FKBP
| Пептидилпролил-цис-транс-транс-транс-транс-типа | |||
|---|---|---|---|
 Человеческий белок FKBP12, связанный с FK506 (такролимус). Поверхность белка окрашена гидрофобностью; Глубокая расщелина, в которой лиганд связан, является гидрофобным. | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Fkbp_c | ||
| Pfam | PF00254 | ||
| InterPro | IPR001179 | ||
| PROSITE | PDOC00426 | ||
| Краткое содержание | 1fkb / scope / supfam | ||
| Мембраном | 336 | ||
| |||
S Белки , связывающие FKBP , или FK506 , составляют семейство белков , которые обладают активностью пролила изомеразы и связаны с циклофилинами функциональными , хотя и не в аминокислотной последовательности . [ 1 ] FKBP были идентифицированы во многих эукариотах , начиная от дрожжей до людей и функционируют как складывания белков шапероны для белков, содержащих пролина остатки . Наряду с циклофилином, FKBP принадлежат к семейству иммунофилина . [ 2 ]
FKBP1A (также известный как FKBP12) известен у людей для связывания иммуносупрессанта молекулы такролимуса (первоначально обозначенный FK506), который используется при лечении пациентов после трансплантации органов и пациентов с аутоиммунными нарушениями. [ 3 ] Было обнаружено, что такролимус снижает эпизоды отторжения органов по сравнению с родственным лечением, препарата циклоспорина , который связывает циклофилин. [ 4 ] [ 5 ] Как комплекс FKBP-Tacrolimus, так и комплекс циклоспорина-циклофилина ингибируют фосфатазу , называемую кальциневрином , таким образом блокируя трансдукцию сигнала в пути трансдукции T- лимфоцитов . [ 6 ] Эта терапевтическая роль не связана с его пролилазомеразной активностью. FKBP25 является ядерным FKBP, который не специфически связывается с ДНК и играет роль в репарации ДНК. [ 7 ]
Использовать в качестве инструмента биологического исследования
[ редактировать ]FKBP (FKBP1A) обычно не образует димер, но будет димеризоваться в присутствии FK1012 , производного препарата Tacrolimus (FK506). Это сделало его полезным инструментом для химически индуцированных применений димеризации , где его можно использовать для манипулирования локализацией белка, сигнальных путей и активации белка. [ 8 ]
Примеры
[ редактировать ]Человеческие гены, кодирующие белки в этом семействе, включают:
- AIP ; AIPL1
- Fkbpl ; Fkbp1a ; Fkbp1b ; FKBP2 ; FKBP3 ; FKBP4 ; FKBP5 ; FKBP6 ; FKBP7 ; FKBP8 ; FKBP9 ; FKBP10 ; FKBP11 ; FKBP14 ; FKBP15 ; [ 9 ]
Ген с неясным статусом (может быть псевдоген ):
- FKBP1C [ 10 ]
Pseudogenes у людей:
- Loc541473; FKBP9L;
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Siekierka JJ, Hung Sh, Poe M, Lin CS, Sigal NH (октябрь 1989). «Цитозольный связывающий белок для иммуносупрессанта FK506 обладает активностью пептидилпролил изомеразы, но отличается от циклофилина». Природа . 341 (6244): 755–7. Bibcode : 1989natur.341..755s . doi : 10.1038/3417555A0 . PMID 2477714 . S2CID 4363530 .
- ^ Balbach J, Schmid FX (2000). «Изомеризация пролина и ее катализ в складывании белка». В боли RH (ред.). Механизмы складывания белка (2 -е изд.). Оксфорд: издательство Оксфордского университета. С. 212–237. ISBN 0-19-963789-X .
- ^ Ван Т., Донахо П.К., Зервос как (июль 1994 г.). «Специальное взаимодействие рецепторов I типа I семейства TGF-бета с иммунофилином FKBP-12». Наука . 265 (5172): 674–6. Bibcode : 1994sci ... 265..674W . doi : 10.1126/science.7518616 . PMID 7518616 .
- ^ Mayer AD, Dmitrewski J, Squifflet JP, Besse T, Grabensee B, Klein B, Eigler FW, Heemann U, Pichlmayr R, Behrend M, Vanrenterghem Y, Donck J, Van Hooff J, Christiaans M, Morales, Andres A, Johnson RW, Short C, Buchholz B, Rehmert N, Land W, Schleibner S, Forsythe JL, Talbot D, Pohanka E (август 1997 г.). «Многоцентровое рандомизированное исследование, сравнивающее такролимус (FK506) и циклоспорин в профилактике отторжения почечного аллотрансплантата: отчет европейской многоцентровой почечной исследовательской группы европейского такролимуса» . Трансплантация . 64 (3): 436–43. doi : 10.1097/00007890-199708150-00012 . PMID 9275110 .
- ^ Пракаш, Аджит; Раджан, Шрикант; Yoon, Ho Sup (апрель 2016 г.). «Кристаллическая структура связывающего домена FK506 человека FKBP25 человека в комплексе с FK506» . Белковая наука . 25 (4): 905–910. doi : 10.1002/pro.2875 . ISSN 1469-896x . PMC 4941220 . PMID 26749369 .
- ^ Liu J, Farmer JD, Lane WS, Friedman J, Weissman I, Schreiber SL (август 1991). «Кальциневрин является общей мишенью комплексов циклофилина-циклоспорина А и FKBP-FK506». Клетка . 66 (4): 807–15. doi : 10.1016/0092-8674 (91) 90124-H . PMID 1715244 . S2CID 22094672 .
- ^ Пракаш, Аджит; Шин, Джун; Раджан, Шрикант; Yoon, Ho Sup (2016-04-07). «Структурная основа распознавания нуклеиновых кислот с помощью FK506-связывающего белка 25 (FKBP25), ядерного иммунофилина» . Исследование нуклеиновых кислот . 44 (6): 2909–2925. doi : 10.1093/nar/gkw001 . ISSN 1362-4962 . PMC 4824100 . PMID 26762975 .
- ^ Феган, а; Белый, б; Карлсон, JC; Вагнер, Кр (9 июня 2010 г.). «Химически контролируемая сборка белка: методы и применение». Химические обзоры . 110 (6): 3315–36. doi : 10.1021/cr8002888 . PMID 20353181 .
- ^ «Генеральная группа: FKBP пролила изомеразы (FKBP)» . Комитет по номенклатуру Хьюго .
- ^ «Символ отчет для fkbp1c» . Комитет по номенклатуру Хьюго .
Внешние ссылки
[ редактировать ]