Гемический
![]() Скриншот Ghemical 3.0.0 | |
Разработчик(и) | Гемические авторы |
---|---|
Первоначальный выпуск | 11 апреля 2000 г [1] |
Репозиторий | |
Написано в | С++ |
Операционная система | Unix-подобный |
Доступно в | ? |
Тип | Вычислительная химия |
Лицензия | лицензия GPL |
Веб-сайт | http://bioinformatics.org/ghemical |
Ghemical — это пакет программного обеспечения для вычислительной химии, написанный на C++ и выпущенный под лицензией GNU General Public License . [2] Программа имеет графический интерфейс пользователя на основе GTK+2 и поддерживает квантово-механические и молекулярно-механические модели с оптимизацией геометрии, молекулярной динамикой и большим набором инструментов визуализации. Ghemical использует внешний код для выполнения квантово-механических расчетов — MOPAC предоставляет полуэмпирические MNDO , MINDO , AM1 и PM3 методы , а также методы MPQC , основанные на расчетах Хартри-Фока .
Химическая экспертная система основана на OpenBabel , которая обеспечивает базовые функции, такие как типирование атомов, генерация ротамеров и импорт/экспорт форматов химических файлов .
См. также
[ редактировать ]- Open Babel — химическая экспертная система
- XDrawChem — программа для 2D-рисования, также основанная на Open Babel.
- Редактор молекул
- Авогадро (программное обеспечение)
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «[ViewVC] Аннотация: gemical/trunk/CHANGES» . биоинформатика.org .
- ^ Хасинен, Томми; Перакила, Микаэль (июнь 2001 г.). «Новые энергетические термины для моделей восстановленного белка, реализованных во внерешеточном силовом поле». Журнал вычислительной химии . 22 (12): 1229–1242. дои : 10.1002/jcc.1080 . S2CID 5073249 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Гемическая домашняя страница
- Гемическая версия интерфейса GAMESS (США)
- Плагин Ghemical для Bioclipse
- Путеводитель по Ghemical на финском языке [ постоянная мертвая ссылка ] (на финском языке)
- Программное обеспечение для вычислительной химии
- Бесплатное программное обеспечение, написанное на C++.
- Бесплатное программное обеспечение по химии
- Бесплатное образовательное программное обеспечение
- Научное программное обеспечение, использующее GTK
- Незавершённые версии научного программного обеспечения
- Незавершенные статьи по вычислительной химии