✖


Jump to content

Лабораторная микоплазма

(Перенаправлено с Syn 3 )
«Синтия» перенаправляется сюда. Чтобы узнать об альбоме The Jezabels, см. Synthia (альбом) .

Лабораторная микоплазма
Научная классификация Изменить эту классификацию
Домен: Бактерии
Тип: Микоплазматота
Сорт: Молликуты
Заказ: Микоплазматы
Семья: Микоплазмовые
Род: Микоплазма
Разновидность:
М. микоидес
Подвиды:
М. м. JCVI-syn1.0
Трехчленное имя
Микоплазма микоидес JCVI-syn1.0
Гибсон и др. , 2010 г. [а 1]
Синонимы [а 2]

Микоплазменная лаборатория Райха, 2000 г.

Микоплазменная лаборатория или Синтия [б 1] относится к синтетическому штамму бактерий . Проект по созданию новой бактерии развивался с момента его создания. Первоначально целью было идентифицировать минимальный набор генов , необходимых для поддержания жизни, из и синтетически генома Mycoplasmagentium перестроить эти гены для создания «нового» организма. Первоначально Mycoplasmagentium была выбрана в качестве основы для этого проекта, поскольку на тот момент у нее было наименьшее количество проанализированных генов среди всех проанализированных организмов. Позже основное внимание переключилось на Mycoplasma mycoides и применили метод проб и ошибок. [б 2]

Чтобы идентифицировать минимальные гены, необходимые для жизни, каждый из 482 генов M.genitalium был удален индивидуально и проверена жизнеспособность полученных мутантов. Это привело к идентификации минимального набора из 382 генов, которые теоретически должны представлять минимальный геном. [а 3] полный набор генов M.genitalium с добавлением водяных знаков для идентификации генов как синтетических. В 2008 году в лаборатории был сконструирован [б 3] [а 4] Однако M.genitalium растет чрезвычайно медленно, и M.mycoides был выбран в качестве нового объекта для ускорения экспериментов, направленных на определение набора генов, действительно необходимых для роста. [б 4]

В 2010 году полный геном M. mycoides был успешно синтезирован на основе компьютерной записи и трансплантирован в существующую клетку Mycoplasma capricolum , из которой была удалена ДНК. [б 5] Подсчитано, что синтетический геном, использованный в этом проекте, обойдется в 40 миллионов долларов США и потребует 200 человеко-лет на производство. [б 4] Новая бактерия смогла расти и получила название JCVI-syn1.0 или Synthia. После дополнительных экспериментов по выявлению меньшего набора генов, которые могли бы создать функциональный организм, был создан JCVI-syn3.0, содержащий 473 гена. [б 2] 149 из этих генов имеют неизвестную функцию. [б 2] Поскольку геном JCVI-syn3.0 является новым, его считают первым по-настоящему синтетическим организмом.

Проект минимального генома

[ редактировать ]

Производство Synthia является результатом усилий в области синтетической биологии в Институте Дж. Крейга Вентера группой из примерно 20 ученых, возглавляемых нобелевским лауреатом Гамильтоном Смитом , в том числе ДНК исследователем Крейгом Вентером и микробиологом Клайдом А. Хатчисоном III . Общая цель — свести живой организм к его основам и таким образом понять, что требуется для создания нового организма с нуля. [а 3] Первоначальным объектом внимания была бактерия M.genitalium , облигатный внутриклеточный паразит , чей геном состоит из 482 генов, содержащих 582 970 пар оснований , расположенных на одной кольцевой хромосоме (на момент начала проекта это был самый маленький геном из всех известных природных организмов, которые могут выращиваться в свободной культуре). Они использовали мутагенез транспозонов для идентификации генов, которые не были необходимы для роста организма, в результате чего минимальный набор из 382 генов. [а 3] Это усилие было известно как Проект Минимального Генома . [а 5]

Выбор организма

[ редактировать ]

