MTHFD1

MTHFD1
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
showСписок идентификационных кодов PDB
	1A4I, 1DIA, 1DIB, 1DIG
Идентификаторы
Псевдонимы	MTHFD1 , MTHFC, MTHFD, C1-THF-синтаза, метилентетрагидрофолатдегидрогеназа, циклогидролаза и формилтетрагидрофолатсинтетаза 1, CIMAH
Внешние идентификаторы	Опустить : 172460 ; МГИ : 1342005 ; Гомологен : 55940 ; GeneCards : MTHFD1 ; OMA : MTHFD1 — ортологи
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 12 (mouse)
End	76,366,577 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; gastrocnemius muscle; ; Achilles tendon; ; adipose tissue; ; ganglionic eminence; ; subcutaneous adipose tissue; ; caudate nucleus; ; nucleus accumbens; ; right coronary artery; ; kidney;
	Top expressed in
	Paneth cell; ; primitive streak; ; right lobe of liver; ; left lobe of liver; ; right kidney; ; epiblast; ; Epithelium of choroid plexus; ; human kidney; ; left lung; ; right lung lobe;
	More reference expression data
	More reference expression data
showГенная онтология
Molecular function	nucleotide binding; methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+) activity; methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NAD+) activity; ligase activity; methylenetetrahydrofolate dehydrogenase [NAD(P)+ activity]; catalytic activity; oxidoreductase activity; ATP binding; hydrolase activity; protein binding; formate-tetrahydrofolate ligase activity; methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activity;
Cellular component	membrane; mitochondrion; extracellular exosome; cytoplasm; cytosol;
Biological process	purine nucleotide biosynthetic process; transsulfuration; neutrophil homeostasis; one-carbon metabolic process; serine family amino acid metabolic process; embryonic neurocranium morphogenesis; tetrahydrofolate interconversion; histidine biosynthetic process; cellular amino acid biosynthetic process; somite development; serine family amino acid biosynthetic process; methionine biosynthetic process; heart development; methionine metabolic process; neural tube closure; folic acid metabolic process; embryonic viscerocranium morphogenesis; metabolism; purine nucleobase biosynthetic process; 10-formyltetrahydrofolate biosynthetic process;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	4522
	108156
	н/д
	ENSMUSG00000021048
	P11586
	Q922D8
	НМ_005956 ; НМ_001364837
	НМ_138745
	НП_005947 ; НП_001351766
	НП_620084
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Метилентетрагидрофолатдегидрогеназа, циклогидролаза и формилтетрагидрофолатсинтетаза 1 ( MTHFD1 ) — это ген , расположенный у человека на хромосоме 14. ^{[ 4 ]} который кодирует белок C-1-тетрагидрофолатсинтазу, цитоплазматический, также известный как C1-THF-синтаза, с тремя различными ферментативными активностями. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}

Функция

Этот ген кодирует белок, который обладает тремя различными ферментативными активностями: метилентетрагидрофолатдегидрогеназой (1.5.1.5), метенилтетрагидрофолатциклогидролазой (3.5.4.9) и формиат-тетрагидрофолатлигазой (6.3.4.3). Каждая из этих активностей катализирует одну из трех последовательных реакций взаимного превращения 1-углеродных производных тетрагидрофолата , которые являются субстратами для синтеза метионина , тимидилата и пуринов de novo . Трехфункциональная ферментативная активность обеспечивается двумя основными доменами: аминоконцевой частью, содержащей дегидрогеназную и циклогидролазную активности, и более крупным синтетазным доменом. ^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}

