Jump to content

Локус количественного признака

(Перенаправлено с QTL )

Локус количественного признака ( QTL ) — локус участок ДНК с вариацией количественного признака в фенотипе популяции ( организмов ), который коррелирует . [ 1 ] QTL картируются путем определения того, какие молекулярные маркеры (такие как SNP или AFLP ) коррелируют с наблюдаемым признаком. Часто это ранний шаг в выявлении реальных генов , вызывающих вариацию признака.

Определение

[ редактировать ]

Локус количественного признака ( QTL ) представляет собой область ДНК , которая связана с определенным фенотипическим признаком , степень которого варьируется и которую можно объяснить полигенными эффектами, т. е. продуктом двух или более генов и их окружения. [ 2 ] Эти QTL часто обнаруживаются на разных хромосомах . Количество QTL, объясняющих вариации фенотипического признака, указывает на генетическую архитектуру признака. Это может указывать на то, что высота растения контролируется множеством генов с небольшим эффектом или несколькими генами с большим эффектом. [ нужна ссылка ]

Как правило, QTL лежат в основе непрерывных признаков (тех признаков, которые непрерывно изменяются, например, рост), в отличие от дискретных признаков (признаков, которые имеют два или несколько значений признака, например, рыжие волосы у людей, рецессивный признак или гладкие или морщинистые горошины, используемые Менделем ). в своих экспериментах).

Более того, один фенотипический признак обычно определяется многими генами. Следовательно, многие QTL связаны с одним признаком. Другое использование QTL — идентификация генов-кандидатов, лежащих в основе признака. Последовательность ДНК любых генов в этой области затем можно сравнить с базой данных ДНК генов, функция которых уже известна, и эта задача имеет фундаментальное значение для улучшения сельскохозяйственных культур с помощью маркеров. [ 3 ] [ 4 ]

Менделевское наследие было вновь открыто в начале 20 века. По мере распространения идей Менделя генетики начали связывать правила Менделя наследования отдельных факторов с дарвиновской эволюцией . Ранним генетикам не сразу было ясно, что плавное изменение таких признаков, как размер тела (т. е. неполное доминирование ), вызвано наследованием отдельных генетических факторов. Хотя сам Дарвин заметил, что инбредные признаки необычных голубей наследуются в соответствии с законами Менделя (хотя Дарвин на самом деле не знал об идеях Менделя, когда делал это наблюдение), не было очевидным, что эти признаки, выбранные заводчиками необычных голубей, могут аналогичным образом объяснить количественные характеристики. изменчивость в природе. [ 5 ]

Ранняя попытка Уильяма Эрнеста Касла объединить законы менделевской наследственности с теорией видообразования Дарвина вызвала идею о том, что виды становятся отличными друг от друга по мере того, как тот или иной вид приобретает новый менделевский фактор. [ 6 ] Вывод Касла был основан на наблюдении, что новые черты, которые можно изучать в лаборатории и которые демонстрируют менделевские закономерности наследования, отражают большое отклонение от дикого типа, и Касл полагал, что приобретение таких признаков является основой «прерывистой изменчивости», которая характеризует видообразование. [ 6 ] Дарвин обсуждал наследование сходных мутантных особенностей, но не считал их необходимым условием видообразования. [ 5 ] Вместо этого Дарвин использовал появление таких особенностей в размножающихся популяциях как доказательство того, что мутации могут происходить случайным образом внутри размножающихся популяций, что является центральной предпосылкой его модели отбора в природе. [ 5 ] Позже в своей карьере Касл усовершенствовал свою модель видообразования, чтобы учесть небольшие вариации, способствующие видообразованию с течением времени. Ему также удалось продемонстрировать это, путем селективного разведения лабораторных популяций крыс для получения фенотипа с капюшоном в течение нескольких поколений. [ 7 ]

Возможно, попытка Касла была первой попыткой, предпринятой в научной литературе, направить эволюцию путем искусственного отбора признака, имеющего непрерывную основную изменчивость, однако ранее эта практика широко применялась в развитии сельского хозяйства для получения домашнего скота или растений с благоприятными характеристиками из популяций, которые демонстрируют количественные вариации таких признаков, как размер тела или урожайность зерна. [ нужна ссылка ]