Микоплазма

[ редактировать ]
Основная статья: Микоплазма

Mycoplasma — род бактерий класса Mollicutes отдела Mycoplasmatota (ранее Tenericutes), характеризующийся отсутствием клеточной стенки (что делает его грамотрицательным ) вследствие паразитического или комменсального образа жизни.В молекулярной биологии этот род получил большое внимание как из-за того, что он является заведомо трудно искореняемым загрязнителем в культурах клеток млекопитающих (он невосприимчив к бета-лактамам и другим антибиотикам), так и из-за того, что он является невосприимчивым к бета-лактамам и другим антибиотикам . [а 6] и за его потенциальное использование в качестве модельного организма из-за небольшого размера генома. [а 7] Выбор рода для проекта Synthia датируется 2000 годом, когда Карл Райх придумал фразу Mycoplasma Laboratorium . [а 2]

Другие организмы с небольшими геномами

[ редактировать ]

По состоянию на 2005 год Pelagibacter ubique ( α-протеобактерия порядка Rickettsiales ) имеет наименьший известный геном (1 308 759 пар оснований) среди всех свободных живых организмов и является одной из самых маленьких известных самовоспроизводящихся клеток. Возможно, это самая многочисленная бактерия в мире (около 10 28 отдельные клетки) и, наряду с другими членами клады SAR11 , по оценкам, составляют от четверти до половины всех бактериальных или архейных клеток в океане. [а 8] Он был идентифицирован в 2002 году по последовательностям рРНК и полностью секвенирован в 2005 году. [а 9] В лабораторных условиях чрезвычайно сложно культивировать вид, который не достигает высокой плотности роста. [а 10] [а 11] Несколько недавно открытых видов имеют меньше генов, чем M.genitalium , но не являются свободноживущими: многие существенные гены отсутствуют у Hodgkinia cicadicola , Sulcia muelleri , Baumannia cicadellinicola (симбионты цикад ) и Carsonella ruddi (симбиот каркаса черешкового желчного листолистника, Пахипсилла венуста [а 12] ) может кодироваться в ядре хозяина. [а 13] Организм с наименьшим известным набором генов по состоянию на 2013 год — Nasuia deltocephalinicola , облигатный симбионт . Он имеет всего 137 генов и размер генома 112 т.п.н. [а 14] [б 6]

название вида количество генов размер (Мбит/с)
Кандидат Hodgkinia cicadicola Dsem [1] 169 0.14
Кандидат Carsonella ruddii PV [2] 182 0.16
Кандидат Sulcia muelleri GWSS [3] 227 0.25
Кандидат Sulcia muelleri SMDSEM [4] 242 0.28
Бухнера афидикола ул. Чинара Чедри [5] 357 0.4261
Микоплазма гениталиум G37 [6] 475 0.58
Кандидат Phytoplasma mali [7] 479 0.6
Бухнера афидикола ул. Байзонгия фисташковая [8] 504 0.6224
Наноархеи верхом на Кин4-М [9] 540 0.49

Техники

[ редактировать ]

Для этого проекта пришлось разработать или адаптировать несколько лабораторных методов, поскольку он требовал синтеза и манипуляций с очень большими фрагментами ДНК.

Трансплантация бактериального генома

[ редактировать ]

В 2007 году команда Вентера сообщила, что им удалось перенести хромосому вида Mycoplasma mycoides в Mycoplasma capricolum с помощью:

  • выделение генома M. mycoides : мягкий лизис клеток, попавших в агар (расплавленный агар смешивают с клетками и оставляют для образования геля), с последующим гель-электрофорезом в импульсном поле и выделением полосы нужного размера (круглая 1,25 Мбит/с);
  • обеспечение компетентности клеток-реципиентов M. capricolum : рост в богатой среде следует за голоданием в бедной среде, где нуклеотидное голодание приводит к ингибированию репликации ДНК и изменению морфологии; и
  • Опосредованная полиэтиленгликолем трансформация кольцевой хромосомы в клетки, свободные от ДНК, с последующей селекцией. [а 15]

Термин «трансформация» используется для обозначения введения вектора в бактериальную клетку (путем электропорации или теплового шока). Здесь используется трансплантация, аналогичная трансплантации ядра .

