Малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид F

СНРПФ
Доступные структуры
ПДБ	Поиск ортологов: PDBe RCSB
показывать Список идентификационных кодов PDB
	3CW1, 3PGW, 3S6N, 4F7U, 4PJO, 4V98, 4WZJ, 3JCR
Идентификаторы
Псевдонимы	SNRPF , SMF, Sm-F, snRNP-F, малый ядерный рибонуклеопротеидный полипептид F
Внешние идентификаторы	Опустить : 603541 ; МГИ : 1917128 ; Гомологен : 130366 ; GeneCards : SNRPF ; ОМА : SNRPF — ортологи
показывать Местоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 12 (human)
End	95,903,828 bp
показывать Местоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 10 (mouse)
End	93,425,568 bp
показывать экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	oocyte; ; embryo; ; ganglionic eminence; ; epithelium of colon; ; ventricular zone; ; mucosa of pharynx; ; bone marrow; ; mucosa of transverse colon; ; oral cavity; ; pericardium;
	Top expressed in
	yolk sac; ; embryo; ; embryo; ; epiblast; ; ventricular zone; ; ganglionic eminence; ; lens; ; zygote; ; neural tube; ; placenta;
	More reference expression data
	More reference expression data
показывать Генная онтология
Molecular function	protein binding; RNA binding;
Cellular component	U4 snRNP; SMN-Sm protein complex; pICln-Sm protein complex; nucleus; U7 snRNP; catalytic step 2 spliceosome; U1 snRNP; cytoplasm; sno(s)RNA-containing ribonucleoprotein complex; nucleoplasm; small nuclear ribonucleoprotein complex; U12-type spliceosomal complex; methylosome; cytosol; spliceosomal complex; U2-type catalytic step 2 spliceosome; U4/U6 x U5 tri-snRNP complex; U2-type precatalytic spliceosome;
Biological process	termination of RNA polymerase II transcription; histone mRNA metabolic process; mRNA processing; mRNA splicing, via spliceosome; RNA splicing; import into nucleus; spliceosomal snRNP assembly;
	Sources:Amigo / QuickGO
скрывать Ортологи
	6636
	69878
	ENSG00000139343
	ЭНСМУСГ00000020018
	P62306
	P62307
	НМ_003095 ; НМ_001394209
	НМ_027246
	НП_003086
	НП_081522
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Малый ядерный рибонуклеопротеин F — белок , который у человека кодируется SNRPF геном . ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Взаимодействия

Было показано, что малый ядерный полипептид F рибонуклеопротеина взаимодействует с DDX20 . ^{[ 7 ]} Малый ядерный рибонуклеопротеин D2 ^{[ 8 ]} и малый ядерный рибонуклеопротеиновый полипептид Е. ^{[ 8 ]}

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000139343 – Ensembl , май 2017 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020018 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Герман Х, Фабрицио П., Рейкер В.А., Фулаки К., Хорниг Х., Брамс Х., Люрманн Р. (май 1995 г.). «Белки snRNP Sm разделяют два эволюционно консервативных мотива последовательности, которые участвуют в белок-белковых взаимодействиях Sm» . Журнал ЭМБО . 14 (9): 2076–88. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07199.x . ПМЦ 398308 . ПМИД 7744013 .
^ «Ген Энтрез: полипептид F малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPF» .
^ Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .

