аспартилпротеазу, которая действует как гомодимер с дисульфидной связью и имеет олигосахаридную цепь с высоким содержанием маннозы. [ 15 ] Он является членом семейства пептидаз А1 и, следовательно, обладает специфичностью, сходной со специфичностью пепсина А и катепсина D. Катепсин Е представляет собой внутриклеточный фермент и, по-видимому, не участвует в переваривании пищевых белков. В наибольшем количестве он обнаруживается на поверхности клеток, образующих эпителиальную слизь желудка. Это первая аспарагиновая протеаза, присутствующая в желудке плода, и она обнаруживается более чем в половине случаев рака желудка, что позволяет считать ее онкофетальным антигеном . варианты транскрипта, использующие альтернативные полиаденилирования сигналы , и два варианта транскрипта, кодирующие разные изоформы . Для этого гена существуют [ 13 ] [ 14 ]

Дефицит уровня катепсина Е в организме может играть роль в воспалительных заболеваниях кожи, таких как атопический дерматит , лечение которого будет зависеть от фиксации функциональности и уровня белка в организме. [ 16 ] Наряду с ренином и катепсином D, катепсин Е является одной из немногих аспарагиновых протеаз, которые, как известно, производятся в тканях человека, отличных от тканей желудочно-кишечного тракта и репродуктивного тракта. [ 17 ]

Структура

[ редактировать ]

Структура катепсина E очень похожа на структуру катепсина D и BACE1 , и все три имеют почти идентичные области активного центра. Различия между ними заключаются в микросреде, окружающей их активные центры . Остатки ДТГ 96-98 и ДТГ 281-283 способствуют образованию активного центра фермента. Также имеются две пары дисульфидных связей у остатков Cys 272–276 и Cys 314–351. Два других остатка Cys в положениях 109 и 114 аминокислотной цепи расположены близко друг к другу в трехмерном пространстве, однако расстояние между их атомами серы составляет 3,53 Å, что слишком велико для образования правильной дисульфидной связи. В структуре также имеются четыре водородные связи между остатками Asp активного центра и окружающими остатками. Отличительным фактором катепсина Е по сравнению со структурой катепсина D и BACE1 можно считать образование дополнительной водородной связи между остатками Asp 96 и Ser 99 и отсутствие водородной связи с Leu/Met у Asp 281. [ 16 ]

Расположение

[ редактировать ]

Фермент распределяется в клетках желудочно-кишечного тракта , лимфоидных тканях, клетках крови, мочевых органах и микроглии . Его внутриклеточная локализация в различных клетках млекопитающих иная, чем у его аналога Катепсина D. Катепсин Е связывается с мембранной тканью во внутриклеточных канальцах париетальных клеток желудка , желчных канальцах печеночных клеток, клетках проксимальных канальцев почки в почках, эпителиальных клетках кишечника, трахеи и бронхов, остеокластах и ​​даже в эритроцитах. Его локализацию в структурах эндосом можно увидеть во многих различных типах клеток, таких как антигенпрезентирующие В-клеточные лимфобласты , клетки желудка и микроглия. Его присутствие также обнаруживается в цистернах клетки эндоплазматической сети . [ 15 ] [ 18 ]

Катепсин Е играет жизненно важную роль в деградации белка и процессинге антигена по MHC класса II. пути [ 13 ] и образование биоактивного белка. Считается также, что фермент участвует в механизме возрастной гибели нейронов, а также в чрезмерной стимуляции глутаматных рецепторов экситотоксинами и транзиторной ишемией переднего мозга . В эксперименте, проведенном на крысах, катепсин Е практически не обнаруживался в тканях головного мозга молодых крыс, однако у старых крыс его уровень был значительно повышен в неостриатуме и коре головного мозга . Фермент также экспрессировался на высоких уровнях в активированной микроглии области CA1 гиппокампа и в дегенерирующих нейронах в течение недели после транзиторной ишемии переднего мозга. [ 18 ] Катепсин Е может играть роль в развитии высокодифференцированной аденокарциномы из кишечной метаплазии . [ 15 ] Фермент также играет роль в ассоциации с дендритными клетками, где он генерирует репертуар CD4 в ответ на собственные и чужеродные белки. [ 19 ]

Посттрансляционная модификация

[ редактировать ]