Синтез бактериальных хромосом

[ редактировать ]

В 2008 году группа Вентера описала производство синтетического генома, копии M. Genitalium G37 последовательности L43967 , с помощью иерархической стратегии: [а 16]

  • Синтез → 1 т.п.н.: Последовательность генома была синтезирована в Blue Heron 1078 кассетах по 1080 п.о. с перекрытием 80 п.н. и сайтами рестрикции NotI (неэффективный, но нечастый обрезчик).
  • Лигирование → 10 т.п.н.: 109 групп из серии из 10 последовательных кассет лигировали и клонировали в E.coli на плазмиде , а правильную перестановку проверяли секвенированием.
  • Мультиплексная ПЦР → 100 кб: 11 групп из серии из 10 последовательных сборок размером 10 кб (выращенных в дрожжах) были объединены с помощью мультиплексной ПЦР с использованием пары праймеров для каждой сборки 10 кб.
  • Выделение и рекомбинация → вторичные сборки были изолированы, объединены и трансформированы в дрожжевые сферопласты без векторной последовательности (присутствуют в сборке 811-900).

Геном этого результата 2008 года, M.ogenicium JCVI-1.0, опубликован в GenBank как CP001621.1 . Его не следует путать с более поздними синтетическими организмами, получившими обозначение JCVI-syn, основанными на M. mycoides . [а 16]

Синтетический геном

[ редактировать ]

В 2010 году Вентер и его коллеги создали Mycoplasma mycoides штамм JCVI-syn1.0 с синтетическим геномом. [а 1] Изначально синтетическая конструкция не работала, чтобы выявить ошибку, которая привела к задержке всего проекта на 3 месяца. [б 4] — создан ряд полусинтетических конструкций. Причиной неудачи стала единственная мутация сдвига рамки считывания в ДНКА , факторе инициации репликации . [а 1]

Целью создания клетки с синтетическим геномом была проверка методологии как шаг к созданию модифицированных геномов в будущем. Использование естественного генома в качестве шаблона свело к минимуму потенциальные источники неудач. JCVI-syn1.0 присутствует несколько отличий В Mycoplasma mycoides от эталонного генома, в частности, транспозон E.coli IS1 (инфекция со стадии 10 т.п.н.) и дупликация 85 п.о., а также элементы, необходимые для размножения в дрожжах, и остатки сайты рестрикции. [а 1]

Были разногласия по поводу того, является ли JCVI-syn1.0 настоящим синтетическим организмом. Хотя геном был синтезирован химически из многих частей, он был сконструирован так, чтобы точно соответствовать родительскому геному, и трансплантирован в цитоплазму природной клетки. ДНК сама по себе не может создать жизнеспособную клетку: для чтения ДНК необходимы белки и РНК, а липидные мембраны необходимы для разделения ДНК и цитоплазмы . В JCVI-syn1.0 два вида, используемые в качестве донора и реципиента, принадлежат к одному и тому же роду, что снижает потенциальные проблемы несоответствия между белками в цитоплазме хозяина и новым геномом. [а 17] Пол Кейм (молекулярный генетик из Университета Северной Аризоны во Флагстаффе ) отметил, что «перед генными инженерами стоят большие задачи, прежде чем они смогут смешивать, сопоставлять и полностью проектировать геном организма с нуля». [б 4]

Водяные знаки

[ редактировать ]
Скрытый водяной знак на полупроводниковом чипе 1976 года, служащий подписью его создателей. Аналогичным образом Дж. К. Вентер и его команда добавили водяные знаки, используя стоп-кодоны, чтобы подписать свое творение.