Работа Касла была одной из первых попыток объединить недавно вновь открытые законы менделевской наследственности с теорией эволюции Дарвина. Тем не менее, пройдет почти тридцать лет, прежде чем теоретическая основа эволюции сложных признаков будет широко формализована. [ 8 ] В раннем изложении теории эволюции непрерывной изменчивости Сьюэлл Райт , аспирант, обучавшийся у Касла, резюмировал современные взгляды на генетическую основу количественной естественной изменчивости: «По мере продолжения генетических исследований обнаруживалось, что все меньшие различия менделизируются, и на любой персонаж, достаточно исследованный, оказывалось влияние многих факторов». [ 8 ] Райт и другие формализовали теорию популяционной генетики, разработанную за предыдущие 30 лет, объясняющую, как такие черты могут наследоваться и создавать стабильно размножающиеся популяции с уникальными характеристиками. Сегодня количественная генетика признаков использует наблюдения Райта о статистических взаимосвязях между генотипом и фенотипом в семьях и популяциях, чтобы понять, как определенные генетические особенности могут влиять на вариации в природных и производных популяциях. [ нужна ссылка ]

Количественные характеристики

[ редактировать ]

Полигенное наследование означает наследование фенотипической характеристики (признака), которая связана с двумя или более генами и может быть измерена количественно. Многофакторное наследование относится к полигенному наследованию, которое также включает взаимодействие с окружающей средой. В отличие от моногенных признаков , полигенные признаки не следуют закономерностям менделевского наследования (дискретные категории). Вместо этого их фенотипы обычно варьируются по непрерывному градиенту, изображенному колоколообразной кривой . [ 9 ]

Примером полигенного признака является изменение цвета кожи человека . Несколько генов влияют на определение естественного цвета кожи человека, поэтому изменение только одного из этих генов может изменить цвет кожи незначительно, а в некоторых случаях, как в случае с SLC24A5 , умеренно. Многие заболевания с генетическими компонентами являются полигенными, включая аутизм , рак , диабет и многие другие. Большинство фенотипических характеристик являются результатом взаимодействия множества генов. [ нужна ссылка ]

Примеры болезненных процессов, которые обычно считаются результатом действия многих способствующих факторов:

Врожденный порок развития

Заболевания, возникающие у взрослых

Утверждается, что многофакторные наследственные заболевания составляют большинство генетических нарушений, поражающих человека, которые влекут за собой госпитализацию или особый уход. [ 14 ] [ 15 ]

Многофакторные черты в целом

[ редактировать ]

Признаки, контролируемые как средой, так и генетическими факторами, называются мультифакториальными. Обычно многофакторные признаки вне болезни приводят к тому, что мы считаем непрерывными характеристиками организмов, особенно человеческих, таких как: рост, [ 14 ] цвет кожи и масса тела. [ 16 ] Все эти фенотипы осложнены большим количеством компромиссов между генами и воздействием окружающей среды. [ 14 ] Описанное выше непрерывное распределение таких признаков, как рост и цвет кожи, отражает действие генов, не проявляющих типичных закономерностей доминантности и рецессивности. Вместо этого считается, что вклад каждого вовлеченного локуса аддитивен. Авторы различали этот вид наследования как полигенное , или количественное наследование . [ 17 ]

Таким образом, из-за природы полигенных признаков наследование не будет происходить по той же схеме, что и простое моногибридное или дигибридное скрещивание . [ 15 ] Полигенное наследование можно объяснить как менделевское наследование во многих локусах. [ 14 ] в результате получается признак, который нормально распространяется . Если n — количество задействованных локусов, то коэффициенты биномиального разложения ( a + b ) даст частоту распределения всех n аллелей комбинаций . При достаточно высоких значениях n это биномиальное распределение начнет напоминать нормальное распределение. С этой точки зрения болезненное состояние станет очевидным на одном из хвостов распределения после некоторого порогового значения. Будут ожидаться болезненные состояния возрастающей степени тяжести по мере того, как человек будет проходить дальше порога и от среднего значения . [ 17 ]

Наследственные заболевания и многофакторное наследование

[ редактировать ]

Мутация, приводящая к болезненному состоянию, часто является рецессивной, поэтому оба аллеля должны быть мутантными, чтобы заболевание проявлялось фенотипически. Заболевание или синдром также могут быть результатом экспрессии мутантных аллелей более чем в одном локусе. Когда задействовано более одного гена, независимо от наличия триггеров окружающей среды, мы говорим, что заболевание является результатом многофакторного наследования. [ нужна ссылка ]

