PSI (вычислительная химия)
| Разработчик(и) | Проект Пси4 |
|---|---|
| Стабильная версия | Пси4 1,8 / 11 мая 2023 г [1] |
| Репозиторий | |
| Написано в | С++ , Питон |
| Операционная система | Linux , Microsoft Windows , Mac OS X |
| Тип | Вычислительная химия |
| Лицензия | лицензия GPL |
| Веб-сайт | http://www.psicode.org |
Psi — это ab initio, пакет вычислительной химии первоначально написанный исследовательской группой Генри Ф. Шефера III ( Университет Джорджии ). Используя Psi, можно выполнить расчет молекулярной системы с помощью различных методов, таких как методы Хартри-Фока , методы электронной корреляции Пост-Хартри-Фока и теория функционала плотности . [2] [3] Программа может вычислять энергии, оптимизировать молекулярную геометрию и вычислять частоты колебаний. [2] [3] Большая часть программы написана на C++ , также доступен Python API , который позволяет пользователям легко выполнять сложные вычисления или автоматизировать задачи. [2] [4] [5] [6]
Psi4 — последняя версия программного пакета — он с открытым исходным кодом , выпущен бесплатно под лицензией GPL через GitHub . Первичная разработка Psi4 в настоящее время выполняется исследовательскими группами Дэвида Шерилла ( Технологический институт Джорджии ), Т. Дэниела Кроуфорда ( Технологический институт Вирджинии ), Франческо Евангелисты ( Университет Эмори ) и Генри Ф. Шефера III ( Университет Джорджии ), с существенными вклад Джастина Терни ( Университет Джорджии ), Энди Симмонетта ( НИЗ ) и Роллина Кинга ( Вефильский университет ). [2] [4] [5] [6] Psi4 доступен в таких выпусках Linux, как Fedora и Ubuntu.
Функции
[ редактировать ]Основные возможности Psi сосредоточены вокруг следующих методов: [2] квантовой химии :
- Метод Хартри – Фока
- Теория функционала плотности
- Теория возмущений Мёллера–Плессе.
- Связанный кластер
- КАССФ
- взаимодействия многоссылочной конфигурации методы
- симметрично адаптированная теория возмущений
Доступно несколько методов расчета возбужденных электронных состояний, включая конфигурационного взаимодействия синглы (CIS), приближение случайной фазы (RPA), теорию функционала плотности, зависящую от времени (TD-DFT) и кластер, связанный с уравнением движения (EOM-CCSD). ). [2]
Psi4 внедрил аппроксимацию плотности во многих частях кода, что привело к ускорению вычислений и снижению требований к вводу-выводу. [2] [4] [5]
Psi4 — это предпочтительный сервер квантовой химии для проекта OpenFermion, целью которого является выполнение квантово-химических вычислений на квантовых компьютерах. [7]
В Пси4 1.4, [6] Программа была адаптирована для облегчения высокопроизводительных рабочих процессов и может быть подключена к BrianQC для ускорения расчетов методами Хартри-Фока и теории функционала плотности .
См. также
[ редактировать ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «v1.8 — май 2023 г.» . 11 мая 2023 г. . Проверено 2 сентября 2023 г.
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж г «Psi4: квантовая химия с открытым исходным кодом» . Проект PSI4 . Проверено 6 июля 2017 г.
- ^ Перейти обратно: а б Пирхади, Сомайе; Сансери, Джоселин; Коес, Дэвид Райан (2016). «Молекулярное моделирование с открытым исходным кодом» . Журнал молекулярной графики и моделирования . 69 : 127–143. дои : 10.1016/j.jmgm.2016.07.008 . ISSN 1093-3263 . ПМК 5037051 . ПМИД 27631126 .