Клиническое значение

Мутации гена MTHFD1 могут вызывать дефицит метилентетрагидрофолатдегидрогеназы 1 , также известный как комбинированный иммунодефицит и мегалобластная анемия с гипергомоцистеинемией или без нее (CIMAH). ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021048 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Отчет по символам для MTHFD1» . ГЮГО . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 13 марта 2024 г.
^ Хум Д.В., Белл А.В., Розен Р., Маккензи Р.Э. (ноябрь 1988 г.). «Первичная структура трехфункционального фермента человека. Выделение кДНК, кодирующей метилентетрагидрофолатдегидрогеназу-метенилтетрагидрофолатциклогидролазу-формилтетрагидрофолатсинтетазу» . Журнал биологической химии . 263 (31): 15946–15950. дои : 10.1016/S0021-9258(18)37540-9 . ПМИД 3053686 .
^ Розен Р., Бартон Д., Ду Дж., Хум Д.В., Маккензи Р.Э., Франк У (июнь 1989 г.). «Хромосомная локализация гена трехфункционального фермента человека метилентетрагидрофолатдегидрогеназы-метенилтетрагидрофолатциклогидролазы-формилтетрагидрофолатсинтетазы» . Американский журнал генетики человека . 44 (6): 781–786. ПМЦ 1715669 . ПМИД 2786332 .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: MTHFD1 метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ+-зависимая) 1, метенилтетрагидрофолатциклогидролаза, формилтетрагидрофолатсинтетаза» .
^ Jump up to: ^а ^б Уоткинс Д., Шварцентрубер Дж.А., Ганеш Дж., Оранж Дж.С., Каплан Б.С., Нуньес Л.Д. и др. (сентябрь 2011 г.). «Новая врожденная ошибка метаболизма фолата: идентификация путем захвата экзома и секвенирования мутаций в гене MTHFD1 у одного пробанда». Журнал медицинской генетики . 48 (9): 590–592. doi : 10.1136/jmedgenet-2011-100286 . ПМИД 21813566 . S2CID 9623450 .