Чем больше генов участвует в скрещивании, тем больше распределение генотипов будет напоминать нормальное или гауссово распределение. [ 14 ] Это показывает, что многофакторное наследование является полигенным, и генетические частоты можно предсказать с помощью полигибридного менделевского скрещивания. Другое дело — фенотипические частоты, особенно если они осложнены факторами окружающей среды. [ нужна ссылка ]

Парадигма полигенного наследования, используемая для определения мультифакториального заболевания, вызвала много разногласий. Тернпенни (2004) обсуждает, что простое полигенное наследование не может объяснить некоторые заболевания, такие как возникновение сахарного диабета I типа, и что в таких случаях считается, что не все гены вносят одинаковый вклад. [ 17 ]

Предположение о полигенном наследовании состоит в том, что все вовлеченные локусы вносят равный вклад в симптомы заболевания. Это должно привести к нормальному (гауссову) распределению генотипов. В противном случае идея полигенетического наследования не может быть поддержана для этой болезни. [ нужна ссылка ]

Вышеупомянутое является хорошо известными примерами заболеваний, имеющих как генетические, так и экологические компоненты. Другие примеры включают атопические заболевания, такие как экзема или дерматит . [ 14 ] spina bifida (открытый позвоночник) и анэнцефалия (открытый череп). [ 10 ]

Хотя шизофрения широко полагают, что биопсихиатры является многофакторно-генетической , никакие характерные генетические маркеры не были определены с какой-либо уверенностью. [ нужна ссылка ]

Если доказано, что братья и сестры пациента больны этим заболеванием, то велика вероятность того, что заболевание является генетическим. [ нужна ссылка ] и что пациент также будет генетическим носителем. Этого недостаточно, поскольку необходимо также доказать, что тип наследования неменделевский. Для этого потребуется изучить десятки, даже сотни различных семейных родословных, прежде чем будет сделан вывод о многофакторном наследовании. Часто это занимает несколько лет. [ нужна ссылка ]

Если действительно имеет место многофакторное наследование, то вероятность заражения пациента снижается только в том случае, если заболевание есть у двоюродных братьев и сестер и более дальних родственников. [ 10 ] Следует отметить, что хотя мультифакториально наследуемые заболевания имеют тенденцию передаваться в семьях, наследование не будет следовать той же схеме, что и простое моногибридное или дигибридное скрещивание . [ 15 ]

Если подозревается генетическая причина и мало что известно о заболевании, то еще предстоит выяснить, сколько именно генов участвует в фенотипическом проявлении заболевания. Как только это будет установлено, необходимо ответить на вопрос: если два человека имеют необходимые гены, почему между ними существуют различия в экспрессии? Как правило, то, что отличает этих двух людей, скорее всего, является факторами окружающей среды. Из-за сложного характера генетических исследований, необходимых для определения таких закономерностей наследования, обычно это не первое направление исследований, которое выбирают для определения этиологии. [ нужна ссылка ]

QTL для остеопороза на хромосоме 20 человека

QTL-картирование

[ редактировать ]
Пример полногеномного сканирования QTL остеопороза

Для организмов, чьи геномы известны, теперь можно попытаться исключить гены в идентифицированной области, функция которых известна с некоторой уверенностью и не связана с рассматриваемым признаком. Если геном недоступен, можно секвенировать идентифицированную область и определить предполагаемые функции генов по их сходству с генами с известной функцией, обычно в других геномах. Это можно сделать с помощью BLAST , онлайн-инструмента, который позволяет пользователям вводить первичную последовательность и искать похожие последовательности в базе данных BLAST генов различных организмов. Часто за фенотипическим признаком отвечает не сам ген, а скорее участок ДНК, тесно связанный с геном. [ 18 ] [ 19 ]

Другой интерес статистических генетиков, использующих QTL-картирование, заключается в определении сложности генетической архитектуры, лежащей в основе фенотипического признака. Например, им может быть интересно узнать, формируется ли фенотип многими независимыми локусами или несколькими локусами, и взаимодействуют ли эти локусы. Это может предоставить информацию о том, как может развиваться фенотип. [ 20 ]

