Ацильный белок
| Ацил/пептидиловый белок | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Acp-like_sf | ||
| Pfam | PF00550 | ||
| PFAM клан | CL0314 | ||
| InterPro | IPR036736 | ||
| PROSITE | PDOC00012 | ||
| Кат - | 1nq4 | ||
| Краткое содержание | 1nq4 / scope / supfam | ||
| |||
Белок ацильного носителя ( ACP ) представляет собой кофактор механизма биосинтеза как жирных кислот , так и поликетида . Это один из самых распространенных белков в клетках E. coli. [ 1 ] В обоих случаях растущая цепь связана с ACP через тиоэфир, полученный из дистального тиола 4'- фосфопантированного фрагмента.
Структура
[ редактировать ]ACP являются небольшими отрицательно заряженными α-спикерами с высокой степенью структурного и аминокислотного сходства. Структуры ряда ацильных белков были решены с использованием различных методов ЯМР и кристаллографии. ACP связаны с структурой и механизмом с белками пептидиловых носителей (PCP) из нерибосомных пептид -синтаз. [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] [ 5 ]
Биосинтез
[ редактировать ]После экспрессии неактивного APO ACP 4'-фосфопантийский фрагмент прикреплен к сериновому остаткам. Эта связь опосредована синтазой ацила-носителя (ACPS), 4'-фосфопантетеинилтрансферазой . 4'- фосфопантехейин представляет собой протезную группу нескольких белков ацила-носителя, включая белки ацила-носителя (ACP) синтаз жирных кислот , ACP поликетид-синтаз , пептидиловых белков (PCP), а также ариловые белки (ARCP) нерибосомальных Пептид -синтетазы (NRP).
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Кронан, Джон Э. (2014). «Механизм прохождения цепи ACP (ацил-носитель-белок)-зависимые ферменты представляется универсальным». Биохимический журнал . 460 (2): 157–163. doi : 10.1042/bj20140239 . PMID 24825445 .
- ^ Roujeinikova A, Baldock C, Simon WJ, Gilroy J, Baker PJ, Stuitje AR, Rice DW, Slabas AR, Rafferty JB (июнь 2002 г.). «Рентгеновские кристаллографические исследования по бутирил-ACP показывают гибкость структуры вокруг предполагаемого сайта связывания ацильной цепи» . Структура 10 (6). Лондон, Англия: 825–35. doi : 10.1016/s0969-2126 (02) 00775-x . PMID 12057197 .
- ^ Crawford JM, Vagstad AL, Ehrlich KC, Udwary DW, Таунсенд Калифорния (июль 2008 г.). «Партнерство ацил-карьера-фосфопантетеинилтрансферазы в грибковых синтазах жирных кислот» . Химбиохим . 9 (10): 1559–63. doi : 10.1002/cbic.200700659 . PMC 3189688 . PMID 18551496 .
- ^ Volkman BF, Zhang Q, Debabov DV, Rivera E, Kresheck GC, Neuhaus FC (июль 2001 г.). «Биосинтез D-аланил-липотихойной кислоты: третичная структура белка аланильного носителя Apo-D-D-аланила». Биохимия . 40 (27): 7964–72. doi : 10.1021/bi010355a . PMID 11434765 .
- ^ Вебер Т., Баумгартнер Р., Реннер С., Марахиль М.А., Холак Та (апрель 2000 г.). «Структура раствора PCP, прототип для доменов пептидил -носителя модульных пептид -синтетаз» . Структура 8 (4): 407–18. doi : 10.1016/s0969-2126 (00) 00120-9 . PMID 10801488 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Белок ацильного носителя в Национальной библиотеке медицинской библиотеки Медицинской библиотеки Медицинской медицины (Mesh)