Семейство гликозид гидролаз 13
| Альфа-амилаза, N-концевой Ig-подобный домен | |||
|---|---|---|---|
 Кристаллическая структура термоактиномикса vulgaris r-47 альфа-амилаза 1 (TVAI) мутант D356N/E396Q, в комплекте с P2, пуллуланским модельным олигосахаридом | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Альфа-амилаза_н | ||
| Pfam | PF02903 | ||
| InterPro | IPR004185 | ||
| Краткое содержание | 1sma / scope / supfam | ||
| |||
| Альфа-амилаза каталитический домен | |||
|---|---|---|---|
 циклодекстрин глюканотрансфераза (EC2.4.1.19) (cgtase) | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | Альфа-амилаза | ||
| Pfam | PF00128 | ||
| PFAM клан | CL0058 | ||
| InterPro | IPR006047 | ||
| Краткое содержание | 1ppi / scope / supfam | ||
| Кэзи | G13 | ||
| |||
В молекулярной биологии семейство гликозид гидролаз 13 представляет собой семейство гликозид -гидролаз .
Гликозид гидролазы EC 3.2.1. это широко распространенная группа ферментов, которые гидролизируют гликозидную связь между двумя или более углеводами или между углеводом и неглеворным фрагментом. Система классификации для гликозидных гидролаз, основанных на сходстве последовательностей, привела к определению> 100 различных семейств. [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] Эта классификация доступна на веб -сайте CAZY , [ 4 ] [ 5 ] а также обсуждается в Cazypedia, онлайн -энциклопедии активных ферментов углеводов. [ 6 ] [ 7 ]
Ферменты, содержащие этот домен, принадлежат к семейству 13 ( Cazy GH_13 ) гликозилгидролаз. Мальтогенная альфа-амилаза представляет собой фермент, который катализирует гидролиз (1-4) -альфа-д-глюкозидных связей в , чтобы удалить последовательные остатки альфа- мельт полисахаридах Мальтоза . Другие ферменты в этом семействе включают неопаллуланазу, которая гидролизует пуллулан до панозы , и цикломальтодекстриназа , которая гидролизует циклодекстрины .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Henrissat B, Callebaut I, Fabrega S, Lehn P, Mornon JP, Davies G (июль 1995 г.). «Консервативный каталитический механизм и прогнозирование общей складки для нескольких семейств гликозилгидролаз» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 92 (15): 7090–4. Bibcode : 1995pnas ... 92.7090h . doi : 10.1073/pnas.92.15.7090 . PMC 41477 . PMID 7624375 .
- ^ Дэвис Г., Энриссат Б. (сентябрь 1995 г.). «Структуры и механизмы гликозилгидролаз» . Структура 3 (9): 853–9. doi : 10.1016/s0969-2126 (01) 00220-9 . PMID 8535779 .
- ^ Henrissat B, Bairoch A (июнь 1996 г.). «Обновление классификации на основе последовательности гликозилгидролаз» . Биохимический журнал . 316 (Pt 2): 695–6. doi : 10.1042/bj3160695 . PMC 1217404 . PMID 8687420 .
- ^ "Дом" . Cazy.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Lombard V, Golaconda Ramulu H, Drula E, Coutinho PM, Henrissat B (январь 2014 г.). «База данных по углеводам-активным ферментам (CAZY) в 2013 году» . Исследование нуклеиновых кислот . 42 (проблема базы данных): D490–5. doi : 10.1093/nar/gkt1178 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .
- ^ «Семейство гликозид гидролаз 13» . Cazypedia.org . Получено 2018-03-06 .
- ^ Консорциум Cazypedia (декабрь 2018 г.). «Десять лет Казипедии: живая энциклопедия углеводов-активных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. doi : 10.1093/glycob/cwx089 . PMID 29040563 .
