Коэффициент инбридинга
Коэффициент инбридинга ( COI ) - это число, измеряющее, насколько инбредь является человеком. В частности, вероятность того , что два аллеля в любом месте человека идентичны спускаются спуска с общего предка двух родителей. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] Более высокий COI сделает черты потомства более предсказуемыми, но также увеличит риск проблем со здоровьем. При размножении собак рекомендуется сохранить COI менее 5%; Однако у некоторых породов это может быть невозможно без постороннего скрещивания . [ 5 ]
Расчет
[ редактировать ]Говорят, что человек инбредь, если есть петля в его родословной . Цикл определяется как путь, который проходит от человека до общего предка через одного родителя и обратно к другому родителю, не проходя через какого -либо человека дважды. Количество петель всегда является количеством общих предков, которые есть родители. Если человек инбредь, коэффициент инбридинга рассчитывается путем суммирования всех вероятностей, которые человек получает один и тот же аллель со стороны своего отца и матери. Поскольку у каждого человека есть 50% шанс передать аллель следующему поколению, формула зависит от 0,5, поднятой до силы, однако многие поколения отделяют человека от общего предка его родителей, как со стороны отца, так и на стороне матери Полем Это количество поколений может быть рассчитано путем подсчета того, сколько людей лежит в цикле, определенной ранее. Таким образом, коэффициент инбридинга (F) отдельного x может быть рассчитана с помощью следующей формулы: [ 6 ] [ 1 ]
где количество людей в вышеупомянутой петле,
и является коэффициентом инбридинга общего предка родителей X.
Чтобы привести пример, рассмотрим следующую родословную.
На этой родословной графике G является потомством C и F, а C является биологическим дядей Ф., чтобы найти коэффициент инбридинга G, сначала найдите петлю, которая ведет от G к общему предку через одного из родителей и обратно вниз. другому родителю, не проходя через одного и того же человека дважды. В этой таблице есть только две петли, так как есть только 2 общих предка C и F. Петли - G - C - A - D - F и G - C - B - D - F, оба из которых имеют 5 члены
Потому что общие предки родителей (A и B) сами не являются инбредными, Полем Следовательно, коэффициент инбридинга отдельных G .
Если родители человека сами не являются инбредными, коэффициент инбридинга человека составляет половину коэффициента отношений между родителями. Это можно проверить в предыдущем примере, так как 12,5% составляет половину 25%, коэффициент взаимосвязи между дядей и племянницей.
Таблица коэффициентов инбридинга
[ редактировать ]| Поколения | Коэффициент инбридинга (F) |
|---|---|
| 1 | 25% |
| 2 | 37.5% |
| 3 | 50% |
| 4 | 59.375% |
| 5 | 67.1875% |
| 6 | 73.4375% |
| 7 | 78.5156% |
| 8 | 82.6172% |
| 9 | 85.9375% |
| 10 | 88.623% |
| 11 | 90.7959% |
| 12 | 92.5537% |
| 13 | 93.9758% |
| 14 | 95.1263% |
| 15 | 96.0571% |
| 16 | 96.8102% |
| 17 | 97.4194% |
| 18 | 97.9122% |
| 19 | 98.3109% |
| 20 | 98.6335% А |
^ На данный момент люди считаются частью инбредного штамма , и каждый человек может эффективно считаться клонами .
Смотрите также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный Райт, Сьюалл (1922), «Коэффициенты инбридинга и отношений», American Naturalist , Vol. 56, с. 330–338, doi : 10.1086/279872
- ^ Redei, George P. (2004), Энциклопедический словарь генетики, геномики и протеомики , John Wiley and Sons, Inc.
- ^ Чарльзворт, Дебора (2005), «Инбридинг», Энциклопедия наук о жизни , John Wiley and Sons, Inc.
- ^ Falconer, DS; Mackay, TFC (1996), Введение в количественную генетику (4 изд.), Лонгман
- ^ Кэрол Беухат (4 июня 2015 г.). «COI FAQS: понимание коэффициента инбридинга» . Институт собачьей биологии . Получено 5 февраля 2024 года .
- ^ Schonewald-Cox, CM, SM Chambers, B. Macbryde и L. Thomas (Eds.). 1983. Генетика и сохранение. Бенджамин/Каммингс, Менло Парк, Калифорния.