Аполипопротеин C-IV

АПОК4
Идентификаторы
Псевдонимы	APOC4 , APO-CIV, APOC-IV, аполипопротеин C4
Внешние идентификаторы	Опустить : 600745 ; МГИ : 87878 ; Гомологен : 1245 ; Генные карты : APOC4 ; ОМА : APOC4 — ортологи
showМестоположение гена ( человек )
Chr.	Chromosome 19 (human)
End	44,945,496 bp
showМестоположение гена ( Мышь )
Chr.	Chromosome 7 (mouse)
End	19,415,404 bp
show экспрессии РНК Характер
	Top expressed in
	right lobe of liver; ; testicle; ; mucosa of transverse colon; ; sural nerve; ; left adrenal cortex; ; right adrenal gland; ; right ovary; ; ventricular zone; ; right adrenal cortex; ; gallbladder;
	Top expressed in
	left lobe of liver; ; gallbladder; ; adrenal gland; ; fetal liver hematopoietic progenitor cell; ; yolk sac; ; sexually immature organism; ; human fetus; ; embryo; ; morula; ; stomach;
	More reference expression data
	n/a
showГенная онтология
Molecular function	lipid transporter activity;
Cellular component	high-density lipoprotein particle; extracellular region; very-low-density lipoprotein particle;
Biological process	lipid transport; positive regulation of sequestering of triglyceride; triglyceride homeostasis; lipid metabolism; very-low-density lipoprotein particle assembly; very-low-density lipoprotein particle clearance;
	Sources:Amigo / QuickGO
hideОртологи
	346
	11425
	ENSG00000267467
	ENSMUSG00000074336
	P55056
	Q61268
	НМ_001646
	НМ_007385
	НП_001637
	НП_031411
	Викиданные
Просмотр/редактирование человека	Просмотр/редактирование мыши

Аполипопротеин C-IV , также известный как аполипопротеин C4 , представляет собой белок , который у человека кодируется APOC4 геном . ^[5]^[6]

Функция

APOC4 является членом аполипопротеина C. семейства генов Он экспрессируется в печени и имеет предсказанную структуру белка, характерную для других генов этого семейства. APOC4 представляет собой ген размером 3,3 т.п.н., состоящий из 3 экзонов и 2 интронов; он расположен на расстоянии 0,5 т.п.н. 5' от гена APOC2 . ^[5]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000267467 – Ensembl , май 2017 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074336 – Ensembl , май 2017 г.
^ «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
^ Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: аполипопротеин C-IV» .
^ Аллан С.М., Уокер Д., Сегрест Дж.П., Тейлор Дж.М. (июль 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового гена человека (APOC4) в локусе генов аполипопротеина E, CI и C-II». Геномика . 28 (2): 291–300. дои : 10.1006/geno.1995.1144 . ПМИД 8530039 .

Внешние ссылки

человека Местоположение генома APOC4 и страница сведений о гене APOC4 в браузере генома UCSC .