В недавней разработке классический анализ QTL был объединен с профилированием экспрессии генов, т.е. с помощью микрочипов ДНК . Такие экспрессирующие QTL (eQTL) описывают цис- и транс -контролирующие элементы экспрессии часто ассоциированных с заболеванием генов. [ 21 ] Наблюдаемые эпистатические эффекты оказались полезными для идентификации ответственного гена путем перекрестной проверки генов в локусах, взаимодействующих с метаболическими путями , а также баз данных научной литературы . [ нужна ссылка ]

Дисперсионный анализ

[ редактировать ]

Самый простой метод картирования QTL — это дисперсионный анализ ( ANOVA , иногда называемый «маркерной регрессией») в локусах маркеров. В этом методе при обратном скрещивании можно рассчитать t-статистику для сравнения средних значений двух групп генотипов маркеров . Для других типов при скрещивании (например, интеркроссе), где существует более двух возможных генотипов, используется более общая форма ANOVA, которая обеспечивает так называемую F-статистику . Подход ANOVA для картирования QTL имеет три важных недостатка. Во-первых, мы не получаем отдельных оценок местоположения QTL и эффекта QTL. Местоположение QTL указывается только путем рассмотрения того, какие маркеры дают наибольшие различия между средними значениями групп генотипов, и видимый эффект QTL на маркере будет меньше, чем истинный эффект QTL в результате рекомбинации между маркером и QTL. Во-вторых, мы должны отбросить особей, чьи генотипы отсутствуют в маркере. В-третьих, когда маркеры расположены далеко друг от друга, QTL может находиться довольно далеко от всех маркеров, и поэтому эффективность обнаружения QTL снизится. [ нужна ссылка ]

Интервальное отображение

[ редактировать ]

Ландер и Ботштейн разработали интервальное картирование, которое устраняет три недостатка дисперсионного анализа маркерных локусов. [ 22 ] Интервальное картирование в настоящее время является наиболее популярным подходом для картирования QTL при экспериментальных скрещиваниях. Этот метод использует генетическую карту типизированных маркеров и, как и дисперсионный анализ, предполагает наличие одного QTL. При картировании интервалов каждый локус рассматривается по одному, и логарифм отношения шансов ( оценка LOD ) рассчитывается для модели, согласно которой данный локус является истинным QTL. Отношение шансов связано с коэффициентом корреляции Пирсона между фенотипом и маркерным генотипом для каждой особи в экспериментальном скрещивании. [ 23 ]

Термин «интервальное картирование» используется для оценки положения QTL в пределах двух маркеров (часто обозначаемых как «маркерная скобка»). Интервальное отображение изначально основано на максимальном правдоподобии, но с помощью простой регрессии также возможны очень хорошие аппроксимации. [ нужна ссылка ]

Принцип картирования QTL заключается в следующем: 1) Вероятность может быть рассчитана для заданного набора параметров (в частности, эффекта QTL и положения QTL) с учетом наблюдаемых данных о фенотипах и маркерных генотипах. 2) Оценки параметров – это те, вероятность которых наибольшая. 3) Порог значимости может быть установлен путем перестановочного тестирования. [ 24 ]

Обычные методы обнаружения локусов количественных признаков (QTL) основаны на сравнении моделей одиночного QTL с моделью, предполагающей отсутствие QTL. Например, в методе «интервального отображения» [ 25 ] вероятность наличия одного предполагаемого QTL оценивается в каждом месте генома. Однако QTL, расположенные в других частях генома, могут оказывать мешающее действие. Как следствие, способность обнаружения может быть поставлена ​​под угрозу, а оценки местоположения и эффектов QTL могут быть необъективными (Lander and Botstein 1989; Knapp 1991). Могут появиться даже несуществующие так называемые «призрачные» QTL (Haley and Knott 1992; Martinez and Curnow 1992). Следовательно, несколько QTL можно картировать более эффективно и точно, используя несколько моделей QTL. [ 26 ] Один из популярных подходов к картированию QTL, когда множественные QTL вносят вклад в признак, заключается в итеративном сканировании генома и добавлении известных QTL в регрессионную модель по мере их идентификации. Этот метод, называемый составным интервальным картированием, определяет как расположение, так и размер эффекта QTL более точно, чем подходы с одним QTL, особенно в небольших популяциях картирования, где эффект корреляции между генотипами в картируемой популяции может быть проблематичным. [ нужна ссылка ]

Составное интервальное картирование (CIM)

[ редактировать ]

В этом методе выполняется картирование интервалов, используя подмножество маркерных локусов в качестве ковариат. Эти маркеры служат заместителями для других QTL для повышения разрешения картирования интервалов за счет учета связанных QTL и уменьшения остаточной вариации. Ключевая проблема CIM касается выбора подходящих маркерных локусов, которые будут служить ковариатами; как только они выбраны, CIM превращает задачу выбора модели в одномерное сканирование. Однако вопрос выбора маркерных ковариат еще не решен. Неудивительно, что подходящие маркеры — это те, которые наиболее близки к истинным QTL, и поэтому, если бы можно было их найти, проблема картирования QTL в любом случае была бы решена.

