Jump to content

Дэвид Гудселл

Дэвид С. Гудселл — доцент Исследовательского института Скриппса. [1] и профессор-исследователь в Университете Рутгерса, Нью-Джерси [2] (совместное назначение). Он особенно известен своими акварельными изображениями интерьеров камер. [3] [4]

Дэвид С. Гудселл на стенде банка данных белков RCSB в 2013 году.

Образование [ править ]

Дэвид Гудселл получил степень бакалавра биологии и химии в Калифорнийском университете в Ирвайне . [1] После этого он защитил докторскую диссертацию по рентгеновской кристаллографии ДНК , в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе которую завершил в 1987 году. [1] [5]

Исследования [ править ]

После получения докторской степени он работал структурным биологом в Научно-исследовательском институте Скриппса (с двухлетним периодом работы в Калифорнийском университете в 1992-94 годах). [1] Темы его исследований включали использование структурной биологии и молекулярно-динамического моделирования для исследования симметрии белковых олигомеров , белок-белковых взаимодействий и компьютерного дизайна лекарств . В частности, он является разработчиком AutoDock , наиболее широко используемой программы, используемой для молекулярного стыковки . [6] Его основными направлениями исследований являются лекарственная устойчивость ВИЧ , а также структура и функции бактериальных клеток . [7]

Иллюстрация [ править ]

Пример отдельного белка: каскадный надзорный комплекс бактериальной иммунной системы CRISPR типа I из Escherichia coli (2015). Cascade Белковый комплекс (синий), связанный с направляющей цепью crRNA (оранжевый). ( PDB : 4tvx )
Пример молекулярного ландшафта: вирус Зика (2016). Вирусы сверху и слева с белками оболочки (красный), мембранными белками (пурпурный), липидной мембраной (светло-фиолетовый), геномом РНК (желтый) и капсидными белками (оранжевый). Целевая клетка-хозяин внизу справа с рецепторами на поверхности клетки (зеленый). Молекулы плазмы крови (желтый).

Гудселл разработал фирменный стиль научного рисунка. Он начал рисовать в раннем детстве, но не изучал искусство в колледже. [8] В аспирантуре Гудселл заинтересовался научной иллюстрацией , когда писал программы молекулярной графики для визуализации структур белков и ДНК . [8]

В фирменном стиле Goodsell обычно используются очень плоские штрихи с яркими и простыми цветовыми схемами . [9] Как это типично для медицинской иллюстрации, изображения представляют собой упрощенные изображения объекта, сохраняющие при этом точность важных характеристик. [10] [11] Его иллюстрации делятся на две категории: отдельные белки и клеточные панорамы.

Его изображения отдельных белков, как правило, представляют собой компьютерные изображения белков, заполненные заштрихованными клетками , часто с вырезами, чтобы показать внутренние сайты связывания и кофакторы . И наоборот, его иллюстрации клеточных интерьеров (иногда называемые молекулярными ландшафтами) нарисованы вручную акварелью. [12] Обычно они представляют собой срезы клетки с сильно упрощенными белковыми структурами в плоском стиле, позволяющие отобразить общую организацию без излишней детализации. [13] Внутренности этих ячеек часто отображаются с эффективным 1 000 000-кратным увеличением для обеспечения единообразия. [14] [15] Таким образом, картины имеют единый стиль, призванный сделать интерпретацию простой и максимально интуитивной. [16]

Его иллюстрации публикуются в серии «Молекула месяца» Protein Data Bank (PDB), архива белковых структур . [8] Его иллюстрации используются в качестве учебного пособия. [17] в учебниках, в научных публикациях, [10] и в качестве обложки журнала. [18]

Процесс [ править ]

Иллюстрации Гудселла для отдельных белков создаются непосредственно на основе решенных белковых структур, хранящихся в PDB, с использованием специальных компьютерных изображений, которые он написал на Фортране (сейчас выпущен как онлайн-инструмент для иллюстраций). [19]

Представления крупных макромолекулярных комплексов или переполненных клеточных сред требуют интерпретации и синтеза множества различных типов научных изображений. [20] К ним относятся рентгеновская кристаллография и ЯМР белковых компонентов, криоэлектронная томография для более крупных комплексов, а также световая микроскопия сверхвысокого разрешения и электронная микроскопия клеточной среды. [5] [21] В этих случаях основное внимание уделяется изображению относительных масштабов, ориентаций и взаимодействий между компонентами. [10]

Награды и признание [ править ]

В 2022 году Гудселл стал лауреатом Премии Карла Брендена. [22] Эта награда присуждается выдающемуся исследователю белков, который также внес исключительный вклад в области образования и/или обслуживания.

Библиография [ править ]

Помимо научных работ, Гудселл является автором нескольких научных книг с акцентом на иллюстрации: [10] [23]

  • Атомные доказательства: взгляд на молекулярную основу жизни (Springer International, 2016)
  • Бионанотехнология: уроки природы (Дж. Уайли и сыновья, 2004 г.)
  • Наша молекулярная природа: двигатели, машины и сообщения тела (Springer-Verlag, 1996)
  • Механизм жизни (Springer-Verlag, 1993).