Дальнейшее чтение

Ким Э., Ли К., Лью С. и др. (2008). «Экспрессия аполипопротеина C-IV регулируется гамма-комплексом рецептора, активируемого пролифератором Ku-антигена и пероксисомы, и коррелирует со стеатозом печени» . Дж. Гепатол . 49 (5): 787–98. дои : 10.1016/j.jhep.2008.06.029 . ПМЦ 2644636 . ПМИД 18809223 .
Буркхардт Р., Кенни Э.Э., Лоу Дж.К. и др. (2008). «Общие SNP в HMGCR у микронезийцев и белых людей, связанные с уровнями холестерина ЛПНП, влияют на альтернативный сплайсинг экзона 13» . Артериосклер. Тромб. Васк. Биол . 28 (11): 2078–84. дои : 10.1161/ATVBAHA.108.172288 . ПМЦ 2764366 . ПМИД 18802019 .
Уиллер С.Дж., Санна С., Джексон А.У. и др. (2008). «Недавно идентифицированные локусы, влияющие на концентрацию липидов и риск ишемической болезни сердца» . Нат. Жене . 40 (2): 161–9. дои : 10.1038/ng.76 . ПМК 5206900 . ПМИД 18193043 .
Мак П.А., Лаффит Б.А., Дерумо С. и др. (2002). «Регулируемая экспрессия кластера генов аполипопротеина E / CI / C-IV / C-II в макрофагах мыши и человека. Критическая роль альфа- и бета-рецепторов ядерной печени X» . Ж. Биол. Хим . 277 (35): 31900–8. дои : 10.1074/jbc.M202993200 . ПМИД 12032151 .
Лю Т, Цянь В.Дж., Гриценко М.А. и др. (2005). «Анализ N-гликопротеома плазмы человека методом иммуноаффинного вычитания, химии гидразидов и масс-спектрометрии» . J. Протеом Рез . 4 (6): 2070–80. дои : 10.1021/pr0502065 . ПМК 1850943 . ПМИД 16335952 .
Катиресан С., Уиллер С.Дж., Пелосо Г.М. и др. (2009). «Общие варианты в 30 локусах способствуют полигенной дислипидемии» . Нат. Жене . 41 (1): 56–65. дои : 10.1038/ng.291 . ПМЦ 2881676 . ПМИД 19060906 .
Мосбругер Т.Л., Дуггал П., Годерт Дж.Дж. и др. (2010). «Крупномасштабный анализ генов-кандидатов спонтанного клиренса вируса гепатита С» . Дж. Заразить. Дис . 201 (9): 1371–80. дои : 10.1086/651606 . ПМЦ 2853721 . ПМИД 20331378 .
Кен-Дрор Дж., Талмуд П.Дж., Хамфрис С.Е., Дренос Ф. (2010). «Генотипы кластера генов APOE/C1/C4/C2, гаплотипы и уровни липидов в проспективном риске ишемической болезни сердца среди здоровых мужчин в Великобритании» . Молекулярная медицина . 16 (9–10): 389–99. дои : 10.2119/molmed.2010.00044 . ПМЦ 2935949 . ПМИД 20498921 .
Маркес-Видаль П., Бочуд М., Пакко Ф. и др. (2010). «Нет взаимодействия между потреблением алкоголя и генами, связанными с ЛПВП, на уровень холестерина ЛПВП». Атеросклероз . 211 (2): 551–7. doi : 10.1016/j.atherosclerosis.2010.04.001 . ПМИД 20430392 .
Талмуд П.Дж., Дренос Ф., Шах С. и др. (2009). «Сигналы геноцентрической ассоциации липидов и аполипопротеинов, идентифицированные с помощью HumanCVD BeadChip» . Являюсь. Дж. Хум. Жене . 85 (5): 628–42. дои : 10.1016/j.ajhg.2009.10.014 . ПМК 2775832 . ПМИД 19913121 .
Дренос Ф., Талмуд П.Дж., Касас Дж.П. и др. (2009). «Комплексные ассоциации генотипов с множественными биомаркерами крови, связанные с риском ишемической болезни сердца» . Хм. Мол. Жене . 18 (12): 2305–16. дои : 10.1093/hmg/ddp159 . ПМЦ 2685759 . ПМИД 19336475 .
Катиресан С., Меландер О., Гуидуччи С. и др. (2008). «Шесть новых локусов, связанных с холестерином липопротеинов низкой плотности, холестерином липопротеинов высокой плотности или триглицеридами в крови у людей» . Нат. Жене . 40 (2): 189–97. дои : 10.1038/ng.75 . ПМЦ 2682493 . ПМИД 18193044 .
Манконе С., Амикон Л., Фимиа Г.М. и др. (2007). «Протеомный анализ липопротеинов очень низкой плотности человека с помощью двумерного гель-электрофореза и MALDI-TOF/TOF». Протеомика . 7 (1): 143–54. дои : 10.1002/pmic.200600339 . ПМИД 17154273 . S2CID 41502305 .
Лоу Дж.К., Маллер Дж.Б., Пеер И. и др. (2009). Гибсон Дж. (ред.). «Полногеномные исследования ассоциаций в изолированной популяции основателей с тихоокеанского острова Косраэ» . ПЛОС Генет . 5 (2): e1000365. дои : 10.1371/journal.pgen.1000365 . ПМЦ 2628735 . ПМИД 19197348 .
Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта полноразмерной кДНК Национального института здравоохранения: Коллекция генов млекопитающих (MGC)» . Геном Рез . 14 (10Б): 2121–7. дои : 10.1101/гр.2596504 . ПМК 528928 . ПМИД 15489334 .
Камбох М.И., Астон CE, Хамман РФ (2000). «Изменение последовательности ДНК в гене аполипопротеина C4 человека и его влияние на липидный профиль плазмы». Атеросклероз . 152 (1): 193–201. дои : 10.1016/S0021-9150(99)00459-1 . ПМИД 10996355 .
Клос К.Л., Синг К.Ф., Бурвинкль Э. и др. (2006). «Последовательное влияние генов, участвующих в обратном транспорте холестерина, на уровни липидов и аполипопротеинов в плазме у участников CARDIA» . Артериосклер. Тромб. Васк. Биол . 26 (8): 1828–36. дои : 10.1161/01.ATV.0000231523.19199.45 . ПМИД 16763159 .
Штраусберг Р.Л., Фейнгольд Е.А., Граус Л.Х. и др. (2002). «Получение и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 99 (26): 16899–903. Бибкод : 2002PNAS...9916899M . дои : 10.1073/pnas.242603899 . ПМК 139241 . ПМИД 12477932 .
Котите Л., Чжан Л.Х., Ю З. и др. (2003). «Человеческий апоС-IV: выделение, характеристика и иммунохимическая количественная оценка плазмы и липопротеинов плазмы» . Дж. Липид Рес . 44 (7): 1387–94. doi : 10.1194/jlr.M300087-JLR200 . ПМИД 12700345 .

