Плесень
 | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
 | |
| Оригинальный автор(ы) | Гийс Шафтенаар |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | 10 ноября 1993 г. [1] |
| Стабильная версия | 6.9 |
| Операционная система | Окна ОС Х Линукс [2] |
| Лицензия | Собственный [3] |
| Веб-сайт | www |
Molden — это общая программа обработки молекулярных и электронных структур.
Основные возможности [ править ]
- Считывает выходные данные из пакетов ab initio GAMESS (US) , Gaussian , MOLPRO , PySCF и из полуэмпирических пакетов, таких как MOPAC , и поддерживает ряд других форматов.
- Отображает молекулярные орбитали или электронную плотность в виде контурных графиков или трехмерных сеточных графиков и выводит их в ряд графических форматов.
- Анимирует пути реакции и молекулярные вибрации.
- Редактор Z-матрицы .
Программа Molden была протестирована на различных платформах, а именно Linux, Windows NT, Windows95, Windows2000, WindowsXP, MacOSX, Silicon Graphics IRIX, Sun SunOS и Solaris.
Амбфор, основной модуль силового поля Молдена, представляет собой внешнюю программу, которую можно инициализировать из Молдена. Амбфор допускает белковое силовое поле Янтарь и GAFF (Общее Янтарное силовое поле). Использование Амбфора происходит автоматически при изучении белка с помощью Молдена. Силовое поле GAFF используется только небольшими молекулами. И Amber, и GAFF основаны на атомных зарядах. Различия в основном заключаются в вычислительных затратах, причем GAFF очень дорог.
Молден может читать несколько форматов файлов с кристаллической информацией.
См. также [ править ]
- Список систем молекулярной графики
- Список программного обеспечения для моделирования молекулярной механики
- ЦМБИ
Ссылки [ править ]
- ^ «ИСТОРИЯ» . Проверено 2 мая 2013 г.
- ^ «Протестированные на данный момент платформы» . Проверено 3 мая 2013 г.
- ^ «CMBI: Авторские права MOLDEN» . Проверено 27 ноября 2021 г.
Molden: программа предварительной и постобработки молекулярных и электронных структур. [1]
 | Эта статья о обеспечении для молекулярного моделирования незавершена . программном Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
- ^ Обзор MOLDEN , Шафтенаар Г., Ноордик Дж.Х. Molden: программа предварительной и постобработки молекулярных и электронных структур. J Мол Дес с помощью компьютеров. 2000 фев;14(2) 123-134. дои:10.1023/а:1008193805436. ПМИД 10721501.