Дальнейшее чтение

Шильд Д., Брейк А.Дж., Кифер М.К., Янг Д., Барр П.Дж. (апрель 1990 г.). «Клонирование трех человеческих многофункциональных генов биосинтеза пуринов de novo путем функциональной комплементации дрожжевых мутаций» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 87 (8): 2916–2920. Бибкод : 1990PNAS...87.2916S . дои : 10.1073/pnas.87.8.2916 . ПМК 53804 . ПМИД 2183217 .
Пери К.Г., Беланджер С., Маккензи Р.Э. (ноябрь 1989 г.). «Нуклеотидная последовательность НАД-зависимой метилентетрагидрофолатдегидрогеназы-циклогидролазы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 17 (21): 8853. doi : 10.1093/nar/17.21.8853 . ПМК 335047 . ПМИД 2587219 .
Маккензи Р.Э., Мехиа Н., Ян XM (1989). «Метилентетрагидрофолатдегидрогеназы в нормальных и трансформированных клетках млекопитающих». Достижения в регуляции ферментов . 27 : 31–39. дои : 10.1016/0065-2571(88)90007-6 . ПМИД 3074630 .
Шеннон К.В., Рабиновиц Дж.К. (сентябрь 1986 г.). «Очистка и характеристика митохондриального изофермента C1-тетрагидрофолатсинтазы из Saccharomyces cerevisiae» . Журнал биологической химии . 261 (26): 12266–12271. дои : 10.1016/S0021-9258(18)67234-5 . ПМИД 3528153 .
Мехия Н.Р., Маккензи Р.Э. (ноябрь 1985 г.). «НАД-зависимая метилентетрагидрофолатдегидрогеназа экспрессируется иммортализованными клетками» . Журнал биологической химии . 260 (27): 14616–14620. дои : 10.1016/S0021-9258(17)38612-X . ПМИД 3877056 .
Аллер М., Ли Ю., Маккензи Р.Э., Сиглер М. (февраль 1998 г.). «Трёхмерная структура фолат-зависимого бифункционального фермента дегидрогеназы/циклогидролазы с разрешением 1,5 А» . Структура . 6 (2): 173–182. дои : 10.1016/S0969-2126(98)00019-7 . ПМИД 9519408 .
Хол Ф.А., ван дер Пут Н.М., Гердс М.П., Хейл С.Г., Трийбелс Ф.Дж., Хамель Б.С. и др. (февраль 1998 г.). «Молекулярно-генетический анализ гена, кодирующего трифункциональный фермент MTHFD (метилентетрагидрофолат-дегидрогеназа, метенилтетрагидрофолат-циклогидролаза, формилтетрагидрофолатсинтетаза) у пациентов с дефектами нервной трубки». Клиническая генетика . 53 (2): 119–125. дои : 10.1111/j.1399-0004.1998.tb02658.x . ПМИД 9611072 . S2CID 42398289 .
Шмидт А., Ву Х., Маккензи Р.Э., Чен В.Дж., Бьюли Дж.Р., Рэй Дж.Э. и др. (май 2000 г.). «Структуры трех ингибиторных комплексов дают представление о механизме реакции человеческой метилентетрагидрофолатдегидрогеназы / циклогидролазы». Биохимия . 39 (21): 6325–6335. дои : 10.1021/bi992734y . ПМИД 10828945 .
Броуди Л.С., Конли М., Кокс С., Кирк П.Н., Маккивер М.П., Миллс Дж.Л. и др. (ноябрь 2002 г.). «Полиморфизм R653Q в трехфункциональном ферменте метилентетрагидрофолатдегидрогеназе/метенилтетрагидрофолатциклогидролазе/формилтетрагидрофолатсинтетазе является материнским генетическим фактором риска дефектов нервной трубки: отчет группы по исследованию врожденных дефектов» . Американский журнал генетики человека . 71 (5): 1207–1215. дои : 10.1086/344213 . ПМЦ 385099 . ПМИД 12384833 .
Геварт К., Готалс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стас А., Томас Г.Р., Вандекеркхове Дж. (май 2003 г.). «Изучение протеомов и анализ обработки белков путем масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Природная биотехнология . 21 (5): 566–569. дои : 10.1038/nbt810 . ПМИД 12665801 . S2CID 23783563 .
Парл-Макдермотт А., Миллс Дж.Л., Кирк П.Н., Кокс С., Синьор К.С., Кирк С. и др. (февраль 2005 г.). «Полиморфизм MTHFD1 R653Q является материнским генетическим фактором риска тяжелой отслойки плаценты». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 132А (4): 365–368. дои : 10.1002/ajmg.a.30354 . ПМИД 15633187 . S2CID 26023725 .
Парл-Макдермотт А., Пангилинан Ф., Миллс Дж.Л., Синьор К.С., Моллой А.М., Коттер А. и др. (июль 2005 г.). «Полиморфизм гена MTHFD1 увеличивает риск необъяснимой потери беременности во втором триместре у матери» . Молекулярная репродукция человека . 11 (7): 477–480. дои : 10.1093/моль/гах204 . ПМИД 16123074 .
Кольмайер М., да Коста К.А., Фишер Л.М., Цейзель Ш. (ноябрь 2005 г.). «Генетическая вариация пути одноуглеродного переноса, опосредованного фолиевой кислотой, предсказывает восприимчивость к дефициту холина у людей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 102 (44): 16025–16030. Бибкод : 2005PNAS..10216025K . дои : 10.1073/pnas.0504285102 . ПМК 1276051 . ПМИД 16236726 .
Де Марко П., Мерелло Э., Калево М.Г., Масчелли С., Расо А., Кама А., Капра В. (2006). «Оценка полиморфизма метилентетрагидрофолат-дегидрогеназы 1958G>A на риск дефекта нервной трубки» . Журнал генетики человека . 51 (2): 98–103. дои : 10.1007/s10038-005-0329-6 . ПМИД 16315005 .
Сунь Дж, Сюй Ю, Чжу Ю, Лу Х (октябрь 2006 г.). «Полиморфизм гена метилентетрагидрофолатредуктазы, гомоцистеин и риск макроангиопатии при сахарном диабете 2 типа». Журнал эндокринологических исследований . 29 (9): 814–820. дои : 10.1007/bf03347376 . ПМИД 17114913 . S2CID 38072740 .
Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф., Ли Х., Тейлор П., Клими С. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белково-белковых взаимодействий человека методом масс-спектрометрии» . Молекулярная системная биология . 3 (1): 89. дои : 10.1038/msb4100134 . ПМЦ 1847948 . ПМИД 17353931 .