- ^ Перейти обратно: а б с Терни, Джастин М.; Симмонетт, Эндрю К.; Пэрриш, Роберт М.; Хоэнштайн, Эдвард Г.; Евангелиста, Франческо А.; Ферманн, Джастин Т.; Минц, Бенджамин Дж.; Бернс, Лори А.; Уилк, Джеремия Дж.; Абрамс, Мика Л.; Расс, Николас Дж.; Лейнингер, Мэтью Л.; Янссен, Кертис Л.; Зайдль, Эдвард Т.; Аллен, Уэсли Д.; Шефер, Генри Ф.; Кинг, Роллин А.; Валеев, Эдвард Ф.; Шерилл, К. Дэвид; Кроуфорд, Т. Дэниел (2012). «Psi4: программа электронной структуры ab initio с открытым исходным кодом». Междисциплинарные обзоры Wiley: вычислительная молекулярная наука . 2 (4): 556–565. дои : 10.1002/wcms.93 . ISSN 1759-0876 . S2CID 57101524 .
- ^ Перейти обратно: а б с Пэрриш, Роберт М.; Бернс, Лори А.; Смит, Дэниел Джорджия; Симмонетт, Эндрю К.; ДеПринс, А. Юджин; Хоэнштайн, Эдвард Г.; Бозкая, Угур; Соколов Александр Юрьевич; Ди Ремиджио, Роберто; Ричард, Райан М.; Гонтье, Жером Ф.; Джеймс, Эндрю М.; Макалександер, Харли Р.; Кумар, Ашутош; Сайтоу, Масааки; Ван, Сяо; Причард, Бенджамин П.; Верма, Пракаш; Шефер, Генри Ф.; Патковский, Конрад; Кинг, Роллин А.; Валеев, Эдвард Ф.; Евангелиста, Франческо А.; Терни, Джастин М.; Кроуфорд, Т. Дэниел; Шерилл, К. Дэвид (2017). «Psi4 1.1: программа электронных структур с открытым исходным кодом, в которой особое внимание уделяется автоматизации, расширенным библиотекам и совместимости» (PDF) . Журнал химической теории и вычислений . 13 (7): 3185–3197. дои : 10.1021/acs.jctc.7b00174 . ISSN 1549-9618 . ПМЦ 7495355 . ПМИД 28489372 .
- ^ Перейти обратно: а б с Смит, Дэниел Джорджия; Бернс, Лори А.; Симмонетт, Эндрю К.; Пэрриш, Роберт М.; Шибер, Мэтью С.; Галвелис, Раймондас; Краус, Питер; Крузе, Хольгер; Ди Ремиджио, Роберто; Аленаизан, Асем; Джеймс, Эндрю М; Лехтола, Суси; Мисевич, Джонатон П.; Шойер, Максимилиан; Шоу, Роберт А.; Шрайбер, Джеффри Б.; Се, Йи; Глик, Закари Л.; Сирианни, Доминик А.; О'Брайен, Джозеф Сенан; Уолдроп, Джонатан М.; Кумар, Ашутош; Хоэнштайн, Эдвард Г.; Причард, Бенджамин П.; Брукс, Бернард Р.; Шефер III, Генри Ф.; Соколов Александр Юрьевич; Патковский, Конрад; ДеПринс, А. Юджин; Бозкая, Угур; Кинг, Роллин А.; Евангелиста, Франческо А.; Терни, Джастин М.; Кроуфорд, Т. Дэниел; Шерилл, К. Дэвид (2020). «Psi4 1.4: Программное обеспечение с открытым исходным кодом для высокопроизводительной квантовой химии» . Журнал химической физики . 152 (18): 184108. Бибкод : 2020JChPh.152r4108S . дои : 10.1063/5.0006002 . hdl : 10138/321376 . ПМЦ 7228781 . ПМИД 32414239 .
- ^ Кан, Джереми (23 октября 2017 г.). «Google представляет программное обеспечение, которое откроет квантовые компьютеры для химиков» . Технология Блумберг . Блумберг ЛП . Проверено 8 апреля 2018 г.