Открытый Вавилон
 | |
| Разработчик(и) | Команда разработчиков Open Babel |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | 2 июня 2005 г |
| Стабильная версия | 3.1.1 [1]  / 8 мая 2020 г |
| Репозиторий | www |
| Написано в | C , C++ ( wxWidgets [2] ) |
| Операционная система | Windows , macOS , Linux , Android |
| Платформа | ИА-32 , x86-64 |
| Доступно в | Английский |
| Тип | Хеминформатика , молекулярное моделирование |
| Лицензия | Лицензионная лицензия 2.0 |
| Веб-сайт | www |
Open Babel — это компьютерное программное обеспечение , химическая экспертная система, в основном используемая для взаимного преобразования химических форматов файлов . [3]
О
[ редактировать ]Из-за тесной связи с информатикой эта программа больше относится к категории хеминформатики, чем к молекулярному моделированию . Он доступен для Windows , Unix , Linux , macOS и Android . Это бесплатное программное обеспечение с открытым исходным кодом, выпущенное под лицензией GNU General Public License (GPL) 2.0.
Заявленная цель проекта:«Open Babel — это управляемый сообществом научный проект, помогающий как пользователям, так и разработчикам, в виде кроссплатформенной программы и библиотеки, предназначенной для поддержки молекулярного моделирования, химии и многих смежных областей, включая взаимное преобразование форматов файлов и данных».
История
[ редактировать ]Open Babel и JOELib были созданы на основе OELib библиотеки хемоинформатики . В свою очередь, OELib была основана на идеях оригинальной программы по химии Babel и неизданной библиотеки объектно-ориентированного программирования под названием OBabel .
Основные особенности
[ редактировать ]- химическая экспертная система
- взаимное преобразование многих форматов химических файлов
- поиск субструктур на основе упрощенной системы линейного ввода молекулярного ввода (SMILES)
- расчет отпечатков пальцев
- Генерация 3D-координат [4]
- оболочки для Python , Perl , Java , Ruby , C# [5]
См. также
[ редактировать ]
- Авогадро — молекулярный конструктор и редактор на основе Open Babel
- Ghemical - программа молекулярной механики на основе Open Babel.
- JOELib – Java-версия Open Babel и OELib.
- XDrawChem — программа для 2D-рисования на основе Open Babel.
- Сравнение программного обеспечения для моделирования молекулярной механики
- Синий Обелиск [6]
- Список бесплатных пакетов программного обеспечения с открытым исходным кодом
Ссылки
[ редактировать ]- ^ «Выпуск 3.1.1» . 8 мая 2020 г. Проверено 9 мая 2020 г.
- ^ «Debian — Подробная информация о пакете openbabel-gui в jessie» . Проверено 10 марта 2017 г.
- ^ О'Бойл, Нью-Мексико; Банк, М.; Джеймс, Калифорния; Морли, К.; Вандермеерш, Т.; Хатчисон, Г. Р. (2011). «Открытый Вавилон: открытый набор химических инструментов» . Журнал хеминформатики . 3:33 . дои : 10.1186/1758-2946-3-33 . ПМК 3198950 . ПМИД 21982300 .
- ^ Ёсикава, Наруки; Хатчисон, Джеффри Р. (1 августа 2019 г.). «Быстрая и эффективная генерация координат на основе фрагментов для Open Babel» . Журнал хеминформатики . 11 (1): 49. дои : 10.1186/s13321-019-0372-5 . ПМК 6676618 . ПМИД 31372768 .
- ^ «Open Babel — набор инструментов для химии — документация Open Babel openbabel-3-1-1» . openbabel.org . Проверено 18 февраля 2024 г.
- ^ Гуха, Р.; Ховард, Монтана; Хатчисон, Греция; Мюррей-Раст, П .; Рзепа, Х. ; Стейнбек, К. ; Вегнер, Дж.; Уиллигхаген, Эл. (2006). «Голубой обелиск — совместимость в химической информатике» . Журнал химической информации и моделирования . 46 (3): 991–998. дои : 10.1021/ci050400b . ПМЦ 4878861 . ПМИД 16711717 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Официальный сайт
- E-BABEL - интерактивная версия Open Babel в виртуальной лаборатории вычислительной химии
- chemCast Episode 003 – ведущий разработчик проекта Джефф Хатчисон дал интервью в подкасте
- Программное обеспечение для вычислительной химии
- Бесплатное программное обеспечение по химии
- Бесплатное программное обеспечение, написанное на C++.
- Программное обеспечение по химии для Linux
- Программное обеспечение, использующее wxWidgets
- Программное обеспечение для конвертации файлов
- программное обеспечение 2005 года