Широко разрекламированной особенностью JCVI-syn1.0 является наличие последовательностей водяных знаков. 4 водяных знака (показаны на рисунке S1 в дополнительных материалах к статье). [а 1] ) представляют собой закодированные сообщения, записанные в ДНК, длиной 1246, 1081, 1109 и 1222 пары оснований соответственно. В этих сообщениях использовался не стандартный генетический код , в котором последовательности из 3 оснований ДНК кодируют аминокислоты, а изобретенный для этой цели новый код, разгадать который читателям было предложено. [б 7] Содержание водяных знаков следующее:

  1. Водяной знак 1: документ HTML , который читается в веб-браузере как текст, поздравляющий декодер, и инструкции о том, как отправить электронное письмо авторам для подтверждения декодирования.
  2. Водяной знак 2: список авторов и цитата Джеймса Джойса : «Жить, ошибаться, падать, торжествовать, воссоздавать жизнь из жизни».
  3. Водяной знак 3: другие авторы и цитата Роберта Оппенгеймера (в титрах): «Видите на вещи не такими, какие они есть, а такими, какими они могли бы быть».
  4. Водяной знак 4: еще авторы и цитата Ричарда Фейнмана : «То, что я не могу построить, я не могу понять».

JCVI-син3.0

[ редактировать ]
Ген функционирует в минимальном геноме синтетического организма 3 Syn . [а 18]

В 2016 году Институт Вентера использовал гены JCVI-syn1.0 для синтеза меньшего генома, который они назвали JCVI-syn3.0, который содержит 531 560 пар оснований и 473 гена. [б 8] В 1996 году, сравнив M.genitalium с другой небольшой бактерией Haemophilus influenzae , Аркадий Мушегян и Евгений Кунин предположили, что может существовать общий набор из 256 генов, который может представлять собой минимальный набор генов, необходимый для жизнеспособности. [б 9] [а 19] В этом новом организме число генов можно сократить только до 473, 149 из которых имеют совершенно неизвестные функции. [б 9] По состоянию на 2022 год неизвестный набор сократился примерно до 100. [б 10] В 2019 году была опубликована полная вычислительная модель всех путей в клетке Syn3.0, представляющая собой первую полную модель in silico для живого минимального организма. [а 20]

Опасения и споры

[ редактировать ]

Прием

[ редактировать ]

6 октября 2007 года Крейг Вентер объявил в интервью британской газете The Guardian синтезировала модифицированную версию единственной хромосомы Mycoplasmaogenicium , что та же самая команда химически . Синтезированный геном еще не был трансплантирован в рабочую клетку. На следующий день канадская по биоэтике группа ETC Group опубликовала заявление через своего представителя Пэта Муни , в котором говорилось, что «творение» Вентера было «шасси, на котором можно построить практически все. огромная угроза человечеству, такая как биологическое оружие». Вентер прокомментировал: «Мы имеем дело с большими идеями. Мы пытаемся создать новую систему ценностей для жизни. Имея дело в таком масштабе, нельзя ожидать, что все будут счастливы». [б 11]

21 мая 2010 года журнал Science сообщил, что группа Вентера успешно синтезировала геном бактерии Mycoplasma mycoides из компьютерной записи и трансплантировала синтезированный геном в существующую клетку бактерии Mycoplasma capricolum , у которой была удалена ДНК. «Синтетическая» бактерия оказалась жизнеспособной, т. е. способной к размножению. [б 1] Вентер описал его как «первый вид… родителями которого были компьютеры». [б 12]

О создании новой синтетической бактерии JCVI-3.0 было объявлено в журнале Science 25 марта 2016 года. Она имеет всего 473 гена. Вентер назвал его «первым дизайнерским организмом в истории» и заявил, что тот факт, что 149 необходимых генов имеют неизвестные функции, означает, что «во всей области биологии не хватает трети того, что необходимо для жизни». [а 21]

Освещение в прессе

[ редактировать ]

Проект получил широкое освещение в прессе благодаря зрелищному мастерству Вентера, до такой степени, что Джей Кислинг , новаторский синтетический биолог и основатель Amyris, прокомментировал: «Единственное регулирование, которое нам нужно, - это слова моего коллеги». [б 13]

Утилита

[ редактировать ]

