Хлорацидобактерия

Хлорацидобактерия
Научная классификация
Домен:	Бактерии
Тип:	Ацидобактериота
Сорт:	«Ацидобактерии»
Заказ:	Ацидобактерии
Семья:	Ацидобактерии
Род:	«Хлорацидобактерия» ; Танк и Брайант 2015
Типовой вид
	«Хлорацидобактерия термофилум». ; Танк и Брайант 2015
Разновидность
	« С. агрегатум » ; « С. термофилум » ; " С. сильный " ;
Синонимы
	« Ca. Chloracidobacterium» Bryant et al. 2007 год ;

Хлорацидобактерии — род ацидобактерий . ^[4] В настоящее время его относят к семейству Acidobacteriaceae , но филогенетические данные позволяют предположить, что он принадлежит к Blastocatellia . ^[5]

Эта группа фотосинтезирующих бактерий была открыта в 2007 году, и их идентификация увеличила число типов бактерий, способных осуществлять фотосинтез на основе хлорофилла, с пяти до шести. ^[3]^[6]

« Кладида хлорацидобактерия термофилум».

Организм Candidatus Chloracidobacterium thermophilum был первоначально обнаружен посредством биоинформатического анализа данных метагеномной последовательности микробных матов, собранных в горячем источнике в Йеллоустонском национальном парке. ^[7] Позже он был выделен после ингибирования видов Synechococcus в образцах микробных матов, что привело к совместной культуре C. thermophilum , видов Anoxybacillus и видов Meiothermus . C. thermophilum высевали на среду Midnight Medium (CTM) для культивирования для получения чистого выделения. Геномное секвенирование бактерии показало, что она не содержит генов ферментов, восстанавливающих сульфат, но зависит от источника восстановленной серы. Исследователи, вероятно, предположили, что он имеет мутуалистические отношения с совместными культурами видов Meiothermus и Anoxybacillus для доступа к источникам пониженного содержания серы. Кроме того, бактерия оказалась аэрофильной, умеренно термофильной, аноксигенной и фотогетеротрофной. В конечном итоге они обнаружили, что это зависит от источника пониженного содержания серы, бикарбоната, L-лизина и витамина B ₁₂ для выделения перед культурой. ^[7]

Филогения

Принятая в настоящее время таксономия основана на Списке названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN). ^[2] и Национальный центр биотехнологической информации (NCBI) ^[8]

на основе 16S рРНК ДП _01_2022 ^[9]^[10]^[11] и Дедыш и Йылмаз 2018 ^[12]

120 маркерных белков на основе GTDB 07-RS207 ^[13]^[14]^[15]

Бластокателлия

Заказ 24

	Бластокателлы

	Приказ 14-2

Chloracidobacterium thermophilum {"Chloracidobacteriales": "Chloracidobacteriaceae"}

« Сильный C. » Saini et al. 2021 год

	« С. агрегат » Saini et al. 2021 год

	« C. thermophilum » Танк и Брайант, 2015 г.

См. также

Ссылки

^ Танк М, Брайант Д.А. (2015). « Chloracidobacterium thermophilum gen. nov., sp. nov.: аноксигенная микроаэрофильная хлорфотогетеротрофная ацидобактерия» . Int J Syst Evol Microbiol . 65 : 1426–1430. дои : 10.1099/ijs.0.000113 . ПМИД 25667398 .
^ Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Хлорацидобактерия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.
^ Jump up to: ^а ^б Брайант Д.А., Костас А.М., Мареска Дж.А., Чу А.Г., Клатт К.Г., Бейтсон М.М. и др. (июль 2007 г.). «» Candidatus Chloracidobacterium thermophilum»: аэробная фототрофная ацидобактерия ». Наука . 317 (5837): 523–6. Бибкод : 2007Sci...317..523B . дои : 10.1126/science.1143236 . ПМИД 17656724 . S2CID 20419870 .
^ См . веб-страницу NCBI , посвященную хлорацидобактериям . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.
^ Дедыш С.Н., Йылмаз П. (2018). «Уточнение таксономической структуры типа ацидобактерий » . Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. дои : 10.1099/ijsem.0.003062 . ПМИД 30325293 .
^ Раймонд Дж. (февраль 2008 г.). «Раскраска в древе жизни». Тенденции в микробиологии . 16 (2): 41–3. дои : 10.1016/j.tim.2007.11.003 . ПМИД 18182293 .
^ Jump up to: ^а ^б Танк М., Брайант Д.А. (27 марта 2015 г.). «Потребность в питательных веществах и физиология роста фотогетеротрофных ацидобактерий , хлорацидобактерий термофилум » . Границы микробиологии . 6 : 226. дои : 10.3389/fmicb.2015.00226 . ПМК 4376005 . ПМИД 25870589 .
^ Сэйерс; и др. «Хлорацидобактерия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.
^ «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2022 г.
^ «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Архивировано из оригинала 4 сентября 2022 года . Проверено 23 февраля 2022 г.
^ «Примечания к выпуску LTP_01_2022» (PDF) . Проверено 23 февраля 2022 г.
^ Дедыш С.Н., Йылмаз П (2018). «Уточнение таксономической структуры типа ацидобактерий » . Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. дои : 10.1099/ijsem.0.003062 . ПМИД 30325293 .
^ «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ "bac120_r207.sp_labels" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.
^ «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

