Ягуар (программное обеспечение)
 | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
| Разработчик(и) | Шрёдингер Инк. |
|---|---|
| Операционная система | Linux , Microsoft Windows , Mac OS X |
| Тип | Вычислительная химия |
| Лицензия | Коммерческий |
| Веб-сайт | https://www.schrodinger.com/jaguar |
Jaguar — это пакет компьютерного программного обеспечения , используемый для ab initio расчетов квантовой химии как для газовой фазы, так и для фазы раствора. [1] Это коммерческое программное обеспечение, продаваемое компанией Schrödinger . Программа была разработана исследовательскими группами Ричарда Фриснера и Уильяма Годдарда и первоначально называлась PS-GVB (имеется в виду так называемый псевдоспектральный метод обобщенных валентных связей , который использовался в программе).
Jaguar является компонентом двух других продуктов Schrödinger: Maestro, который обеспечивает графический интерфейс пользователя для Jaguar, и QM/MM программы QSite , которая использует Jaguar в качестве своего квантово-химического двигателя. Текущая версия — Jaguar 10.4 (2020 г.).
Функции
[ редактировать ]Отличительной особенностью Jaguar является использование псевдоспектрального приближения. [2] Это приближение можно применить к дорогостоящим интегральным операциям, присутствующим в большинстве квантово-химических расчетов. В результате вычисления выполняются быстрее с небольшой потерей точности. [3] [4] [5]
Текущая версия включает в себя следующий функционал:
- Хартри-Фока ( RHF , UHF , ROHF ) и теория функционала плотности ( LDA , градиентно-корректированные, дисперсионно-корректированные и гибридные функционалы)
- второго порядка локальная теория возмущений Меллера – Плессе (LMP2)
- валентных связей (GVB-PP) и GVB-LMP2 расчеты обобщенного идеального спаривания
- предсказание возбужденных состояний с использованием конфигурационного взаимодействия (CIS) и теории функционала плотности, зависящей от времени (TDDFT)
- оптимизация геометрии и переходных состояний поиск
- сольватационные расчеты на основе уравнения Пуассона – Больцмана
- предсказание спектров инфракрасного (ИК), ядерного магнитного резонанса (ЯМР), ультрафиолетового (УФ) и колебательного кругового дихроизма (VCD)
- pKa предсказание
- создание различных молекулярных поверхностей ( электростатический потенциал , электронная плотность , молекулярные орбитали и т. д.)
- предсказание различных свойств молекул ( мультипольные моменты , поляризуемость , частоты колебаний и т. д.)
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Янг, Дэвид (2001). «Приложение AA2.5 Jaguar». Вычислительная химия . Уайли-Интерсайенс. п. 337.
- ^ Орзаг, Стивен А. (сентябрь 1972 г.). «Сравнение псевдоспектрального и спектрального приближения». Исследования по прикладной математике . 51 (3): 253–259. дои : 10.1002/sapm1972513253 .
- ^ Фриснер, РА (октябрь 1991 г.). «Новые методы расчета электронной структуры больших молекул». Ежегодный обзор физической химии . 42 (1): 341–367. Бибкод : 1991ARPC...42..341F . дои : 10.1146/annurev.pc.42.100191.002013 . ПМИД 1747190 . S2CID 32730211 .
- ^ Фриснер, Ричард А.; Мерфи, Роберт Б.; Бичи, Майкл Д.; Рингнальда, Мурко Н.; Поллард, В. Томас; Дуниц, Барри Д.; Цао, Исян (апрель 1999 г.). «Коррелированные ab initio расчеты электронной структуры больших молекул». Журнал физической химии А. 103 (13): 1913–1928. Бибкод : 1999JPCA..103.1913F . дои : 10.1021/jp9825157 .
- ^ Ладо, Ф.; Ломба, Э.; Ломбардеро, М. (1995). «Алгоритм интегрального уравнения для жидкостей с полностью анизотропными молекулами» (PDF) . Журнал химической физики . 103 (1): 481. Бибкод : 1995ЖЧФ.103..481Л . дои : 10.1063/1.469615 .