Вентер утверждал, что синтетические бактерии — это шаг к созданию организмов, способных производить водород и биотопливо , а также поглощать углекислый газ и другие парниковые газы . Джордж М. Черч , еще один пионер синтетической биологии , выразил противоположное мнение, что создание полностью синтетического генома не является необходимым, поскольку E. coli растет более эффективно, чем M. Genitalium, даже со всей ее дополнительной ДНК; он отметил, что синтетические гены были включены в E.coli для выполнения некоторых из вышеперечисленных задач. [б 14]

Интеллектуальная собственность

[ редактировать ]

Институт Дж. Крейга Вентера подал патенты на геном Mycoplasma Laboratorium («минимальный бактериальный геном») в США и за рубежом в 2006 году. [б 15] [б 16] [а 22] Группа ETC, канадская группа по биоэтике, выразила протест на том основании, что объем патента слишком широк. [б 17]

Похожие проекты

[ редактировать ]

С 2002 по 2010 год группа Венгерской академии наук создала штамм Escherichia coli под названием MDS42, который сейчас продается компанией Scarab Genomics из Мэдисона, штат Висконсин, под названием «Чистый геном. E.coli». [б 18] где 15% генома родительского штамма (E. coli K-12 MG1655) было удалено для повышения эффективности молекулярной биологии, удаления IS-элементов , псевдогенов и фагов, что привело к лучшему сохранению кодируемых плазмидами токсичных генов, которые часто инактивируется транспозонами. [а 23] [а 24] [а 25] Биохимия и механизм репликации не были изменены.

Ссылки

[ редактировать ]