Ссылки [ править ]

  1. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д «Резюме Гудселла, Дэвид» . vivo.scripps.edu . Проверено 11 июля 2019 г.
  2. ^ «Профиль: Дэвид Гудселл» . www.researchwithrutgers.com . Университет Рутгерса . Проверено 13 июля 2019 г.
  3. ^ Коэн, Джон (11 апреля 2019 г.). «Познакомьтесь с ученым-художником, который превращает смертельные вирусы в прекрасные произведения искусства» . Наука . doi : 10.1126/science.aax6641 .
  4. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б Тейлор, Мишель (17 июня 2019 г.). «Пересечение искусства и науки» . Лабораторное оборудование . Архивировано из оригинала 18 июня 2019 года . Проверено 11 июля 2019 г.
  5. ^ Соуза, Сержио Филипе; Фернандес, Педро Александрино; Рамос, Мария Жуан (2006). «Стыковка белка и лиганда: текущее состояние и будущие проблемы». Белки: структура, функции и биоинформатика . 65 (1): 15–26. дои : 10.1002/prot.21082 . ISSN   1097-0134 . ПМИД   16862531 . S2CID   21569704 .
  6. ^ Гудселл, Дэвид. «Домашняя страница Goodsell: Наука» . scripps.edu . Проверено 20 июля 2019 г.
  7. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с Миллер, Мэри К. «Интервью с Дэвидом Гудселлом» . exploratorium.edu . Журнал «Эксплораториум» . Проверено 3 апреля 2015 г.
  8. ^ Заковиц, Мэгги (28 мая 2016 г.). «Это вирус Зика в действии, нарисованный учёным-художником» . NPR.org .
  9. ^ Jump up to: Перейти обратно: а б с д Коэн, Джон (11 апреля 2019 г.). «Познакомьтесь с ученым-художником, который превращает смертельные вирусы в прекрасные произведения искусства» . Наука .
  10. ^ Гудселл, Дэвид С.; Франзен, Маргарет А.; Герман, Тим (19 октября 2018 г.). «От атомов к клеткам: использование мезомасштабных ландшафтов для создания визуальных повествований» . Журнал молекулярной биологии . 430 (21): 3954–3968. дои : 10.1016/j.jmb.2018.06.009 . ISSN   0022-2836 . ПМК   6186495 . ПМИД   29885327 .
  11. ^ Фессенден, Марисса (21 июня 2016 г.). «Эта картина показывает, как это может выглядеть, когда вирус Зика заражает клетку» . Смитсоновский институт . Проверено 11 июля 2019 г.
  12. ^ Аугенбраун, Элиена (22 марта 2016 г.). «Превращение вируса-убийцы в отмеченное наградами произведение искусства [Видео]» . Научный американский блог .
  13. ^ Шиков, Сергей (2011). «Дэвид Гудселл: Мастер мол-арта» . www.asbmb.org . Американское общество биохимии и молекулярной биологии сегодня.
  14. ^ Гудселл, Дэвид (26 февраля 2016 г.). «Клеточные пейзажи в акварели» . Журнал биокоммуникаций . 40 (1): e6. дои : 10.5210/jbc.v40i1.6627 . ISSN   0094-2499 . ПМЦ   9138463 . ПМИД   36407827 .
  15. ^ Гудселл, Дэвид С. (2011). «Панорама эукариотической клетки» . Образование в области биохимии и молекулярной биологии . 39 (2): 91–101. дои : 10.1002/bmb.20494 . ISSN   1539-3429 . ПМИД   21445900 . S2CID   37998506 .
  16. ^ Гудселл, Дэвид С.; Франзен, Маргарет А.; Герман, Тим (19 октября 2018 г.). «От атомов к клеткам: использование мезомасштабных ландшафтов для создания визуальных повествований» . Журнал молекулярной биологии . 430 (21): 3954–3968. дои : 10.1016/j.jmb.2018.06.009 . ISSN   0022-2836 . ПМК   6186495 . ПМИД   29885327 .
  17. ^ Седерквист, Томас (2010). «Коммерческое предложение: Дэвид Гудселл» . Природная медицина . 16 (9): 943. doi : 10.1038/nm0910-943 . ISSN   1078-8956 . ПМИД   20823862 . S2CID   2731570 .
  18. ^ «Нефотореалистичная биомолекулярная иллюстрация» . ccsb.scripps.edu . Проверено 20 июля 2019 г.
  19. ^ Колдервуд, Кэтлин (8 июля 2016 г.). «Найти красоту в смертельных вирусах» . Национальное радио ABC . Проверено 11 июля 2019 г.
  20. ^ Лалли, Робин (24 февраля 2011 г.). «Искусство науки» . Рутгерс сегодня .
  21. ^ «Просветительская работа и образование» . cdn.rcsb.org . Проверено 08 января 2024 г.
  22. ^ «Автор: Дэвид Гудселл» . сайт americanscientist.org . 12 июня 2011 г. Архивировано из оригинала 12 июня 2011 г. Проверено 11 июля 2019 г.

Внешние ссылки [ править ]

Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 107ba0b300a6a45bbe6439e9fee55eb7__1717019400
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/10/b7/107ba0b300a6a45bbe6439e9fee55eb7.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
David Goodsell - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)