Jump to content

Имидазолглицеринфосфатдегидратаза

имидазолглицеринфосфатдегидратаза
Идентификаторы
Номер ЕС. 4.2.1.19
Номер CAS. 9024-35-5
Базы данных
ИнтЭнк вид IntEnz
БРЕНДА БРЕНДА запись
Экспаси Просмотр NiceZyme
КЕГГ КЕГГ запись
МетаЦик метаболический путь
ПРЯМОЙ профиль
PDB Структуры RCSB PDB PDBe PDBsum
Генная онтология АмиГО / QuickGO
Поиск
PMCarticles
PubMedarticles
NCBIproteins
Имидазолглицеринфосфатдегидратаза
кристаллическая структура имидазолглицеролфосфатдегидратазы
Идентификаторы
Символ ИГПД
Пфам PF00475
Пфам Клан CL0329
ИнтерПро IPR000807
PROSITE PDOC00738
ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 1rhy / SCOPe / СУПФАМ
Доступные белковые структуры:
Pfam  structures / ECOD  
PDBRCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsumstructure summary

Фермент . имидазолглицеролфосфатдегидратаза ( КФ 4.2.1.19 ) катализирует химическую реакцию

D -эритро-1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфат 3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропилфосфат + H 2 O

Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , в частности гидролиаз, которые расщепляют связи углерод-кислород. Систематическое название этого класса ферментов — D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфатгидролиаза [3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропилфосфатобразующая] . Другие широко используемые названия включают дегидратазу IGP и D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфатгидролиазу . Этот фермент участвует в метаболизме гистидина, поскольку он участвует в 6-м этапе биосинтеза гистидина как часть девятиэтапного циклического пути.

Существует две изоформы ИГПД; ИГПД1 и ИГПД2. Различные изоформы высококонсервативны: между ними различаются всего 8 аминокислот. Эти тонкие различия, однако, влияют на их активность, но пока неизвестно, как.

У большинства организмов IGPD представляет собой монофункциональный белок массой около 22–29 кДа . У некоторых бактерий, таких как Escherichia coli , это С-концевой домен бифункционального белка, который включает домен гистидинол-фосфатазы . [ 1 ] В E. coli это белок, кодируемый геном hisB . [ 2 ]

Торможение

[ редактировать ]

Некоторые соединения, ингибирующие IGPD, использовались в качестве гербицидов , поскольку у животных нет этого белка. Одним из таких ингибиторов является 3-амино-1,2,4-триазол (3-АТ), который также использовался в качестве конкурентного ингибитора продукта дрожжевого гена HIS3 (другой IGPD), например, в дрожжевых двух- гибридная система . [ 3 ] [ 4 ]

Структурные исследования

[ редактировать ]

По состоянию на конец 2007 года 3 структуры для этого класса ферментов были решены PDB с кодами доступа 1RHY , 2AE8 и 2F1D . [ 5 ]

  1. ^ Карломаньо М.С., Кьяриотти Л., Алифано П., Наппо А.Г., Бруни CB (октябрь 1988 г.). «Структура и функции гистидиновых оперонов Salmonella typhimurium и Escherichia coli K-12». Дж. Мол. Биол . 203 (3): 585–606. дои : 10.1016/0022-2836(88)90194-5 . ПМИД   3062174 .
  2. ^ Брилли, М.; Фани, Р. (2004). «Молекулярная эволюция генов hisB». Журнал молекулярной эволюции . 58 (2): 225–237. Бибкод : 2004JMolE..58..225B . дои : 10.1007/s00239-003-2547-x . ПМИД   15042344 . S2CID   1684458 .
  3. ^ Бреннан, МБ; Струль, К. (25 января 1980 г.). «Механизмы повышения экспрессии дрожжевого гена в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 136 (3): 333–338. дои : 10.1016/0022-2836(80)90377-0 . ISSN   0022-2836 . ПМИД   6990004 .
  4. ^ Кэгни, Г.; Утц, П.; Филдс, С. (2000). «Высокопроизводительный скрининг белок-белковых взаимодействий с использованием двухгибридного анализа». Применение химерных генов и гибридных белков. Часть C: Белко-белковые взаимодействия и геномика . Методы энзимологии. Том. 328. стр. 3–14. дои : 10.1016/s0076-6879(00)28386-9 . ISBN  9780121822293 . ISSN   0076-6879 . ПМИД   11075334 .
  5. ^ Глинн С.Э., Бейкер П.Дж., Седельникова С.Е., Дэвис К.Л., Идсфорт Т.К., Леви К.В., Роджерс Х.Ф., Блэкберн Г.М., Хоукс Т.Р., Винер Р., Райс Д.В. (2005). «Строение и механизм имидазолглицеринфосфатдегидратазы» . Структура . 13 (12): 1809–17. дои : 10.1016/j.str.2005.08.012 . ПМИД   16338409 .

Дальнейшее чтение

[ редактировать ]


Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 9471c6759b4f54218b38f47d84c1931d__1719011400
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/94/1d/9471c6759b4f54218b38f47d84c1931d.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)