Первоисточники

[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б с д и Гибсон, генеральный директор; Гласс, Джи; Лартиг, К.; Носков В.Н.; Чуанг, Р.-Ю.; Алжир, Массачусетс; Бендеры, Джорджия; Монтегю, Миннесота; Ма, Л.; Муди, ММ; Мерриман, К.; Ваши, С.; Кришнакумар, Р.; Асад-Гарсия, Н.; Эндрюс-Пфанкох, К.; Денисова Е.А.; Янг, Л.; Ци, З.-Ц.; Сигалл-Шапиро, TH; Калви, Швейцария; Пармар, ПП; Хатчисон, Калифорния; Смит, ХО; Вентер, JC (20 мая 2010 г.). «Создание бактериальной клетки, контролируемой химически синтезированным геномом» . Наука . 329 (5987): 52–56. Бибкод : 2010Sci...329...52G . дои : 10.1126/science.1190719 . ПМИД   20488990 .
  2. ^ Перейти обратно: а б Райх, штат Калифорния (июнь 2000 г.). «Поиск незаменимых генов». Исследования в области микробиологии . 151 (5): 319–24. дои : 10.1016/S0923-2508(00)00153-4 . ПМИД   10919511 . Кроме того, сложная генетика этих организмов делает проблематичной последующую проверку существенности путем направленного нокаута и практически исключает возможность осуществления синтеза de novo 'M. Laboratorium», источник внимания в популярной прессе.
  3. ^ Перейти обратно: а б с Гласс, Джон И.; Насира Асад-Гарсия; Нина Альперович; Шибу Юсеф; Мэтью Р. Льюис; Махир Маруф; Клайд А. Хатчисон; Гамильтон О. Смит; Дж. Крейг Вентер (10 января 2006 г.). «Основные гены минимальной бактерии» . Труды Национальной академии наук . 103 (2): 425–430. Бибкод : 2006PNAS..103..425G . дои : 10.1073/pnas.0510013103 . ПМЦ   1324956 . ПМИД   16407165 .
  4. ^ Гибсон, генеральный директор; Бендеры, Джорджия; Эндрюс-Пфанкох, К.; Денисова Е.А.; Баден-Тилсон, Х.; Завери, Дж.; Стоквелл, ТБ; Браунли, А.; Томас, DW (29 февраля 2008 г.). «Полный химический синтез, сборка и клонирование генома Mycoplasmaogenicium». Наука . 319 (5867): 1215–1220. Бибкод : 2008Sci...319.1215G . дои : 10.1126/science.1151721 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   18218864 . S2CID   8190996 .
  5. ^ Хатчисон, Калифорния, Монтегю М.Г. (2002). «Микоплазмы и концепция минимального генома». Молекулярная биология и патогенность микоплазм (Разин С., Херрманн Р., ред.) . Нью-Йорк: Kluwer Academic/Plenum. стр. 221–54. ISBN  978-0-306-47287-9 .
  6. ^ Янг Л., Сунг Дж., Стейси Дж., Мастерс-младший. «Обнаружение микоплазмы в клеточных культурах». Нат Проток. 2010 5 (5): 929–34. Электронная публикация 2010 г., 22 апреля.
  7. ^ Фрейзер К.М., Гокейн Дж.Д., Уайт О. и др. (октябрь 1995 г.). «Минимальный набор генов Mycoplasmagentium ». Наука . 270 (5235): 397–403. Бибкод : 1995Sci...270..397F . дои : 10.1126/science.270.5235.397 . ПМИД   7569993 . S2CID   29825758 .
  8. ^ Моррис Р.М. и др. (2002). «Клада SAR11 доминирует в сообществах бактериопланктона на поверхности океана». Природа . 420 (6917): 806–10. Бибкод : 2002Natur.420..806M . дои : 10.1038/nature01240 . ПМИД   12490947 . S2CID   4360530 .
  9. ^ Стивен Дж. Джованнони, Х. Джеймс Трипп и др. (2005). «Оптимизация генома космополитической океанической бактерии». Наука . 309 (5738): 1242–1245. Бибкод : 2005Sci...309.1242G . дои : 10.1126/science.1114057 . ПМИД   16109880 . S2CID   16221415 .
  10. ^ Раппе М.С., Коннон С.А., Вергин К.Л., Джованнони С.Л. (2002). «Культивирование повсеместно распространенной клады морского бактериопланктона SAR11». Природа . 418 (6898): 630–33. Бибкод : 2002Natur.418..630R . дои : 10.1038/nature00917 . ПМИД   12167859 . S2CID   4352877 .
  11. ^ Трипп Х.Дж., Китнер Дж.Б., Швальбах М.С., Дейси Дж.В., Вильгельм Л.Дж., Джованнони С.Дж. (10 апреля 2008 г.). «Морским бактериям SAR11 для роста требуется экзогенная восстановленная сера». Природа . 452 (7188): 741–4. Бибкод : 2008Natur.452..741T . дои : 10.1038/nature06776 . ПМИД   18337719 . S2CID   205212536 .
