ФлексЭЙД

**Гибкая стыковка искусственного интеллекта** ( **FlexAID** )
Оригинальный автор(ы)	Луи-Филипп Моранси, Франсис Годро, Рафаэль Дж. Найманович
Репозиторий	github .с /NRGlab /ФлексЭЙД
Написано в	С , С++
Операционная система	Linux, macOS, Win64 (поддержка и разработка прекращены с 2022 г.)
Платформа	x86_64, система на кристалле на базе ARM (Apple M1 [ Pro Max ])
Тип	Стыковка белок-лиганд
Лицензия	Лицензия Апач
Веб-сайт	Нрглаб .github .что

FlexAID — это программное обеспечение для молекулярной стыковки , которое может использовать небольшие молекулы и пептиды в качестве лигандов, а белки и нуклеиновые кислоты — в качестве мишеней для стыковки. Как следует из названия, FlexAID поддерживает полную гибкость лиганда, а также гибкость боковой цепи мишени. Для этого используется функция мягкой оценки, основанная на взаимодополняемости двух поверхностей (лиганда и мишени).

Было показано, что FlexAID превосходит существующее широко используемое программное обеспечение, такое как AutoDock Vina и FlexX, в прогнозировании поз привязки. Это особенно верно в тех случаях, когда целевая гибкость имеет решающее значение, что, вероятно, имеет место при использовании моделей гомологии. ^[1]^[2]^[3] Исходный код доступен на GitHub под лицензией Apache . ^[4]

Графический интерфейс пользователя

Плагин PyMOL для FlexAID, NRGsuite, также был разработан первоначальными авторами. ^[5]

См. также

Ссылки

^ https://nrglab.github.io
^ Моренси, Луи-Филипп; Годро, Фрэнсис; Найманович, Рафаэль (2018). «Применение NRGsuite и программного обеспечения для молекулярной стыковки FlexAID в вычислительном открытии и разработке лекарств». Вычислительное открытие и разработка лекарств . Методы молекулярной биологии. Том. 1762. стр. 367–388. дои : 10.1007/978-1-4939-7756-7_18 . ISBN 978-1-4939-7755-0 . ПМИД 29594781 .
^ Годро, Фрэнсис; Найманович, Рафаэль Дж. (27 июля 2015 г.). «FlexAID: новый взгляд на стыковку неродных сложных структур» . Журнал химической информации и моделирования . 55 (7): 1323–1336. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00078 . ISSN 1549-9596 . ПМИД 26076070 .
^ GitHub — NRGlab/FlexAID: гибкая стыковка искусственного интеллекта. , NRGlab, 28 февраля 2018 г. , получено 22 мая 2019 г.
^ Годро, Фрэнсис; Моренси, Луи-Филипп; Найманович, Рафаэль Дж. (01 декабря 2015 г.). «NRGsuite: плагин PyMOL для моделирования стыковки в реальном времени с использованием FlexAID» . Биоинформатика . 31 (23): 3856–3858. doi : 10.1093/биоинформатика/btv458 . ISSN 1367-4803 . ПМЦ 4653388 . ПМИД 26249810 .

Внешние ссылки

- Ресурсы Исследовательской группы Наймановича

Эта научная статья о программном обеспечении незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] ttps://nrglab.github.io

[2] Моренси, Луи-Филипп; Годро, Фрэнсис; Найманович, Рафаэль (2018). «Применение NRGsuite и программного обеспечения для молекулярной стыковки FlexAID в вычислительном открытии и разработке лекарств». Вычислительное открытие и разработка лекарств . Методы молекулярной биологии. Том. 1762. стр. 367–388. дои : 10.1007/978-1-4939-7756-7_18 . ISBN 978-1-4939-7755-0 . ПМИД 29594781 .

[3] Годро, Фрэнсис; Найманович, Рафаэль Дж. (27 июля 2015 г.). «FlexAID: новый взгляд на стыковку неродных сложных структур» . Журнал химической информации и моделирования . 55 (7): 1323–1336. doi : 10.1021/acs.jcim.5b00078 . ISSN 1549-9596 . ПМИД 26076070 .

[4] GitHub — NRGlab/FlexAID: гибкая стыковка искусственного интеллекта. , NRGlab, 28 февраля 2018 г. , получено 22 мая 2019 г.

[5] Годро, Фрэнсис; Моренси, Луи-Филипп; Найманович, Рафаэль Дж. (01 декабря 2015 г.). «NRGsuite: плагин PyMOL для моделирования стыковки в реальном времени с использованием FlexAID» . Биоинформатика . 31 (23): 3856–3858. doi : 10.1093/биоинформатика/btv458 . ISSN 1367-4803 . ПМЦ 4653388 . ПМИД 26249810 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]