Дальнейшее чтение

Заутерер Р.А., Гоял А., Зиве Г.В. (январь 1990 г.). «Цитоплазматическая сборка небольших ядерных рибонуклеопротеиновых частиц из промежуточных продуктов, не содержащих 6 S и 20 S РНК, в фибробластах мыши L929» . Журнал биологической химии . 265 (2): 1048–58. дои : 10.1016/S0021-9258(19)40157-9 . ПМИД 1688550 .
Фини Р.Дж., Заутерер Р.А., Фини Дж.Л., Зиве Г.В. (апрель 1989 г.). «Цитоплазматическая сборка и ядерное накопление зрелых малых ядерных рибонуклеопротеиновых частиц» . Журнал биологической химии . 264 (10): 5776–83. дои : 10.1016/S0021-9258(18)83617-1 . ПМИД 2522439 .
Воппманн А., Ринке Дж., Люрманн Р. (декабрь 1988 г.). «Прямое сшивание белков snRNP F и 70K с snRNA ультрафиолетовым излучением in situ» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (23): 10985–1004. дои : 10.1093/нар/16.23.10985 . ПМК 338992 . ПМИД 2974540 .
Бональдо М.Ф., Леннон Дж., Соарес М.Б. (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода к открытию генов» . Геномные исследования . 6 (9): 791–806. дои : 10.1101/гр.6.9.791 . ПМИД 8889548 .
Плессель Г., Люрманн Р., Кастнер Б. (январь 1997 г.). «Электронная микроскопия промежуточных продуктов сборки ядра snRNP: морфологическое сходство между гетеромером белка без РНК (EFG) и интактным ядром snRNP». Журнал молекулярной биологии . 265 (2): 87–94. дои : 10.1006/jmbi.1996.0713 . ПМИД 9020971 .
Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .
Камбах С., Уок С., Янг Р., Авис Дж. М., де ла Фортель Э., Рейкер В. А., Люрманн Р., Ли Дж., Нагай К. (февраль 1999 г.). «Кристаллические структуры двух белковых комплексов Sm и их значение для сборки сплайсосомных мяРНП» . Клетка . 96 (3): 375–87. дои : 10.1016/S0092-8674(00)80550-4 . ПМИД 10025403 . S2CID 17379935 .
Бюлер Д., Рейкер В., Люрманн Р., Фишер У. (декабрь 1999 г.). «Основная роль тюдоровского домена SMN в сборке сплайсосомных U-мяРНП: последствия спинальной мышечной атрофии» . Молекулярная генетика человека . 8 (13): 2351–7. дои : 10.1093/hmg/8.13.2351 . ПМИД 10556282 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .
Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Йонг Дж., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (март 2000 г.). «Gemin4. Новый компонент комплекса SMN, который содержится как в драгоценных камнях, так и в ядрышках» . Журнал клеточной биологии . 148 (6): 1177–86. дои : 10.1083/jcb.148.6.1177 . ПМК 2174312 . ПМИД 10725331 .
Урлауб Х., Рейкер В.А., Костка С., Люрманн Р. (январь 2001 г.). «Взаимодействие белка Sm и сайта Sm РНК внутри внутреннего кольца основной структуры сплайсосомного мяРНП» . Журнал ЭМБО . 20 (1–2): 187–96. дои : 10.1093/emboj/20.1.187 . ПМК 140196 . ПМИД 11226169 .
Пеллиццони Л., Бэккон Дж., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфус Дж. (март 2002 г.). «Очистка нативной выживаемости комплексов мотонейронов и идентификация Gemin6 как нового компонента» . Журнал биологической химии . 277 (9): 7540–5. дои : 10.1074/jbc.M110141200 . ПМИД 11748230 .
Фризен В.Дж., Вайс А., Паушкин С., Абель Л., Раппсилбер Дж., Манн М., Дрейфусс Г. (март 2002 г.). «Новый белковый компонент WD-повторов метилосомы связывает белки Sm» . Журнал биологической химии . 277 (10): 8243–7. дои : 10.1074/jbc.M109984200 . ПМИД 11756452 .
Юрица М.С., Ликлайдер Л.Дж., Гиги С.Р., Григорьев Н., Мур М.Дж. (апрель 2002 г.). «Очистка и характеристика нативных сплайсосом, подходящих для трехмерного структурного анализа» . РНК . 8 (4): 426–39. дои : 10.1017/S1355838202021088 . ПМК 1370266 . ПМИД 11991638 .
Уилл С.Л., Шнайдер С., Хоссбах М., Урлауб Х., Раухут Р., Эльбашир С., Тушль Т., Люрманн Р. (июнь 2004 г.). «Человеческий 18S U11/U12 snRNP содержит набор новых белков, не обнаруженных в U2-зависимой сплайсосоме» . РНК . 10 (6): 929–41. дои : 10.1261/rna.7320604 . ПМЦ 1370585 . ПМИД 15146077 .
Ленер Б., Сандерсон К.М. (июль 2004 г.). «Схема взаимодействия белков для деградации мРНК человека» . Геномные исследования . 14 (7): 1315–23. дои : 10.1101/гр.2122004 . ПМК 442147 . ПМИД 15231747 .
Ма Ю, Дости Дж., Дрейфусс Г., Ван Дуйн Г.Д. (июнь 2005 г.). «Гетеродимер Gemin6-Gemin7 из комплекса выживания мотонейронов имеет структуру, подобную белку Sm» . Структура . 13 (6): 883–92. дои : 10.1016/j.str.2005.03.014 . ПМИД 15939020 .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 12 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000139343 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Перейти обратно: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020018 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[pmid7744013-5] Герман Х, Фабрицио П., Рейкер В.А., Фулаки К., Хорниг Х., Брамс Х., Люрманн Р. (май 1995 г.). «Белки snRNP Sm разделяют два эволюционно консервативных мотива последовательности, которые участвуют в белок-белковых взаимодействиях Sm» . Журнал ЭМБО . 14 (9): 2076–88. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07199.x . ПМЦ 398308 . ПМИД 7744013 .

[entrez-6] «Ген Энтрез: полипептид F малого ядерного рибонуклеопротеина SNRPF» .

[pmid10601333-7] Шарру Б., Пеллицони Л., Перкинсон Р.А., Шевченко А., Манн М., Дрейфус Г. (декабрь 1999 г.). «Gemin3: новый белок DEAD box, который взаимодействует с SMN, продуктом гена спинальной мышечной атрофии, и является компонентом драгоценных камней» . Журнал клеточной биологии . 147 (6): 1181–94. дои : 10.1083/jcb.147.6.1181 . ПМК 2168095 . ПМИД 10601333 .

[pmid9417867-8] Перейти обратно: ^а ^б Фьюри М.Г., Чжан В., Христодулопулос I, Зиве Г.В. (ноябрь 1997 г.). «Множественный белок: белковые взаимодействия между общими коровыми белками мяРНП». Экспериментальные исследования клеток . 237 (1): 63–9. дои : 10.1006/excr.1997.3750 . ПМИД 9417867 .

[1]

[2]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

v т и РНК-связывающий белок : рибонуклеопротеины.
snRNP	A A1 B B2 C D1 D2 D3 E F G N 70K/U1 spliceosomal RNA SNRNP200
hnRNP	A0 C L R
Other transcription	Telomerase
Translation	Ribosome
Vault ribonucleoprotein particles	Major vault protein
Other	Signal recognition particle