Вспомогательная деятельность Семейство 9
| Вспомогательная деятельность Семейство 9 | |||
|---|---|---|---|
| Идентификаторы | |||
| Символ | Aux_act_9 | ||
| Pfam | PF03443 | ||
| InterPro | IPR005103 | ||
| Кэзи | AA9 | ||
| |||
Вспомогательная деятельность Family 9 (ранее GH61) - это семейство литических полисахаридных монооксигеназ . Семья ранее была неправильно классифицирована как семейство гликозид-гидролаз 61, однако она была повторно классифицирована в марте 2013 года. [ 1 ] [ 2 ]
Известно, что AA9 является зависимым от меди, окислительным ферментом, способным расщеплять кристаллическую целлюлозу. [ 3 ] Заявление в значительной степени зависит от наличия дивалентного медного иона и редуктата, такого как галлат или аскорбат. Окислительное действие AA9 может работать либо на восстанавливающемся, либо на не редуцирующем конце глюкозных фрагментов. [ Цитация необходима ] Хотя ферменты AA9 можно найти в большом спектре биомассы, разлагающих грибки, исследования в этом семействе являются относительно новыми. [ 4 ] Эта классификация доступна на веб -сайте CAZY , [ 5 ] [ 6 ] а также обсуждается в Cazypedia, онлайн -энциклопедии активных ферментов углеводов. [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Левассер, Энтони; Друла, Элоди; Ломбард, Винсент; Coutinho, Pedro M.; Энриссат, Бернард (2013-03-21). «Расширение ферментативного репертуара базы данных CAZY для интеграции вспомогательных окислительно -восстановительных ферментов» . Биотехнология для биотоплива . 6 (1): 41. doi : 10.1186/1754-6834-6-41 . ISSN 1754-6834 . PMC 3620520 . PMID 23514094 .
- ^ Hemsworth, Glyn R; Дэвис, Гидеон Дж; Уолтон, Пол Х (2013). «Недавние понимания литических полисахарид-монооксигеназ-литических полисахаридов». Современное мнение в структурной биологии . 23 (5): 660–668. doi : 10.1016/j.sbi.2013.05.006 . PMID 23769965 .
- ^ Vaaje-Kolstad, Густав; Вестеренг, Бьёрдж; Хорн, Свейн Дж.; Лю, Чжанлиан; Чжай, Хонг; Сорли, Мортен; Eijsink, Vincent GH (2010-10-08). «Окислительный фермент, увеличивающий ферментативное преобразование непокорных полисахаридов». Наука . 330 (6001): 219–222. Bibcode : 2010sci ... 330..219V . doi : 10.1126/science.1192231 . ISSN 0036-8075 . PMID 20929773 . S2CID 206527624 .
- ^ Бей, Матье; Чжоу, Симэн; Пудевин, Латития; Энриссат, Бернард; Coutinho, Pedro M.; Беррин, Жан-Гуй; Sigoillot, Жан-Клод (2013-01-15). «Окисление цеболооолигосахаридов выявляет различия между двумя литическими полисахаридными монооксигеназами (семейство GH61) от Podospora anserina» . Прикладная и экологическая микробиология . 79 (2): 488–496. Bibcode : 2013apenm..79..488b . doi : 10.1128/aem.02942-12 . ISSN 0099-2240 . PMC 3553762 . PMID 23124232 .
- ^ "Дом" . Cazy.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (январь 2014 г.). «База данных по углеводам-активным ферментам (CAZY) в 2013 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 42 (проблема базы данных): D490–5. doi : 10.1093/nar/gkt1178 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .
- ^ «Вспомогательная деятельность семьи 9» . Cazypedia.org . Получено 2018-03-08 .
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 61» . Cazypedia.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Консорциум Cazypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет Казипедии: живая энциклопедия углеводов-активных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . PMID 29040563 .