  12. ^ Накабачи, А.; Ямасита, А.; Тох, Х.; Исикава, Х.; Данбар, HE; Моран, Северная Каролина; Хаттори, М. (2006). «Геном бактериального эндосимбионта карсонеллы размером 160 тысяч оснований». Наука 314 (5797):267.doi 10.1126 : /science.1134196 . ПМИД   17038615 . S2CID   44570539 .
  13. ^ Маккатчеон, JP; Макдональд, БР; Моран, Н.А. (2009). «Конвергентная эволюция метаболических ролей в бактериальных косимбионтах насекомых» . Труды Национальной академии наук . 106 (36): 15394–15399. Бибкод : 2009PNAS..10615394M . дои : 10.1073/pnas.0906424106 . ПМЦ   2741262 . ПМИД   19706397 .
  14. ^ Нэнси А. Моран; Гордон М. Беннетт (2014). «Самые крошечные геномы» . Ежегодный обзор микробиологии . 68 : 195–215. doi : 10.1146/annurev-micro-091213-112901 . ПМИД   24995872 .
  15. ^ Лартиг С., Гласс Дж.И., Альперович Н., Пипер Р., Пармар П.П., Хатчисон Калифорния, 3-й, Смит Х.О., Вентер Дж.К. (3 августа 2007 г.). «Трансплантация генома бактерий: замена одного вида на другой». Наука . 317 (5838): 632–8. Бибкод : 2007Sci...317..632L . CiteSeerX   10.1.1.395.4374 . дои : 10.1126/science.1144622 . ПМИД   17600181 . S2CID   83956478 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  16. ^ Перейти обратно: а б Гибсон, Б; Клайд А. Хатчисон; Синтия Пфанкох; Дж. Крейг Вентер; и др. (24 января 2008 г.). «Полный химический синтез, сборка и клонирование генома Mycoplasmaogenicium». Наука . 319 (5867): 1215–20. Бибкод : 2008Sci...319.1215G . дои : 10.1126/science.1151721 . ПМИД   18218864 . S2CID   8190996 .
  17. ^ Поволоцкая И.С.; Кондрашов, Ф.А. (июнь 2010 г.). «Пространство последовательностей и продолжающееся расширение белковой вселенной». Природа . 465 (7300): 922–6. Бибкод : 2010Natur.465..922P . дои : 10.1038/nature09105 . ПМИД   20485343 . S2CID   4431215 .
  18. ^ Хатчисон, Клайд А.; Чуанг, Рэй-Юань; Носков Владимир Н.; Асад-Гарсия, Насира; Диринк, Томас Дж.; Эллисман, Марк Х.; Гилл, Джон; Каннан, Кришна; Карась, Богумил Ж. (25 марта 2016 г.). «Дизайн и синтез минимального бактериального генома» . Наука . 351 (6280): аад6253. Бибкод : 2016Sci...351.....H . дои : 10.1126/science.aad6253 . ISSN   0036-8075 . ПМИД   27013737 .
  19. ^ Аркадий Робертович Мушегян; Евгений Владимирович Кунин (сентябрь 1996 г.). «Минимальный набор генов клеточной жизни, полученный путем сравнения полных бактериальных геномов» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 93 (19): 10268–10273. Бибкод : 1996PNAS...9310268M . дои : 10.1073/pnas.93.19.10268 . ПМК   38373 . ПМИД   8816789 .
  20. ^ Брейер, Мэриан; Эрнест, Тайлер М.; Мерриман, Чак; Уайз, Ким С.; Сунь, Лицзе; Лайнотт, Микаэла Р.; Хатчисон, Клайд А.; Смит, Гамильтон О.; Лапек, Джон Д.; Гонсалес, Дэвид Дж.; Де Креси-Лагард, Валери; Хаас, Драго; Хэнсон, Эндрю Д.; Лабхсетвар, Пиюш; Гласс, Джон И.; Люти-Шультен, Зайда (2019). «Необходимый метаболизм для минимальной клетки» . электронная жизнь . 8 . дои : 10.7554/eLife.36842 . ПМК   6609329 . ПМИД   30657448 .
  21. ^ Герпер, Мэтью. «После 20 лет поисков биологи создали синтетические бактерии без дополнительных генов» . Форбс . Проверено 02 июля 2019 г.
  22. ^ Заявка на патент США: 20070122826.
  23. ^ Уменхоффер К., Фехер Т., Балико Г., Аяйдин Ф., Посфаи Дж., Блаттнер Ф.Р., Посфаи Г. (2010). «Пониженная способность к развитию Escherichia coli MDS42, клеточного шасси без IS для приложений молекулярной и синтетической биологии» . Заводы по производству микробных клеток . 9:38 . дои : 10.1186/1475-2859-9-38 . ПМЦ   2891674 . ПМИД   20492662 .