Фермент гликозилирован . Различные типы клеток способствуют различиям в природе углеводной цепи. Олигосахарид с высоким содержанием маннозы наблюдается в проферменте фибробластов, однако зрелый фермент можно увидеть с помощью олигосахарида сложного типа. В мембранах эритроцитов зрелый фермент и профермент содержат олигосахарид сложного типа. Автокаталитическое расщепление дает две формы фермента: форма 1 начинается с остатка Ile 54, а форма 2 — с Thr 57. [ 20 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Jump up to: а б с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000196188 Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ Jump up to: а б с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000004552 Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ Куврёр Дж.М., Азума Т., Миллер Д.А., Рокки М., Мохандас Т.К., Буди Ф.А., Таггарт Р.Т. (август 1990 г.). «Присвоение катепсина E (CTSE) области хромосомы человека 1q31 путем гибридизации in situ и анализа гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 53 (2–3): 137–9. дои : 10.1159/000132914 . ПМИД   2369841 .
  6. ^ Jump up to: а б с Азума Т., Палс Г., Мохандас Т.К., Куврёр Дж.М., Таггарт Р.Т. (октябрь 1989 г.). «Человеческий желудочный катепсин Е. Предсказанная последовательность, локализация на хромосоме 1 и гомология последовательности с другими аспарагиновыми протеиназами» . Журнал биологической химии . 264 (28): 16748–53. дои : 10.1016/S0021-9258(19)84768-3 . ПМИД   2674141 .
  7. ^ «Ген Энтрез: катепсин Е CTSE» .
  8. ^ Лапрель С, Пюисдар В, Поршон-Бертолотто С, Жукофф Э, Тюрк V (июнь 1986 г.). «Структурные различия между кроличьим катепсином E и катепсином D». Биологическая химия Хоппе-Сейлера . 367 (6): 523–6. дои : 10.1515/bchm3.1986.367.1.523 . ПМИД   3741628 .
  9. ^ Ёнедзава С., Фуджи К., Маэдзима Ю., Тамото К., Мори Ю., Муто Н. (ноябрь 1988 г.). «Дальнейшие исследования крысиного катепсина Е: субклеточная локализация и существование активной формы субъединицы». Архив биохимии и биофизики . 267 (1): 176–83. дои : 10.1016/0003-9861(88)90021-5 . ПМИД   3058036 .
  10. ^ Джапп Р.А., Ричардс А.Д., Кей Дж., Данн Б.М., Вайкофф Дж.Б., Самлофф И.М., Ямамото К. (сентябрь 1988 г.). «Идентификация аспарагиновых протеиназ мембран эритроцитов человека и слизистой оболочки желудка (медленно движущихся протеиназ) как каталитически эквивалентных катепсину Е» . Биохимический журнал . 254 (3): 895–8. дои : 10.1042/bj2540895 . ПМЦ   1135167 . ПМИД   3058118 .
  11. ^ «CTSE катепсин E [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 16 октября 2016 г.
  12. ^ Куврёр Дж.М., Азума Т., Миллер Д.А., Рокки М., Мохандас Т.К., Буди Ф.А., Таггарт Р.Т. (1990). «Присвоение катепсина E (CTSE) области хромосомы человека 1q31 путем гибридизации in situ и анализа гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика . 53 (2–3): 137–9. дои : 10.1159/000132914 . ПМИД   2369841 .
  13. ^ Jump up to: а б с Заиди Н., Кальбахер Х. (март 2008 г.). «Катепсин Е: мини-обзор». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 367 (3): 517–22. дои : 10.1016/j.bbrc.2007.12.163 . ПМИД   18178150 .
  14. ^ Jump up to: а б Ясуда Ю, Кагеяма Т, Акамине А, Сибата М, Коминами Э, Утияма Ю, Ямамото К (июнь 1999 г.). «Характеристика новых флуорогенных субстратов для быстрого и чувствительного анализа катепсина E и катепсина D». Журнал биохимии . 125 (6): 1137–43. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022396 . ПМИД   10348917 .
  15. ^ Jump up to: а б с Саку Т., Сакаи Х., Сибата Ю., Като Ю., Ямамото К. (декабрь 1991 г.). «Иммуноцитохимическое исследование различной внутриклеточной локализации катепсина E и катепсина D в клетках желудка человека и различных клетках крысы». Журнал биохимии . 110 (6): 956–64. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123696 . ПМИД   1794985 .
  16. ^ Jump up to: а б Чжоу К.С. (май 2005 г.). «Моделирование третичной структуры катепсина-Е человека». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 331 (1): 56–60. дои : 10.1016/j.bbrc.2005.03.123 . ПМИД   15845357 .
  17. ^ Лиз В.Е., Калинка С., Мич Дж., Кэппер С.Дж., Кук Н.Д., Кей Дж. (октябрь 1990 г.). «Генерация человеческого эндотелина катепсином Е». Письма ФЭБС . 273 (1–2): 99–102. дои : 10.1016/0014-5793(90)81060-2 . ПМИД   2226872 . S2CID   43466635 .
  18. ^ Jump up to: а б Цукуба Т., Окамото К., Ясуда Ю., Морикава В., Наканиси Х., Ямамото К. (декабрь 2000 г.). «Новые функциональные аспекты катепсина D и катепсина E». Молекулы и клетки . 10 (6): 601–11. дои : 10.1007/ s10059-000-0601-8 ПМИД   11211863 . S2CID   20761872 .
  19. ^ Чейн Б.М., Фри П., Медд П., Светман С., Табор А.Б., Терраццини Н. (февраль 2005 г.). «Экспрессия и функция катепсина Е в дендритных клетках» . Журнал иммунологии . 174 (4): 1791–800. doi : 10.4049/jimmunol.174.4.1791 . ПМИД   15699105 .
  20. ^ «CTSE - предшественник катепсина E - Homo sapiens (человек) - ген и белок CTSE» . www.uniprot.org . Проверено 16 октября 2016 г.

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 7f2283cbe6a1ca824a8bb847aead4e07__1703376600
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/7f/07/7f2283cbe6a1ca824a8bb847aead4e07.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Cathepsin E - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)