Имидазолглицеринфосфатдегидратаза
| имидазолглицеринфосфатдегидратаза | |||
|---|---|---|---|
 | |||
| Идентификаторы | |||
| Номер ЕС. | 4.2.1.19 | ||
| Номер CAS. | 9024-35-5 | ||
| Базы данных | |||
| ИнтЭнк | вид IntEnz | ||
| БРЕНДА | БРЕНДА запись | ||
| Экспаси | Просмотр NiceZyme | ||
| КЕГГ | КЕГГ запись | ||
| МетаЦик | метаболический путь | ||
| ПРЯМОЙ | профиль | ||
| PDB Структуры | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||
| Генная онтология | АмиГО / QuickGO | ||
| |||
| Имидазолглицеринфосфатдегидратаза | |||
|---|---|---|---|
 кристаллическая структура имидазолглицеролфосфатдегидратазы | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | ИГПД | ||
| Пфам | PF00475 | ||
| Пфам Клан | CL0329 | ||
| ИнтерПро | IPR000807 | ||
| PROSITE | PDOC00738 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1rhy / SCOPe / СУПФАМ | ||
| |||
Фермент . имидазолглицеролфосфатдегидратаза ( КФ 4.2.1.19 ) катализирует химическую реакцию
- D -эритро-1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфат 3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропилфосфат + H 2 O
Этот фермент принадлежит к семейству лиаз , в частности гидролиаз, которые расщепляют связи углерод-кислород. Систематическое название этого класса ферментов — D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфатгидролиаза [3-(имидазол-4-ил)-2-оксопропилфосфатобразующая] . Другие широко используемые названия включают дегидратазу IGP и D - эритро -1-(имидазол-4-ил)глицерин-3-фосфатгидролиазу . Этот фермент участвует в метаболизме гистидина, поскольку он участвует в 6-м этапе биосинтеза гистидина как часть девятиэтапного циклического пути.
Существует две изоформы ИГПД; ИГПД1 и ИГПД2. Различные изоформы высококонсервативны: между ними различаются всего 8 аминокислот. Эти тонкие различия, однако, влияют на их активность, но пока неизвестно, как.
У большинства организмов IGPD представляет собой монофункциональный белок массой около 22–29 кДа . У некоторых бактерий, таких как Escherichia coli , это С-концевой домен бифункционального белка, который включает домен гистидинол-фосфатазы . [ 1 ] В E. coli это белок, кодируемый геном hisB . [ 2 ]
Торможение
[ редактировать ]Некоторые соединения, ингибирующие IGPD, использовались в качестве гербицидов , поскольку у животных нет этого белка. Одним из таких ингибиторов является 3-амино-1,2,4-триазол (3-АТ), который также использовался в качестве конкурентного ингибитора продукта дрожжевого гена HIS3 (другой IGPD), например, в дрожжевых двух- гибридная система . [ 3 ] [ 4 ]
Структурные исследования
[ редактировать ]По состоянию на конец 2007 года 3 структуры для этого класса ферментов были решены PDB с кодами доступа 1RHY , 2AE8 и 2F1D . [ 5 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Карломаньо М.С., Кьяриотти Л., Алифано П., Наппо А.Г., Бруни CB (октябрь 1988 г.). «Структура и функции гистидиновых оперонов Salmonella typhimurium и Escherichia coli K-12». Дж. Мол. Биол . 203 (3): 585–606. дои : 10.1016/0022-2836(88)90194-5 . ПМИД 3062174 .
- ^ Брилли, М.; Фани, Р. (2004). «Молекулярная эволюция генов hisB». Журнал молекулярной эволюции . 58 (2): 225–237. Бибкод : 2004JMolE..58..225B . дои : 10.1007/s00239-003-2547-x . ПМИД 15042344 . S2CID 1684458 .
- ^ Бреннан, МБ; Струль, К. (25 января 1980 г.). «Механизмы повышения экспрессии дрожжевого гена в Escherichia coli». Журнал молекулярной биологии . 136 (3): 333–338. дои : 10.1016/0022-2836(80)90377-0 . ISSN 0022-2836 . ПМИД 6990004 .
- ^ Кэгни, Г.; Утц, П.; Филдс, С. (2000). «Высокопроизводительный скрининг белок-белковых взаимодействий с использованием двухгибридного анализа». Применение химерных генов и гибридных белков. Часть C: Белко-белковые взаимодействия и геномика . Методы энзимологии. Том. 328. стр. 3–14. дои : 10.1016/s0076-6879(00)28386-9 . ISBN 9780121822293 . ISSN 0076-6879 . ПМИД 11075334 .
- ^ Глинн С.Э., Бейкер П.Дж., Седельникова С.Е., Дэвис К.Л., Идсфорт Т.К., Леви К.В., Роджерс Х.Ф., Блэкберн Г.М., Хоукс Т.Р., Винер Р., Райс Д.В. (2005). «Строение и механизм имидазолглицеринфосфатдегидратазы» . Структура . 13 (12): 1809–17. дои : 10.1016/j.str.2005.08.012 . ПМИД 16338409 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Эймс Б.Н. (1957). «Биосинтез гистидина; D-эритроимидазолглицеролфосфатдегидраза» . Ж. Биол. Хим . 228 (1): 131–43. дои : 10.1016/S0021-9258(18)70696-0 . ПМИД 13475302 .