  24. ^ Посфаи Г., Планкетт Г. 3-й, Фехер Т., Фриш Д., Кейл Г.М., Уменхоффер К., Колисниченко В., Шталь Б., Шарма С.С., де Арруда М., Берланд В., Харкум С.В., Блаттнер Ф.Р. (2006). «Новые свойства Escherichia coli с уменьшенным геномом». Наука . 312 (5776): 1044–6. Бибкод : 2006Sci...312.1044P . дои : 10.1126/science.1126439 . ПМИД   16645050 . S2CID   43287314 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
  25. ^ Колисниченко В, Планкетт Г (3-й), Херринг КД, Фехер Т, Посфаи Дж, Блаттнер ФР, Посфаи Г (апрель 2002 г.). «Инженерия уменьшенного генома Escherichia coli» . Геном Рез . 12 (4): 640–7. дои : 10.1101/гр.217202 . ПМК   187512 . ПМИД   11932248 . {{cite journal}}: CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка ) CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
[ редактировать ]
  1. ^ Перейти обратно: а б Роберта Квок (2010). «Геномика: мастера ДНК» . Природа . 468 (7320): 22–5. Бибкод : 2010Natur.468...22K . дои : 10.1038/468022a . ПМИД   21048740 .
  2. ^ Перейти обратно: а б с Каллауэй, Юэн (2016). « Минимальная» клетка повышает ставки в гонке за освоение синтетической жизни» . Природа . 531 (7596): 557–558. Бибкод : 2016Natur.531..557C . дои : 10.1038/531557a . ISSN   0028-0836 . ПМИД   27029256 .
  3. ^ Болл, Филип (24 января 2008 г.). «Геном, сшитый вручную» . Природа . дои : 10.1038/news.2008.522 . ISSN   0028-0836 .
  4. ^ Перейти обратно: а б с д Пенниси Э (май 2010 г.). «Геномика. Синтетический геном дает бактериям новую жизнь» (PDF) . Наука . 328 (5981): 958–9. дои : 10.1126/science.328.5981.958 . ПМИД   20488994 .
  5. ^ Кацнельсон, Алла (20 мая 2010 г.). «Исследователи запускают клетку с синтетическим геномом» . Природа . дои : 10.1038/news.2010.253 . ISSN   0028-0836 .
  6. ^ Циммер, Карл (23 августа 2013 г.). «И геномы продолжают сокращаться…» National Geographic . Архивировано из оригинала 23 августа 2013 года.
  7. ^ Кен Ширрифф (10 июня 2010 г.). «Использование Arc для расшифровки секретного водяного знака ДНК Вентера» . Блог Кена Ширриффа . Проверено 29 октября 2010 г.
  8. ^ Первая минимальная синтетическая бактериальная клетка . Астробиологический Интернет . 24 марта 2016 г.
  9. ^ Перейти обратно: а б Йонг, Эд (24 марта 2016 г.). «Таинственная вещь о чудесной новой синтетической клетке» .
  10. ^ Сомерс, Джеймс (7 марта 2022 г.). «Путешествие к центру наших клеток» . Житель Нью-Йорка . Нью-Йорк: Конде Наст .
  11. ^ Пилкингтон, Эд (6 октября 2009 г.). «Я создаю искусственную жизнь, — заявляет генный пионер США» . Хранитель . Лондон . Проверено 23 ноября 2012 г.
  12. ^ «Как ученые создали «искусственную жизнь» » . Новости Би-би-си . 20 мая 2010 г. Проверено 21 мая 2010 г.
  13. ^ Поллак, Эндрю (4 сентября 2010 г.). «Его корпоративная стратегия: научный метод» . Нью-Йорк Таймс .
  14. ↑ Самый длинный кусок синтетической ДНК , Scientific American News , 24 января 2008 г.
  15. ^ « Искусственная жизнь: патент заявлен », The Economist , 14 июня 2007 г. Проверено 7 октября 2007 г.
  16. ↑ Роджер Хайфилд, « Искусственный микроб «для создания бесконечного биотоплива» », Telegraph , 8 июня 2007 г. Проверено 7 октября 2007 г.
  17. ^ Янкулович, Елена (15 января 2008 г.). «Новая область синтетической биологии: «Син» или спасение?» . Наука в новостях . Проверено 03 июля 2019 г.
  18. ^ "ООО "Скарабей Геномикс". Веб-сайт компании" .


[ редактировать ]
Retrieved from "https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Mycoplasma_laboratorium&oldid=1229322732#JCVI-syn3.0"
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 2f347e4c9ef6065d821fadadb319187f__1718503320
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/2f/7f/2f347e4c9ef6065d821fadadb319187f.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Mycoplasma laboratorium - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)