Эта ацидобактериями статья, связанная с , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Танк М, Брайант Д.А. (2015). « Chloracidobacterium thermophilum gen. nov., sp. nov.: аноксигенная микроаэрофильная хлорфотогетеротрофная ацидобактерия» . Int J Syst Evol Microbiol . 65 : 1426–1430. дои : 10.1099/ijs.0.000113 . ПМИД 25667398 .

[LPSN-2] Jump up to: ^а ^б АС Парте; и др. «Хлорацидобактерия» . Список названий прокариот, имеющих номенклатуру (LPSN) . Проверено 9 сентября 2022 г.

[Bryant-3] Jump up to: ^а ^б Брайант Д.А., Костас А.М., Мареска Дж.А., Чу А.Г., Клатт К.Г., Бейтсон М.М. и др. (июль 2007 г.). «» Candidatus Chloracidobacterium thermophilum»: аэробная фототрофная ацидобактерия ». Наука . 317 (5837): 523–6. Бибкод : 2007Sci...317..523B . дои : 10.1126/science.1143236 . ПМИД 17656724 . S2CID 20419870 .

[4] См . веб-страницу NCBI , посвященную хлорацидобактериям . Данные, извлеченные из «Ресурсы таксономии NCBI» . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 19 марта 2007 г.

[D&Y-5] Дедыш С.Н., Йылмаз П. (2018). «Уточнение таксономической структуры типа ацидобактерий » . Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. дои : 10.1099/ijsem.0.003062 . ПМИД 30325293 .

[6] Раймонд Дж. (февраль 2008 г.). «Раскраска в древе жизни». Тенденции в микробиологии . 16 (2): 41–3. дои : 10.1016/j.tim.2007.11.003 . ПМИД 18182293 .

[:0-7] Jump up to: ^а ^б Танк М., Брайант Д.А. (27 марта 2015 г.). «Потребность в питательных веществах и физиология роста фотогетеротрофных ацидобактерий , хлорацидобактерий термофилум » . Границы микробиологии . 6 : 226. дои : 10.3389/fmicb.2015.00226 . ПМК 4376005 . ПМИД 25870589 .

[NCBI-8] Сэйерс; и др. «Хлорацидобактерия» . База данных таксономии Национального центра биотехнологической информации (NCBI) . Проверено 9 сентября 2022 г.

[9] «ЛТП» . Проверено 23 февраля 2022 г.

[10] «Дерево LTP_all в формате Ньюика» . Архивировано из оригинала 4 сентября 2022 года . Проверено 23 февраля 2022 г.

[11] «Примечания к выпуску LTP_01_2022» (PDF) . Проверено 23 февраля 2022 г.

[12] Дедыш С.Н., Йылмаз П (2018). «Уточнение таксономической структуры типа ацидобактерий » . Int J Syst Evol Microbiol . 68 : 3796–3806. дои : 10.1099/ijsem.0.003062 . ПМИД 30325293 .

[about-13] «Выпуск GTDB 07-RS207» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[tree-14] "bac120_r207.sp_labels" . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[taxon_history-15] «История таксонов» . База данных геномной таксономии . Проверено 20 июня 2022 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]