Кристалл Эксплорер
 Скриншот сгенерированной поверхности Хиршфельда в CrystalExplorer17 | |
| Оригинальный автор(ы) | Д Джаятилака и М. А. Спэкман |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | 2007 г |
| Стабильная версия | КристаллЭксплорер 21 / 2021 |
| Операционная система | Windows 10/11 (64 бит) , Убунту 20.04 ЛТС , МакОС 10.13+ |
| Лицензия | бесплатно (применяются условия) |
| Веб-сайт | исследователь кристаллов |
CrystalExplorer ( CE ) — это бесплатная программа, предназначенная для анализа кристаллической структуры в формате файла *.cif . [1]
CE полезен для исследования различных областей химии твердого тела , таких как поверхности Хиршфельда анализ , межмолекулярные взаимодействия , полиморфизм , влияние давления и температуры на кристаллическую структуру , реакции между монокристаллами, анализ пустот, присутствующих в кристалле, и структура. -имущественные отношения. [1] [2]
Графический интерфейс CE для трехмерной визуализации кристаллической структуры помогает рисовать кристаллическую структуру с поверхностью Хиршфельда или без нее. [3]
История [ править ]
CrystalExplorer запущен как графический пользовательский интерфейс, который облегчает визуализацию взаимодействий в молекулярных кристаллических структурах. В 2006 году студент М. А. Спакмана Дилан Джаятилака и его коллеги представили доклад о своем новом кристаллографическом программном обеспечении на 23-й Европейской кристаллографической встрече (ECM23), проходившей в Левене. [4] Это программное обеспечение было разработано Школой биомедицинских и химических наук Университета Западной Австралии, Недлендс 6009, Австралия. С 2006 года исследователи начали цитировать программу в своих исследовательских работах. [5]
CrystalExplorer 2.1 предназначен для платформ Mac OS X, Windows и Linux для анализа кристаллических структур и может использоваться для исследования многих областей химии твердого тела, таких как изучение межмолекулярных взаимодействий , полиморфизма , влияния давления и температуры на кристаллические структуры , одиночных -кристалл-монокристаллические реакции, анализ кристаллических пустот, взаимосвязь структура-свойства, [6] изоструктурные соединения, [7] и рассчитать энергии межмолекулярного взаимодействия. [8]
По данным анализа Google, по состоянию на сентябрь 2020 года существует более 2000 исследовательских работ, в которых цитируется программное обеспечение CrystalExplorer. [5]
Лицензия [ править ]
CrystalExplorer17 лицензируется бесплатно при таких условиях, как отказ от использования бесплатной версии CrystalExplorer для проведения коммерческих или конфиденциальных исследований, а также исследований, которые вряд ли будут опубликованы в рецензируемом журнале. [9]
См. также [ править ]
- Кембриджский центр кристаллографических данных
- Кристаллографический информационный файл
- Международный союз кристаллографии
Ссылки [ править ]
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Главная страница CrystalExplorer» . Crystalexplorer.scb.uwa.edu.au . Архивировано из оригинала 7 марта 2020 года . Проверено 31 августа 2020 г.
- ^ Спэкман, Марк А.; Джаятилака, Дилан (21 ноября 2008 г.). «Анализ поверхности Хиршфельда» . CrystEngComm . 11:19 . дои : 10.1039/B818330A .
- ^ Маккензи, Кэмпбелл Ф.; Спэкман, Питер Р.; Джаятилака, Дилан; Спэкман, Марк А. (4 июля 2017 г.). «Энергия модели CrystalExplorer и энергетические основы: распространение на координационные соединения металлов, органические соли, сольваты и системы с открытой оболочкой» . МСКРЖ . 4 (Часть 5): 575–587. дои : 10.1107/S205225251700848X . ISSN 2052-2525 . ПМК 5600021 . ПМИД 28932404 .
- ^ «CrystalExplorer: инструмент для отображения поверхностей Хиршфельда и визуализации межмолекулярных взаимодействий в молекулярных кристаллах» . Акта Кристаллогр . А62 : s90. 2006.
- ↑ Перейти обратно: Перейти обратно: а б «Гугл Академика» . ученый.google.com .
- ^ «CrystalExplorer 2.1 — CrystalExplorer — это полнофункциональный инструмент визуализации молекулярных кристаллов» . Software.informer.com . Software.informer.com.
- ^ Арункумар, Челлая (13 апреля 2014 г.). «Количественный анализ кристаллической структуры фторированных порфиринов» . Журнал химии фтора . 163 : 16–22. дои : 10.1016/j.jfluchem.2014.04.002 .
- ^ Спэкман, PR; Спэкман, Массачусетс (18 марта 2021 г.). «CrystalExplorer: программа для анализа поверхности Хиршфельда, визуализации и количественного анализа молекулярных кристаллов» . Дж. Прил. Кристаллогр . 54 (3): 1006–1011. дои : 10.1107/S1600576721002910 . ПМК 8202033 . ПМИД 34188619 .
- ^ «CrystalExplorer — Лицензирование» . Crystalexplorer.scb.uwa.edu.au . Архивировано из оригинала 7 марта 2020 года . Проверено 31 августа 2020 г.