Инклюзивное картирование составных интервалов (ICIM) также было предложено в качестве потенциального метода картирования QTL. [ 27 ]

Семейно-родословное картирование

[ редактировать ]

Картирование QTL на основе семьи или картирование на основе семейной родословной ( картирование связей и ассоциаций ) включает в себя несколько семей, а не одну семью. Картирование QTL на основе семейства было единственным способом картирования генов, в которых экспериментальные скрещивания провести сложно. Однако из-за некоторых преимуществ сейчас генетики растений пытаются использовать некоторые методы, впервые использованные в генетике человека. [ 28 ] Обсуждалось использование подхода, основанного на семейно-родословной (Bink et al. 2008). Семейные связи и ассоциации были успешно реализованы (Rosyara et al. 2009). [ 29 ]

См. также

[ редактировать ]
  1. ^ Майлз, К; Уэйн, М. (2008). «Количественный анализ локуса признаков (QTL)» . Природное образование . 1 (1).
  2. ^ Консорциум сложных черт —; Абиола, Одуола; Ангел, Джо М.; Авнер, Филип; Бахманов Александр Александрович; Белкнап, Джон К.; Беннетт, Бет; Бланкенхорн, Элизабет П.; Blizzard, Дэвид А.; Боливар, Валери; Брокманн, Гудрун А.; Бак, Кари Дж.; Бюро, Жан-Франсуа; Кэсли, Уильям Л.; Чеслер, Элисса Дж.; Чеверуд, Джеймс М.; Черчилль, Гэри А.; Кук, Меллони; Крэбб, Джон К.; Крузио, Вим Э.; Дарваси, Ариэль; Петух, Джеральд; Демант, Питер; Дорге, RW; Эллиотт, Розмари В.; Фарбер, Чарльз Р.; Флаэрти, Лоррейн; Флинт, Джонатан; Гершенфельд, Ховард; Гибсон, Джон П.; Гу, Цзин; Гу, Вэйкуань; Химмельбауэр, Хайнц; Хитцеманн, Роберт; Сюй, Хуэй-Чен; Хантер, Кент; Ираки, Фуад А.; Янсен, Ритсерт К.; Джонсон, Томас Э.; Джонс, Байрон С.; Кемперманн, Герд; Ламмерт, Фрэнк; Лу, Лу; Мэнли, Кеннет Ф.; Мэтьюз, Дуглас Б.; Медрано, Джон Ф.; Мехрабян, Маргарет; Миттлман, Гай; Мок, Беверли А.; Могил, Джеффри С.; Монтагутелли, Ксавье; Морахан, Грант; Маунтц, Джон Д.; Нагасе, Хироки; Новаковски, Ричард С.; О'Хара, Брюс Ф.; Осадчук Александр В.; Пейген, Беверли; Палмер, Авраам А.; Пирс, Джереми Л.; Помп, Дэниел; Розманн, Майкл; Розен, Гленн Д.; Шалквик, Леонард Дж.; Зельцер, Зеев; Сеттл, Стивен; Симомура, Кадзухиро; Шоу, Сымин; Сикела, Джеймс М.; Сиракьюс, Линда Д.; Спироу, Джимми Л.; Тойшер, Кори; Тредгилл, Дэвид В.; Тот, Линда А.; Той, Айо А.; Вадас, Чаба; Ван Зант, Гэри; Уэйкленд, Эдвард; Уильямс, Роберт В.; Чжан, Хуан-Ге; Цзоу, Фэй (2003). «Природа и идентификация локусов количественных признаков: взгляд сообщества» . Обзоры природы Генетика . 4 (11). Природный портфель : 911–916. дои : 10.1038/nrg1206 . ПМК   2063446 . ПМИД   14634638 . S2CID   27285742 . S2CID   195367115 .
  3. ^ Ватанабэ, Сатоши; Хидесима, Румико; Ся, Чжэнцзюнь; и др. (2009). «Клонирование на основе карты гена, связанного с локусом зрелости E3 сои» . Генетика . 182 (4): 1251–1262. doi : 10.1534/genetics.108.098772 . ПМЦ   2728863 . ПМИД   19474204 .
  4. ^ Даваре, Анураг; Парида, Сваруп К.; Тьяги, Ахилеш К. (2020), Васкетто, Луис М. (редактор), «Интегрированные геномные стратегии для улучшения генетики зерновых: сочетание QTL и картирования ассоциаций», Геномика зерновых: методы и протоколы , Методы молекулярной биологии, том. 2072, Springer US, стр. 15–25, номер документа : 10.1007/978-1-4939-9865-4_3 , ISBN.  9781493998654 , PMID   31541435 , S2CID   202711099