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в свободном доступе .

Эта статья о гене человека й хромосоме незавершена в 19 - . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[refGRCh38Ensembl-1] Jump up to: ^а ^б ^с GRCh38: Версия Ensembl 89: ENSG00000267467 – Ensembl , май 2017 г.

[refGRCm38Ensembl-2] Jump up to: ^а ^б ^с GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000074336 – Ensembl , май 2017 г.

[3] «Ссылка на Human PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[4] «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .

[entrez-5] Jump up to: ^а ^б «Ген Энтрез: аполипопротеин C-IV» .

[pmid8530039-6] Аллан С.М., Уокер Д., Сегрест Дж.П., Тейлор Дж.М. (июль 1995 г.). «Идентификация и характеристика нового гена человека (APOC4) в локусе генов аполипопротеина E, CI и C-II». Геномика . 28 (2): 291–300. дои : 10.1006/geno.1995.1144 . ПМИД 8530039 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

v т и Липиды : метаболизм липопротеиновых частиц .
липопротеинов Классы частиц и подклассы	доставка ТГ : Хиломикрон ЛПОНП доставка C и CE : IDL ЛПНП фунт ЛПНП СД ЛПНП Лп(а) ЛПВП Остаточный холестерин
Аполипопротеины	АПОА 1 2 4 5 АПОБ АПОК 1 2 3 4 И Т. Д АПОЕ АПОН ПОГОДА САА1
Внеклеточные ферменты	LCAT ЛИПК ЛПЛ
Белки-переносчики липидов	CETP МТТП ПЛТП
Рецепторы клеточной поверхности	ЛПВП: SCARB1 ИДЛ: ЛРП ЛРП1 ЛРП1Б ЛРП2 ЛРП3 ЛРП4 ЛРП5 ЛРП5Л ЛРП6 ЛРП8 ЛРП10 GMP11 ЛРП12 ЛПНП: ЛПНП LRPAP1
АТФ-связывание кассетный транспортер	АБСА1 ABCG5 ABCG8