Внешние ссылки

Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : P11586 (C-1-тетрагидрофолатсинтаза, цитоплазматическая) в PDBe-KB .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 14 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCm38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021048 – Ensembl , май 2017 г.

[2] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[3] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Отчет по символам для MTHFD1» . ГЮГО . Комитет по генной номенклатуре Хьюго . Проверено 13 марта 2024 г.

[pmid3053686-5] Хум Д.В., Белл А.В., Розен Р., Маккензи Р.Э. (ноябрь 1988 г.). «Первичная структура трехфункционального фермента человека. Выделение кДНК, кодирующей метилентетрагидрофолатдегидрогеназу-метенилтетрагидрофолатциклогидролазу-формилтетрагидрофолатсинтетазу» . Журнал биологической химии . 263 (31): 15946–15950. дои : 10.1016/S0021-9258(18)37540-9 . ПМИД 3053686 .

[pmid2786332-6] Розен Р., Бартон Д., Ду Дж., Хум Д.В., Маккензи Р.Э., Франк У (июнь 1989 г.). «Хромосомная локализация гена трехфункционального фермента человека метилентетрагидрофолатдегидрогеназы-метенилтетрагидрофолатциклогидролазы-формилтетрагидрофолатсинтетазы» . Американский журнал генетики человека . 44 (6): 781–786. ПМЦ 1715669 . ПМИД 2786332 .

[entrez-7] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтреза: MTHFD1 метилентетрагидрофолатдегидрогеназа (НАДФ+-зависимая) 1, метенилтетрагидрофолатциклогидролаза, формилтетрагидрофолатсинтетаза» .

[Watkins_2011-8] Jump up to: ^а ^б Уоткинс Д., Шварцентрубер Дж.А., Ганеш Дж., Оранж Дж.С., Каплан Б.С., Нуньес Л.Д. и др. (сентябрь 2011 г.). «Новая врожденная ошибка метаболизма фолата: идентификация путем захвата экзома и секвенирования мутаций в гене MTHFD1 у одного пробанда». Журнал медицинской генетики . 48 (9): 590–592. doi : 10.1136/jmedgenet-2011-100286 . ПМИД 21813566 . S2CID 9623450 .

[1]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и Ферменты : CO CS и CN лигазы ( EC 6.1-6.3)
6.1: Carbon-Oxygen	Aminoacyl tRNA synthetase Alanine Arginine Asparagine Aspartate Cysteine D-alanine—poly(phosphoribitol) ligase Glutamate Glutamine Glycine Histidine Isoleucine Leucine Lysine Methionine Phenylalanine Proline Serine Threonine Tryptophan Tyrosine Valine
6.2: Carbon-Sulfur	Succinyl coenzyme A synthetase Acetyl—CoA synthetase Long-chain-fatty-acid—CoA ligase
6.3: Carbon-Nitrogen	Glutamine synthetase Ubiquitin ligase Cullin Von Hippel–Lindau tumor suppressor UBE3A Mdm2 Anaphase-promoting complex UBR1 Glutathione synthetase CTP synthetase Adenylosuccinate synthase Argininosuccinate synthase Holocarboxylase synthetase GMP synthase Asparagine synthetase Carbamoyl phosphate synthetase I II Glutamate–cysteine ligase

v т и Ферменты
Activity	Active site Binding site Catalytic triad Oxyanion hole Enzyme promiscuity Diffusion-limited enzyme Cofactor Enzyme catalysis
Regulation	Allosteric regulation Cooperativity Enzyme inhibitor Enzyme activator
Classification	EC number Enzyme superfamily Enzyme family List of enzymes
Kinetics	Enzyme kinetics Eadie–Hofstee diagram Hanes–Woolf plot Lineweaver–Burk plot Michaelis–Menten kinetics
Types	EC1 Oxidoreductases (list) EC2 Transferases (list) EC3 Hydrolases (list) EC4 Lyases (list) EC5 Isomerases (list) EC6 Ligases (list) EC7 Translocases (list)