  5. ^ Jump up to: а б с «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 3 октября 2013 года . Проверено 24 сентября 2013 г. {{cite web}}: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка )
  6. ^ Jump up to: а б Замок МЫ (1903 г.). «Закон наследственности Менделя» . Наука . 18 (456): 396–406. Бибкод : 1903Sci....18..396C . дои : 10.1126/science.18.456.396 . ПМИД   17752783 . S2CID   11670642 .
  7. ^ Замок, МЫ (1 мая 1951 г.). «Вариации в окрасе крыс с капюшоном и новый аллель капюшона» . Генетика . 36 (3): 254–266. дои : 10.1093/генетика/36.3.254 . ПМК   1209518 . PMID   14840647 – через www.genetics.org.
  8. ^ Jump up to: а б Райт, Сьюэлл (1 марта 1931 г.). «Эволюция менделевских популяций» . Генетика . 16 (2): 97–159. дои : 10.1093/генетика/16.2.97 . ПМК   1201091 . PMID   17246615 – через www.genetics.org.
  9. ^ Рики Льюис (2003), Многофакторные черты , Высшее образование McGraw-Hill .
  10. ^ Jump up to: а б с Гордый, Вирджиния и Робертс, Хелен (31 декабря 2005 г.). «Медицинская генетика: многофакторное наследование» . Детская больница дочерей короля. Архивировано из оригинала 15 октября 2006 года . Проверено 6 января 2007 г.
  11. ^ Jump up to: а б «Многофакторное наследование» . Центр медицинского просвещения по вопросам беременности и новорожденных . Марш десятицентовиков. Архивировано из оригинала 2 ноября 2006 года . Проверено 12 ноября 2014 г.
  12. ^ Элементы медицинской генетики Эмери
  13. ^ Бишофф, Фариде; Симпсон, Джо Ли (апрель 2004 г.). «Генетика эндометриоза: наследственность и гены-кандидаты». Передовая практика и исследования в области клинического акушерства и гинекологии . 18 (2): 219–232. дои : 10.1016/j.bpobgyn.2004.01.004 . ПМИД   15157639 .
  14. ^ Jump up to: а б с д и ж Тиссо, Роберт. «Генетика человека для студентов 1 курса: многофакторное наследование» . Проверено 6 января 2007 г.
  15. ^ Jump up to: а б с Центр генетики врожденных дефектов, Медицинский факультет Университета Южной Дакоты. «Многофакторное наследование» . Клиническая генетика: Руководство для самообучения для медицинских работников . Медицинский факультет Университета Южной Дакоты. Архивировано из оригинала 30 декабря 2006 года . Проверено 6 января 2007 г.
  16. ^ «Определение многофакторного наследования» . Словарь медицинских терминов MedicineNet.com . MedicineNet.com. Архивировано из оригинала 17 декабря 2013 года . Проверено 6 января 2007 г.
  17. ^ Jump up to: а б с Тернпенни, Питер (2004). «Глава 9» (PDF) . Элементы медицинской генетики Эмери (12-е изд.). Эльзевир . Проверено 6 января 2007 г.
  18. ^ «BLAST: базовый инструмент поиска локального выравнивания» . blast.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 18 февраля 2018 г.
  19. ^ Даваре, Анураг; Парида, Сваруп К.; Тьяги, Ахилеш К. (2020), Васкетто, Луис М. (редактор), «Интегрированные геномные стратегии для улучшения генетики зерновых: сочетание QTL и картирования ассоциаций», Геномика зерновых: методы и протоколы , Методы молекулярной биологии, том. 2072, Springer US, стр. 15–25, номер документа : 10.1007/978-1-4939-9865-4_3 , ISBN.  9781493998654 , PMID   31541435 , S2CID   202711099
  20. ^ Гризель, Джудит Э.; Крэбб, Джон К. (1995). «Количественное картирование локусов признаков» . Алкогольное здоровье и мир исследований . 19 (3): 220–227. ISSN   0090-838X . ПМЦ   6875759 . ПМИД   31798043 .
  21. ^ Вестра Х.Дж. и др. (2013). «Систематическая идентификация транс-eQTL как предполагаемых факторов известных ассоциаций заболеваний» . Нат Жене . 45 (10): 1238–1243. дои : 10.1038/ng.2756 . ПМЦ   3991562 . ПМИД   24013639 .
  22. ^ Ландер, ЕС; Ботштейн, Д. (1989). «Сопоставление менделевских факторов, лежащих в основе количественных характеристик, с использованием карт связи RFLP» . Генетика . 121 (1): 185–199. дои : 10.1093/генетика/121.1.185 . ПМЦ   1203601 . ПМИД   2563713 .
  23. ^ Линч, М. и Уолш, Б. Генетика и анализ количественных признаков, издание 1 (Sinauer Associates, 1998).
  24. ^ Блум Дж.С.; Эренрайх И.М.; Лоо ВТ; Лайт Т.-ЛВ; Кругляк Л. (2013). «Обнаружение источников отсутствия наследственности в скрещивании дрожжей» . Природа . 494 (7436): 234–237. arXiv : 1208.2865 . Бибкод : 2013Natur.494..234B . дои : 10.1038/nature11867 . ПМК   4001867 . ПМИД   23376951 .
  25. ^ Картирование менделевских факторов, лежащих в основе количественных характеристик, с использованием карт связи RFLP. Э. С. Ландер и Д. Ботштейн. Генетика. 1989 год
  26. ^ Янсен, Р.К. (1 сентября 1993 г.). «Интервальное картирование нескольких локусов количественных признаков» (PDF) . Генетика . 135 (1): 205–211. дои : 10.1093/генетика/135.1.205 . ПМК   1205619 . ПМИД   8224820 . Проверено 1 марта 2023 г.
  27. ^ Ли, Шаньшань; Ван, Цзянькан; Чжан, Луян (10 июля 2015 г.). «Инклюзивное составное картирование интервалов QTL по взаимодействиям с окружающей средой в популяциях с двумя родителями» . ПЛОС ОДИН . 10 (7): e0132414. Бибкод : 2015PLoSO..1032414L . дои : 10.1371/journal.pone.0132414 . ISSN   1932-6203 . ПМЦ   4498613 . ПМИД   26161656 .
  28. ^ Яннинк, Дж; Бинк, Мак; Янсен, Р.С. (август 2001 г.). «Использование сложных родословных растений для картирования ценных генов». Тенденции в науке о растениях . 6 (8): 337–42. дои : 10.1016/S1360-1385(01)02017-9 . ISSN   1360-1385 . ПМИД   11495765 .
  29. ^ Росьяра, УР; Мэксон-Штайн, КЛ; Гловер, К.Д.; Штейн, Дж. М.; Гонсалес-Эрнандес, JL (2007). «Семейное картирование QTL устойчивости к FHB у гексаплоидной пшеницы». Материалы Национального форума по фузариозу .
  • Бинк МКАМ, Бур М.П., ​​тер Браак С.Дж.Ф., Янсен Дж., Вооррипс Р.Э., ван де Вег В.Е.: Байесовский анализ сложных признаков в популяциях породистых растений.

Евфитика 2008, 161:85–96.

  • Росьяра У.Р., Х.Л. Гонсалес-Эрнандес, К.Д. Гловер, К.Р. Гедье и Дж.М. Штайн. 2009. Семейное картирование локусов количественных признаков в селекционных популяциях растений с устойчивостью к фузариозу колоса пшеницы в качестве иллюстрации Theoretical Applied Genetics 118:1617–1631.
  • Гарнье, Софи, Труонг, Винь, Полногеномный гаплотипический анализ локусов количественных признаков цис-экспрессии в моноцитах [1]
[ редактировать ]
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: f4238c56fba77accfd1006344f2d0eda__1722419160
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/f4/da/f4238c56fba77accfd1006344f2d0eda.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Quantitative trait locus - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)